Gene expression data are the quantitative measurements of expression levels and ratios of numberous genes in different situations based on microarray image analysis results. The process to draw meaningful information related to genomic diseases and various biological activities from gene expression data is known as gene expression data analysis. In this paper, we present a hierarchical clustering method of gene expression data based on self organizing map which can analyze the clustering result of gene expression data more efficiently. Using our proposed method, we could eliminate the uncertainty of cluster boundary which is the inherited disadvantage of self organizing map and use the visualization function of hierarchical clustering. And, we could process massive data using fast processing speed of self organizing map and interpret the clustering result of self organizing map more efficiently and user-friendly. To verify the efficiency of our proposed algorithm, we performed tests with following 3 data sets, animal feature data set, yeast gene expression data and leukemia gene expression data set. The result demonstrated the feasibility and utility of the proposed clustering algorithm.
The marine self-organizing VHF data link is a digital radio link with self-organizing ability, which exploits the STDMA algorithm and operates in marine VHF channels. It can support the applications of surveillance, situation awareness and communication. It is the core technology of the Universal AIS which is considered as a future surveillance system at sea by the IMO. In this paper, the operational principle of the marine self-organizing VHF data link is introduced. Simultaneously, a new access protocol is proposed to enhance the marine self-organizing VHF data link so as to support point-to-point communication. The point-to-point communication is one of the most important bases to establish dynamic internetworks among computers on the bridges in the future.
한국지능정보시스템학회 1999년도 추계학술대회-지능형 정보기술과 미래조직 Information Technology and Future Organization
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pp.303-311
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1999
The amount of financial information in today's sophisticated large data bases is huge and makes comparisons between company performance difficult or at least very time consuming. The purpose of this paper is to investigate whether neural networks in the form of self-organizing maps can be used to manage the complexity in large data bases. This paper structures and analyzes accounting numbers in a large data base over several time periods. By using self-organizing maps, we overcome the problems associated with finding the appropriate underlying distribution and the functional form of the underlying data in the structuring task that is often encountered, for example, when using cluster analysis. The method chosen also offers a way of visualizing the results. The data base in this study consists of annual reports of more than 80 Korean companies with data from the year 1998.
This paper provides a framework for semantic correspondence of heterogeneous databases using self- organizing map. It solves the problem of overlapping between different databases due to their different schemas. Clustering technique using self-organizing maps (SOM) is tested and evaluated to assess its performance when using different kinds of data. Preprocessing of database is performed prior to clustering using edit distance algorithm, principal component analysis (PCA), and normalization function to identify the features necessary for clustering.
This paper considers reinforcement learning control with the self-organizing map. Reinforcement learning uses the observable states of objective system and signals from interaction of the system and environment as input data. For fast learning in neural network training, it is necessary to reduce learning data. In this paper, we use the self-organizing map to partition the observable states. Partitioning states reduces the number of learning data which is used for training neural networks. And neural dynamic programming design method is used for the controller. For evaluating the designed reinforcement learning controller, an inverted pendulum on the cart system is simulated. The designed controller is composed of serial connection of self-organizing map and two Multi-layer Feed-Forward Neural Networks.
A huge amount of financial information in large databases makes performance comparisons among organizations difficult or at least very time-consuming. This paper investigates whether neural networks in the form of self-organizing maps can be effectively employed to perform a competitive benchmarking in large databases. By using self-organizing maps, we expect to overcome problems associated with finding appropriate underlying distributions and functional forms of underlying data. The method also offers a way of visualizing the results. The database in this study consists of annual financial reports of 100 biggest Korean companies over the years 1998, 1999, and 2000.
Feature-based similarity retrieval become an important research issue in image database systems. The features of image data are useful to discrimination of images. In this paper, we propose the highspeed k-Nearest Neighbor search algorithm based on Self-Organizing Maps. Self-Organizing Maps (SOM) provides a mapping from high dimensional feature vectors onto a two-dimensional space. The mapping preserves the topology of the feature vectors. The map is called topological feature map. A topological feature map preserves the mutual relations (similarity) in feature spaces of input data. and clusters mutually similar feature vectors in a neighboring nodes. Each node of the topological feature map holds a node vector and similar images that is closest to each node vector. In topological feature map, there are empty nodes in which no image is classified. We experiment on the performance of our algorithm using color feature vectors extracted from images. Promising results have been obtained in experiments.
This paper considers reinforcement learning control with the self-organizing map. Reinforcement learning uses the observable states of objective system and signals from interaction of the system and the environments as input data. For fast learning in neural network training, it is necessary to reduce learning data. In this paper, we use the self-organizing map to parition the observable states. Partitioning states reduces the number of learning data which is used for training neural networks. And neural dynamic programming design method is used for the controller. For evaluating the designed reinforcement learning controller, an inverted pendulum of the cart system is simulated. The designed controller is composed of serial connection of self-organizing map and two Multi-layer Feed-Forward Neural Networks.
Using 1991 FDIC financial statement data, we develop fuzzy clusters of the data set. We also identify the distinctive characteristics of the fuzzy clustering algorithm and compare the closest hard-partitioning result of the fuzzy clustering algorithm with the outcomes of two self-organizing neural networks. When nine clusters are used, our analysis shows that the fuzzy clustering method distinctly groups failed and extreme performance banks from control (healthy) banks. The experimental results also show that the fuzzy clustering method and the self-organizing neural networks are promising tools in identifying potentially failing banks.
본 논문에서는 Self Organizing Map을 이용하여 fMRI data를 분석해 보았다. fMRl (functional Magnetic Resonance Imaging)는 인간의 뇌에 대한 비 침투적 연구 방법 중 최근에 각광받고 있는 것이다. Motor task를 수행하고 있는 피험자로부터 image data를 얻어내어 SOM을 적용하여 clustering한 결과 motor cortex 영역이 뚜렷하게 clustering 되었음을 알 수 있었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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