• 제목/요약/키워드: Environmental DNA

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일부 자원자들의 이동전화 4시간 연속 사용 후 림프구 DNA 손상 평가 (DNA Damage of Lymphocytes in Volunteers after 4 hours Use of Mobile Phone)

  • 지선미;오은하;설동근;최재욱;박희찬;이은일
    • Journal of Preventive Medicine and Public Health
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    • 제37권4호
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    • pp.373-380
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    • 2004
  • Objectives : There has been gradually increasing concern about the adverse health effects of electromagnetic radiation originating from cell phones which are widely used in modern life. Cell phone radiation may affect human health by increasing free radicals of human blood cells. This study has been designed to identify DNA damage of blood cells by electromagnetic radiation caused by cell phone use. Methods : This study investigated the health effect of acute exposure to commercially available cell phones on certain parameters such as an indicator of DNA damage for 14 healthy adult volunteers. Each volunteer during the experiment talked over the cell phone with the keypad facing the right side of the face for 4 hours. The single cell gel electrophoresis assay (Comet assay), which is very sensitive in detecting the presence of DNA strand-breaks and alkali-labile damage in individual cells, was used to assess peripheral blood cells (T-cells, B-cells, granulocytes) from volunteers before and after exposure to cell phone radiation. The parameters of Comet assay measured were Olive Tail Moment and Tail DNA %. Results : The Olive Tail Moment of B-cells and granulocytes and Tail DNA % of B-cells and granulocytes were increased by a statistically significant extent after 4-hour use of a cell phone compared with controls. Conclusion : It is concluded that cell phone radiation caused the DNA damage during the 4 hours of experimental condition. Nonetheless, this study suggested that cell phone use may increase DNA damage by electromagnetic radiation and other contributing factors.

일부 자원 여성에서 모발염색 후 림프구의 DNA손상과 관련 요인 (DNA Damage in Lymphocytes after Hair Dyeing and Related Factors among Women Volunteers)

  • 조진아;오은하;설동근;이은일
    • Journal of Preventive Medicine and Public Health
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    • 제35권4호
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    • pp.275-281
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    • 2002
  • Objectives : To evaluate the DNA damage by hair dyeing in human lymphocytes Methods : Comet assays were carried out to evaluate the DNA damage in lymphocytes by hair dyeing. Twenty subjects were selected from women volunteers whose age ranged from 55 to 67 year old. All subjects had no smoking history. Blood samples were collected before and 6 hours after hair dyeing. DNA damage was evaluated by means of the tail moments, which were quantified by a KOMET 4.0 image analysis system. Results : The tail moments before hair dyeing showed no significant differences among subjects except for the high frequency group. The mean values of the tail moments in subjects with low and high frequencies of hair dyeing were 1.39 and 1.77, respectively (p<0.05). The tail moments after hair dyeing increased significantly, The mean values of tail moments in subjects before and after hair dyeing were 1.45 and 1.79, respectively (p<0.01). However, the difference levels of DNA damage in lymphocytes before and after hair dyeing were found to be slightly lower in both the dietary supplement taking group and high frequency group. Conclusions : The high frequency group appears to have a higher level of DNA damage than the low frequency group before hair dyeing. DNA damage in lymphocytes was found to be significantly higher in the volunteers after hair dyeing. In this study, the related factors such as high frequency and taking dietary supplements appeard to reduce DNA damage in lymphocytes after hair dyeing.

Molecular Typing of Pseudomonas aeruginosa by Randomly Amplified Polymorphic DNA

  • Byoung-Seon Yang
    • 대한의생명과학회지
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    • 제9권4호
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    • pp.183-187
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    • 2003
  • Pseudomonas aerugionsa is a commonly isolated nosocomial pathogen. DNA fingerprinting of P. aerugionsa is examined by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD). In this study, P. aeruginosa were isolated from environmental and clinical specimens and the molecular typing of the microorganisms was investigated by RAPD. Thirty strains of P. aeruginosa were selected from the strains isolated formerly and submitted for type identification to the University Hospital. 15 strains of P. aeruginosa were received from Chungnam University Hospital and 14 strains from Gyeongsang University Hospital. DNA of P. aeruginosa was extracted by Qiagen genomic DNA kit. PCR mixtures were set up and incubated, Reactions mixtures were made to be optimal for P. aeruginosa. RAPD typing analysis was carried out by the multivariate statistical program (MVSP) V3.0. RAPD type I was the most common pattern and included 23 strains. Most of strains from Gyeongsang University Hospital belonged to RAPD type lb and 15 strains from Chungnam University Hospital to RAPD type I or II. RAPD typing of P. aeruginosa isolated from the environmental and clinical specimens was very simple and reproducible.

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Chinese Hamster Ovary세포에서 Benzo(a)pyrene과 3-Methylcholanthrene에 의한 DNA 단사절단과 복제억제에 미치는 Saponin의 영향

  • 이정섭;이형호;박기현;박상대
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제10권2호
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    • pp.127-134
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    • 1990
  • 본 연구는 Chinese hamster ovary (CHO-KI) 배양세포에서 S-15분획에 의해 활성화된 bezo(a) pyrene (BP)과 3-methylcholanthrene(MC)에 의해 유발된 DNA단사절단과 DNA복제억제 및 그 회복과정에 미치는 한국산 인삼추출물 saponin의 영향을 조사하여 다음과 같은 결과를 얻었다. S-15분획으로 활성화된 10-5 M의 BP 또는 MC를 1.0-10ng/ml의 saponin과 함께 처리할 경우 BP와 MC단독처리군에 비해 DNA 단사절단률이 감소하였다. DNA 합성률은 활성화된 10-5M의 BP와 10-6 M의 MC에 의해 각각 50% 및 75% 억제되었으나, 0.1-10ng/ml의 saponin을 동시에 처리할 경우 DNA 합성억제률이 약 10% 이상 둔화되었다.

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한국인 집단에서 사립체 DNA에 존재하는 5178 A/C 다형성과 고혈압과의 관련성에 관한 연구 (Lack of Association of the Mitochondrial DNA 5178 A/C Polymorphism with Hypertension in a Korean Population)

  • Kang, Byung-Yong;Kim, Seon-Jeong;Jang, Dai-Ho;Kim, Hyun-Hee;Lee, Kang-Oh
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • 제18권1호
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    • pp.27-32
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    • 2003
  • 고혈압은 다양한 유전적 요인과 환경적 요인이 상호작용하는 다인자성 질환으로 알려져 있으며, 최근의 연구에 의하면 사립체 DNA에 존재하는 유전적 다형성이 고혈압과 유의한 관련성을 나타낸다는 보고가 있다. 이에 본 연구에서는 한국인 집단을 대상으로 하여 사립체 DNA의 5178번째 위치의 염기서열에 존재하는 A/C 다형성이 고혈압과 관련성을 나타내는 지를 분석하였다. 환자-대조군 연구를 수행한 결과, 사립체 DNA의 5178번째 위치에 존재하는 다형성의 대립 유전자 빈도는 한국인에서 고혈압군과 정상 혈압군 사이에 유의한 차이를 나타내지 않았다. 따라서, 이 다형성은 적어도 한국인에 대해서는 고혈압에 유의하게 영향을 미치는 유전적 소인은 아닌 것으로 사료된다.

Chinese Hamster Ovary세포에 있어 methyl methanesulfonate에 의한 DNA 복제억제와 이의 회복경로 (Replication Inhibition and Its Recovery/Process in Chinese Hamster Ovary Cells Treated with Methyl Methanesulfonate)

  • 이천복;이형호;박상대;이치건
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제9권1호
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    • pp.33-46
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    • 1989
  • 본 연구는 알킬화제를 처리한 CHO-K1 세포에서 DNA 복제억제와 그 회복과정의 분자론적 기작을 규명할 목적으로 방사선 이중 표지에 의한 DNA 합성율의 측정, 알칼리 자당 농도구배 초원심분리법에 의한 DNA 분자량과 후복제 회복율을 측정하여 다음과 같은 결과를 얻었다. (1) 1mM methyl methanesulfonate (MMS)와 1nM N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine (MNNG) 이하의 낮은 농도의 처리군에서는 DNA 합성율이 급격히 감소하였으나, 2 mM MMS, 2mM MNNG이상의 농도에서는 그 감소양상이 둔화되었다, (2) DNA 합성율은 알킬화제의 처리 직후 감소하였다가 시간경과에 따라 회복되어 처리후 4시간 째에는 대조군 수준 또는 그 이상으로 회복되었다.

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DNA 교잡에 의한 토양 미생물 군집의 다양성과 유사성 (The Diversity and Similarity of Soil Microbial Communities by DNA Cross Hybrization)

  • 김유영;송인근;민병례;조홍범;최영길
    • 환경생물
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    • 제17권3호
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    • pp.279-284
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    • 1999
  • 토양으로부터 직접 추출한 DNA를 cross hybridization하는 방법을 통해서 서로 다른 토양 환경 간에 미생물 군집의 유전형적 유사성과 상대적 다양성을 비교하였다. 그 결과 소나무삼림토양이 다른 토양에 비해 상대적 다양성이 높은 것으로 밝혀졌으며, 경작지, 나지, 초지, 신갈삼림 순으로 다양성 정도를 나타내었다. 또한 유전형적 유사성의 정도에 따른 집괴 분석 결과 소나무삼림과 경작지 토양, 신갈나무삼림과 초지 토양 그리고 나지 등 세 부류로 구분되었다.

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U937 세포에서 발암관련 유전자들로 구성된 DNA chip을 이용한 방사선 감수성 유전자들의 선발 (Identification of Radiation-Sensitive Gene in U937 Cell by using cDNA-Chip Composed of Human Cancer Related Gene)

  • 김종수;김인규;강경선;윤병수
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제22권1호
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    • pp.54-59
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    • 2002
  • We have used cDNA microarray hybridization to identify gene regulated in response to gamma-irradiation in U-937 cell. The cDNA-chip was composed entirely of 1,000 human cancer related gene including apoptosis and angiogenesis etc. In gamma-irradiated U-937 cell, highly charged protein, ribosomal protein L32, four and a half LIM domains 3, lipocalin 2 (oncogene 24p3) and interleukin 15, ataxia telangiectasia mutated (includes complementation groups A, C and D) genes showed increased level of its transcription, and cell division cycle 25A, dihydrofolate reductase, topoisomerase (DNA) II beta(180kD), kinase suppressor of ras and strarigin genes showed reduced level of its transcription compared to untreated U-937 cell. The significant change of level of transcription was not found in well-known ionizing radiation(IR)-responsive gene, such as transcription factor TP53 and p53 related gene, except ataxia telangiectasia mutated gene.

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Identification of bird species and their prey using DNA barcode on feces from Korean traditional village groves and forests (maeulsoop)

  • Joo, Sungbae;Park, Sangkyu
    • Animal cells and systems
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    • 제16권6호
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    • pp.488-497
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    • 2012
  • A DNA barcode based on 648 bp of cytochrome c oxidase I (COI) gene aims to build species-specific libraries for animal groups. However, it is hard to recover full-length (648 bp) barcode gene from environmental fecal samples due to DNA degradation. In this study, we designed a new primer set (K_Bird), which amplifies a 226 bp fragment targeted an inner position of full-length COI barcode based on 102 species of Korean birds to improve amplification success, and we attempted to identify bird species from 39 avian fecal samples collected during 4 months from Jinan, South Korea. Simultaneously, we conducted a dietary analysis using a universal DNA mini-barcode (Uni_Minibar) from same fecal samples. In silico analysis on newly designed mini-barcode represented that genetic distances were 0.5% in species and 9.1% in genera. Intraspecific variations of 149 species out of 174 species (86%) between Korea and North America were within the threshold (5.3% threshold in this study). From environmental fecal samples collected in Jinan, we identified seven avian species, which have high similarity (99-100%) with registered COI sequences in GenBank. Eight kinds of prey species, such as moth, spider, fly, and dragonfly, were identified in dietary analysis. We suppose that our strategy applying mini-barcode for environmental fecal samples, might be a useful and convenient tool for species identification and dietary analysis for birds.

이온화 방사선에 의해 손상된 Eisenia fetida 체강세포의 DNA 수복에 수은이 미치는 영향 (Influence of Mercury on the Repair of Ionizing Radiation-induced DNA Damage in Coelomocytes of Eisenia fetida)

  • 류태호;모하마드 닐리;안광국;김진규
    • 환경생물
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    • 제29권3호
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    • pp.236-240
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    • 2011
  • 수은이 DNA 수복에 미치는 영향을 알아보기 위해 E. fetida를 염화수은(II)과 이온화 방사선에 순차적으로 노출시킨 후, 단세포 겔 전기영동 기법을 이용하여 DNA의 손상 수준과 방사선 조사 후 시간 경과에 따른 수복 양상을 관찰하였다. 염화수은(II)의 농도를 40 mg $kg^{-1}$으로 하여 48시간 동안 in vivo 노출 시험을 수행한 뒤 20Gy의 감마선을 조사한 결과, 시간이 지날수록 대체로 DNA 손상의 수준이 감소했다. 이온화 방사선에 의해 손상된 DNA가 완전히 수복되기 위해 요구되는 시간을 비교해 보면, 수은과 감마선에 함께 노출된 E. fetida는 방사선 조사 후 약 37시간, 감마선만 조사한 실험군은 약 2.35시간이 지나고 난 뒤 손상된 DNA의 대부분이 수복되는 것을 볼 수 있었다. 한편 E. fetida에 20 Gy의 감마선을 조사하면 방사선 조사가 끝나고 약 45분, 수은 처리 후 방사선을 조사하면 약 1시간 12분 정도가 경과한 시점에서 손상되었던 DNA의 절반이 수복되는 것을 확인할 수 있었다. 또한 DNA 수복 속도가 빠른 구간을 도식화하여 그 기울기를 계산한 결과, 수은에 노출된 실험군의 DNA 수복률은 수은에 노출되지 않은 실험군보다 약 5배 정도 수복 속도가 느리다고 판단할 수 있었다. 손상된 DNA가 천천히 수복되는 구간을 수식으로 표현해 DNA의 미수복분율을 산출하면 방사선 단독처리군과 수은 및 방사선의 복합처리군의 미수복분율은 각각 0.4910과 0.9470로 나타난다. 미수복분율 값의 차는 수은에 의해 DNA의 정상적인 수복이 방해되었음을 의미한다.