• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제8권4호
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• pp.416-421
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• 1998

A carboxyl group modifier, l-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide (EDC) was used to study the interactions between three components of toluene dioxygenase (TDO) from Pseudomonas putida FI. $Ferredoxin_{TOL}$ activity was increased by the treatment with EDC; however, the activity was rapidly declined in the prolonged incubation. In covalent cross-linking experiments with EDC, $Ferredoxin_{TOL}$ made a one-to-one complex with $Reductase_{TOL}$ or the large subunit of $ISP_{TOL}$. These results provide evidence for the involvement of electrostatic interactions in the TDO electron transfer system.

• 한국환경과학회:학술대회논문집
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• 한국환경과학회 2001년도 가을 학술발표회 발표논문집
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• pp.102-104
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• 2001

본 연구는 방향족 화합물질 중 페놀폐수에 대한 생물학적 처리를 위해 본 실험실에서 분리한 페놀분해능이 우수한 Rhodococcus sp. EL-GT를 이용하여 catechol 분해 catechol 1,2-dioxygenase 분해활성을 측정하였고, 이것이 ortho-pathway임을 확인할 수 있었다. 또한 다른 연구에서 보고된 Rhodococrus rhodochrous NCIMB 13259 균주의 catechol 1,2 dioxygenase를 기초로한 primer를 이용하여 PCR을 수행하였으며 이 분해 유전자의 cloning실험을 수행 중이다. 이들 실험을 통하여 Rhodoroccus sp. EL-GT의 페놀분해 균의 유전적 구조 및 특성을 검토하고 이를 이용하여 방향족 화합물의 분해능이 보다 우수한 균주의 개발을 시도하고자 한다.

• Archives of Pharmacal Research
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• 제15권4호
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• pp.360-364
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• 1992

Methylcatechol 2, 3-dioxygenase encoded in pWWO megaplasmid of Pseudomonas putida mt-2 has been cloned and overexpressed in Escherichia coli. This enzyme gene has been localized inside 2. 3-kb XhoI fragment derived from the pWWO megaplasmid. Analysis of enzyme activity and SDS-PAGE showed that the cloned methylcatechol 2, 3-dioxygenase gene in E. coli was about 100 fold overexpressed compared with the parental gene in P. putida mt-2 (pWWO). The cloned enzyme exhibited higher ring-fission activity to catechol than catechol derivatives including 3-methylcatechol, 4-methylcatechol, and 4-chlorocatechol.

• Journal of Microbiology
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• 제43권6호
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• pp.572-576
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• 2005

This study focused on detecting catabolic genes for polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) distributed in the reed rhizosphere of Sunchon Bay, Korea. These marsh and mud environments were severely affected by human activities, including agriculture and fisheries. Our previous study on microbial roles in natural decontamination displayed the possibility that PAH-degrading bacteria, such as Achromobacter sp., Alcaligenes sp., Burkholderia sp. and Pseudomonas sp. play an important decontamination role in a reed rhizosphere. In order to gain further fundamental knowledge on the natural decontamination process, catabolic genes for PAH metabolism were investigated through PCR amplification of dioxygenase genes using soil genomic DNA and sequencing. Comparative analysis of predicted amino acid sequences from 50 randomly selected dioxygenase clones capable of hydroxylating inactivated aromatic nuclei indicated that these were divided into three groups, two of which might be originated from PAH-degrading bacteria. Amino acid sequences of each dioxygenase clone were a part of the genes encoding enzymes for initial catabolism of naphthalene, phenanthrene, or pyrene that might be originated from bacteria in the reed rhizosphere of Sunchon Bay.

• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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• 제3권2호
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• pp.112-114
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• 1998

For enhancement of cis,cis-muconate productivity from benzoate, catechol 1,2-dioxygenase (C12O) which catalyzes the rate-limiting step (catechol conversion to cis,cis-muconate) was cloned and expressed in recombinant Pseudomonas putida BCM114. At higher benzoate concentrations (more than 15 mM), cis,cis-muconate productivity gradually decreased and unconverted catechol was accumulated up to 10 mM in the cae of wild-type P. putida BM014, whereas cis,cis-muconate productivity continuously increased and catechol was completely transformed to cis,cis-muconate for P. putida BCM114. Specific C12O activity of P. putida BCM114 was about three times higher than that of P. putida BM014, and productivity was enhanced more than two times.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제11권5호
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• pp.884-886
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• 2001

The reactivity and stability of purified Lignostilbene- ${\alpha}$,${\beta$}-dioxygenase (LSD)-I were examined. Its optimum temperature was $50^{\circ}C$ at pH 8.5, but it was stable only up to $30^{\circ}C$. The activity of LSD-I increased 12-fold by $30\%$, with increased $V_{max}$ and lowered $K_m.$ LSD-I was stable in 10% methanol.

• 생명과학회지
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• 제19권5호
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• pp.659-663
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• 2009

장기간 경유로 오염된 지역의 토양으로부터 분리한 세균 3Y는 석유계 탄화수소를 구성하는 다양한 화합물을 유일 탄소원으로하여 성장하였다. Sphingomonas sp. 3Y는 지방족 화합물은 물론이고 방향족 화합물을 이용해서 성장할 수 있었다. 지방족 화합물로서는 hexane과 hexadecane을 이용하여 성장하였고, 한편 방향족 화합물로서는 BTEX는 물론이고 phenol, biphenyl, 또는 phenanthrene을 유일 탄소원으로 이용하여 성장하였다. 본 균주는 indole과 catechol을 이용한 실험결과 방향족 탄화수소의 생분해 과정에서 맨 첫 단계 반응에 관여하는 효소인 aromatic ring dioxygenase 활성과 benzene 환을 깨는 효소인 meta-cleavage dioxygenase 활성을 나타내었다. Sphingomonas sp. 3Y의 16S rRNA 유전자의 염기서열 분석과 계통수 작성 결과 본 균주는 ${\alpha}$-Proteobacteria인 Sphingomonas속에 해당하였으며 지금까지 잘 알려진 석유계 탄화수소를 분해하는 Sphingomonas sp. 균주들과는 다른 cluster를 형성하였다. 다양한 석유계 탄화수소 성분을 이용하여 성장하는 Sphingomonas sp. 3Y는 유류로 오염된 토양의 복원에 유용하게 사용될 것으로 여겨지며 이 균주의 최적 분해 조건을 조사한다면 그 결과는 이 균주가 분리된 오염지역의 생물학적 분해를 최적화하는데 기여할 것이다.

• 한국해양환경ㆍ에너지학회지
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• 제7권3호
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• pp.146-151
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• 2004

포접력을 지닌 2-hydroxypropyl-β-cyclodextrin(β-HPCD)을 비롯한 cyclodextrin계 화합물은 소수성 유기물질의 용해도를 증가시킴으로써 미생물에 의한 분해를 촉진시키나 그 외의 자세한 기작은 알려져 있지 않다. 본 실험에서는 β-HPCD 유무에 따라 고분자 PAHs 분해력을 지닌 Novosphingobium pentaromtivorans US6-1 균주의 pyrene라 benzo[a]pyrene(B[a]P)의 분해정도, 이때의 biomass 변화 및 dioxygenase활성을 측정함으로써 PAHs 생분해과정에서 β-HPCD의 역할을 규명하고자 하였다. 실험구는 균주와 PAHs, β-HPCD의 존재 유무에 따라 8개 조건으로 준비하였으며 각 실험구의 배양기간에 따른 PAHs 분해도와 생체량의 변화를 측정하였다. Pyrene의 경우 β-HPCD가 존재함에 따라 분해도가 증진되는 것이 확인되었으며, 특히 B[a]P의 분해에는 β-HPCD가 필수요소로 작용하였다. 생체량의 변화는 PAHs의 존재 유무에 영향을 받지 않았고 β-HPCD의 존재 유무에 따라 차이를 나타내었다. 또한 US6-1 균주는 β-HPCD가 포함된 MM2 무기영양배지에서 전배양 할 때에 ZoBell 배지에서 전배양하는 경우에 비해 catechol-1,2-dioxygenase 효소활성이 높은 것으로 나타났으나 그 값은 빈영양상태에서 배양한 세포의 효소환성과 큰 차이를 보이지는 않았다. 이상의 결과로 볼 때 β-HPCD는 PAHs의 이용성을 높여주는 동시에 탄소원으로 이용되어 균주의 생체량 증가에 기여함으로써 PAMs의 분해력을 증진시키지만 dioxygenase 효소활성에는 영향을 미치지 않는 것으로 사료된다.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제43권1호
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• pp.44-48
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• 2000

Burkholderia cepacia strain G4 (pHG-2) containing toluene 2-monooxygenase and toluene dioxygenase, was able to grow on toluene and accumulate cis-3-methyl-3,5-cyclohexadien-1,2-diol (cis-toluene dihydrodiol) in the liquid culture. The cis-toluene dihydrodiol produced was identical to the authentic compound, as judged through mass spectrometry and nuclear magnetic resonance analysis. Our results indicate that pHG-2 provides an economical means to produce chemically-important chiral synthons while growing on toluene.

• 생약학회지
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• 제42권4호
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• pp.379-385
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• 2011

Indoleamine 2,3-dioxygenase (IDO) is predicted to be therapeutic target for treatment of cancer and immune disease. Thus, we examined methanol extracts prepared from 156 Korean local plants for their inhibitory effects on IDO in vitro. Among them sixteen extracts showed more than 50% inhibition of IDO activity at the concentration of 30 ${\mu}g/ml$. Especially, the extracts of Platycarya strobilacea, Quercus acutissima, Acer ginnala and Alnus japonica were most potent because their $IC_{50}$ value were 6.5, 8.1, 3.9 and 4.2 ${\mu}g/ml$, respectively.