We determined the nucleotide sequence of the URA3 gene encoding orotidine-5'-phosphate decarboxylase (OMPDCase) of the erythritol-producing osmotolerant yeast Candida magnoliae by degenerate polymerase chain reaction and genome walking. Sequence analysis revealed the presence of an uninterrupted open-reading frame of 795 bp, encoding a 264 amino acid residue protein with the highest identity to the OMPDCase of the yeast Kluyveromyces marxianus. Phylogenetic analysis of the deduced amino acid sequence revealed that it shared a high degree of identity with other yeast OMPDCase homologs. The cloned URA3 gene successfully complemented the ura3 null mutation in Saccharomyces cerevisiae, revealing that it encodes a functional OMPDCase in C. magnoliae. An enzyme activity assay and reverse transcription polymerase chain reaction indicated that the expression level of the C. magnoliae URA3 gene in S. cerevisiae was not as high as that of the S. cerevisiae URA3 gene. The GenBank accession number for C. magnoliae URA3 is JF521441.
Park, Eun-Hee;Lee, Dae-Hee;Seo, Jin-Ho;Kim, Myoung-Dong
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.21
no.3
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pp.277-283
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2011
Glyoxalase I catalyzes the conversion of methylglyoxal to S-D-lactoylglutathione in the presence of glutathione. The structural gene of glyoxalase I (GLO1) was cloned from an osmotolerant yeast, Candida magnoliae, which produces a functional sweetener, erythritol, from sucrose. DNA sequence analysis revealed that the uninterrupted open reading frame (ORF) of C. magnoliae GLO1 (CmGLO1) spans 945 bp, corresponding to 315 amino acid residues, and shares 45.2% amino acid sequence identity to Saccharomyces cerevisiae Glo1. The cloned ORF in a multicopy constitutive expression plasmid complemented the glo1 mutation of S. cerevisiae, confirming that it encodes Glo1 in C. magnoliae. The responses of CmGLO1 to environmental stresses were different from those of S. cerevisiae, which only responds to osmotic stress. An enzyme activity assay and reverse transcription polymerase chain reaction revealed that the expression of CmGLO1 is induced by stress inducers such as methylglyoxal, $H_2O_2$, KCl, and NaCl. The GenBank Accession No. for CmGLO1 is HM000001.
Rhee, Y.;Kim, C. J.;Kim, S. H.;Yoo, I. D.;Mheen, T. I.
Korean Journal of Microbiology
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v.25
no.1
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pp.17-22
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1987
For the purpose of securing of strains which can be usefully utilized to study symbiosis between Rhizobium and legume plant, A. tumefaciens T7 was isolated and characterized and then subgroup biovar was determined. A. tumefaciens T7 induced smooth tumor like nopaline type one and did not grow at $37^{\circ}C$ and in the presence of 2% NaCl on yeast extract mannitol medium. The strain was able to grow on the New and Kerr selective media and utilize erythritol but not phenylalanine, tryptophan, and tartarate as a sole carbon source. Negative results were obtained from 3-keto-lactose production and oxidase test. The strain produced alkalifrom malonate and citrate and showed acid litmus milk reaction At least two large plasmids were detected in the cell lysate. According to all of these results, it could be concluded that subdivision of isolated strain was biovar 2.
Metabolic alterations of Cordyceps bassiana mycelium were investigated under the following culture medium and light conditions: dextrose agar supplemented with 0.5% yeast extract (SDAY) medium with light (SL), SDAY medium without light (SD), nut medium without light (ND), and iron-supplemented SDAY medium without light (FD). The levels of asparagine, aspartic acid, glutamic acid, glutamine, histidine, lysine, ornithine, and proline were significantly higher under SD and SL conditions. The levels of most of the alcohols, saturated fatty acids, unsaturated fatty acids, fatty acid esters, sterols, and terpenes were higher under the ND condition than in the other conditions, but beauvericin was not detectable under the ND condition. The FD condition was favorable for the enhanced production of aminomalonic acid, malic acid, mannonic acid, and erythritol. Thus, the metabolic characteristics of C. bassiana can be manipulated by varying the cultivation conditions, rendering this fungus potentially favorable as a nutraceutical and medicinal resource.
In order to develop a good separation and simultaneous analysis of different sugar in an artificial mixed sugar solution, we analyzed 10 sugar components in an artificial mixed sugar solution composed of fructose, glucose, mannitol, sucrose, maltose, lactose, xylose, xylitol erythritol, and trehalose with using HPLC-ELSD or HPLC-RI. Separation and quantification by HPLC-ELSD was superior to those by HPLC-RI and detection sensitivity by HPLC-ELSD was higher then that by HPLC-RI as micorgram($\mu\textrm{g}$) level. 1. The units of minimal detectable limits were showed $\mu\textrm{g}$/$m\ell$ and ng/$m\ell$ by the HPLC-RI and HPLC-ELSD, respectively. 2. The condition of ELSD was drift tube temperature $82^{\circ}C$, $N_2$ gas flow rate 2.10 SLPM, and colum oven temperature $30^{\circ}C$, respectively. Isolation and recovery rates of single sugar from the multiple sugar solution was higher at the condition (time: flow rate: D.W.:ACN MeOH, min : $m\ell$/min:v:v:v) of linear gradient elution of mobile phase as 0 : 1.00 : 15 : 85 : 0.1 : 1.00 : 6 : 90 : 4, 17 : 1.00 : 10 : 70 : 20, 28 : 1.00 : 15 : 85 : 0 an 35 : 1.00 : 15 : 85 : 0, in order.
Proceedings of the Korean Society of Life Science Conference
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2001.11a
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pp.3-8
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2001
Isopentenyl diphosphate (IPP) is the common, five-carbon building block in the biosynthesis of all carotenoids, IPP in Escherichia coli is synthesized through the non-mevalonate pathway. The first reaction of IPP biosynthesis in E. coli is the formation of 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate (DXP), catalyzed by DXP synthase and encoded by dxs. The second reaction in the pathway is the reduction of DXP to 2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate, catalyzed by DXP reductoisomerase and encoded by dxr. To determine if one or more of the reactions in the non-mevalonate pathway controlled flux to IPP, dxs and dxr were placed on several expression vectors under the control of three different promoters and transformed into three E. coli strains (DH5(, XL1-Blue, and JM101) that had been engineered to produce lycopene. Lycopene production was improved significantly in strains transformed with the dxs expression vectors. When the dxs gene was expressed from the arabinose-inducible araBAD promoter (PBAD) on a medium-copy plasmid, lycopene production was 2-fold higher than when dxs was expressed from the IPTG-inducible trc and lac promoters (Ptrc and Plac, respectively) on medium-copy and high-copy plasmids, Given the low final densities of cells expressing dxs from IPTG-inducible promoters, the low lycopene production was probably due to the metabolic burden of plasmid maintenance and an excessive drain of central metabolic intermediates. At arabinose concentrations between 0 and 1.33 mM, cells expressing both dxs and dxr from PBAD on a medium-copy plasmid produced 1.4 - 2.0 times more lycopene than cells expressing dxs only. However, at higher arabinose concentrations lycopene production in cells expressing both dxs and dxr was lower than in cells expressing dxs only. A comparison of the three E. coli strains transformed with the arabinose-inducible dxs on a medium-copy plamid revealed that lycopene production was highest in XL1-Blue.
Candida magnoliae, an osmotolerant and erythritol producing yeast, prefers D-fructose to D-glucose as carbon sources. For the investigation of the fructophilic characteristics with respect to sugar transportation, a sequential extraction method using various detergents and ultracentrifugation was developed to isolate cellular membrane proteins in C. magnoliae. Immunoblot analysis with the Pma1 antibody and two-dimensional electrophoresis analysis coupled with MS showed that the fraction II was enriched with membrane proteins. Eighteen proteins out of 36 spots were identified as membrane or membrane-associated proteins involved in sugar uptake, stress response, carbon metabolism, and so on. Among them, three proteins were significantly upregulated under the fructose supplying conditions. The hexose transporter was highly homologous to Ght6p in Schizosaccharomyces pombe, which was known as a predominant transporter for the fructose uptake of S. pombe because it exhibited higher affinity to D-fructose than D-glucose. The physicochemical properties of the ATP-binding cassette transporter and inorganic transporter explained their direct or indirect associations with the fructophilic behavior of C. magnoliae. The identification and characterization of membrane proteins involved in sugar uptake might contribute to the elucidation of the selective utilization of fructose to glucose by C. magnoliae at a molecular level.
Proceedings of the Korean Society for Applied Microbiology Conference
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2001.06a
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pp.141-145
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2001
Isopentenyl diphosphate (IPP) is the common, five-carbon building block in the biosynthesis of all carotenoids. IPP in Escherichia coli is synthesized through the non-mevalonate pathway. The first reaction of IPP biosynthesis in E. coli is the formation of l-deoxy-D-xylulose-5-phosphate (DXP), catalyzed by DXP synthase and encoded by dxs. The second reaction in the pathway is the reduction of DXP to 2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate, catalyzed by DXP reductoisomerase and encoded by dxr. To determine if one or more of the reactions in the non-mevalonate pathway controlled flux to IPP, dxs and dxr were placed on several expression vectors under the control of three different promoters and transformed into three E. coli strains (DH5$\alpha$, XL1-Blue, and JMl0l) that had been engineered to produce lycopene. Lycopene production was improved significantly in strains transformed with the dxs expression vectors. When the dxs gene was expressed from the arabinose-inducible araBAD promoter ( $P_{BAD}$) on a medium-copy plasmid, lycopene production was 2-fold higher than when dxs was expressed from the IPTG-inducible trc and lac promoters ( $P_{trc}$ and $P_{lac}$, respectively) on medium-copy and high-copy plasmids. Given the low final densities of cells expressing dxs from IPTG-inducible promoters, the low lycopene production was probably due to the metabolic burden of plasmid maintenance and an excessive drain of central metabolic intermediates. At arabinose concentrations between 0 and 1.33 roM, cells expressing both dxs and dxr from $P_{BAD}$ on a medium-copy plasmid produced 1.4 - 2.0 times more lycopene than cells expressing dxs only. However, at higher arabinose concentrations lycopene . production in cells expressing both dxs and dxr was lower than in cells expressing dxs only. A comparison of the three E. coli strains transformed with the arabinose-inducible dxs on a medium-copy plasmid revealed that lycopene production was highest in XLI-Blue.LI-Blue.
The objective of this study was to improve the Dasik through the addition of sugar alcohol(xylitol, mannitol, sorbitol, erythritol) and agar during the production of Dasik in order to complement the texture of Dasik. Dasik sample were prepared, and the sensory quality and physical characteristics of the samples were compared and the antibacterial characteristics of green tea Dasik containing sugar alcohol against oral bacteria were also examined. The results are summarized as follows. The moisture content of green tea containing sugar alcohol to improve the physical properties was over 30%. The water activity of the agar-added Dasik was higher than that of the control group. The pH was significantly higher for both the experimental group and the control group. The color L value was the brightest at 59.21 for FAOG, while the a value was the lowest for SG, and the b value was the highest for MG. In the texture analysis, the hardness of the control group was the highest at $5181.04\;g/cm^2$ for SSG. The cohesiveness was the highest at 0.16% for SG and the chewiness was the highest at 182.12 g for MG, while the lowest cohesiveness was determined to be 43.73 g for EG. As for the adhesiveness, the agar, sugar alcohol-added groups were overall negative (-) while SG was found to have the lowest negative value at -39.25 g. In the sensory evaluation, the control XYG group scored the highest in moistness, adhesiveness, chewiness, and overall acceptance. In addition, all groups except SSG exhibited antibacterial characteristics against P. bivia. In conclusion, Dasik with added agar was shown to complement the texture of Dasik due to the added sugar alcohol.
Proceedings of the Korean Society for Applied Microbiology Conference
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2000.04a
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pp.208-213
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2000
Penicillium fellutanum produces a phosphorylated, choline-containing extracellular peptido-polysaccharide, peptidophosphogalactomannan (pPxGM) (8). The $\^$13/C-methyl labeled pPxGM ([methyl-$\^$13/C]pPxGM) was prepared from the cultures supplemented with L-[methyl-$\^$13/C]methionine or [2-$\^$13/C]glycine and was used as a probe to monitor the fate of phosphocholine in this polymer. Addition of purified [methyl-$\^$l3/C]pPxGM to growing cultures in low phosphate medium resulted in the disappearance of [methyl-$\^$13/C]phosphocholine and -N,N'-dimethyl-phosphoethanolamine from the added [methyl-$\^$13/C]pPxGM. Two $\^$l3/C-methyl-enriched cytoplasmic solutes, choline-O-sulfate and glycine betaine, were found in mycelial extracts, suggesting that phosphocholine-containing extracellular pPxGM of P.fellutanum is a precursor of intracellular choline-O-sulfate and glycine betaine and thus of phosphatydilcholine (l0). $\^$13/C-Methyl-labeled cells grown in 3 M NaCl-containing medium showed 2.6- and 22-fold more accumulation of $\^$13/C-methyl labeled choline-O-sulfate and glycine betaine, respectively, originated from the extracellular [$\^$13/C-methyl]pPxGM than those grown without added NaCl. The results suggest that, in addition to glycerol and erythritol, glycine betaine and choline-O-sulfate and thus choline are also osmoprotectants and hence that pPxGM is involved in osmotolerance of this fungus (11). Taken collectively, the $\^$l3/C- and $\^$31/P-NMR analyses of cytosolic solute pools and structural modulation of extracellular pPxGM corresponding to environmental stimuli in P. fellutanum, provided evidence that pPxGM is involved in cellular choline metabolism, osmotolerance, and recycling of metabolites.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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