• 제목/요약/키워드: Entropic force

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콜로니 에너지를 이용한 단백질-리간드 결합 문제에서의 엔트로피 효과 계산 (Consideration of the entropic effect in protein-ligand docking using colony energy)

  • 이주용;석차옥
    • Bioinformatics and Biosystems
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    • 제1권2호
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    • pp.103-108
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    • 2006
  • 단백질-리간드 결합 예측은 새로운 신약 선도 물질을 발견하고 최적화 하는데 있어서 중요한 도구로 널리 사용되고 있다. 결합의 정확도는 일반적으로 각 결합 계산에서 사용되는 평가 함수(scoring function)에 따라 결정된다. 평가 함수는 그 함수가 가지고 있는 기력 가정에 따라 force-field based, empirical, knowledge-based의 세 가지로 분류할 수 있다. 이 중에서 force-field based 함수는 물리적인 상호작용을 가장 구체적으로 기술한다. 그러나 현재 제시된 대부분의 force-field based 함수들은 분산력과 정전기적인 힘 등의 에너지만을 고려할 뿐 엔트로피의 영향을 포함하지 않는 단점을 가지고 있다. 본 논문에서는 force-field based 평가 함수를 이용하는 경우 기존의 도킹 프로그램이 생성해 내는 구조 정보를 활용하여, 엔트로피를 고려할 수 있는 방법을 제시한다. 또한 이 방법을 DOCK 평가 함수에 적용시켰을 때 decoy discrimination에서 향상된 결과를 얻어낼 수 있음을 보였다. 이는 더 정확한 도킹 계산이 가능함을 의미한다.

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Temperature-dependent Conformational changes of Single Polymer Chains

  • Ohno, Naoto;Watanabe, Kenji;Nakajima, Ken;Nishi, Toshio
    • 한국고분자학회:학술대회논문집
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    • 한국고분자학회 2006년도 IUPAC International Symposium on Advanced Polymers for Emerging Technologies
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    • pp.342-342
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    • 2006
  • Atomic force microscope (AFM) enables us to stretch a single polymer chain by picking it at its two modified termini. Using this method called "nanofishing," we have studied statistical properties of single polymer chains. A force-extention curve obtained for a polystyrene with thiol termini in a cyclohexane showed a good agreement with a worm-like chain (WLC) model, and thus gave microscopic information about entropic elasticity. In this report, the experiments were performed at wide-range temperatures, resulting in wide-range solvent qualities from poor to good solvent condition. The temperature dependence of statistical properties of polystyrene was examined. The coil-strand transformation realized in a poor solvent was also discussed.

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Direct Transfer Printing of Nanomaterials for Future Flexible Electronics

  • 이태윤
    • 한국재료학회:학술대회논문집
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    • 한국재료학회 2011년도 춘계학술발표대회
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    • pp.3.1-3.1
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    • 2011
  • Over the past decade, the major efforts for lowering the cost of electronics has been devoted to increasing the packaging efficiency of the integrated circuits (ICs), which is defined by the ratio of all devices on system-level board compared to the area of the board, and to working on a larger but cheaper substrates. Especially, in flexible electronics, the latter has been the favorable way along with using novel nanomaterials that have excellent mechanical flexibility and electrical properties as active channel materials and conductive films. Here, the tool for achieving large area patterning is by printing methods. Although diverse printing methods have been investigated to produce highly-aligned structures of the nanomaterials with desired patterns, many require laborious processes that need to be further optimized for practical applications, showing a clear limit to the design of the nanomaterial patterns in a large scale assembly. Here, we demonstrate the alignment of highly ordered and dense silicon (Si) NW arrays to anisotropically etched micro-engraved structures using a simple evaporation process. During evaporation, entropic attraction combined with the internal flow of the NW solution induced the alignment of NWs at the corners of pre-defined structures. The assembly characteristics of the NWs were highly dependent on the polarity of the NW solutions. After complete evaporation, the aligned NW arrays were subsequently transferred onto a flexible substrate with 95% selectivity using a direct gravure printing technique. As proof-of-concept, flexible back-gated NW field effect transistors (FETs) were fabricated. The fabricated FETs had an effective hole mobility of 0.17 $cm2/V{\cdot}s$ and an on/off ratio of ${\sim}1.4{\times}104$. These results demonstrate that our NW gravure printing technique is a simple and effective method that can be used to fabricate high-performance flexible electronics based on inorganic materials.

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Properties of Cylindrical Brush Polymers

  • Zhang Bin;Fischerl Karl;Grohn Franziska;Pedersen J S.;Schmidt Manfred
    • 한국고분자학회:학술대회논문집
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    • 한국고분자학회 2006년도 IUPAC International Symposium on Advanced Polymers for Emerging Technologies
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    • pp.109-109
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    • 2006
  • Flexible polymers with densely grafted side chains adopt the shape of cylindrical brushes, because the steric repulsion of the side chains overcomes the entropic restoring force of the main chain. Combined light-and neutron scattering measurements elucidate the extend of main chain and side chain stretching as function of side chain length. The application of cylindrical brushes as molecular actuators in response to external stimuli which is discussed.

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충전된 고무재료의 열변화에 따른 수축력/팽창력 측정 (Measurement of Thermal Shrinkage/Expansion Force of Filled Rubber)

  • 박상민;홍창국;조동련;강신영
    • Elastomers and Composites
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    • 제42권4호
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    • pp.201-208
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    • 2007
  • 본 연구에서는 충전된 고무재료의 온도 변화에 대한 치수 안정성을 고찰하기 위해 카본블랙 또는 실리카가 충전된 NR과 SBR의 열변화시 발생하는 수축력과 팽창력을 측정하였다. 일정 길이로 인장된 시편의 온도를 올렸을 때 고무사슬의 엔트로피적 변화에 의해 수축력이 발생하였다. 카본블랙이나 실리카가 첨가된 NR의 경우 충전제 함량이 증가함에 따라 최대 열수축력 값이 감소하였으나, SBR의 경우는 30 phr 함량에서 미충전 고무보다 높은 열수축력 값을 보였다. 압축된 시편의 열팽창력 측정의 경우, 카본블랙을 첨가한 NR의 열팽창력은 거의 변화가 없었으나, SBR은 카본블랙 양의 증가와 함께 최대 팽창력 값이 증가하였다. 실리카를 첨가했을 경우 NR, SBR시편 모두 첨가량이 증가할수록 최대 열팽창력 값이 증가하였다.