Pufferfish (Takifugu spp.) are economically important edible marine fish. Mistakes in pufferfish classification can lead to poisoning; therefore, accurate species identification is critical. In this study, we used the mtDNA cytochrome c oxidase subunit I gene (COI) to design specific primers for six Takifugu species among the 21 domestic or imported pufferfish species legally sold for consumption in Korea. We rapidly and simultaneously identified these pufferfish species using a highly efficient, multiplex polymerase chain reaction (PCR) system with the six species-specific primers. The results showed that species-specific multiplex PCR (multiplex species-specific polymerase chain reaction; MSS-PCR) either specifically amplified PCR products of a unique size or failed. MSS-PCR yielded amplification fragment lengths of 897 bp for Takifugu pardalis, 822 bp for T. porphyreus, 667 bp for T. niphobles, 454 bp for T. poecilonotus, 366 bp for T. rubripes, and 230 bp for T. xanthpterus using the species-specific primers and a control primer (ca. 1,200 bp). We visualized the results using agarose gel electrophoresis to obtain accurate contrasts of the six Takifugu species. MSS-PCR analysis is easily performed and provides identification results within 6 h. This technique is a powerful tool for the discrimination of Takifugu species and will help prevent falsified labeling, protect consumer rights, and reduce the risk of pufferfish poisoning..
Park, Soo-Dong;Lee, Sang-Nam;Park, Ik-Hyun;Choi, Jong-Su;Jeong, Wol-Kyu;Kim, Youn-Hee;Lee, Heung-Shick
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
제14권4호
/
pp.789-795
/
2004
A promoter-probe shuttle vector pSK1Cat was constructed for the isolation of transcriptional signal sequences from Corynebacterium glutamicum. Besides conferring resistance to kanamycin in Escherichia coli and C. glutamicum, the vector carried a promoterless cat gene to confer resistance to chloramphenicol upon insertion of the appropriate transcriptional signals in the multiple cloning site. By utilizing the vector, a series of transcriptionally active fragments were isolated from the genome of C. glutamicum. The clones, ranging from 200 bp to 1 kb in size, were grouped into 3 classes of strong, medium, and weak, based on the chloramphenicol acetyltransferase (CAT) activity and sensitivity to the chloramphenicol of the clone-carrying C. glutamicum cells. C. glutamicum cells carrying the $P_{19}$ clone, a representative in the strong class, were able to grow on minimal agar plates containing over $40 mg/mell$ chloramphenicol, and showed CAT activity of 10 m㏖/mgㆍmin, performing slightly better than the cells carrying $P_{tac}$ , a strong E. coli promoter. Subcloning analysis of the $P_{19}$ clone identified a 180 bp intergenic fragment ($P_{180}$), which was located upstream of a gene encoding a hypothetical membrane protein. The expression conferred by $P_{180}$ was not affected by either the kinds of carbon sources or changes in temperature. These properties make the $P_{180}$ clone useful for the deregulated expression of biosynthetic genes in C. glutamicum during amino acid fermentation.
The genetic diversity of Schistosoma haematobium remains largely unstudied in comparison to that of Schistosoma mansoni. To characterize the extent of genetic diversity in S. haematobium among its definitive host (humans), we collected S. haematobium eggs from the urine of 73 infected schoolchildren at 5 primary schools in White Nile State, Sudan, and then performed a randomly amplified polymorphic DNA marker ITS2 by PCR-RFLP analysis. Among 73 S. haematobium egg-positive cases, 13 were selected based on the presence of the S. haematobium satellite markers A4 and B2 in their genomic DNA, and used for RFLP analysis. The 13 samples were subjected to an RFLP analysis of the S. haematobium ITS2 region; however, there was no variation in size among the fragments. Compared to the ITS2 sequences obtained for S. haematobium from Kenya, the nucleotide sequences of the ITS2 regions of S. haematobium from 4 areas in Sudan were consistent with those from Kenya (> 99%). In this study, we demonstrate for the first time that most of the S. haematobium population in Sudan consists of a pan-African S. haematobium genotype; however, we also report the discovery of Kenyan strain inflow into White Nile, Sudan.
Koh, Young Jin;Kim, Gyoung Hee;Koh, Hyun Seok;Lee, Young Sun;Kim, Seong-Cheol;Jung, Jae Sung
The Plant Pathology Journal
/
제28권4호
/
pp.423-427
/
2012
Pseudomonas syringae pv. actinidiae strains, the causal agents of bacterial canker on kiwifruit, were isolated from Korea and Italy in 2011. Among 87 isolates, a total of six representative strains, three from Korea and three from Italy, were identified on the basis of biochemical and physiological tests. Identities were confirmed by PCR using P. syringae pv. actinidiae-specific primers PsaF1/R2, which amplified a 280-bp DNA fragment. The strains isolated from Korea in this study displayed BOX-PCR patterns similar to those isolated from Italy but different from those isolated previously in Korea or the pathotype P. syringae pv. actinidiae strain. The effector hopA1 and hopH1 genes, which are known to be present in strains isolated recently from France and Italy, were also present in P. syringae pv. actinidiae strains, SYS1, SYS2 and SYS4, isolated from Korea in this work. However, no amplicons of the expected size were obtained from strains previously isolated from Korea and Japan. In addition, the Korean strains isolated in this work belonged to haplotype I for the cts gene identical to those strains isolated from recent outbreaks in Italy. These results suggest that P. syringae pv. actinidiae strains isolated from Korea and examined in this work are a new type of strain similar to those found from recent outbreaks in Italy. This is the first report on the occurrence of cts haplotype I strains of P. syringae pv. actinidiae affecting kiwifruit plants in Korea.
An, Dong-jun;Song, Jae-young;Lee, Joung-bok;Park, Jong-hyeon;Shin, Jin-ho;Kim, Yong-hwan;An, Soo-hwan
대한수의학회지
/
제39권4호
/
pp.778-785
/
1999
To detect CDV RNA in clinical samples and differentiate prevailing CDV virulent strains affecting susceptible animals from attenuated vaccine strains, we performed RT-PCR, RFLP, and sequencing. CDV specific primers were generated from the middle part of nucleocapsid gene. The expected size of PCR products, 519 bp, was observed in tissues of Jindo dog, poodle dog, badger, fourteen of nineteen blood samples as well as 5 vaccine strains including domestic and imported products. The PCR products obtained from tissues and PBMCs of infected animals were digested to 317- and 202-bp fragments by Bam HI, but the products obtained from four of five vaccine strains and Lederle strain were not digesed by Bam HI. Only one vaccine strain of which the PCR products were digested by Bam HI was confirmed as imported vaccine, modified Synider Hill strain. Based on seqencing data obtained from the 519-bp products, it was confirmed that Bam HI restriction site tends to be conserved in field isolates compared to the commercially available attenuated vaccine strains. Partial nucleotide sequences of CDV NP gene obtained from tissues of Jindo dog, poodle and badger shared 100% homology each other, whereas the nucleotide sequences showed 96.3, 96.5, 93.6 and 93.4% homology with Yanaka (virulent), Han95 (virulent), Lederle (attenuated) and Onderstepoort (attenuated) strain, respectively.
Objectives : The purpose of this study was to investigate the effect of genetic polymorphism of cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) and aldehyde dehydrogenase 2 (ALDH2) on the xylene metabolism. Methods : Among 247 workers, 116 were occupationally exposed to xylene and 131 were not. Workers exposed to xylene had different work such as spray, touch-up, mix & assist, and pre-treat. Questionnaire variables were age, sex, use of personal protective equipment, smoking, previous night's drinking and work duration. The urinary methylhippuric acid was measured in the urine collected in the afternoon and corrected by urinary creatinine concentration. The genotypes of CYP2E1 and ALDH2 were investigated by using PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism) methods with DNA extracted from venous blood. Results : 1. The urinary concentrations of o-, m-, and p-methylhippuric acid and total methylhippuric acid in the exposed group were significantly higher than those in the non-exposed group (p<0.001). 2. In multiple regression analysis, the urinary methylhippuric acid concentration was significantly influenced by exposure grade (Job-exposure matrixes), smoking, drug use and kind of protective equipment (p<0.1). 3. Genetic polymorphism of CYP2E1 and ALDH2 did not affect urinary methylhippuric acid level in the exposed group (p>0.05). Conclusions : Exposure grade, smoking, drug use and kind of protective equipment affected urinary methylhippuric acid level, whereas genetic polymorphism of CYP2E1 and ALDH2 did not. However, further investigation for the effect of genetic polymorphism on the metabolism of xylene with a larger sample size is needed.
고추 유묘의 신초가 말라죽고 잎에 수침상점무의 증상으로부터 병원균을 분리하여 균총의 색깔과 형태, 포자의 모양과 크기를 관찰한 결과 균총의 색깔은 처음에는 핑크색 띄나 차츰 회색으로 변하였고, 분생포자는 방추형으로 크기가 $8.1-17.0{\times}2.0-3.8{\mu}m$이며 생장최적온도 $25-27^{\circ}C$이다. 종 특이적 프라이머를 이용하여 고추 유묘에서 분리한 균을 동정한 결과 C. acutatum에 특이적인 프라이머인 CaINT에서만 496 bp의 증폭산물을 얻었다. 이들 결과를 바탕으로 유묘에서 분리한 균은 Collectotrichum acutatum으로 동정하였다. 고추 유묘에서 분리한 균주를 고추묘 생육단계별로 병원성 검정한 결과 유묘 뿐 아니라 식물체 전 생육기에 잎 탄저병 증상을 나타내었으며 또한 고추 열매에서도 강한 병원성을 나타내었다.
An advanced and reliable high performance liquid chromatography (HPLC)/ultraviolet detector (UV)/ion-trap time-of-flight (IT-TOF) mass spectrometry was developed for the simultaneous quantification of 19 marker compounds in Bang-poong-tong-sung-san (BPTS), a traditional oriental prescription. Various parameters affecting HPLC separation and IT-TOF detection were investigated, and optimized conditions were identified. The separation was achieved on a Capcell PAK C18 column ($1.5mm{\times}250mm$, $5{\mu}m$ particle size) using a gradient elution of acetonitrile and water containing 0.1% formic acid at a flow rate of 0.1 mL/min. The column temperature was maintained at $40^{\circ}C$ and the injection volume was $2{\mu}L$. IT-TOF system was equipped with an electrospray ion source (ESI) operating in positive or negative ion mode. The optimized electrospray ionization parameters were as follows: ion spray voltage, +4.5 kV (positive ion mode), or -3.5 kV (negative ion mode); drying gas ($N_2$), 1.5 L/min; heat block temperature, $200^{\circ}C$. Automatic $MS^n$ (n = 1~3) analyses were carried out to obtain structural information of analytes. Elemental compositions and their mass errors were calculated based on their accurate masses obtained from a formula predictor software. The marker compounds in BPTS were identified by comparisons between $MS^n$ spectra from standards and those from extracts. Moreover, the libraries of $MS^2$ and $MS^3$ spectra and accurate masses of parent and fragment ions for marker compounds were constructed. The developed method was successfully applied to the BPTS extracts and identified 17 out of 19 marker compounds in the BPTS extracts.
PARK JAE-YONG;NAM SU JIN;KIM JONG-HWAN;JEONG SEON-JU;KIM JUNG KON;HA YEONG LAE;KIM JEONG HWAN
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
제15권3호
/
pp.525-531
/
2005
From a genomic library of Lactobacillus reuteri ATCC 55739, one clone, NE347, carrying a pyrH gene encoding UMP kinase, was identified. pNE347 carried a 1.88 kb EcoRI fragment and the pyrH was located in the middle of the insert. pyrH ORF was 723 bp in size and capable of encoding UMP kinase composed of 240 amino acid residues. tsf encoding an elongation factor-Ts and frr encoding a ribosomal recycling factor were present upstream and downstream of pyrH, respectively. When introduced into E. coli KUR1244, a pyrH-negative strain, pNE347 restored the ability to grow at $42^{\circ}C$, indicating that pyrH from L. reuteri synthesized functional UMP kinase in E. coli. Northern blot experiment showed that pyrH and frr were cotranscribed as a 1.4 kb single transcript. pyrH was overexpressed in E. coli by using a pET26b(+) vector, and a major 25 kDa protein band appeared on SDS-polyacrylamide gel.
Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
/
제31권1호
/
pp.82-88
/
2005
Treatment methods of mandibular condylar fracture were conservative and surgical method. Surgical method of mandibular high condylar fracture was very difficult because approach and internal fixation of small size fracture fragment were difficult. So there is a tendency to select conservative method over surgical method for guiding a stable occlusion and avoiding TMJ disorder and growth disturbance, minimizing pain and deviation during function. But, in case of mandibular high condylar fracture patient who has no biting teeth on posterior teeth area, guiding a stable occlusion and conservative functional treatment were very difficult. In this case, patient was 62years old male. He had fracture of mandibular symphysis, right mandibular body, left mandibular high condyle. We treated the patient for mandibular symphysis and right mandibular body fracture area with surgical method. But left mandibular high condylar fracture area was difficult to treat with surgical method. So we selected a conservative functional method on left mandibular high condylar fracture area. We intended recovery of vertical dimension and stable occlusion with implantation of immediate provisional implant on maxillar and mandibular posterior teeth area, and temporary crown. And then patient did mandibular functional movement and his mandibular function was recoverd.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.