• 제목/요약/키워드: Cynoglossus spp.

검색결과 4건 처리시간 0.015초

Genetic Distances Within-Population and Between-Population of Tonguesole, Cynoglossus spp. Identified by PCR Technique

  • Yoon, Jong-Man
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
    • /
    • 제23권3호
    • /
    • pp.297-304
    • /
    • 2019
  • The higher fragment sizes (>2,100 bp) are not observed in the two C. spp. populations. The six oligonucleotides primers OPA-11, OPB-09, OPB-14, OPB-20, OPC-14, and OPC-18 were used to generate the unique shared loci to each tonguesole population and shared loci by the two tonguesole populations. The hierarchical polar dendrogram indicates two main clusters: Gunsan (GUNSAN 01-GUNSAN 11) and the Atlantic (ATLANTIC 12-ATLANTIC 22) from two geographic populations of tonguesoles. The shortest genetic distance displaying significant molecular difference was between individuals' GUNSAN no. 02-GUNSAN no. 01 (genetic distance=0.038). In the long run, individual no. 02 of the ATLANTIC tonguesole was most distantly related to GUNSAN no. 06 (genetic distance=0.958). These results demonstrate that the Gunsan tonguesole population is genetically different from the Atlantic tonguesole population. The potential of PCR analysis to identify diagnostic markers for the identification of two tonguesole populations has been demonstrated. As a rule, using various oligonucleotides primers, this PCR method has been applied to identify polymorphic/specific markers particular to species and geographical population, as well as genetic diversity/polymorphism in diverse species of organisms.

다중 PCR 분석법을 이용한 참서대과 어종의 신속하고 정확한 종판별 분석법 개발 (Rapid and Specific Identification of Genus Cynoglossus by Multiplex PCR Assays Using Species-specific Derived from the COI Region)

  • 노은수;강현숙;안철민;박중연;김은미;강정하
    • 생명과학회지
    • /
    • 제26권9호
    • /
    • pp.1007-1014
    • /
    • 2016
  • 본 연구에서는 국산 참서대과 어류 5종(개서대, 참서대, 칠서대, 박대, 용서대) 및 수입산 참서대과(Cynoglossidae) 어류 5종(기니개서대, 긴개서대, 큰비늘개서대, 큰입개서대, 세네갈 개서대)을 대상으로 분자생물학적 방법을 이용한 신속하고 정확한 종판별법을 검토하였다. 참서대과 어류 10종에 대한 최적의 종 특이 프라이머를 선정하기 위하여 약 1,500 bp의 COI 유전자를 분석하였으며, 종간 특이적인 단일염기다형성 유전자가 3’ 말단에 위치하도록 프라이머를 제작하였다. 제작된 10종에 대한 종특이 정방향 프라이머는 동일한 PCR조건과 전기영동을 통해 육안으로 식별이 가능할 정도의 PCR 산물의 상대적인 크기를 고려하였다. 다중 PCR 분석을 위해 종특이 정방향 프라이머는 모두 혼합되어 사용되었으며, 그 결과 세네갈개서대(208 bp), 용서대(322 bp), 큰입개서대(493 bp), 큰 비늘개서대(754 bp), 박대(874 bp), 칠서대(952 bp), 참서대(1,084 bp), 긴개서대(1,198 bp), 개서대(1,307 bp), 기니개서대(1,483 bp)에 해당하는 종 특이적인 증폭을 확인하였다. 또한 이들의 PCR 민감도를 측정한 결과 0.1~1.0 ng/μ l의 농도까지 검출이 가능한 것을 확인 하였다. 본 연구에서 확인된 참서대과 어류 10종에 대한 종특이 프라이머는 특이도 및 민감도가 우수하며 향후 수산물의 수출입 및 유통 관리에 사용이 이루어진다면 정확한 종명 표기가 가능하여 국민 먹거리 안전을 위한 효과적인 방법이 될 것이다.

서대 3중자망의 망목 선택성에 관한 연구 (A study on the selectivity of the mesh size in trammel net for Cynoglossidae spp.)

  • 조영복;박창두;이주희
    • 수산해양기술연구
    • /
    • 제36권2호
    • /
    • pp.89-95
    • /
    • 2000
  • 서대 3중자망의 망목 선택성을 규명하기 위하여 각각 3가지 종류의 망목(70.5mm, 86.6mm, 101mm)으로 구성 된 자망 및 3중자망을 사용하여 1999년 5월부터 8월까지 전남 여수시 돌산도 연안에서 총 30회의 실험조업을 하고, 그 결과를 분석하였다. 망목 선택성 곡선은 개서대를 대상으로 Kitahara 방법으로 작성되었다. 본 연구에 대한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 현용어구 규격인 3중자망(내망 망목 70.5mm망)의 어획비율은 39.0%로, 자망 15.8%에 비해서 약 2.5배 높았다. 2. 3중자망의 선택률이 1이 되는 최적 l/m값은 3.51로 자망 3.38에 비해서 약 0.13 높게 나타났다. 3. 3중자망의 낮은 체장계급에서의 선택성은 자망과 비슷하였으나, 높은 체장계급에서의 선택성은 자망에 비해서 떨어졌다. 이 때 3중자 망의 50% 선택 구간은 1.33으로 자망 0.83에 비해 1.5배 넓게 나타났다. 이상의 결과에서 볼 때, 서대의 경우 3중자망은 자망에 비해 어획성능이 우수하고, 망목 크기를 조절함으로서 대상 어종의 어획 체장을 제어할 수 있음을 알 수 있었다.

  • PDF

낙동강 하구 부근의 해양 환경 조사 연구 (Ecological Survey of the Nakdong River Estuary)

  • 박청길
    • 수산해양기술연구
    • /
    • 제22권4호
    • /
    • pp.1-20
    • /
    • 1986
  • Physical, chemical and biological surveys on Nakdong River estuary were made from October, 1985 to September, 1986. 1. For all the seasons except summer, the sea surface temperature in northwest area of the line which linked from Seo Island to Jisim Island was I-2$^{\circ}$C lower than in southeast area, but in summer the sea surface temperature in northwest area was I-2$^{\circ}$C higher than in southeast area. On the contrary, bottom temperature of coastal area was 1$^{\circ}$C higher than that of oceanic area except winter. 2. Surface salinity in summer and fall has minimum value of 1. 9%0 and maximum value of 32.9%0. This large variation was caused by the runoff of the Nakdong River. Effect of less saline Nakdong River water in northwest area of the line which linked from Seo Island to Jisim Island was greater than in southeast area. A strong current rip always formed near this line. 3. The yellowish-green colored zone was observed in the Nakdong River estuary throughout the year by influence of river discharge. The characteristics of the water quality in the zone have shown that the water color was grade 7 by the Forel water-color meter, transparency was less than 4 m, and concentration of suspended solids was more than 5 mg/1. This water body was in the state of eutrophication in terms of chlorophyll-a and inorganic nitrogen concentration during summer season. 4. During the study period, total 276 taxa were identified. Most of them were diatoms and dinoflagellates which consisted of 97.5%. The component ratio of the above two groups was 84.4% and 13.1 % respectively. Diatoms were plentiful in December and dinoflagellates in July. Dominant species were Nitzschia seriata in October, Thalassiosira rotula in December, Skeletoncma costatum in April, and Nitzschia longissima in July. 5. A total of 47 zooplankton taxa was identified from the samples collected. Copepods were numerically the most important components of zooplankton communities in the study area. The domir:ant copepod species were Paracalanus parvus, Acartia clausi and Temora turbinata. Noctiluca scintillans was the next important component. The other zooplankton with minor abundance were Cladocera. Sagitta spp., Cnidaria, Mysidacea, Lucifer spp. and Amphipoda. 6. During the study period, fishes from 47 families and 87 species were sampled in th~ study area. The four most abundant fish species were Rep~mucen//'s valencicnnei, Leiognathus n~cha!is, Amblychaeturicllthys hexanema and Sardirel/a zun:zsi. The fish species of the secondary importance in abundance were Cynoglossus joyneri, Sillago sihama, Engra~lis japonicus, Encdrias nebulos'l, Acanthogobius flavimanus, Trichiurus lepturus, LiParis tanai/ai, Cynagloss//'s interruptus, Aj)ogon line:z!us, Thrissz la 1l.'1la!ensis, and Limanda yokohamac.

  • PDF