• 한국미생물학회:학술대회논문집
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• 한국미생물학회 2008년도 International Meeting of the Microbiological Society of Korea
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• pp.171-171
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• 2008

We monitored the occurrence of human enteric viruses in urban rivers by cell culture-PCR and RT-nested PCR. Water samples were collected monthly or semimonthly between May 2002 and March 2003 in four urban tributaries. Enteric viruses were detected by RT-nested PCR and cell culture-PCR based on a combination of Buffalo Green monkey kidney (BGMK) and A549 cell lines, followed by phylogenetic analysis of amplicons. By RT-nested PCR analysis, 45 (77.6%), 32 (55.2%), 32 (55.2%), 26 (44.8%), 12 (20.7%), 2 (3.4%), 4 (6.9%), and 4 (6.9%) of 58 samples showed positive results with adenoviruses, enteroviruses, noroviruses (NV) genogroup I (GI) and II (GII), reoviruses, hepatitis A viruses, rotaviruses and sapoviruses, respectively. Adenoviruses were most often detected and only eight (13.8%) samples were negative for adenoviruses and positive for other enteric viruses in the studied sites. Thirty-one (77.5%) of the 40 samples were positive for infectious adenoviruses and/or enteroviruses based on cell culture-PCR, and the frequency of positive samples grown on A549 and BGMK (65.0%) was higher than that grown on BGMK alone (47.5%). The occurrence of each enteric virus, except reoviruses and hepatitis A viruses was not statistically correlated with the water temperature and levels of fecal coliforms according to Binary logistic regression model. By sequence analysis, most strains of adenoviruses and enteroviruses detected in this study are similar to the causative agent of viral diseases in Korea and most NV GI- and GII-grouped strains were closely related to the reference strains from China and Japan, and GII/4-related strains had similar sequences to strains recognized as a worldwide epidemic outbreak. Our results suggested that monitoring human enteric viruses is necessary to improve microbial quality and cell culture-PCR using the combination of A549 and BGMK cells and the adenovirus detection by PCR could be useful for monitoring viral contamination in the aquatic environment.

• 대한임상검사과학회지
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• 제49권2호
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• pp.141-149
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• 2017

2015년 3월부터 2017년 2월까지 2년간 Multiplex-PCR을 이용한 소아청소년의 급성설사질환 원인규명을 위해 의뢰된 521 분변 검체를 대상으로 5종의 바이러스 검사와 10종의 세균검사를 실시한 521 분변 검체 중 바이러스나 세균이 확인된 170명 중 중복 감염이 확인된 9명의 검체를 포함하여 179개의 양성검체의 결과를 분석한 결과 남아가 102명(56.98%), 여아가 77명(43.02%)이었으며, 3~4세(51.96%), 5~6세(12.29%) 연령대에서 가장 높은 양성율을 보였다. 179건의 양성 검체 중 중복감염을 포함한 209건(209/521, 40.12%)을 분석한 결과 norovirus-GII 감염이 88건(88/521, 16.89%), Campylobacter spp. 감염이 26건(26/521, 4.99%), rotavirus 감염이 18건(18/521, 3.45%), Clostridium difficile Toxin B 감염이 18건(18/521, 3.45%), adenovirus 감염이 17건(17/521, 3.26%), Clostridium perfringens 감염은 16건(16/521, 3.07%), astrovirus 감염은 11건(11/521, 2.11%), Salmonella spp. 감염은 5건(5/521, 0.96%), norovirus-GI, Yersinia spp., Aeromonas spp. 감염은 각각 3건(3/521, 0.58%), verocytotoxin-producing E. coli 감염은 1건(1/521, 0.19%), Vibrio spp, E. coli O157:H7, Shigella spp. 감염은 나타나지 않았다. 유아기(6세 이하)의 계절별 분리 양상을 확인한 결과는 기온이 낮은 겨울(11~2월)에는 주로 norovirus-GI, norovirus-GII가 유행하였고, 기온이 상승하기 시작하는 봄(3~5월)에는 rotavirus가 유행하는 경향을 전형적인 장염바이러스의 경향을 보였다. Astrovirus 경우에는 norovirus-GI, norovirus-GII, rotavirus가 유행하는 시기가 아닌 4월~10월에 유행하는 경향을 보이고, adenovirus인 경우에는 8월~2월까지 유행하는 경향을 보였다. 연령이 높아질수록 바이러스뿐만 아니라 세균이 원인이 되어 급성설사질환을 유발하는 것으로 나타났으며, 다중 중합효소연쇄반응으로 원인을 파악하고자 할 때에는 유아기 때에는 바이러스 검사를 의뢰하는 것이 유효하지만 연령이 높아짐에 따라 바이러스와 세균을 동시에 의뢰하는 것이 바람직하다고 사료된다.

• 대한의생명과학회지
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• 제17권3호
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• pp.191-196
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• 2011

Noroviruses (noroV) are the major cause of nonbacterial gastroenteritis in humans worldwide. Since noroV cannot yet be cultured in vitro and their diagnosis by electron microscopy requires at least $10^6$ viral particles/g of stool a variety of molecular detection techniques represent an important step towards the detection of noroV. In the present study, we have applied real-time nucleic acid sequence-based amplification (real-time NASBA) for simultaneous detection of NoroV genogroup I (GI) and genogroup II (GII) using standard viral RNA. For real-time NASBA assay which can detected noroV GI and GII, a selective region of the genes encoding the capsid protein was used to design primers and genotype-specific molecular beacon probes. The specificity of the real-time NASBA using newly designed primers and probes were confirmed using standard viral RNA of noroV GI and GII. To determine the sensitivity of this assay, serial 10-fold dilutions of standard viral RNA of noroV GI and GII were used for reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and real-time NASBA. The results showed that while agarose gel electrophoresis could detect RT-PCR products with 10 pg of standard viral RNA, the real-time NASBA assay could detect 100 fg of standard viral RNA. These results suggested that the real-time NASBA assay has much higher sensitivity than conventional RT-PCR assay. This assay was expected that might detect the viral RNA in the specimens which could have been false negative by RT-PCR. There were needed to perform real-time NASBA with clinical specimens for evaluating accurate sensitivity and specificity of this assay.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제27권2호
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• pp.90-101
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• 2020

목적: 급성 위장염의 대부분의 경우 원인 병원체가 확인되지 않는다. 최근 들어 발달한 multiplex reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) 검사는 장염 병원체 검출에 도움을 줄 수 있다. 이 연구는 multiplex RT-PCR을 이용해, 소아 장염환자에서 병원체의 역학을 조사하고자 하였다. 방법: 2015년 5월부터 2018년 6월까지 대한민국 서울의 2차병원에서 급성 위장염으로 진단받은 소아 환자의 대변에서 병원체를 확인하기 위해 multiplex RT-PCR 검사를 시행하였다. 결과: 바이러스 병원체에 대한 1,366개의 대변 검체 중, 483개(35.3%)에서 1개 이상의 병원체가 분리되었다. A군 로타바이러스는 106건(7.8%)에서 확인되었으며, 양성률은 3.0% (8/263)에서 16.7% (48/288)까지 매년 증가했다(P<0.001). 노로바이러스 GII는 가장 흔한 바이러스성 병원체였고(263/1366, 19.3%), 3년간 양성률은 증가하지 않았다. 세균성 병원체에 대한 304개의 대변 검체 중 캄필로박터(32/304, 10.5%)는 가장 흔한 세균성 병원체였으며, 그 다음으로 Clostridium difficile (toxin B) (22/304, 7.2%), 살모넬라균(17/304, 5.6%)이었다. 이 균들의 양성률은 연구기간 동안 증가하지 않았다. 결론: 로타바이러스 백신 도입 이후 노로바이러스 GII가 소아 장염에서 주요한 병원체였지만, 연구기간 동안 로타바이러스 감염 환자가 증가했고, 특히 2018년에는 급증했다. 따라서 새로운 로타바이러스 균주의 등장 가능성을 포함한 추가 연구가 필요하다. 캄필로박터는 소아 세균성 장염의 주요 원인이며, 적절한 치료를 위해 이 균의 임상적 특성을 고려하고 지속적 감시가 필요하겠다.

• 한국작물학회지
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• 제28권1호
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• pp.12-40
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• 1983

우리나라 수도 품종의 시대적 변천에 따른 그들 품종의 생육형질 및 수량구성형질들의 변이를 조사비교하여 앞으로 품종육성 및 재배기술 발전에 필요한 기초자료를 얻고자 연대별 주요품종을 5개씩 25개 품종을 공시하여 5대 품종군, 즉 ${circled1}$1907년대의 재래품종들을 GI군, ${circled2}$ 1920년대의 도입품종들을 GII군 ${circled3}$ 1930년대에 육성 보급된 품종들을 GIII군, ${circled4}$ 1950년대에 육성 보급된 품종들을 GIV군, ${circled5}$ 1971년 통일품종 육성이후에 육성된 품종들을 GV군으로 구분하여 이앙시기를 5월 15일, 5월 30일, 6월 14일 및 6월 29일의 4회로 하여 시험조사 하였는데 그 결과는 다음과 같다.

• 디지털융복합연구
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• 제18권12호
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• pp.425-434
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• 2020

바이러스감염으로 인한 설사는 전 세계적으로 공중 보건의 주요 문제이며 사망률의 큰 부분을 차지하고 있지만 기후데이터를 이용하여 분석한 연구는 많지 않다. 따라서 본 연구는 설사를 유발하는 바이러스인 Rotavirus Gr.A, Norovirus G-I & GII의 감염과 기후와의 인과관계를 분석하여 조기진단과 치료를 용이하게 하고 계절성 질환을 더욱 관리하고 예방하는데 기여하고자 하였다. 2010년 6월부터 2019년 12월까지 단국대학교 병원에서 시행한 대변 시료 4,009개의 설사바이러스 6종의 멀티플렉스 역전사 PCR(mRT-PCR)검사결과와 다양한 기후 요인 중 체감온도, 상대습도, 일조율과의 상관관계를 후향적으로 분석하였다. 4,009 개의 대변 샘플 중 985 개는 Rotavirus Gr.A, Norovirus G-I & GII 감염에 대해 양성이었다. 이 985 건 중 95.3 % (n = 939)는 10 세 미만으로 Rotavirus Gr.A, Norovirus G-I & GII는 10 세 미만 환자에서 높은 감염률을 보였다. 우리는 기상 빅데이터와 연령, 시기별 감염분석 등에 기초하여 Rotavirus Gr.A의 감염이 상대 습도에 따라 유의한 상관 관계가 있음을 확인하였고 Norovirus G-II의 감염은 체감 온도와 유의한 상관 관계가 있음을 확인하였다. 본 연구는 기후요인에 따른 Rotavirus Gr.A, Norovirus G-I & GII 감염의 분포에 대한 이해도를 향상시킴으로써 바이러스성 설사질환과 관련된 보건정책의 설정이나 계절적 영향에 대한 새로운 통찰력을 제공하는데 유용한 자료가 될 것으로 기대한다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제28권2호
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• pp.210-217
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• 2018

A one-step multiplex reverse transcription PCR (RT-PCR) method comprising six primer sets (for the detection of norovirus GI and GII, hepatitis A virus, rotavirus, and astrovirus) was developed to simultaneously detect four kinds of pathogenic viruses. The size of the PCR products for norovirus GI and GII, hepatitis A virus (VP3/VP1 and P2A regions), rotavirus, and astrovirus were 330, 164, 244, 198, 629, and 449 bp, respectively. The RT-PCR with the six primer sets showed specificity for the pathogenic viruses. The detection limit of the developed multiplex RT-PCR, as evaluated using serially diluted viral RNAs, was comparable to that of one-step single RT-PCR. Moreover, this multiplex RT-PCR was evaluated using food samples such as water, oysters, lettuce, and vegetable product. These food samples were artificially spiked with the four kinds of viruses in diverse combinations, and the spiked viruses in all food samples were detected successfully.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제12권2호
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• pp.183-193
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• 2009

목 적: 로타바이러스, 노로바이러스, 아스트로바이러스, 장 아데노바이러스는 소아에서 급성 위장관염을 일으키는 주요 원인 바이러스이다. 일부 소아에서는 급성 위장관염 경과 중에 무열성 경련을 보이는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 급성 위장관염 및 급성 위장관염에 병발하는 양성 무열성 경련(BIS-MG) 소아 환자의 대변에서 검출한 바이러스와 바이러스 유전자형을 분석하고자 하였다. 방 법: 2004년 8월에서 2005년 7월까지 분당서울대병원 소아청소년과에 급성 위장관염으로 입원한 311명 소아 환자를 대상으로 하였다. 모든 대상 환자의 대변에서 로타바이러스, 노로바이러스, 아스트로바이러스, 아데노바이러스에 대한 검사를 실시하여 장염 원인 바이러스를 검출하였고, 217명의 소아에서 분자유전학적 검사에 의하여 각 바이러스의 유전자형을 분석하였다. 결 과: 급성 위장관염 소아 환아 217명(남아 121명, 여아 96명, 평균 연령 20.6${\pm}$15.4개월) 중에서 로타바이러스가 109명(50.2%), 노로바이러스가 28명(12.9%), 아데노바이러스가 13명(6.0%), 아스트로바이러스가 2명 (0.9%)에서 검출되었다. 로타바이러스의 유전자형 분석결과 P[8]G3가 36명, P[4]G2 21명, P[6]G4 10명, P[4]G4 9명, P[8]G9과 P[8]G1 6명, P[4]G3 4명, P[4]G93명, P[6]G2 2명이었다. 노로바이러스의 유전자형은 GII-4가 27명, GII-6 1명이었다. 16명의 소아가 급성 위장관염에 병발하는 양성 무열성 경련으로 진단되었으며, 로타바이러스가 13명, 노로바이러스가 2명에서 검출되었고, 나머지 1명은 아무런 바이러스도 발견되지 않았다. BIS-MG군에서 검출된 로타바이러스 유전자형은 P[8]G3 6명, P[4]G2 2명, P[4]G9 1명이었으며, 노로바이러스 유전자형은 2명 모두 GII-4였다. 결 론: 급성 위장관염에 병발하는 양성 무열성 경련을 보인 소아 환자의 대변에서 시행한 바이러스 분석결과 로타바이러스와 노로바이러스가 중요한 원인 바이러스였으며, 향후 이에 대한 지속적인 연구가 필요할 것이다.

• 한국식품영양과학회지
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• 제40권12호
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• pp.1700-1707
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• 2011

본 연구에서는 4주간 혼합곡 식이를 공급하여 treadmill을 통한 운동시간과 glycogen 저장능력 변화를 관찰함으로써 지구력 개선에 대한 평가를 하였다. 7주령 SD rats은 정상군 (Nor, 정상식이, n=6), 대조군(Con, 20% 정상식이+80% milled rice, n=6), GI(혼합곡 식이 I, n=6), GII(혼합곡 식이 II, n=6), GIII(혼합곡 III, n=6)와 GIV(혼합곡 식이 IV, n=6)으로 임의 군배정을 하였다. 지구력 시험은 24일간의 적응훈련과 혼합곡 식이 공급을 한 후 실시하였다. 운동 지속시간과 glycogen 저장능력은 혼합곡 식이 공급에 의해서 증가하였다. 더욱이 25 min 운동 그리고/또는 탈진 시까지의 운동 후에서 혈액 내 무기질 인, CPK와 lactate의 농도는 혼합곡 투여에 의하여 감소하였으나, GOP, GTP, lactate LDH의 농도는 군간 차이는 보이지 않았다. 본 연구에서는 4주간의 혼합곡 식이가 운동 지속 시간과 glycogen 장 능력이 증가되었으며, 피로물질인 무기질 인, CPK와 lactate의 농도가 감소시킴으로써 지구력 개선에 도움을 줄 것으로 생각된다.

• Clinics in Shoulder and Elbow
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• 제11권2호
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• pp.158-164
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• 2008

목적: 본 연구의 목적은 관절경하 Bankart 수복술에서 금속 봉합나사못과 생체흡수성 봉합나사못을 사용 시의 결과를 비교하는데 있다. 대상 및 방법: 2006년 10월에서 2007년 3월까지 견관절 전방 불안정에 대해 관절경하 Bankart 수복술을 시행한 26명을 대상으로 하였고, 금속 봉합나사못 군(GI)은 15명, 생체흡수성 봉합나사못 군(GII)은 11명이었다. 조사대상의 평균연령은 27.4세였고, 평균 추시기간은 14개월이었다. 기능평가는 KSSI 점수, Rowe 점수, ASES점수, UCLA 점수를 사용하여 평가하였다. 결과: 금속 봉합나사못 군(GI)에서 KSSI, ASES점수, UCLA점수, Rowe 점수들의 평균값의 상승은 각각 20.6, 24.0, 4.0, 45.5이었고, GII에서는 각각 21.0, 23.6, 4.6, 48.9였다. 최종 추시 시 두 군에서 기능평가상 유의한 차이를 보이지 않았지만(p>.05), GII에서 금속돌출로 인한 문제와 외상에 의한 재탈구가 각각 1예씩 있었다. 결론: 두 군 모두 만족스런 결과를 보였으며, 생체흡수성 봉합나사못을 사용할 경우 금속으로 인한 문제를 피할 수 있는 이점이 있어 추천할 만한 술식으로 생각되었다.