• 제목/요약/키워드: DNA analysis

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A Review of Extended STR Loci and DNA Database

  • Cho, Yoonjung;Lee, Min Ho;Kim, Su Jin;Park, Ji Hwan;Jung, Ju Yeon
    • 대한의생명과학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.157-169
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    • 2022
  • DNA typing is the typical technology in the forensic science and plays a significant role in the personal identification of victims and suspects. Short tandem repeat (STR) is the short tandemly repeated DNA sequence consisting of 2~7 bp DNA units in specific loci. It is disseminated across the human genome and represents polymorphism among individuals. Because polymorphism is a key feature of the application of DNA typing STR analysis, STR analysis becomes the standard technology in forensics. Therefore, the DNA database (DNA-DB) was first introduced with 4 essential STR markers for the application of forensic science; however, the number of STR markers was expanded from 4 to 13 and 13 to 20 later to counteract the continuously increased DNA profile and other needed situations. After applying expanded STR markers to the South Korean DNA-DB system, it positively affected to low copy number analysis that had a high possibility of partial DNA profiles, and especially contributed to the theft cases due to the high portion of touch DNA evidence in the theft case. Furthermore, STR marker expansion not only contributed to the resolution of cold cases but also increased kinship index indicating the potential for improved kinship test accuracy using extended STR markers. Collectively, the expansion of the STR locus was considered to be necessary to keep pace with the continuously increasing DNA profile, and to improve the data integrity of the DNA-DB.

CONSTRUCTION OF SEX CHROMOSOMAL STR LOCI TYPING SYSTEM

  • Woo, Kwang-Man;Kim, Jong-Yeol;Park, Su-Jeong;Oh, Hye-Hyun;Lee, Seung-Hwan
    • 한국동물학회:학술대회논문집
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    • 한국동물학회 1998년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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    • pp.356.2-356
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    • 1998
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PCR에 의한 X,Y-Specific Alphoid Repeat Sequences의 분석 (Gender Determination of X and Y-Specific Alphoid Repeat Sequences by PCR)

  • 최동호;강필원;이양한;한면수
    • 분석과학
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    • 제12권1호
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    • pp.80-83
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    • 1999
  • 사람에게서 유래된 DNA시료의 X,Y 특이의 alphoid gene을 PCR법으로 분석하면 성별을 확인할 수 가 있다. PCR법으로 alphoid gene을 분석한바 매우 예민도가 높아 genomic DNA 약 60pg까지 성별을 분석할 수 있었다. 그리고 성별이 혼합되어 있는 DNA에서 female DNA의 1/10비 까지는 male DNA를 분석할 수 있었다. 따라서 이 결과는 혼합된 DNA에서 X,Y 특이의 alphoid gene을 분석하는데 기준으로 활용할 수가 있다.

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유전자(DNA)증폭 온도 사이클 시스템에 열전소자 활용을 위한 연구 (Application of thermoelectric module to DNA amplifying thermal cycle system)

  • 조재설;정세훈;남재영;최재붕;김영진
    • 대한기계학회:학술대회논문집
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    • 대한기계학회 2004년도 춘계학술대회
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    • pp.210-215
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    • 2004
  • : A DNA analysis system based on fluorescence analysis has to have a DNA amplifying thermal cycle system. DNA amplification is executed by the temperature control. Accuracy of fluorescence analysis is influenced by the temperature control technology. For that reason, the temperature control is core technology in developing the DNA analysis system. Therefore, the objective of this paper is to develop the hardware to apply thermoelectric module to the DNA amplifying thermal cycle system. In order to verify the developed hardware for controlling the temperature of thermoelectric module, a DNA amplifying thermal cycle test was performed. From the test, the developed hardware controlled the temperature of thermoelectric module successfully. Therefore, it is expected that the developed hardware can be applied to the DNA amplifying thermal cycle system.

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폐가스 처리용 바이오필터에 미생물 군집 분석 기법의 적용 (Application of Methodology for Microbial Community Analysis to Gas-Phase Biofilters)

  • 이은희;박현정;조윤성;류희욱;조경숙
    • Korean Chemical Engineering Research
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    • 제48권2호
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    • pp.147-156
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    • 2010
  • 폐가스 처리용 바이오필터의 핵심 요소 기술은 생촉매(미생물), 담체, 설계 운전 기술 및 진단 관리 기술이다. 특히, 바이오필터의 성능은 부하 조건과 바이오필터 내 미생물 군집 구조에 의해 영향을 받는다. 지금까지 바이오필터의 미생물 연구는 대부분 배양법을 기초로 하여 수행되어 왔으나, 최근에 보다 신속하고 정확하게 미생물 군집을 분석할 수 있는 방법들이 제시되고 있다. 본 논문에서는 생리적, 생화학적 및 분자생물학적 미생물 군집 분석 방법과 이를 활용한 바이오필터의 미생물 군집 특성을 조사한 연구사례를 소개하고, 미생물 군집 분석법의 바이오필터에 적용 가능성에 대해 고찰하였다. Community-level physiological profile 방법은 시료 중에 포함된 종속영양미생물의 탄소기질 이용능력을 기반으로 군집 특성을 조사하는 것이며, Phospholipid fatty acid analysis는 미생물 세포막 지방산을 분석하여 군집 특성을 조사하는 방법이다. 환경시료로부터 직접 추출한 DNA를 활용하는 분자생물학적 분석법에는 "partial community DNA analysis"와 "whole community DNA analysis"가 있다. 전자의 방법은 PCR 과정에 의해 증폭시킨 염기서열을 분석하는 것으로 ribosomal operon 유전자가 가장 많이 활용되었다. 이 방법은 다시 PCR fragment cloning 및 genetic fingerprinting으로 구분되며, genetic fingerprinting 방법으로는 denaturing gradient gel electrophoresis, terminal-restriction fragment length polymorphism, ribosomal intergenic spacer analysis 및 random amplified polymorphic DNA 방법으로 세분화된다. 추출된 전체 군집의 DNA를 분석하는 방법에는 total genomic cross-DNA hybridization, 총 추출 DNA의 열 변성/재결합 방법 및 밀도구배를 이용하여 추출한 DNA를 분획화하는 방법 등이 있다.

FoLT-PCR에 의한 유전자형 (HumTH01, HumTPOX, HumCSF1PO & Amelogenin) 분석 (Quadruplex Genotype Analysis at HumTH01, HumTPOX, HumCSF1PO and Amelogenin Loci by FoLT-PCR)

  • 이양한;임시근;강필원;최동호;윤송노;한면수
    • 분석과학
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    • 제12권3호
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    • pp.260-264
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    • 1999
  • 법적시료(Forensic Evidences)로 사용되는 혈흔, 정액반, 타액반 및 모발을 DNA의 분리과정 없이 FoLT (Formamide Low Temperature) PCR법으로 DNA의 특정부위를 분석하고자 하였다. FoLT PCR법으로 3종류의 STR(Short Tandem Repeat) 좌위와 성별을 확인하는 Amelogenin gene을 PCR법으로 동시에 분석하기 위하여 formamide농도와 annealing온도를 검토한 바 최적의 formamide농도는 8%(v/v)이었고 annealing온도는 $48^{\circ}C$이었다. 그리고 1% Triton X-100을 이용하여 시료를 세척한 경우에 증폭 효율이 증가하였다. 따라서 FoLT-PCR법을 이용한 경우 DNA를 분리하기 위한 전처리없이 소량의 시료를 기존의 PCR법보다 빠른 시간내에 한번의 PCR 및 전기영동으로 HumTH01, HumTPOX, HumCSF1PO 및 Amelogenin을 동시에 분석할 수 있었다.

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