• Environmental Engineering Research
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• 제12권5호
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• pp.231-237
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• 2007

The microbial eco-physiology has been the vital key of microbial ecological research. Unfortunately, available methods for direct identity of microorganisms and for the investigation of their activity in complicated community dynamics are limited. In this study, metagenomics was considered as a promising functional genomics tool for improving our understanding of microbial eco-physiology. Its potential applications and challenges were also reviewed. Because of tremendous diversity in microbial populations in environment, sequence analysis for whole metagenomic libraries from environmental samples seems to be unrealistic to most of environmental engineering researchers. When a target function is of interest, however, sequence analysis for whole metagenomic libraries would not be necessary. For this case, nucleic acids of active populations of interest can be selectively gained using another cutting-edge functional genomic tool, SIP (stable isotope probing) technique. If functional genomes isolated by SIP can be transferred into metagenomic library, sequence analysis for such selected functional genomes would be feasible because the reduced size of clone library may become adequate for sequencing analysis. Herein, integration of metagenomics with SIP was suggested as a novel functional genomics approach to study microbial eco-physiology in environment.

• 한국문헌정보학회지
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• 제57권4호
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• pp.289-310
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• 2023

데이터 공유 및 재사용은 필수가 되었다. 데이터 리포지터리는 이러한 데이터 공유 및 재사용을 위한 핵심 도구이다. 본 연구의 목적은 국립생태원이 구축 및 운영 중인 EcoBank의 서비스를 제안하기 위함이다. 연구 목적을 달성하기 위하여 re3data.org에 등록된 생태 분야 해외 데이터 리포지터리 123개 중 10개를 선정하여 조사 및 분석하였다. 분석 결과 3가지 서비스가 공통으로 도출되었다. 3가지 서비스는 첫째, 연구데이터 정책, 둘째, 연구데이터 품질 검토 그리고 연구데이터 관리 교육 및 워크숍으로 구성된다. 여기에 EcoBank의 글로벌한 데이터 공유를 위해서는 re3data.org와 같은 데이터 리포지터리 레지스트리에 등록을 해야 하며 리포지터리의 신뢰성 및 품질 확보를 위한 인증을 추진할 것을 제안해 본다.

• 한국환경교육학회:학술대회논문집
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• 한국환경교육학회 2004년도 전반기 정기 학술발표대회
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• pp.108-120
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• 2004

• Journal of Plant Biology
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• 제32권2호
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• pp.79-87
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• 1989

Southern hybridization of genomic DNAs with radioactively labeled cDNA of tomato proteinase inhibitor II revealed that proteinase inhibitor II proteins in potato plants are encoded by a family of about 10 related sequences. Screening of potato EcoRI genomic library with the cDNA resulted in isolation of 13 recombinant phage clones which carry 3 different genomic regions. Of these clones, clones 8, 18, and 39 were subjected to restriction mapping and subcloning. Further characterization of the subclones of clones 8, 18 and 39 indicated that two inhibitor II genes are present on a 8.0 kb EcoRI fragment of clone 8, one on 3.3 and 0.8 kb EcoRI fragments of clone 18 and two genes on a 13.5 kb EcoRI fragment of clone 39.

• 한국자원리싸이클링학회:학술대회논문집
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• 한국자원리싸이클링학회 2005년도 춘계임시총회 및 제25회 학술발표대회
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• pp.19-19
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• 2005

In this paper, the author analyzed the characteristics of cycle Economy which is a key concept of current Japanese environmental policy. The Japanese government has adopted the Eco Town Project in order to grow up vein industry. But it is not clear that Eco lown project alms to create cycle society or sustainable society. When considering the location of vein industries, it is important to consider how efficient this industry collects wastes and develops a recycling goods market. Present Japanese law requires the people and companies to reduce waste. As a result, conventional manufacturing discharges waste this is too massive for vein industry to dispose of or recycle.

• 한국동물학회지
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• 제33권1호
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• pp.35-44
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• 1990

생쥐 악하선으로부터 분리한 전 RNA를 poly(U)-sepharose chromatography와 sucrose linear density gradient centrifugation 방법으로 레닌 mRNA를 분리하여 in vitro translation과 immunoprecipitation에 의하여 레닌 mRNA를 확인하였다. 레닌 mRNA로부터 레닌 cDNA를 합성하여 EcoRI inker를 이용하여 pUC19에 삽입시켰고, Taq, polymerase를 이용한 PCR방법으로 합성한 레닌 cDNA는 pUC19의 Hinalll 부의에 삽입하여 재조합 plamid를 각각 작성하였다. 이것을 JM103에 형질전환시켜 레닌 유전자 발현을 유도하여 45,000의 분자량을 갖는 레닌을 얻었으며 이 레닌 단백은 토끼으 혈압을 850115mmHg에서 115-140mmHg로 증가시키는 생리 활성을 나타냈다. 토끼의 신장 DNA를 EMBL3 phage에 삽입시켜 genomic library를 작성한 후, 레닌 cDNA로부터 합성한 probe로 plaque hybridization시켜 genomic 유전자를 갖는 재조합 phage를 분리하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제18권1호
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• pp.98-102
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• 1990

본 실험에서는 채소 등에서 연부병을 유발시키는 원인균의 일종인 Erwinia herbicola의 생육을 저해시키는 bacteriocin 생산균주를 경작지로부터 분리하여 몇 가지 특성을 조사하였다. 분리균주가 생산하는 bacteriocin은 배양 48시간안에서 가장 많은 축적량을 보였고 bacteriocin 생산유전자는 chromosome 상에 있음을 확인하였다. 또한 Erwinia 속의 chromosomal DNA 를 분리하여 EcoRI으로 절단하고 pLAFR3 vector의 EcoRI site에 cloning 하여 bacteriocin을 생성하는 형질전환체, 두 개체를 얻었다. 이들 중 bacteriocin 생산능이 우수한 CH 49 clone의 제한효소 지도를 작성하였다. Vector 내에 삽입된 3.0kb insert 내에 BamHI과 NglII site가 각각 한 개씩 있음을 밝혔다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제20권9호
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• pp.1666-1672
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• 2016

최근 스마트 기술이 다양한 정보시스템 분야에 적용되고 있다. 특히, 기존 도서관 서비스 분야는 디지털도서관을 넘어 스마트 도서관으로 변화되었다. 이러한 변화의 환경에서 다양한 콘텐츠와 서비스 그리고 사용자와 스마트 디바이스를 지원하는 도서관 서비스 소프트웨어 플랫폼이 요구된다. 기존 도서관 서비스는 서로 다른 이기종의 도서관 시스템간의 의미적 상호운용성이 저해되는 제한점을 갖고 있다. 본 논문은 다양한 콘텐츠 제공과 시스템간의 상호작용 그리고 서비스의 통합에 중점을 두어 미래 도서관 시스템의 원형으로 링크드오픈데이터 기반의 스마트 라이브러리 제안한다. 링크드 오픈데이터 기반 스마트 라이브러리는 첨단 정보기술이 모여진 혁신적인 시스템이다. 우리는 링크드오픈데이터를 기반으로 스마트 라이브러리를 위한 다양한 요구사항에 따라 시스템 환경을 설계하였다. 이용자의 요구사항과 정보기술의 에코시스템을 고려하여 스마트 라이브러리 시스템의 기능적 요구사항에 대해 기술한다. 또한 기능적 요구사항을 수용하고 다양한 스마트 디바이스를 통해 사용자에게 스마트 지식 서비스를 제공할 수 있는 참조 프레임워크를 보여준다.

• 미생물학회지
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• 제31권2호
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• pp.123-128
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• 1993

해녀콩 뿌리혹의 질소고정 공생균인 Rhizobium sp. SNU003 균주의 게놈내 7.9 kb 의 EcoRI, 6.5kb 의 SalI, 7.3 kb 의 HindIII 와 4.4 kb 의 PstI 절편에 nifHD 가 존재함을 확인하였다. 람다파아지 EMBL3-BamHI arm 을 사용하여 genomic library 를 제조하였으며 이로부터 nif-유전자를 포함하고 있는 9개의 재조합 파아지 클론을 선별하였다. 이들 중 15.3 kb 의 삽입 DNA 를 가지고 있는 Rnif-6 클론은 7.6 kb 의 BamHI/SacI 절편에 nifHD 가 위치하고 있었다. 따라서 이절편을 pUC19 에 sub cloning 하고 제한효소 지도를 작성한 결과 Rhizobium sp. SNU003 의 nifH 와 nifD 는 4.5 kb 의 BamHI/BglII 절편에 연속배열하고 있다.

• 미생물학회지
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• 제30권4호
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• pp.246-251
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• 1992

대두 (Glycine max) 뿌리혹의 질소고정 공생균주 Bradyrhizobium japonicum SNU001 의 nod 유전자를 클로닝하였다. Rhizobium meliloti 의 4.5 kb EcoRI/ HindIII 절편을 탐침으로 한 게놈 혼성화 반응을 분리균주의 게놈상에 nod 유전자가 존재함을 확인하고, lambda EMBL3-BamHI vector 를 이용하여 genomic library 를 작성하였다. 작성된 library 로부터 1, 2 차 선별과정을 통해 nod 유전자가 있는 클론 1-5 를 선별하고, 클론 2로부터 nod DABC 탐침과 lambda DNA 탐침을 사용한 혼성화반응을 수행하여 삽입된 genomic DNA 에 대한 부분적인 제한효소 지도를 작성하였다. nod DABC 탐침과 가장 강한 혼성화반응을 보인 phage 클론 lambda CNS-1 의 3.9 kb BamHI 절편을 pBS KS(+) vector 에 subcloning 하고 동일한 탐침을 이용한 혼성화반응을 통해 subclone pBjCNS-1 을 선별하였다. 이 subclone 에 대한 부분적인 제한효소 지도를 작성하여 nod DABC 가 1.8 KpnI/SacI 절편에 존재함을 확인하였다.