• 제목/요약/키워드: Fluorescence Pseudomonas

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느타리버섯 갈반병에 대한 길항균의 선발 및 특성조사 (Screening and Characterization of Antagonistic Strains Against Brown Blotch Causing Bacteria on Pleutrotus ostreatus)

  • 이은관;유승오;조재선;전억한
    • KSBB Journal
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    • 제14권2호
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    • pp.146-152
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    • 1999
  • 갈반병이 유발된 느티리버섯과 비섯 재배장 주변 토양에서 채집한 균주로부터 갈반병 원인균주 4개와 갈항균주 3개를 선발하였다- 선발된 균주를 API 2DE kit에 의해 동정한 결과 갈반병 원인 균주 P-24, P-28은 Pseudomonas putida로 P-27, P-33은 P.tolaasii로 동정되었으며, 길형균주 중 A-ll, A-20은 Pseudomonas fluorescence로 A-29는 Pseudοmonas sp.로 동정되었으며, 그 중 A-ll 균주가 버섯 균사 및 자실체에 해를 주지 않으면서 길항성이 우수한 균주로 선발되었다. 길항성은 갈반병 원인균 대 길항균의 농도비를 1:1로 처리하였을 때 길항성이 양호하였다.

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Cometabolism in the Biodegradation of Benzene, Toluene, and ${\rho}-xylene$ Mixture by Isolated Pseudomonas fluorescence BE103

  • Lim, Hye-Kyung;Lee, Jang-Young;Kim, Hak-Sung
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제4권1호
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    • pp.63-67
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    • 1994
  • A microorganism showing degradative activity towards benzene, toluene and ${\rho}-xylene$ (BTX) was isolated from an activated sewage sludge and was tentatively identified as Pseudomonas fluorescence BE103. This strain was found to utilize benzene and toluene as growth substrates, but to degrade ${\rho}-xylene$ in the obligate presence of a growth substrate. The metabolic product resulted from the cometabolism of ${\rho}-xylene$ was identified as 3, 6-dimethylpyrocatechol by LC/MS analysis, and the metabolic pathway was analyzed to be similar to the tod pathway. From the kinetic studies done regarding BTX biodegradation using Pseudomonas fluorescence BE103, it was revealed that the cometabolism of ${\rho}-xylene$ is significantly affected by the ratio of growth substrate concentration to biomass concentration, and that the cometabolism of ${\rho}-xylene$ initiates only when this ratio was about 0.03.

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논 토양 서식 미생물의 다양성에 관한 연구 (Soil Microbial Diversity of Paddy Fields in Korea)

  • 서장선;신제성
    • 한국토양비료학회지
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    • 제30권2호
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    • pp.200-207
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    • 1997
  • 우리 나라 논 토양 환경의 생물학적 특성을 파악하기 위하여 전국 13개 농업기후지대별 63개 지점의 이앙전 무담수 논 토양의 표토를 채취하여 주요 토양 미생물의 밀도 및 다양성을 조사하였다. 농업기후지대별 전국 평균치 이상의 미생물 종류는 북부지방 보다는 남부지방일 수록 많았으며, 검정된 미생물중 지역간 차가 가장 큰 균은 형광성 Pseudomonas 속이었다. 지형간 미생물 밀도는 호기성 세균, 형광성 Pseudomonas 속과 Azotobacter 속등이 하해혼성지에서, 토성간에는 사상균이 식토에서, Bacillus 속, Azotobacter 속 그리고 탈질균은 식양토에서 유의적으로 가장 높았다. 한편 Azotobacter 속과 암모니아 산화세균의 밀도는 토양 pH가 높아 질수록 증가하였다. Bacillus 속, 형광성 Pseudomonas 속, Azotobacter속, 탈질균, 암모니아 산화균, 아질산산화균, 방선균 및 사상균등을 요인으로 한 미생물 다양성 지수의 지역간 최소 값은 0.109, 최대 값은 0.661 이었다. 지형별 다양성 지수는 하해혼성지가 0.332, 홍적대지 0.335, 하성평탄지 0.432 그리고 곡간선상지 0.447이었으며, 토성별 다양성지수는 사질 0.443, 사양질 0.427, 미사식양질 0.414, 식양질 0.405 그리고 식질토양이 0.362로 사질토양일수록 증가하는 경향이었다.

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탄화수소를 자화하는 Pseudomonas의 분리동정 (Isolation and Identification of Pseudomonas Utilizing Hydrocarbon)

  • 김정국;이영록
    • 미생물학회지
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    • 제22권1호
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    • pp.29-34
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    • 1984
  • 서울 근교에서 채취한 河川水 및 土壤標品으로부터 238菌株의 탄화수소자화세균을 分離하였다. 分離된 菌株중 68菌株는 Pseudomonas屬으로 同定되었고, 11菌株는 Alcaligenes屬으로, 10菌株는 Acinetobacter屬으로 同定되었다. 68菌株의 Pseudomona중, 35菌株는 P. aeruginosa, 5菌株는 P. fluorescence, 10菌株는 P. putida, 그리고 2菌株는 P. mendocina로 각각 同定되었다.

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Application of Multiparametric Flow Cytometry (FCM) to Enumerate the Diagnosis of Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli

  • Hwang, Myoung-Goo;Oh, Jung-Woo;Katayama, Hiroyuki;Ohgaki, Shinichiro;Cho, Jin-Kyu
    • Environmental Engineering Research
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    • 제17권1호
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    • pp.35-39
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    • 2012
  • In this study, multiparametric flow cytometry (FCM) was installed to enumerate the diagnosis of Pseudomonas aeruginosa ATCC 10145 and Escherichia coli K12 (IFO 3301). The nucleic acids (DNA/RNA) were double stained by a LIVE/DEAD bacLight viability kit, involving green SYTO 9 and red propidium iodide (PI), based on the permeability of two chemicals according to the integrity of plasma membrane. As the results showed, the gate for dead bacteria was defined as the range of $0.2{\times}10^0$ to $6.0{\times}10^1$ photo multiplier tube (PMT) 2 fluorescence (X-axis) and $2.0{\times}10^0$ to $2.0{\times}10^2$ PMT 4 fluorescence (Y-axis), and the gate for live bacteria was defined as the range of $6.0{\times}10^0$ to $6.0{\times}10^2$ PMT 2 fluorescence (X-axis) and $2.0{\times}10^0$ to $4.0{\times}10^2$ PMT 4 fluorescence (Y-axis). In the comparison of the number of the tested bacteria detected by FCM (viability assessment) and plate culture (cultivability assessment), the number of bacteria detected by FCM well represented the number of bacteria that was detected by the colony forming unit (CFU) counting method when bacteria were exposed to isopropyl alcohol and silver/copper cations. Consequently, it is concluded that the application of FCM to monitor the functional effect of disinfectants on the physiological status of target bacteria can offer more rapid and reliable data than the plate culture colony counting method.

원유오염 토양으로부터 분리한 Pseudomonas fluorescence KNU417의 톨루엔 분해에서 환경 인자의 영향 (Environmental Effect on the Biodegradation of Toluene by Pseudomonas fluorescence KNU417)

  • 권혁만;염승호
    • 유기물자원화
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    • 제14권3호
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    • pp.117-125
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    • 2006
  • 원유에 오염된 토양으로부터 톨루엔을 분해할 수 있는 미생물을 분리하였으며 동정결과 Pseudomonas fluorescence였다. 이 미생물을 생물학적 톨루엔 처리공정에 사용하기 위해 온도, 톨루엔 농도, pH, 질소원 등의 환경영향이 분해에 미치는 영향에 대해서 연구를 하였다. 이 미생물의 최적 분해 온도는 $30^{\circ}C$였으며 이 때 최대 비성장속도와 최대 비소모속도는 각각 $0.76hr^{-1}$$0.36hr^{-1}$이었다. $10^{\circ}C$$40^{\circ}C$에서는 톨루엔을 분해하지 못하였으나 $30^{\circ}C$에 적응한 미생물은 $10^{\circ}C$에서 17시간 만에 100mg/L의 톨루엔을 완전히 분해하였고 $40^{\circ}C$ 에서는 30시간 동안 80% 정도 분해할 수 있었다. 본 미생물은 200mg/L 이상의 톨루엔은 분해할 수 없었으나 20mg/L의 낮은 농도의 톨루엔에 적응을 시킴으로써 300mg/L의 톨루엔까지 분해할 수 있었다. pH는 5.5~9.0 범위에서 분해 속도에 별다른 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다. 암모늄 (${NH_4}^+$) 대신 질산염(${NO_3}^-$)을 사용했을 때 적응기가 2~10시간 정도 길어졌고 미생물 수율이 45% 정도 감소하였다. 그러나 적응기가 지난 후의 톨루엔 분해속도에서는 별 차이를 보이지 않았다. 본 연구에서 얻은 결과들은 향후 바이오필터 등의 생물학적 톨루엔 처리공정 개발에 유용하게 사용될 것으로 기대된다.

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Visual Analysis for Detection and Quantification of Pseudomonas cichorii Disease Severity in Tomato Plants

  • Rajendran, Dhinesh Kumar;Park, Eunsoo;Nagendran, Rajalingam;Hung, Nguyen Bao;Cho, Byoung-Kwan;Kim, Kyung-Hwan;Lee, Yong Hoon
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제32권4호
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    • pp.300-310
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    • 2016
  • Pathogen infection in plants induces complex responses ranging from gene expression to metabolic processes in infected plants. In spite of many studies on biotic stress-related changes in host plants, little is known about the metabolic and phenotypic responses of the host plants to Pseudomonas cichorii infection based on image-based analysis. To investigate alterations in tomato plants according to disease severity, we inoculated plants with different cell densities of P. cichorii using dipping and syringe infiltration methods. High-dose inocula (${\geq}10^6cfu/ml$) induced evident necrotic lesions within one day that corresponded to bacterial growth in the infected tissues. Among the chlorophyll fluorescence parameters analyzed, changes in quantum yield of PSII (${\Phi}PSII$) and non-photochemical quenching (NPQ) preceded the appearance of visible symptoms, but maximum quantum efficiency of PSII ($F_v/F_m$) was altered well after symptom development. Visible/near infrared and chlorophyll fluorescence hyperspectral images detected changes before symptom appearance at low-density inoculation. The results of this study indicate that the P. cichorii infection severity can be detected by chlorophyll fluorescence assay and hyperspectral images prior to the onset of visible symptoms, indicating the feasibility of early detection of diseases. However, to detect disease development by hyperspectral imaging, more detailed protocols and analyses are necessary. Taken together, change in chlorophyll fluorescence is a good parameter for early detection of P. cichorii infection in tomato plants. In addition, image-based visualization of infection severity before visual damage appearance will contribute to effective management of plant diseases.

Design, Synthesis, Fluorescence Properties and Antibacterial Activities of New 8-Chloro-3-Alkyl-3H-Pyrazolo[4,3-a]acridine-11-Carbonitriles

  • Rahmani, Zeynab;Pordel, Mehdi;Davoodnia, Abolghasem
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제35권2호
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    • pp.551-556
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    • 2014
  • The treatment of alkylated nitro derivatives of indazole with 2-(4-chlorophenyl)acetonitrile under basic conditions gave the new 8-chloro-3-alkyl-3H-pyrazolo[4,3-a]acridine-11-carbonitriles via the nucleophilic substitution of hydrogen which proceeds at room temperature with concomitant cyclisation in fairly good yields. The structures of all newly synthesized compounds were confirmed by IR, $^1H$ NMR, $^{13}C$ NMR and mass spectral data. Fluorescence experimental results of all newly synthesized compounds revealed remarkable photoluminescence properties and strong green fluorescence properties. Also, the new compounds exhibited potent antibacterial activity and their antibacterial activity (MIC) against Gram positive (Staphylococcuse aureus methicillin resistant S. aureus and Bacillus subtilis) and negative bacterial (Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli) species were determined.

연작장해지토양(連作障害地土壤)의 식물독소(植物毒素)에 관(關)한 연구(硏究) 제(第)3보(報) Siderophore 생성(生成) Pseudomonas 속(屬) 세균접종(細菌接種) 및 양(陽) ion 첨가(添加)가 토양부생균(土壤腐生菌)의 생육(生育)에 미치는 영향(影響) (Studies on Phytotoxin in Intensively Cultivated Upland Soil III. The Abilities of Siderophore Formation, Competition and Absorption of Fe3+ and Mn2+ with Inoculation of the Fluorescence Forming Soil Bacteria and Soil Saprophytic Fungi)

  • 이상규;서장선
    • 한국토양비료학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.41-47
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    • 1988
  • 토양중(土壤中) 향광색소생성세균(螢光色素生成細菌)에서 형성(形成)되는 3가철등(價鐵等)의 양(陽) ion 결합물질(結合物質)인 Siderophore 생성(生成)이 토양부생성사상균(土壤腐生成絲狀菌)의 생육(生育) 및 $Fe^{3+}$$Mn^{2+}$의 흡수이용(吸收利用)에 관(關)한 영향(影響)을 밝히고저 실내실험(室內實驗)한 결과(結果)는 다음과 같다. 1. 형광색소생성(螢光色素生成) 토양세균(土壤細菌)인 Pseudomonas putida Pt-II의 인공배지(人工培地)에 접종(接種)은 Siderophore 생성(生成)을 증가(增加)시켰다. 2. 경시적(徑時的) Siderophore 생성량(生成量)은 3가철(價鐵)의 첨가(添加)로 감소(減少)되었으며 철결합물질(鐵結合物質)인 EDDHA와 유사(類似)한 작용(作用)을 보였다. 3. Siderophore 농도(濃度)의 증가(增加)는 토양부생성(土壤腐生性) 사상균(絲狀菌)의 생육(生育)을 억제(抑制)하였으며 억제(抑制)의 정도(程度)는 독소생성(毒素生成) 사상균(絲狀菌)인 Stachybotrys chatarum과 F. solani에서 강(强)하였으나 F. oxysporum에 대해서는 억제력(抑制力)이 약(弱)하였다. 4. 인공배지내(人工培地內)에서 $Mn^{2+}$의 농도변화(濃度變化)는 Siderophore 생성(生成)에 영향(影響)하지 못하였으나 토양부생성사상균(土壤腐生性絲狀菌)의 생체중(生體重) 증가(增加)와는 정상관관계(正相關關係)를 보였음.

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