A new quinoline-based acylhydrazone (1) has been synthesized and applied as a fluorescent probe. Probe 1 exhibits high selectivity and sensitivity to $Cu^{2+}$ with fluorescence "ON-OFF" behavior in HEPES buffered (1‰ DMSO, HEPES 20 mM, pH = 7.4) solution. The on-site generated 1-$Cu^{2+}$ complex displays excellent selectivity to sulfide ions with fluorescence "OFF-ON" performance through copper displacement approach.
Synthesis, absorption and fluorescence properties of 3-methyl indole (1), N-(benzenesulfonyl)-3-(3-oxo-but-1-enyl)-indole (2) and 1H-3-(3-oxo-but-1-enyl)-indole (3) are described. Extended conjugation at C-3 of indole as in 3 causes moderate resolution of $^1L_a$ and $^1L_b$ bands. However, 2 having an electron-withdrawing group at indolic nitrogen shows only the $^1L_a$ band. While the $^1L_b$ band largely remains solvent polarity independent, the $^1L_a$ band undergoes moderate red shift in polar solvents. The fluorescence in 2 and 3 originates from the $L_b$ transition. Additionally, interaction of 2 and 3 with BSA indicates that these compounds bind to the hydrophobic site of BSA with the formation of a highly fluorescent BSA-probe complex.
Dual-modality imaging strategy using near-infrared fluorescence (FLI) and photoacoustic imaging (PAI) demands a suitable probe to enable dual-modular signal production. Herein, we demonstrate a synthetic protocol of small molecular dye for dual-modular FLI and PAI. A condensation reaction between squaric acid and carboxypentyl benzoindolium, and followed by basic hydrolysis to give the benzoindole derived squaraine (BSQ) dye in 49% yield. Next, the carboxylic acid group of BSQ was further functionalized with N-hydroxysuccinimide or azide group for an efficient conjugation with a targeting biomolecule. BSQ showed a maximum fluorescent emission at around 680 nm and the photoacoustic signal reached a maximum intensity at 680-700 nm. Based on these results, we conclude that BSQ analogs will be useful probes for dual-modular (FLI/PAI) imaging studies in animal models.
Singlet oxygen ($^1O_2$) is an important species for oxidation in biological processes. $^1O_2$ is implicated in the genotoxic effect, and plays an important role in the cell-signaling cascade and in the induction of gene expression. However, the rapid detection of $^1O_2$ in biological environments with sufficient specificity and sensitivity is hampered by its extremely low emission probability. Here, a layer-by-layer (LbL) film of CdTe quantum dots (QDs), polymers, and ascorbate have been designed as a rapid, highly selective, and sensitive fluorescence probe for $^1O_2$ detection. Upon reaction with $^1O_2$, the probe exhibits a strong photoluminescence (PL) response even at trace levels. This remarkable PL change should enable the probe to be used for $^1O_2$ detection in many chemical and biological systems and as an environmental sensor.
Kim, Choong-jae;Kim, Sook-Yang;Kim, Kui-Young;Kang, Young-Sil;Kim, Hak-Gyoon;Kim, Chang-Hoon
한국양식학회:학술대회논문집
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한국양식학회 2003년도 추계학술발표대회 논문요약집
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pp.132-133
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2003
The marine dinoflagellate genus Alexandrium comprise PSP producing A. acatenella, A. angustitabuzatum, A. catenella, A. fundyense, A. minutum, A. ostenfezdii, A. tamiyavanichii and A. tamarense. In monitoring toxic Alexandrium, rapid and exact species identification is one of the significant prerequisite work, however we have suffered confusion of species definition in Alexandrium. To surmount this problem, we chose DNA probing, which has long been used as an alternative for conventional identification methods, primarily relying on morphological approaches using microscope in microbial field. Oligonucleotide DNA probes targeting rRNA or rDNA have been commonly used in diverse studies to detect and enumerate cells concerned as a culture-indetendent powerful tool. Despite of the massive literature on the HAB species containing Alexandrium, application of DNA probing for species identification and detection has been limited to a few documents. DNA probes of toxic A. tamarense, A. catenella and A. tamiyavanichii, and non-toxic A. affine, A. fraterculus, A. insuetum and A. pseudogonyaulax were designed from LSU rDNA D1-D2, and applied to whole cell-FISH. Each DNA probes reacted only the targeted Alexandrium cells with very high species-specificity within Alexandrium. The probes could detect each targeted cells obtained from the natural sea water samples without cross-reactivity. Labeling intensity varied in the growth stage, this showed that the contents of probe-targeted cellular rRNA decreased with reduced growth rate. Double probe TAMID2S1 achieved approximately two times higher fluorescent intensity than that with single probe TAMID2. This double probe did not cross-react with any kinds of microorganisms in the natural sea waters. Therefore we can say that in whole-cell FISH procedure this double DNA probe successfully labeled targeted A. tamiyavanichii without cross-reaction with congeners and diverse natural bio-communities.
Fluorescence correlation spectroscopy (FCS) is a sophisticated and an accurate analytical technique used to study the diffusion of molecules in a solution at the single-molecule level. FCS is strongly affected by many factors such as the stability of the excitation power, photochemical processes, mismatch between the refractive indices, and variations in the cover glass thickness. We have studied FCS near the surface of a cover glass by using rhodamine 123 as a fluorescent probe and have observed that the surface has a strong influence on the measurements. The temporal autocorrelation of FCS decays with two characteristic times when the confocal detection volume is positioned near the surface of the cover glass. As the position of the detection volume is moved away from the surface, the FCS autocorrelation becomes one-component decaying; the characteristic time of the decay is the same as the faster-decaying component in the FCS autocorrelation near the surface. This observation suggests that the faster component can be attributed to the free diffusion of the probe molecules in the solution, while the slow component has its origin from the interaction between the probe molecules and the surface. We have characterized the surface contribution to the FCS measurements near the surface by changing the position of the detection volume relative to the surface. The influence of the surface on the diffusion of the probe molecules was monitored by changing the chemical properties of the surface. The surface contribution to the temporal autocorrelation of the FCS strongly depends on the chemical nature of the surface. The hydrophobicity of the surface is a major factor determining the surface influence on the free diffusion of the probe molecules near the surface.
교류 $50{\sim}100\;kHz$의 고주파와 수 kV의 고전압으로 구동되는 냉음극 형광램프의 전류 및 전압을 계측하는 방법을 조사하였다. 고 전압 측에 설치되는 프로브 자체의 임피던스 영향으로 램프의 휘도가 변화하고 누설 전류가 발생하여 정확한 전류 및 전압의 계측이 어렵다. 따라서 프로브의 임피던스와 누설 전류를 고려한 회로 분석을 통하여 올바른 계측 방법을 제시하였다. 프로브 설치로 휘도 변화 시, 인버터에 입력되는 DC 전압을 조정하여 램프의 특정 휘도를 유지하여 계측한다. 램프 전류($I_G$)는 접지 측에서 전류 프로브나 고주파 전류계로 계측하며, 전압은 고 전압 측에 설치한 전압 프로브로 계측한다. 램프 전압($V_C$)은 고전압이 인가되는 냉음극과 안전 캐패시터 사이에서 계측하며, 인버터의 출력 전압(VI)은 안전 캐패시터와 인버터 출력단 사이에서 계측한다. 램프 전압($V_C$)과 램프 전류($I_G$)의 위상차가 없기 때문에, 램프 자체의 순수 소모 전력은 램프 전압($V_C$)와 램프 전류($I_G$)의 곱이다. 인버터의 출력 전압($V_I$)과 램프 전류($I_G$)의 위상차($\theta$)는 전압 프로브의 용량성 임피던스로 인하여 계측값이 부정확하며, 회로의 분석에서 얻어진 $cos{\theta}=V_C/V_I$로부터 위상차를 얻을 수 있다.
Escherichia coli transcription termination factor Rho catalyzes the unwinding of RNA/DNA duplex in reactions that are coupled to ATP binding and hydrolysis. Fluorescence stopped-flow methods using ATP and the fluorescent 2'(3')-O-( N-methylanthraniloyl) derivatives (mant-derivatives) of ATP and ADP were used to probe the kinetics of nucleotide binding to and dissociation from the Rho-RNA complex. Presteady state nucleotide binding kinetics provides evidence for the presence of negative cooperativity in nucleotide binding among the multiple nucleotide binding sites on Rho hexamer. The binding of the first nucleotide to the Rho-RNA complex occurs at a bimolecular rate of 3.6${\times}$10$\^$6/ M$\^$-1/ sec$\^$-1/ whereas the second nucleotide binds at a slower rate of 4.7${\times}$10$\^$5/ M$\^$-1/ sec$\^$-1/ at 18$^{\circ}C$, RNA complexed with Rho affects the kinetics of nucleotide interaction with the active sites through conformational changes to the Rho hexamer, allowing the incoming nucleotide to be more accessible to the sites. Adenine nucleotide binding and dissociation is more favorable when RNA is bound to Rho, whereas ATP binding and dissociation step in the absence of RNA occurs significantly slower, at a rate ∼70- and ∼40-fold slower than those observed with the Rho-RNA complex, respectively.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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