• 제목/요약/키워드: DNA STR Information

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RFID 스마트카드내 DNA STR Information과 일회용 의사난수를 사용한 다중 사용자 인증시스템 (Multi User-Authentication System using One Time-Pseudo Random Number and Personal DNA STR Information in RFID Smart Card)

  • 성순화;공은배
    • 정보처리학회논문지C
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    • 제10C권6호
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    • pp.747-754
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    • 2003
  • 본 논문에서는 DNA 생체정보와 소유자 기반의 hardware RFID(Radio Frequency Identification) 스마트카드, 그리고 Software 인증 분야인 PKI 전자서명을 도입한 다중 사용자 인증시스템을 제시한다. 이는 현 시스템의 인가딘 자의 접근 방법인 ID or password 가 안전한 방법이 아니므로 논문[1] 에서 제안한 사항을 다음과 같이 개선하였다. 즉, 사용자 인증 카드인 two card(the biometric registered seal card and the DNA persional ID card) 대신 하나의 RFID 스마트카드로 사용자 인증을 할 수 있고, 카드 분실시 사용자 정보 노출의 위험을 저가의 RFID로 해결한다. 또한 DNA personal ID 민으로 일난성 쌍둥이, 수혈한 환다, 암세포에서 돌연변이가 발생한 경우의 사용자 인증이 어려운 경우까지 사용자 ID 에 대응하는 일회용 의사난수와 DNA 정보로 사용자 인증을 해결하였다. 그러므로 현 생체 정보 사용자 인증시스템의 단점인 패턴 매칭과 패턴 비교의 에러르 정확한 digital DNA 생체정보로 안전하게 스마트카드에 저장하여 터미널에 로그온하는 local applications에 적용할 수 있다. 스미트카드내 RFID는 사용자를 판독, 추적, 관리할 수 있으므로 카드 분실시 카드 위치를 추적하고 개인 정보를 관리할 수 있으며, 어떠한 개인 DNA 정보도 노출되지 않는다. 현 PKI 전자서명의 비밀키 안전성을 해결한다. 뿐만 아니라 이러한 시스템은 생체정보의 RFID 스마트카드 사용 확대 계기로, 신용카드, 신분증, 그리고 여권 등에서도 이용할 수 있다. 제시한 시스템의 안전성을 통계학적 분석으로 보여진다.

PCR-based genotyping of Korean population for forensic applications

  • 류재송;구윤모;소재성
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2000년도 춘계학술발표대회
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    • pp.592-595
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    • 2000
  • In human chromosome, a short sequence of DNA has been repeated a number of times. These repeats are called variable number of tandem repeat(VNTR) or short tandem repeat(STR) which has short repeat core. VNTR and STR are used in the field of forensic science, evolution, and anthropology. In this work, we examined allele frequencies of 3 VNTR(YNZ22, NeuR, D21S11) and one STR(Humth01) in a Korean population sample by polymerase chain reaction(PCR) followed by high-resolution polyacrylamide gelelectrophoresis(PAGE) with silver staining. Subsequently, the polymorphism information content(PIC) was calculated : the highest PIC was observed for the NeuR locus(0.95680) and lowest for the Humth01 locus(0.75809).

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PCR Analysis of Four Length-Polmorphic Loci in Korea Population for Genotyping

  • Ryu, Jae-Song;Koo, Yoon-Mo;So, Jae-Seong
    • Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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    • 제5권3호
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    • pp.169-173
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    • 2000
  • On human chromoscomes, a short sequence of DNA is known to repeat a number of times. These are called variable number of tandem repeat (VNTR) or short tandem respeat (STR) which has a short core. VNTR and STR are used in the filed of forensic science, evolution, and anthropology. In this work, we examined allele frequencies of one VNTR (YNZ22) and three STRs (NeuR, D21S11, Humth01) in a korean population sample by polymerase chain reaction (RCP) followed by high-resolution polyacrylamide gel electro-phoresis (PAGE) with silver stain. Subsequently, the polymorphism information content (PIC) was calculated : the hifhest PIC was observed in the NeuR locus (0.95680) and lowest in the Humth01 locus (0.75809).

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DNA 해프로트리와 유전적거리에 의한 가계족보의 계층화 (Genealogical Stratification by Genetic Distance and DNA Haplotrees)

  • 류광렬
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제24권1호
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    • pp.65-70
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    • 2020
  • 본 논문은 유전자가계족보 작성을 위해 인체세포의 Y염색체와 X염색체의 DNA에서 해프로코드로 부터 해프로 그룹의 해프로트리, 유전적거리 및 전통가계족보를 결합하고 계층구조화한다. 적용지역은 충청지방으로 부계의 Y-DNA는 O그룹에서 O3a∗ 및 O2b∗ 그룹의 빈도가 높고, 모계의 mtDNA는 L3그룹의 D∗와 M∗그룹의 빈도가 비교적 높다. 유전자 거리 산정은 니의 표준유전적거리법을 적용한다. 실험결과 0.1는 바로 직계가족, 0.1에서 0.8은 근친이며, 1.0 이상은 친족으로 추정하기 어렵다. DNA의 해프로그룹과 해프로트리에 의해 STR은 친족 확인에 적합하고 SNP는 개인유전적식별이 정확하므로 한국전통 족보는 3가지 인수를 추가하므로 더 과학적인 계층화가 구현된다.

외형 및 행동 습관 관련 50개 SNP 마커 분석을 위한 targeted amplicon next-generation sequencing 패널 개발 (Development of targeted amplicon next-generation sequencing panel of 50 SNPs related to externally visible characteristics and behavior)

  • 박희연;노윤지;김응수;박현철
    • 분석과학
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    • 제37권3호
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    • pp.189-199
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    • 2024
  • 법유전학에서 개인의 신원확인을 위한 STR 프로필 분석이 불가한 경우, DNA를 이용한 외형추정특성을 이용하여 개인에 대한 정보를 얻을 수 있다. 최근 눈동자, 머리카락, 피부 색과 같은 외형추정특성을 확인하는 방법들이 연구되고 있지만, 이러한 외형추정특성 정보만 가지고는 한국을 비롯한 동아시아 지역에서 적용하기에는 한계가 있다. 본 연구에서는 개인의 외형과 관련된 표현형을 수사정보로서 활용하기 위해 눈 모양, 머리카락 굵기, 피부 색 뿐만 아니라 탈모, 체형, 고도근시, 얼굴모양, 여드름, 행동습관과 관련된 SNP를 탐색하였다. 이들 표현형과 관련된 50개의 SNP를 선정하여 한 번에 증폭할 수 있는 targeted amplicon NGS 방식의 multiplex PCR 패널을 개발하였다. 실험 결과 14개 샘플에서 50개 SNP의 대립유전자 유형과 빈도를 확인할 수 있었다. 향후 본 패널을 가지고 더 많은 샘플을 이용하여 유전형과 표현형 간 연관성 확인 및 결과 해석 방법을 분석할 예정이다.

유전적(遺傳的) 분석법(分析法)에 의한 사상체질(四象體質)의 연구(硏究) (Study on Sasang Constitution by Genetic Analysis Using Four Short Tandem Repeat Loci)

  • 김민희;김경석;지상은;최선미;조동욱
    • 사상체질의학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.169-183
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    • 1999
  • This study was carried out for the objectification and clinical application of the Sasang Constitutional Medicine(四象醫學). So, the Taeum Soyang, Soum groups were classified by diagnostic rules of Sasang constitution, and investigated by Amp-FLP method far genetic difference. The Amp-FLP was one of the most frequently used human genetic analysis methods which adopts STR typing. In this study, 100 genomic DNA samples of Taeum, Soyang, Soum constitution group were analysed by Amp-FLP method. Allele frequencies of four tetrameric short tandem repeat(STR) loci(TPOX, LPL, D21744, and D13S317) were determined in Taeum, Soyang, Soum groups. The heterozygosities and the polymorphism information content(PIC) values of forur STR loci were 0.812 and 0.789 in D3S1744, 0.811 in D13S317, 0.466 and 0.417 in LPL, and 0.625 and 0.561 in TPOX, respectively. The allele distribution of four STR loci was statistically evaluated. It was found out that the allele distribution of four STR loci was not significantly different among different constitutions. But all loci were found to be highly polymorphic in Taeum, Soyang, Soum groups. It was found out in this study that Taeum, Soum groups are genetically more related each other than they are related to Soyang groups.

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Mixture에서 봉우리 면적을 활용한 유전자 증거의 해석 (Interpreting Mixtures Using Allele Peak Areas)

  • 홍유림;이효정;이재원
    • 응용통계연구
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    • 제23권1호
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    • pp.113-121
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    • 2010
  • 형사사건에서 STR(short tandem repeat)을 이용한 개인 식별은 범죄현장에서 발견된 유전자 증거와 용의자의 유전자 검사 결과를 이용하여 평가하게 된다. 특히 범죄현장에서 발견된 유전자 증거 표본에 기여자가 두 명 이상인 경우를 Mixture라고 하며, 이는 강간 등과 같은 사건에서 흔히 볼 수 있다. 이러한 상황에서 법의학적 추론을 위해 유전자 증거 표본을 해석하고자 하는 연구들이 계속되어 왔으며, 최근에는 Mixture에서 발생한 대립유전자의 봉우리 면적을 활용하여 유전자 증거를 해석하기 위한 노력들이 계속되고 있다. 따라서 본 연구에서는 봉우리 변적을 이용하여 유전자 증거 표본을 해석하기 위한 연구 방법들에 대해 살펴볼 것이며, 또한 유전자 증거 표본에 기여한 사람의 수가 세 명 이상안 표본으로 확장시킨 연구를 실시해 볼 것이다. 마지막으로 사례틀 통해 유전자 증거를 해석하는 방법을 살펴보고자 한다.

Microbial Forensics: Human Identification

  • Eom, Yong-Bin
    • 대한의생명과학회지
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    • 제24권4호
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    • pp.292-304
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    • 2018
  • Microbes is becoming increasingly forensic possibility as a consequence of advances in massive parallel sequencing (MPS) and bioinformatics. Human DNA typing is the best identifier, but it is not always possible to extract a full DNA profile namely its degradation and low copy number, and it may have limitations for identical twins. To overcome these unsatisfactory limitations, forensic potential for bacteria found in evidence could be used to differentiate individuals. Prokaryotic cells have a cell wall that better protects the bacterial nucleoid compared to the cell membrane of eukaryotic cells. Humans have an extremely diverse microbiome that may prove useful in determining human identity and may even be possible to link the microbes to the person responsible for them. Microbial composition within the human microbiome varies across individuals. Therefore, MPS of human microbiome could be used to identify biological samples from the different individuals, specifically for twins and other cases where standard DNA typing doses not provide satisfactory results due to degradation of human DNA. Microbial forensics is a new discipline combining forensic science and microbiology, which can not to replace current STR analysis methods used for human identification but to be complementary. Among the fields of microbial forensics, this paper will briefly describe information on the current status of microbiome research such as metagenomic code, salivary microbiome, pubic hair microbiome, microbes as indicators of body fluids, soils microbes as forensic indicator, and review microbial forensics as the feasibility of microbiome-based human identification.

유전자검사자료의 통계분석을 위한 수량화 및 그래프 방법 (Quantification and Graphical Method for DNA Fingerprinting)

  • 박미라
    • 응용통계연구
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    • 제15권1호
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    • pp.85-105
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    • 2002
  • 본 연구에서는 유전자 검사자료에서 각 유전자좌내 및 유전자좌간의 대립형질들간의 관계를 파악하기 위한 탐색적 방법을 고려하였다. 이를 위해 유전자데이터를 재배열한 후 대응분석 및 다중대응분석의 알고리즘을 적용하여 이를 수량화, 그래프화하는 방법 및 대응행렬도를 적용한 방법을 제안하였다 이러 한 수량화 및 그래프 결과가 하디-와인버그 평형검정 및 연관균형검정 결과와 어떤 관계가 있는지 알아보고 실제 한국인 집단에 대한 STR 유전자좌 자료를 이용하여 결과를 비교하였다.

Biosurfactant Production by Marine Actinomycetes Isolates Streptomyces althioticus RG3 and Streptomyces californicus RG8 as Promising Sources of Antimicrobial and Antifouling Effects

  • Hamed, Moaz M.;Abdrabo, Mohamed A.A.;Youssif, Asmaa M.
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제49권3호
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    • pp.356-366
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    • 2021
  • Two marine actinobacterial isolates, RG3 and RG8, were identified using 16Sr DNA as Streptomyces althioticus RG3 and Streptomyces californicus RG8 and submitted to the database of genetic information with accession numbers MW661230 and MW661234, respectively; they were found to have emulsification indexes of 60 ± 2.5% and 53 ± 2.2%, respectively. The biosurfactants obtained were stable at a temperature of 35℃ for both strains; they were stable at 10% NaCl, in the case of S. althioticus RG3 and at 10-15% NaCl in the case of Str.californicus RG8; both strains produced the most biosurfactant when exposed to alkaline conditions. We characterized the biosurfactants, including features such as their chemical composition, using Fourier transform infrared spectroscopy analysis. The antimicrobial activity of the biosurfactant extracts was evaluated using the well diffusion method against Vibrio alginolyticus MK170250, Escherichia coli ATCC 8739, Pseudomonas aeruginosa ATCC 4027, and Staphylococcus aureus ATCC 25923. S. althioticus RG3 biosurfactants were found to have better antimicrobial activity than those of Str. californicus RG8, indicating that they may be used in pharmaceutical industries and in the manufacture of antifouling products.