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Optimization of Swine Breeding Programs Using Genomic Selection with ZPLAN+

  • Lopez, B.M.;Kang, H.S.;Kim, T.H.;Viterbo, V.S.;Kim, H.S.;Na, C.S.;Seo, K.S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권5호
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    • pp.640-645
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    • 2016
  • The objective of this study was to evaluate the present conventional selection program of a swine nucleus farm and compare it with a new selection strategy employing genomic enhanced breeding value (GEBV) as the selection criteria. The ZPLAN+ software was employed to calculate and compare the genetic gain, total cost, return and profit of each selection strategy. The first strategy reflected the current conventional breeding program, which was a progeny test system (CS). The second strategy was a selection scheme based strictly on genomic information (GS1). The third scenario was the same as GS1, but the selection by GEBV was further supplemented by the performance test (GS2). The last scenario was a mixture of genomic information and progeny tests (GS3). The results showed that the accuracy of the selection index of young boars of GS1 was 26% higher than that of CS. On the other hand, both GS2 and GS3 gave 31% higher accuracy than CS for young boars. The annual monetary genetic gain of GS1, GS2 and GS3 was 10%, 12%, and 11% higher, respectively, than that of CS. As expected, the discounted costs of genomic selection strategies were higher than those of CS. The costs of GS1, GS2 and GS3 were 35%, 73%, and 89% higher than those of CS, respectively, assuming a genotyping cost of $120. As a result, the discounted profit per animal of GS1 and GS2 was 8% and 2% higher, respectively, than that of CS while GS3 was 6% lower. Comparison among genomic breeding scenarios revealed that GS1 was more profitable than GS2 and GS3. The genomic selection schemes, especially GS1 and GS2, were clearly superior to the conventional scheme in terms of monetary genetic gain and profit.

Klebsiella pneumoniae가 생산하는 Glutamine synthetase의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of Glutamine synthetase of Klebsiella pneumoniae)

  • 차정학;이왕식;성하진
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.259-264
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    • 1991
  • K.pneumoniae의 nif 유전자 발현에 미치는 glnA 산물 (GS)의 영향을 살펴보기 앞서 K.pneumoniae의 GS를 분리.정제하여 그 성질을 조사하였다. K.pneumoniae의 GS는 분자량 약 600,000의 12개 동일 subunit으로 구성되어져 이었으며 최적 반응 pH 및 온도는 각기 pH 7.0, $37^{\circ}C$ 였고 pH 5-8사이에서 활성의 변화가 크지 않았으며 $57^{\circ}C$에서 10분간 열처리 할 때 50의 활성 감소가 나타났다. 또 암모니아 농도의 변화에 따라 adenylylation-deadenylylation 기작에 의한 활성조절기작이 E.coli GS와 동일 했으며 anti-E.coli GS 항체를 이용한 immunodiffusion에서도 K.pneumoniae GS가 E.coli GS와 혈청적으로 매우 유사함이 드러났다.

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In Vitro Antibacterial Effect of the Combination of Galla rhois ethanol extracts and Sodium chlorate against Intramacrophage Brucella abortus

  • Cha, Chun-Nam;Hong, Il-Hwa;Yu, Eun-Ah;Park, Eun-Kee;Yoo, Chang-Yeol;Kim, Suk;Lee, Hu Jang
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제29권1호
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    • pp.67-72
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    • 2014
  • 본 연구는 오배자 에탄올 추출물 (GRE), 염소산나트륨 (SC) 그리고 오배자 에탄올 추출물과 염소산나트륨 합제 (GS)의 B. abortus에 대한 항균효과를 확인하기 위해 수행되었다. GRE, SC 그리고 GS를 B. abortus에 처리하여 배양한 후, B. abortus의 생존수를 확인하였으며, 마우스 탐식세포 내 감염된 B. abortus의 증식 억제효과를 경시별 (2, 24, 48시간)로 조사하였다. GRE, SC 그리고 GS는 각각 $400{\mu}g/mL$ 이하, 15 mM 그리고 0.6GS (GS 1, GRE $1,000{\mu}g/mL$ + SC 30 mM) 이하의 농도에서 세포독성을 나타나지 않았다. 모든 처리구에서 B. abortus의 생존율은 용량-의존적으로 현저하게 감소하는 결과를 나타내었다. 또한, GRE ($400{\mu}g/mL$), SC (15 mM) 그리고 0.5GS (GRE $500{\mu}g/mL$ + SC 15 mM)를 처리한 세포에서 배양 48시간 후에, B. abortus의 증식이 통계적으로 유의성 있게 감소하였으며 (GRE, p < 0.01; SC and 0.5GS, p < 0.001), 특히, GS를 처리한 경우, B. abortus의 세포내 증식이 GRE와 SC의 상승작용에 의한 강력한 항균효과를 나타내었다. 결론적으로, GS는 B. abortus에 대한 항균물질로서 유용할 뿐만 아니라, 식육과 우유 위생 분야에 적용할 수 있을 것으로 생각된다.

단순 다각형에서의 경비 가능 충분 집합 (Guard Sufficiency Set for Simple Polygons)

  • 양태천;신찬수
    • 한국정보과학회논문지:시스템및이론
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    • 제28권1_2호
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    • pp.73-79
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    • 2001
  • 단순 다각형 P에 대한 새로운 화량문제인 경비가능충분집합(Guard Sufficiency Set:GSS)에 대하여 소개하고 정의하였다. 집합 S P가 P의 경비가능집합이라는 의미는 P의 각 점들이 최소한 S에 있는 한 점으로부터 보인다는 것을 의미한다. 집합 G P가 P의 경비가능충분집합이라는 의미는 G를 경비 가능한 임의의 집합 S P가 P 역시 경비 가능하다는 것을 의미한다. 본 논문에서는 꼭지점에 대한 GSS가 다각형 전체에 대한 GSS가 되는 다각형 부류를 제시하고, 또한 에지에 대한 GSS가 다각형 전체에 대한 GSS가 되는 다각형 부류를 제시한다. 그리고, P의 꼭지점에 대한 GSS의 크기에 대한 하한과 상한을 제시하고, 기하학적 요소에 특정 제약조건을 주어 대체 GSS을 정의할 수 있음을 보인다. 이 외에도 다양한 GSS 문제들을 소개하고, 기하학적 요소에 제약을 가한 대체 GSS를 정의하고 그와 관련된 가설을 하나 제시한다.

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GSS의 수용 요인과 GSS의 사용이 개인의 성과에 미치는 영향에 관한 연구 (The Influence of Acceptance Factors and Usage of GSS on Organizational Member's Performance)

  • 강소라;양희동;박현여
    • 한국IT서비스학회:학술대회논문집
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    • 한국IT서비스학회 2006년도 추계학술대회
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    • pp.483-490
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    • 2006
  • 본 연구에서는 조직 구성원의 협업을 위하여 도입되는 그룹지원시스템(group support system; GSS)를 대상으로 GSS의 사용에 미치는 영향과 GSS의 사용으로 인한 개인의 성과의 관계에 대한 연구를 실시하였다. 본 연구를 위해 개인의 기술수용 요인에 대한 연구에서 보편적으로 널리 사용되어 온 기술수용모델(technology acceptance model; TAM)과 사용자의 과업과의 연관성을 고려한 과학기술적합(task-technology fit; TTF) 개념, 그리고 적응구조화이론(adaptive structuration theory; AST)을 통합하여 그룹 구성원들이 GSS의 도입의도에 맞게 사용하는 것이 개인과 조직의 성과를 향상시키는지 검증하였다. 연구결과, 높은 TTF는 사용자들이 GSS에 대하여 지각하는 유용성과 용이성에 영향을 미친다는 것을 검증하였다. 또한, TTF가 사용자들의 적절한 사용을 이끌고 있음을 검증하여 TTF 중심의 연구와 AST의 적절한 사용(faithfulness on appropriation; FOA)을 중심으로 하는 두 연구에 대한 통합 모델을 제시하였다.

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Google Scholar의 학술정보 검색을 위한 정보 유용성 비교연구 (An Investigation of Information Usefulness of Google Scholar in Comparison with Web of Science)

  • 김현정
    • 한국비블리아학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.215-234
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    • 2014
  • Google Scholar(GS)는 인용색인 데이터베이스 측면에서 나름 부족한 부분은 있으나 무료라는 점과 대규모 크기의 데이터를 갖춘 이용자 중심의 자료라는 점에서 많은 이용자에 의해 이용되고 있다. 본 연구는 Google Scholar의 학술정보 검색을 겨냥한 정보 유용성 진단을 목적으로 기존의 통제어휘의 기반을 둔 인용색인 데이터베이스인 Web of Science(WoS)와 대비하여 비교분석한다. 실증적 정보 유용성 평가를 위해 두 가지 분석으로 진행되었다; 첫째는 문헌정보학 분야의 학술지를 중심으로 두 데이터베이스의 검색결과와 인용문헌의 수의 차이가 있는가를 정량 분석했다. 두 번째는 WoS 접근성이 떨어지는 이용자의 경우 GS가 WoS의 대체 정보원으로 기능할 수 있는지에 대해 이용자를 대상으로 정성분석을 실시했다. 실증 데이터 분석을 통해 얻어진 연구 결과는 정량평가에서 GS는 WoS에 대비해서 통계적으로도 유의한 높은 검색결과와 인용문헌수의 차이를 보여 대체 정보원의 기능이 가능한 반면, 정성평가에서는 이용자들은 GS와 WoS의 질적 차이를 크게 느끼지 못하는 것으로 나타나 대체기능을 확인할 수 없는 것으로 나타났다.

관상동맥이완과 혈소판응집에 대한 GS283과 GS386의 약리작용기전에 관한 연구 (Pharmacological Mechanism of Action of GS283 and GS386 on Human Platelet and Pig Coronary Artery)

  • 장기철;이회영;이균우;구의본;강영진;이영수
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제5권3호
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    • pp.239-245
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    • 1997
  • Trimetoquinol (TMQ) and its analogs are known to have thromboxane $A_2$ antagonistic action. We also reported that GS389, chemically similar to TMQ, has competitive antagonistic action in rat aorta and human platelets. In the present study, we investigated the pharmacological characteristics of GS283 and GS 386, analogs of GS389, using vascular smooth muscle, human platelets and rat brain homogenates. In isolated pig coronary artery (PCA), both of GS283 and GS386 relaxed U46619-contracted rings in concentration dependent manner. Pretreatment with several concentrations of GS283 and GS386 shifted the dose-response curves to the right, and reduced of maximum contration dose-dependently. Furthermore, GS283 and GS386 strongly inhibited $Ca^{2+}$ -induced contraction in the PCA. In human platelets, U46619- and A23187-induced platelet aggregation was inhibited by GS283 and GS386, concentration-dependently. Anti-platelet aggregation was related to the compound\`s ability to inhibit ATP release at each stimulation. In rat brain homogenates, receptor-binding assay resulted that both GS283 and GS386 have a relative affinity to $\alpha$-adrenergic receptor. Taken together. we concluded that the mechamism of action of GS283 and GS86 is not related with in TXA$_2$ receptor but concerned with calcium antagonistic action and a-blocking action.n.

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연쇄상구균 GS-5의 ag I/II와 gtfD 유전자 클로닝 (IDENTIFICATION OF THE AG I/II AND GTFD GENES FROM STREPTOCOCCUS MUTANS GS-5)

  • 정진우;백병주;양연미;서정아;김재곤
    • 대한소아치과학회지
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    • 제32권2호
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    • pp.357-369
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    • 2005
  • 치아 우식은 석회화 조직의 일부가 용해되고 파괴되는 감염성 세균 질환이다. 최근에 보고된 치아우식증 관련 미생물에 대한 연구는 대부분이 Streptococcus mutans와 같은 Mutans streptococci에 초점을 맞추고 있다. Mutans streptococci는 7가지의 서로 다른 종(S. cricetus, S. downei, S. ferus, S. macacae, S. mutans, S. rattus, S. sobrinus)과 8가지의 혈청형(serotype a-h)을 모두 포함하여 일컫는다. 산 생성으로 인한 치아의 법랑질 탈회뿐 아니라 치면에 접착하여 군집를 형성하는 것이 균의 독성에 있어 중요하다. 그러므로 우식은 치태와 밀접한 관련이 있다. 이런 초기 군집 형성은 antigen I/II(Ag I/II)와 glucosyltransferase(GTF)에 의해 이루어진다. 그러므로, Ag I/II와 GTF는 S. mutans GS-5에 대한 백신개발에 있어 적당한 목표가 된다. 본 실험은 S. mutans GS-5로부터 ag I/II와 gtfD 유전자를 복제하고 나열하였다. 핵산의 나열순서 분석결과 앞서 보고된 나열과 높은 일치도를 보였다. 복제된 Ag I/II와 앞서 보고된 S. mutans GS-5의 해당 부위의 280개의 핵산은 완벽하게 일치하였다. gtfD와 S. mutans UA159와 비교시, 105개의 아미노산 중 4부위에서 변화를 관찰하였다.

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목초액 (거성 Y.L.S-95)의 유전독성에 관한 연구 (Studies on the Genetic Toxicity of Guh Sung Y.L.S.-95)

  • 이수용;이광용;윤호권;정은정;김연수;이혜영;이병훈
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.107-112
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    • 2006
  • Guh Sung Y.L.S-95 (GS95)는 초산을 주성분으로 하는 목초액으로 본 연구에서는 GS95의 유전독성을 국립독성연구원의 표준작업지침서에 따라 수행하였다. Salmonella typhimurium TA1535, TA1537, TA98, TA100을 이용한 복귀돌연변이시험에서 GS95는 최고농도 $5,000{\mu}g/plate$까지 돌연변이 집락수를 유의적으로 증가시키지 않았다. Chinese hamster lung fibroblast를 이용한 염색체이상 시험에서 GS95는 1.25-5mg/mL의 농도범위까지 음성의 결과를 나타내었다. 또한 ICR mouse를 이용한 소핵시험에서 GS95는 최고농도 5,000mg/kg까지에서 소핵을 가진 다염성적혈구의 출현율이 음성대조군에 비해 유의한 차이를 나타내지 않았다. 이상의 연구결과에 따라 GS95는 상용량에서 유전독성을 유발하지 않을 것으로 사료된다.