• Title/Summary/Keyword: Fission

검색결과 685건 처리시간 0.024초

Mutation Analysis of Synthetic DNA Barcodes in a Fission Yeast Gene Deletion Library by Sanger Sequencing

  • Lee, Minho;Choi, Shin-Jung;Han, Sangjo;Nam, Miyoung;Kim, Dongsup;Kim, Dong-Uk;Hoe, Kwang-Lae
    • Genomics & Informatics
    • /
    • 제16권2호
    • /
    • pp.22-29
    • /
    • 2018
  • Incorporation of unique barcodes into fission yeast gene deletion collections has enabled the identification of gene functions by growth fitness analysis. For fine tuning, it is important to examine barcode sequences, because mutations arise during strain construction. Out of 8,708 barcodes (4,354 strains) covering 88.5% of all 4,919 open reading frames, 7,734 barcodes (88.8%) were validated as high-fidelity to be inserted at the correct positions by Sanger sequencing. Sequence examination of the 7,734 high-fidelity barcodes revealed that 1,039 barcodes (13.4%) deviated from the original design. In total, 1,284 mutations (mutation rate of 16.6%) exist within the 1,039 mutated barcodes, which is comparable to budding yeast (18%). When the type of mutation was considered, substitutions accounted for 845 mutations (10.9%), deletions accounted for 319 mutations (4.1%), and insertions accounted for 121 mutations (1.6%). Peculiarly, the frequency of substitutions (67.6%) was unexpectedly higher than in budding yeast (~28%) and well above the predicted error of Sanger sequencing (~2%), which might have arisen during the solid-phase oligonucleotide synthesis and PCR amplification of the barcodes during strain construction. When the mutation rate was analyzed by position within 20-mer barcodes using the 1,284 mutations from the 7,734 sequenced barcodes, there was no significant difference between up-tags and down-tags at a given position. The mutation frequency at a given position was similar at most positions, ranging from 0.4% (32/7,734) to 1.1% (82/7,734), except at position 1, which was highest (3.1%), as in budding yeast. Together, well-defined barcode sequences, combined with the next-generation sequencing platform, promise to make the fission yeast gene deletion library a powerful tool for understanding gene function.

여과지전기영동법(濾過紙電氣泳動法)에 의한 장수명(長壽命) 핵분열(核分裂) 생성물분리(生成物分離) (Paper Electrophoretic Separation of Some Long-Lived Fission Products)

  • 이병헌;이종두
    • Journal of Radiation Protection and Research
    • /
    • 제8권2호
    • /
    • pp.15-35
    • /
    • 1983
  • 특별히 제작한 영동장치를 써서 고전압 전기영동법에 의하여 24시간 중성자 조사하고 150일 냉각한 90% 농축질산우라닐 수용액의 핵분열 생성물을 분리하였다. 핵분열생성물부터 Zr-95, Nb-95의 분리는 0.1M-$HClO_4$(pH=0.85), 0.05M-HCl+0.09M-KCl(pH=0.9), 0.1M-HCl(pH=1.1), 0.01M-HCl(pH=2.0)의 이동조건에서 가능하며 Zr-95, Nb-95는 원점부터 +1cm의 거리에서 분리된다. Zr-95와 Nb-95의 상호분리는 2% 수산암모늄을 첨가하는 경우 가능하다. 즉 0.1M-$HClO_4$, 0.05M-HCl+0.09M-KCl, 0.1M-HCl, 0.1M-식초산+0.1M- 식초산나트륨(pH=4.68)의 이동조건에서 원점부터 $-6{\sim}-7cm$ 거리에서 Nb-95, $+1{\sim}-1cm$ 거리에서 Zr-95가 각각 분리된다. 핵분열생성물부터 Ru-103의 분리는 0.025M-$Na_2CO_3+0.025M-NaHCO_3(pH=10.0)$, $0.01M-Na_3PO_4(pH=11.7)$, 0.1M-NaOH(pH=13.2)의 이동조건에서 가능하며 Ru-103는 각각 원점부터 -6cm, -4cm, -3cm거리 이동한다.

  • PDF

$TBP/XAD-16/HNO_3$추출 크로마토그래피에 의한 모의 사용후핵연료 용해용액 중 미량 핵분열생성물 원소의 분리 (Separation of Fission Product Elements from Synthetic Dissolver Solutions of Spent Pressurized Water Reactor Fuels by $TBP/XAD-16/HNO_3$Extraction Chromatography)

  • 이창헌;최광순;김정석;최계천;지광용;김원호
    • 대한화학회지
    • /
    • 제45권4호
    • /
    • pp.304-311
    • /
    • 2001
  • 경수로 사용후 핵 연료에 미량 함유되어 있는 핵분열생성물을 유도 결합 플라스마 원자방출분광법(ICP-AES)으로 분석하기 위하여 우라늄으로부터 학분열생성물을 추출 크로마토그래피로 분리, 회수하는 방법을 검토하였다. 우라늄 분리 분야에서 잘 알려져 있는 tri-n-butyl phosphate(TBP)를 추출제로 사용하여 몇 가지 Amberlite XAD 다공성 수지들에 대한 침윤능을 비교한 후 TPB침윤양이 가장 큰 Amberlite XAD-16을 지지체로 선택하였다. 사용후핵연료 용해용액과 화학조성이 유사한 모의 사용후핵연료 용해용액을 사용하여 TBP 침윤수지에 대한 핵분열생성물 원소들의 흡착거동을 조사하고, 분리에 미치는 여러 변수들을 최적화 하였다. Pd 및 Ru을 제외한 대부분의 핵분열생성물 원소들을 정밀도 3.1% 이하의 범위에서 정량적으로 회수할 수 있었다.

  • PDF

분열효모 SpHMT1을 세포질 파이토킬레이트를 생성하지 않는 효모에서 발현으로 인한 카드뮴에 대한 저항성 증가 (Heterologous Expression of Fission Yeast Heavy Metal Transporter, SpHMT-1, Confer Tolerance to Cadmium in Cytosolic Phytochelatin-Deficient Saccharomyces cerevisiae)

  • 이상만
    • 생명과학회지
    • /
    • 제19권12호
    • /
    • pp.1685-1689
    • /
    • 2009
  • 파이토킬레이트(PC)는 PCS에 의해 생성되는 작은 폴리펩타이드로서 여러 생물에서 발견되고 있다. PC의 역할은 카드뮴과 같은 중금속을 세포질에서 결합하며 이는 액포막에 존재하는 HMT에 의해서 액포 안으로 이동된다. HMT1은 분열효모에서 처음으로 알려졌으며 이후 선충, 초파리 등에서도 발견되었으며 세포 내 역할은 카드뮴 같은 중금속 해독에 관여를 하고 있다. 하지만 액포가 존재하지 않고 PC를 생성하지 않는 초파리에서의 HMT1의 발견은 그 동안 알려진 HMT1의 역할을 재 조명하게 된다. 따라서 PC를 생성하지 못하는 출아효모에 PC를 생성하는 분열효모 유래 SpHMT1을 발현시켜 카드뮴에 대한 저항성을 분석하였다. SpHMT1을 발현하는 출아효모는 카드뮴에 대한 저항성이 현저하게 증가되었고 이는 SpHMT1이 PC가 존재하지 않는 조건에서도 카드뮴에 대한 해독작용을 하는 것을 암시한다. 또한 SpHMT1을 발현하는 출아효모는 GSH에 대한 저항성을 보였고 카드뮴에 대한 저항성도 GHS에 의해서 더 증가되는 결과를 보였다. 이러한 결과는 HMT1이 PC와 결합된 카드뮴을 액포안으로 이동시키는 가능성보다 GSH와 결합된 카드뮴을 액포 안으로 이동시켜 카드뮴에 대한 해독작용을 한다는 것을 암시한다.

Spectrometry Analysis of Fumes of Mixed Nuclear Fuel (U0.8Pu0.2)O2 Samples Heated up to 2,000℃ and Evaluation of Accidental Irradiation of Living Organisms by Plutonium as the Most Radiotoxic Fission Product of Mixed Nuclear Fuel

  • Kim, Dmitriy;Zhumagulova, Roza;Tazhigulova, Bibinur;Zharaspayeva, Gulzhanar;Azhiyeva, Galiya
    • Nuclear Engineering and Technology
    • /
    • 제48권1호
    • /
    • pp.274-284
    • /
    • 2016
  • Purpose: The purpose of this work is to describe the spectrometric analysis of gaseous cloud formation over reactor mixed uranium-and-plutonium (UP) fuel $(U_{0.8}Pu_{0.2})O_2$ samples heated to a temperature $>2,000^{\circ}C$, and thus forecast and evaluate radiation hazards threatening humans who cope with the consequences of any accident at a fission reactor loaded by UP mixed oxide $(U_{0.8}Pu_{0.2})O_2$, such as a mixture of 80% U and 20% Pu in weight. Materials and methods: The UP nuclear fuel samples were heated up to a temperature of over $2,000^{\circ}C$ in a suitable assembly (apparatus) at out-of-pile experiments' implementation, the experimental in-depth study of metabolism of active materials in living organisms by means of artificial irradiation of pigs by plutonium. Spectrometric measurements were carried out on the different exposed organs and tissues of pigs for the further estimation of human internal exposure by nuclear materials released from the core of a fission reactor fueled with UP mixed oxide. Results: The main results of the research described are the following: (1) following the research on the influence of mixed fuel fission products (radioactive isotopes being formed during reactor operation as a result of nuclear decay of elements included into the fuel composition) on living organisms, the authors determined the quantities of plutonium dioxide ($PuO_2$) that penetrated into blood and lay in the pulmonary region, liver, skeleton and other tissues; and (2) experiments confirmed that the output speed of plutonium out of the basic precipitation locations is very small. On the strength of the experimental evidence, the authors suggest that the biological output of plutonium can be disregarded in the process of evaluation of the internal irradiation doses.