The basic building block of solar filaments/prominences is thin threads of cool plasma. We have studied the spectral properties of velocity threads, clusters of thinner density threads moving together, by analyzing a sequence of $H{\alpha}$ images of a quiescent filament. The images were taken at Big Bear Solar Observatory with the Lyot filter being successively tuned to wavelengths of -0.6, -0.3, 0.0, +0.3, and +0.6 ${\AA}$ from the centerline. The spectra of contrast constructed from the image data at each spatial point were analyzed using cloud models with a single velocity component, or three velocity components. As a result, we have identified a couple of velocity threads that are characterized by a narrow Doppler width($\Delta\lambda_D=0.27{\AA}$), a moderate value of optical thickness at the $H{\alpha}$ absorption peak($\tau_0=0.3$), and a spatial width(FWHM) of about 1". It has also been inferred that there exist 4-6 velocity threads along the line of sight at each spatial resolution element inside the filament. In about half of the threads, matter moves fast with a line-of-sight speed of $15{\pm}3km\;s^{-1}$, but in the other half it is either at rest or slowly moving with a line-of-sight velocity of $0{\pm}3km\;s^{-1}$. It is found that a statistical balance approximately holds between the numbers of blue-shifted threads and red-shifted threads, and any imbalance between the two numbers is responsible for the non-zero line-of-sight velocity determined using a single-component model fit. Our results support the existence not only of high speed counter-streaming flows, but also of a significant amount of cool matter either being at rest or moving slowly inside the filament.
EL CVn-type eclipsing binaries are composed of a massive A-type main-sequence primary star and a hotter B-type secondary one. These are worthy of particular attention because the secondary stars are rare objects to be extremely low-mass white dwarf precursors (ELM proto-WD) with the mass of ${\leq}0.2M_{\odot}$, evolving to higher effective temperatures and higher surface gravities. A few of them were discovered to show multi-periodic pulsations in one or both components. We monitored one of these rare and interesting objects, J0247-25 (=1SWASP J024743.37-251549.2), at two KMTNet sites of SAAO in South Africa and SSO in Australia. The observations were performed with the KMTNet 1.6m telescopes and pre-science 4K CCD cameras during the system test run from July to November 2014. Using the photometric data obtained for a total of 23 nights, we constructed well-defined eclipsing light curves in B/V-bands and derived absolute parameters (mass and radius, etc.) of each binary component. After subtracting model eclipsing curves from the data, we detected seven frequencies with 33~53 cycles per day (c/d) and identified them to be Delta Sct-type pulsations originated from the A-type primary component. Five frequencies were turned out to be excited by rotational splitting of non-radial pressure modes, enabled us to investigate rotational properties. We could not detect any frequency higher than 100 c/d, implying that pulsation amplitudes of the proto-WD secondary decrease greatly.
Phosphoinositide-specific phospholipase C is an effector molecule in the signal transduction process. It generates two second messengers, inositol-1,4,5-trisphosphate and diacylglycerol from phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate. Currently, thirteen mammal PLC isozymes have been identified, and they are divided into six groups: PLC-$\beta$, -$\gamma$, -$\delta$, -$\varepsilon$, -$\zeta$ and -$\eta$. Sequence analysis studies demonstrated that each isozyme has more than one alternative splicing variant. PLC isozymes contain the X and Y domains that are responsible for catalytic activity. Several other domains including the PH domain, the C2 domain and EF hand motifs are involved in various biological functions of PLC isozymes as signaling proteins. The distribution of PLC isozymes is tissue and organ specific. Recent studies on isolated cells and knockout mice depleted of PLC isozymes have revealed their distinct phenotypes. Given the specificity in distribution and cellular localization, it is clear that each PLC isozyme bears a unique function in the modulation of physiological responses. In this review, we discuss the structural organization, enzymatic properties and molecular diversity of PLC splicing variants and study functional and physiological roles of each isozyme.
Nugroho, Wahyu Sri Kunto;Kim, Dong-Woo;Han, Jong-Cheol;Hur, Young Baek;Nam, Soo-Wan;Kim, Hak Jun
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제26권12호
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pp.2087-2097
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2016
Most cold-adapted enzymes possess higher $K_m$ and $k_{cat}$ values than those of their mesophilic counterparts to maximize the reaction rate. This characteristic is often ascribed to a high structural flexibility and improved dynamics in the active site. However, this may be less convincing to cold-adapted metabolic enzymes, which work at substrate concentrations near $K_m$. In this respect, cold adaptation of a shikimate kinase (SK) in the shikimate pathway from psychrophilic Colwellia psychrerythraea (CpSK) was characterized by comparing it with a mesophilic Escherichia coli homolog (EcSK). The optimum temperatures for CpSK and EcSK activity were approximately $30^{\circ}C$ and $40^{\circ}C$, respectively. The melting points were $33^{\circ}C$ and $45^{\circ}C$ for CpSK and EcSK, respectively. The ${\Delta}G_{H_2O}$ (denaturation in the absence of denaturing agent) values were 3.94 and 5.74 kcal/mol for CpSK and EcSK, respectively. These results indicated that CpSK was a cold-adapted enzyme. However, contrary to typical kinetic data, CpSK had a lower $K_m$ for its substrate shikimate than most mesophilic SKs, and the $k_{cat}$ was not increased. This observation suggested that CpSK may have evolved to exhibit increased substrate affinity at low intracellular concentrations of shikimate in the cold environment. Sequence analysis and homology modeling also showed that some important salt bridges were lost in CpSK, and higher Arg residues around critical Arg 140 seemed to increase flexibility for catalysis. Taken together, these data demonstrate that CpSK exhibits characteristics of cold adaptation with unusual kinetic parameters, which may provide important insights into the cold adaptation of metabolic enzymes.
This study investigated the color change, enhancement of dye uptake, washing fastness, and light fastness of cotton and silk when dyed with Juniperus chinensis and Terminalia chebula (combination dyeing) using various methods. The dyeing methods were 1) dyeing Juniperus chinensis extract and Terminalia chebula Retzius extract sequentially (J-T), 2) dyeing Terminalia chebula Retzius extract and Juniperus chinensis extract sequentially (T-J), 3) dyeing Juniperus chinensis extract and Terminalia chebula Retzius extract simultaneously (J+T), and 4) dyeing Juniperus chinensis extract 4 times repeatedly and followed by a dyeing Terminalia chebula Retzius extract in sequence. In terms of increased dyeing uptake, combination dyeing (dyeing 2 times like method 1, 2, 3) had the same impact as the repeated dyeing (method 4). The color of J, T combination dyeing showed wide range of mixed YR series, Y series resulting from Terminalia chebula Retzius, and R series resulting from Juniperus chinensis. In cotton, J-T dyeing method showed superior enhancement of dye uptake, and T-J method in silk. In both of the cases, Y series color from Terminalia chebula Retzius extract was mainly shown (Y series color was superior to R series color after dyeing). Therefore, it is recommended for cotton to implement T-J method and for silk to implement J-T method in order to enhance both dyeing uptake and emphasize the color of R series. The K/S value of combination dyed fabrics was decreased by increasing washing time; however, the K/S value of combination dyed fabrics was increased by increasing UV irradiation time. But after repeated washing and longer UV irradiation, ${\Delta}E$ value of combination dyed fabric became smaller compared to fabric dyed with Juniperus chinensis only. Thus, it was found that after J, T combination dyeing, fabric became less prone to fading by washing and UV than after Juniperus chinensis single dyeing was done.
A noninsecticidal strain, Bacillus thuringiensis NTB-88, isolated from Korean soil, had a typical bipyramidal parasporal inclusion and its serotype is identical to B. thuringiensis subspmorrisoni (H8a8b). To elucidate differences between insecticidal and noninsecticidal strains, we compared strain NTB-88 to other toxic B. thuringiensis subsp. morrisoni strains (HD-12 and PG-14). Restriction endonucleases digested plasmid DNA patterns showed that strain NTB-88 was different from lepidopteran-toxic strain, HD-12, but it was similar to dipteran-toxic strain, PG-14. The gene type of strain NTB-88 was different from those of other insecticidal strains, Furthermore, the NH2-terminal amino acid sequence of crystal protein of strain NTB-88 had no relation to those of the previously known $\delta$-endotoxins in other toxic strains as well as HD-12 and PG-14 strains. Therefore, the noninsecticidal crystal protein in strain NTB-88 is novel and its property is different from insecticidal ones.
We observed a low-mass pre-main sequence star, HBC722 (also known as $LkH{\alpha}$ 188 G4), with Camera for QUasars in EArly uNiverse (CQUEAN) attached to 2.1 Otto Struve telescope at McDonald Observatory, USA. HBC722 is a new FU orionis-type object in the direction of NGC7000/IC5070, which produced large amplitude optical outbursts (${\delta}V$=4.7 mag over one year) for a few months and reached the peak in 2010 September. We carried out the photometric observation in SDSS r,i, and z band in 2011 April, July and August to monitor the long term decrease of its brightness. We also made continuous observation in r-band for half night in July, and whole two nights in August to investigate short term variability which could be related to the rotation of the central star or the inner circumstellar disk. In this poster, we present a preliminary result of the photometric observation for HBC722.
The cyclic alternating pattern (CAP) is a periodic EEG activity in NREM sleep, characterized by sequences of transient electrocortical events that are distinct from background EEG activities. A CAP cycle consists of two periodic EEG features, phase A and subsequent phase B whose durations are 2-60 s. At least two consecutive CAP cycles are required to define a CAP sequence. The CAP phase A is a phasic EEG event, such as delta bursts, vertex sharp transients, K-complex sequences, polyphasic bursts, K-alpha, intermittent alpha, and arousals. Phase B is repetitive periods of background EEG activity. The absence of CAP more than 60 seconds or an isolated phase A is classified as non-CAP. Phase A activities can be classified into three subtypes (A1, A2, and A3), based on the amounts of high-voltage slow waves (EEG synchrony) and low-amplitude fast rhythms (EEG desynchrony). CAP rate, the percentage of CAP durations in NREM sleep is considered to be a physiologic marker of the NREM sleep instability. In insomnia, the frequent discrepancy between self-reports and polysomnographic findings could be attributed to subtle abnormalities in the sleep tracing, which are overlooked by the conventional scoring methods. The conventional scoring scheme has superiority in analysis of macrostructure of sleep but shows limited power in finding arousals and transient EEG events that are major component of microstructure of sleep. But, it has recently been found that a significant correlation exists between CAP rate and the subjective estimates of the sleep quality in insomniacs and sleep-improving treatments often reduce the amount of CAP. Thus, the extension of conventional sleep measures with the new CAP variables, which appear to be the more sensitive to sleep disturbance, may improve our knowledge on the diagnosis and management of insomnia.
eIF5B는 단백질합성의 개시 인자로서 Met-$tRNA^{Met}$을 AUG 개시코돈에 전달하고, 리보솜의 두 소단위체 결합을 유도한다. 이 인자의 기능을 연구할 목적으로 eIF5B를 코딩하는 FUN12 유전자의 5'말단 부위를 삭제하는 연구를 수행하였다. 프로모터의 대부분을 삭제한 FUN12를 함유한 pRS효모벡터를 FUN12가 삭제되어 천천히 자라는 돌연변이주 ($fun12{\Delta}g$)에 전달하였을 때 그 표현형을 부분적으로 상보하였다. 위와 같이 제조된 벡터에서 N-말단이 상실된 eIF5B 단백질이 발현되었고, 그 양이 정상 균주에서 발현되는 eIF5B 양의 약 5%에 불과하였다. 이와 같이 부분적으로 성장을 상보한 균주에서 발현된 적은 양의 단백질합성개시 인자 eIF5B는 직접적으로 그 성장을 제한하는 요소로 작용한다. 이러한 균주에서 성장의 제한인자인 eIF5B는 in vitro 에서도 역시 전체 단백질 합성의 활성을 조절하였다.
The spatial landmark protein Bud8 plays a crucial role in bipolar budding in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae. The unconventional yeast Yarrowia lipolytica can also bud in a bipolar pattern, but is evolutionarily distant from S. cerevisiae. It encodes the protein YALI0F12738p, which shares the highest amino acid sequence homology with S. cerevisiae Bud8, sharing a conserved transmembrane domain at the C-terminus. Therefore, we named it YlBud8. Deletion of YlBud8 in Y. lipolytica causes cellular separation defects, resulting in budded cells remaining linked with one another as cell chains or multiple buds from a single cell, which suggests that YlBud8 may play an important role in cell separation, which is distinct from the function of Bud8 in S. cerevisiae. We also show that the YlBud8-GFP fusion protein is located at the cell membrane and enriched in the bud cortex, which would be consistent with a role in the regulation of cell separation. The coiled-coil domain at the N-terminus of YlBud8 is important to the correct localization and function of YlBud8, as truncated proteins that do not contain the coiled-coil domain cannot rescue the defects observed in $Ylbud8{\Delta}$. This finding suggests that a new signaling pathway controlled by YlBud8 via regulation of cell separation may exist in Y. lipolytica.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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