• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2004년도 봄 학술발표논문집 Vol.31 No.1 (A)
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• pp.46-48
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• 2004

표준모형의 힉스입자를 찾는 것을 목적으로 미국 페르미 연구소에서 수행되고 있는 CDF 실험은 전 세계에 11개국 55개의 연구소가 참여하고 있다. 테바트론가속기에서 산출되어지는 데이타를 분석하는데는 많은 컴퓨팅 자원이 필요한데 Run IIb 기간동안 생성되는 데이타를 처리하고, 전 세계에 흩어져 있는 연구원들이 사용하기에는 페르미 연구소의 분석용 팜(Centralized Analysis Farm)은 자원이 부족하다. 따라서, 실험에 참여하고 있는 여러 나라의 컴퓨팅 자원을 공유할 수 있는 방안으로 DCAF(DeCentralized Analysis Farm)가 개발되었다. DCAF는 Grid 구현을 위한 중간 단계라 할 수 있으며, 궁극적으로 CMS의 Tier-1 환경과의 통합 구축을 목적으로 하고 있다.

• Molecules and Cells
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• 제43권11호
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• pp.935-944
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• 2020

Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator (ARNT) plays an essential role in maintaining cellular homeostasis in response to environmental stress. Under conditions of hypoxia or xenobiotic exposure, ARNT regulates the subset of genes involved in adaptive responses, by forming heterodimers with hypoxia-inducible transcription factors (HIF1α and HIF2α) or aryl hydrocarbon receptor (AhR). Here, we have shown that ARNT interacts with DDB1 and CUL4-associated factor 15 (DCAF15), and the aryl sulfonamides, indisulam and E7820, induce its proteasomal degradation through Cullin-RING finger ligase 4 containing DCAF15 (CRL4^DCAF15) E3 ligase. Moreover, the two known neo-substrates of aryl sulfonamide, RNA-binding motif protein 39 (RBM39) and RNA-binding motif protein 23 (RBM23), are not required for ARNT degradation. In line with this finding, aryl sulfonamides inhibited the transcriptional activities of HIFs and AhR associated with ARNT. Our results collectively support novel regulatory roles of aryl sulfonamides in both hypoxic and xenobiotic responses.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2003년도 봄 학술발표논문집 Vol.30 No.1 (A)
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• pp.46-48
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• 2003

미국 페르미연구소에서 현재 수행되고 있는 고에너지물리 실험의 하나인 CDF 실험에서는 현재 303대의 Dual CUP 클러스터를 이용한 중심분석용팜(CAF, Central Analysis Farm)을 페르미 연구소 내에 구성하여 실제 데이터 처리 및 모의 시늉 데이터를 생산하는데 사용하고 있다. 그러나 페르미 연구소에서의 중심분석용팜(CAF)은 향후 그 자원이 충분치가 못하므로, 이에 참여하고 있는 여러 나라의 컴퓨팅 자원들을 공유할 수 있어야 한다. 따라서, 한국그룹은 경북대학교 고에너지물리연구소에 있는 PC 클러스터를 활용하여 탈중심분산팜 (DCAF, DeCenteralized Analysis Farm)을 국제공동연구로 설계하여 테스트베드를 구축하였다. 이 구성에는 CAF의 기술뿐만 아니라 페르미 연구소라는 원격에 있는 실험 데이터를 이용하여 job을 수행하므로 데이터 전송 기술인 SAM(Sequential data Access via Meta-data) 및 Kerberos의 보안 시스템, 그리드(Grid)를 포함하는 모든 IT 기술의 종합으로 이루어져있다.

• 생명과학회지
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• 제26권3호
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• pp.364-375
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• 2016

번역 후 변형 과정은 외부 자극으로부터 세포의 신속한 반응을 야기하는데 있어서 매우 효율적인 기작이다. 이 중, 유비퀴티네이션은 진핵생물 내 대표적인 번역 후 변형 과정으로서, 이러한 유비퀴티네이션에 의해 매개되는 UPS (유비퀴틴/프로테아좀 시스템)는 세포 내 다양한 단백질들의 분해과정을 통해 그들의 안정성을 조절한다. 유비퀴티네이션 과정에 참여하는 3종류의 효소 중에서, E3 효소는 분해할 대상 기질을 결정한다는 면에서 그 중요성을 가지고 있다. CRL (cullin-RING E3 ubiquitin ligase)은 E3 효소 중 가장 거대한 그룹을 형성하고 있는데, 이들은 생체 내에서 cullin, RBX1, 어댑터, 기질 수용체로 이루어진 복합체의 형태로서 그 기능을 발휘한다. 이 중, SCF 복합체로도 알려진 CRL1 복합체의 기능은 다양한 연구를 통해 광범위하게 알려져 온 반면, CRL4 복합체에 대한 연구 및 고찰은 상대적으로 미흡한 실정이다. 또한, 애기장대는 DCAF로 명명된 잠재적 기질 수용체를 총 119개 보유하고 있는데, 현재까지 이들 중 일부 기질 수용체들의 기능만이 밝혀진 상태로서, 나머지 기질 수용체들의 기능 규명은 향후 활발히 탐색되어야 할 연구분야라 할 수 있다. 본 총설에서는 식물의 CRL4 복합체의 구조 및 활성 조절을 알아보고, 각 CRL4 복합체가 관여하는 다양한 식물 내 이벤트에 관하여 최근까지 보고된 CRL4 기질 수용체들을 중심으로 그 연구 진행 사항을 업데이트하고자 한다. 이러한 접근은 각 CRL4 복합체가 기능하는 식물의 다양한 신호 전달 기작들을 보다 명확히 이해하고, 향후 전체 CRL4 복합체의 작용 네트워크를 구축하는데 있어 도움이 될 것으로 사료된다.