Earworm is very useful animal in soil ecosystem, however it is harmful for golf courses because they introduce many cast on turfgrass that reduces turf uniformity and play quality. However, no information has found on earthworm diversity and seasonal fluctuation in different Korean golf courses. In this study, we focused to carry out earthworm species composition and seasonal population structure in turfgrass of golf courses. During spring and fall season survey with direct digging and tea saponin drenching sampling in 5 different golf courses, 6 species under 3 families of earthworms were collected. Earthworm species composition and density was different among the golf courses. Aporrectodea caliginosa in Lumbricidae was dominant species in Anseong and Dongrae Benest Golf Club; however Amynthas carnosus in Megascolecidae was dominant species in Anyang and Glenrose Golf Club. Ap. caliginosa was collected only aclitellum in July and Am. carnosus was collected aclitellum and clitellum in August in golf courses. Seasonal population of earthworm was different depending on earthworm species (Am. hupeiensis was the highest in August and Ap. caliginosa was in April) however small number of collected earthworm species were not dominant trend in golf courses.
Kim, Min-Jeong;Kim, Tae-Soo;Shim, Chang-Ki;Kim, Yong-Ki;Jee, Hyeong-Jin
Weed & Turfgrass Science
/
v.1
no.4
/
pp.57-63
/
2012
This study was carried our to examine the genetic relationship of 13 commercial turfgrass cultivars using Random Amplified Polymorphic DNA to provide genetic informations more efficient golf course management. Analysis of 56 random hexamer primers generated 13 to 54 polymorphic bands among the 13 cultivars with an average of 30.7 bands per primer. The results of cluster analysis based on RAPDs revealed that three major variety groups: Group I - 'Shadow II', 'Aurora Gold', 'Little Bighorn Blue', 'PennA-1', and 'PennA-4'; Group II - 'Midnight II', 'Prosperity', 'Moon light SLT', 'Bright star SLT', and 'Silver dollar'; and Group III - 'Olympic Gold', 'Silver Star', and 'Tar Heel II'. The genetic similarity coefficients among 13 turfgrass cultivars ranged from 0.039 to 1.0 with highest coefficient in Group III. Studies on morphological characters and the effective molecular markers such as sequence characterized amplified regions are further needed to identify relationships and genetic diversities within species and among species.
Fluorescent in situ hybridization (FISH) with rRNA-targeted oligonucleotide probes was used to compare the community structures of free-living and aggregated bacteria at thawing period in Lake Baikal. Targeted groups were Eubacteria, $\alpha$-, $\beta$-, $\gamma$- proteobacteria groups, Cytophaga-Flavobacterium group and Planctomycetales. Total bacterial numbers of free-living bacteria were ranged from $0.2{\times}10^6\cells{\cdot}ml^-1$ to $3.2{\times}10^6\cells{\cdot}ml^-1$, which were decreasing with depth, while the aggregated bacterial numbers were dramatically increasing from $0.4{\times}10^4 to 3.3{\times}10^4 \cells{\cdot}ml^-1$ with depth. The ratios of EUB probe binding cells to DAPI counts were ranged from 52.3 to 74.1% in free-living bacteria, and from 39.6 to 66.7% in the aggregated bacteria, respectively. Community structures of the aggregated bacteria were very different from each free-living bacteria at every depth. At 25 m depth, where the chlorophyll a concentration was highest, both structures were quite different from those of surface layers, rendering the fact that the community structures might be affected by phytoplankton. The vertical profile of community structure of aggregated bacteria is particular. The proportion of $\beta$-proteobacteria group was increasing with depth and it was 51.8% at 100 m, but the dominant group was $\gamma$-pro-teobacteria group at 250 m. Taken together, the biodiversity and succession of aggregated bacteria are quite different from free-living bacteria.
Kim, Woon-Ho;Choi, Ok-Kyung;Jeong, Jin-A;Park, Sung-Hee;Lee, Yea-Eun;Park, Gwang-Hee;Yoon, Mi-Hye
Korean Journal of Microbiology
/
v.54
no.1
/
pp.31-37
/
2018
Campylobacter jejuni is an important food-borne pathogen causing gastroenteritis in human. We isolated 208 strains of Campylobacter jejuni from 430 diarrhea patients and food employees with 17 food-poisoning outbreaks between 2014 and 2016 in Gyeonggi area. The strains were tested for genetic relationship and the genotype distribution using PFGE and multiplex-PCR typing. Among the 47 Penner-serotypes known for C. jejuni, it was identified as a genotype consisting of 35 genotypes by multiplex-PCR typing and represented 7 genotypes (HS2, HS4A, HS8, HS15, HS29, HS41, and HS53) in the selected strain. From the PFGE analysis of 11 food-poisoning outbreaks, 5 group of PFGE profile were obtained, and genetic similarity in these clusters ranged from 61.8 to 66.6%. This study examines the genetic diversity of C. jejuni that have been separated in the Gyeonggi area through various genetic analysis methods and identifies the correlation between strains in patients who have been infected with the disease in the future.
To develop indicators for soil health evaluation, biological characteristics of native soils from the different parent materials were studied. Survival rate of fluorescent Pseudomonas in soils was the lowest as 0.1% while those of thermophilic Bacillus and alkaliphilic bacteria were over the 90% by the soil drying stress. There was positive relationship between soil microbial biomass and organic carbon exudated from the microbial biomass by the treatment. The average air-drying effect of soils was 39.7% with ranges of 9.7~95.0%. The propagules of mesophilic Bacillus and Gram negative bacteria were increased by the re-wetting of dried soils. Soil pH affected positively to the recovering rate of microbial number. Average recovering rate of microbes was 65.3%, and there was positive relationship between microbial biomass recovery and fluorescent Pseudomonas population.
In the present study, genomic DNAs were purified from Korean isolates (KT8, KT6, KT-Kim and KT-Lee) and foreign strains (CDC85, IR78 and NYH 286) of 1Trichomonas voslnalis, and hybridized with a probe based on the repetitive sequence cloned from T. uqfinolis to observe the genetic differences. By Southern hybridization, all isolates of T. uoSinoLis except the NYH386 strain had 11 bands. Therefore all isolates examined were distinguishable into 3 groups according to their banding patterns; i) KT8, KT6 and KT-Kim isolates had 11 identical bands such as 1 kb, 1.2 kb, 1.6 kb, 1.9 kb, 2.3 kb. 27 kb, 3.2 kb, 2.4 kb, 3.8 kb, 4.9 kb and 6.0 kb, ii) The metronidazole-resistant IR78 strain had the some bands as KT-Lee isolate at bands of 1 kb, 1.2 kb, 1.6 kb. 1.8 kb, 2.1 kb, 2.5 kb, 2.7 kb, 2.9 kb, 3.4 kb, 5.0 kb and 6.0 kb, Bands of CDC85, metronidazole-resistant strain, were similar to those of IR78 and KT-Lee, except that 3.2 kb replaced 2.9 kb. iii) NYH286 particularly had 12 bands and bun patterns were similar to IR78 with a few exceptions as follows; i) 6.2 kb in place of 6.0 kb, ii) 2.0 kb and 2.2 kb instead of 2.1 kb. Through the results obtained, genetic variance of T. uoginnlis isolates was demonstrated by Southern hybridization.
Botanas, Chrislean Jun;Yoon, Seong Shoon;de la Pena, June Bryan;dela Pena, Irene Joy;Kim, Mikyung;Woo, Taeseon;Seo, Joung-Wook;Jang, Choon-Gon;Park, Kyung-Tae;Lee, Young Hun;Lee, Yong Sup;Kim, Hee Jin;Cheong, Jae Hoon
Biomolecules & Therapeutics
/
v.25
no.2
/
pp.122-129
/
2017
A diversity of synthetic cathinones has flooded the recreational drug marketplace worldwide. This variety is often a response to legal control actions for one specific compound (e.g. methcathinone) which has resulted in the emergence of closely related replacement. Based on recent trends, the nitrogen atom is one of the sites in the cathinone molecule being explored by designer type modifications. In this study, we designed and synthesized two new synthetic cathinones, (1) ${\alpha}-piperidinopropiophenone$ (PIPP) and (2) ${\alpha}-piperidinopentiothiophenone$ (PIVT), which have piperidine ring substituent on their nitrogen atom. Thereafter, we evaluated whether these two compounds have an abuse potential through the conditioned place preference (CPP) in mice and self-administration (SA) in rats. We also investigated whether the substances can induce locomotor sensitization in mice following 7 days daily injection and challenge. qRT-PCR analyses were conducted to determine their effects on dopamine-related genes in the striatum. PIPP (10 and 30 mg/kg) induced CPP in mice, but not PIVT. However, both synthetic cathinones were not self-administered by the rats and did not induce locomotor sensitization in mice. qRT-PCR analyses showed that PIPP, but not PIVT, reduced dopamine transporter gene expression in the striatum. These data indicate that PIPP, but not PIVT, has rewarding effects, which may be attributed to its ability to affect dopamine transporter gene expression. Altogether, this study suggests that PIPP may have abuse potential. Careful monitoring of this type of cathinone and related drugs are advocated.
E2 glycoprotein of hepatitis C virus (HCV) comprises a surface of viral particle together with E1 glycoprotein, and is thought to be involved in the attachment of HCV viral particle to receptor (s) on the permissible cells including hepatocytes, B cells, T cells, and monocytes. We constructed a phage library expressing cellular proteins of hepatocytes on the phage surface, which turned out to be 8.8${\times}$$10^5$ cfu of diversity and carried inserts in 95% of library. We screened both cDNA phage library and 12-mer peptide library to identify the cellular proteins binding to E2 protein. Some intracellular proteins including tensin and membrane band 4.1 which are involved in signal transduction of survival and cytoskeleton organization, were selected from cDNA phage library through several rounds of panning and screening. On the contrary, membrane proteins such as CCR7, CKR-L2, and insulin-like growth factor-1 receptor were identified through screening of peptide library. Phages expressing peptides corresponding to those membrane proteins were bound to E2 protein specifically as determined by neutralization of binding assay. Since it is well known that HCV can infect T cells as well as hepatocytes, we examined to see if E2 protein can bind to CCR7, a member of C-protein coupled receptor family expressed on T cells, using CCR7 transfected tells. Human CCR7 cDNA was cloned into pcDNA3.1(-) vector and transfected into human embryonic kidney cell, 293T, and expressed on the surface of the cell as shown by flow cytometer. Binding assay of E2 protein using CCR7 transfected cells indicated that E2 protein bound to CCR7 by dose-dependent mode, giving rise to the possibility that CCR7 might be a putative cellular receptor for HCV.
Kim, Dong-Sub;Ahn, Soon-Cheol;Kim, Young-Jin;Park, Byoung-Keun;Ahn, Yong-Tae;Kim, Ji-Youn;Kyoji, Morita;Her, Song
Journal of Life Science
/
v.17
no.3
s.83
/
pp.305-311
/
2007
Glucocorticoids (GCs) alter metabolism, synaptogenesis, apoptosis, neurogenesis, and dendritic morphology in the hippocampus. To better understand how glucocorticoids regulate these aspects of hippocampal biology, we studied gene expression patterns in the CA3 (Hippocampal pyramidal cell field CA3) and dentate gyrus (DG). Litter-matched Lewis inbred rats treated for 20 days with either 9.5 mg per day sustained-release corticosterone or placebo pellets were compared with high-density oligonucleotide microarray analysis (Rat Neurobiology U34 Arrays, Affymetrix). In placebo-treated rats, 32 genes were expressed at greater levels in CA3 than DG, whereas 3 genes were expressed at great levels in DC than CA3. Regional differences were also apparent in corticosterone-induced changes in the hippocampal transcriptome. Six genes in CA3 and 41 genes in DC were differentially regulated by corticosterone. As per the glucocorticoid effects on gene transcription in the brain, forty three of these genes were upregulated, and 4 genes were downregulated. Genes differentially expressed in hippocampus included those for 13 neurotransmitter proteins, 5 ion channel related proteins, 4 transcription factors, 3 neurotrophic factors, 1 cytokine, 1 apoptosis related protein, and 5 genes involved in synaptogenesis. Interestingly, GCs can have suppressive effects on brain BDNF mRNA transcription, one of the neurotrophic factors. These results indicate the diversity of targets affected by chronic exposure to corticosterone and highlight important regional differences in hippocampal neurobiology.
Due to rapid development of bioinformatics technologies, various biological data have been produced in silico. So now days complicated and large scale biodata are used to accomplish requirement of researcher. Developing visualization and annotation tool using them is still hot issues although those have been studied for a decade. However, diversity and various requirements of users make us hard to develop general purpose tool. In this paper, I propose a novel system, Genome Viewer and Annotation tool (GenoVA), to annotate and visualize among genomes using known information and multiple relation graph. There are several multiple alignment tools but they lose conserved area for complexity of its constrains. The GenoVA extracts all associated information between all pair genomes by extending pairwise alignment. High frequency conserved area and high BLAST score make a block node of relation graph. To represent multiple relation graph, the system connects among associated block nodes. Also the system shows the known information, COG, gene and hierarchical path of block node. In this case, the system can annotates missed area and unknown gene by navigating the special block node's clustering. I experimented ten bacteria genomes for extracting the feature to visualize and annotate among them. GenoVA also supports simple and rough computational annotation of new genome.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.