• 제목/요약/키워드: Coomassie brilliant blue

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Fast Protein Staining in Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel using Counter ion-Dyes, Coomassie Brilliant Blue R-250 and Neutral Red

  • Choi, Jung-Kap;Yoo, Gyurng-Soo
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제25권5호
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    • pp.704-708
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    • 2002
  • A fast and sensitive protein staining method in sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) using both an acidic dye, Coomassie Brilliant Blue R-250 (CBBR) and a basic dye, Neutral Red (NR) is described. It is based on a counter ion-dye staining technique that employs oppositely charged two dyes to form an ion-pair complex. The selective binding of the free dye molecules to proteins in an acidic solution enhances the staining effect of CBBR on protein bands, and also reduces gel background. It is a rapid staining procedure, involving fixing and staining steps with short destaining that are completed in about 1 h. As the result, it showed two to fourfold increase in sensitivity comparing with CBBR staining. The stained protein bands can be visualized at the same time of staining.

Coomassie brilliant blue G 및 R을 이용한 말 정액 첨체 염색 기법 (Acrosome staining with Coomassie brilliant blue G or R on the horse spermatozoa)

  • 김성우;신상민;유연희;이재영;김찬란;고응규
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제21권9호
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    • pp.57-63
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    • 2020
  • 말 정자의 첨체 손상도를 간단하게 분석하는 기술을 개발하기 위하여 Coomassie brilliant blue G 또는 R 염색 시약을 이용하여 정자 도말 슬라이드에 대한 염색도를 조사하였고, 3.7% paraformaldehyde (PF)과 35% methanol (MT) 고정제가 첨체 염색에 미치는 영향을 연구하였다. PF로 고정한 후 말 정자 도말 슬라이드를 0.05, 0.1 및 0.2 % 농도 CBB에 각 2분간 염색을 실시하여 첨체를 관찰하면 0.05%의 경우 완전한 첨체 염색도가 G형에서 62.6%, R형은 61.5%로 관찰되었으나, 0.1 및 0.2%의 경우, 80.2 및 79.7%로 (G 형), 78.1 및 76.0%로 (R 형) 관찰되어 유의적 차이가 나타났다. 그러나 MT 고정제를 이용할 경우, 첨체 외막이 느슨해진 정자의 비율은 3.5%로 관찰되어 PF 고정제를 사용하면 9.0%로 관찰되어 유의적으로 낮게 관찰되었다. 이러한 결과는 말정자첨체손상도를 관찰하기 위하여 CBB G 또는 R형 염색시약을 0.1~0.2% 농도로 이용될 수 있음을 증명한다. 또한, 말 정자 슬라이드 도말을 고정하는데 있어 고정제의 선택이 중요하며 MT보다 PF를 활용하는 것이 첨체 변화 과정 중인 정자를 관찰하는데 중요하다는 보여 준다. 이러한 방법은 말의 인공수정을 위한 정액의 저온저장 또는 동결보존과정 중에서 정자첨체손상율을 정확하게 판별하는데 이용될 수 있음을 증명한다.

Comparison of Three Substrates (Casein, Fibrin, and Gelatin) in Zymographic Gel

  • Choi, Nack-Shick;Yoon, Kab-Seog;Lee, Jin-Young;Han, Kyoung-Yoen;Kim, Seung-Ho
    • BMB Reports
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    • 제34권6호
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    • pp.531-536
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    • 2001
  • Three zymographic techniques using casein, fibrin, and gelatin as substrates in SDS-PAGE were compared based on three aspects: (1) The proteolytic pattern of extracellular enzymes from the three bacterial strains, Bacillus sp. DJ-1, DJ-2, and DJ-3. (2) The enzymatic sensitivity of their activity on zymogram gels. (3) The stability of stained zymogram gels with Coomassie brilliant blue in the destaining solution. There was no significant difference on the pattern of extracellular enzymes from the three strains. The bands in the fibrin gel were clearer and more distinct from the extensive destaining process. It was also shown that the gelatin gel revealed the highest enzymatic sensitivity among the three gels, based on the densitometric analysis. In the casein gel, a trace that could be mistaken as a proteolytic band appeared around 40-50 kDa.

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Identification of Proteins in Human Follicular Fluid by Proteomic Profiling

  • Sim, Young-Jin;Lee, Mi-Young
    • Molecular & Cellular Toxicology
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    • 제4권3호
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    • pp.253-259
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    • 2008
  • Human follicular fluid (HFF) is the in vivo microenvironment for oocyte maturation and includes a variety of proteins that could be involved in oocyte development and fertilization. We therefore used a proteomic approach to identify new HFF proteins. HFF from mature human follicles was obtained from five women following oocyte collection for in vitro fertilization (IVF). Ethanol-precipitated HFF run on two-dimensional gel electrophoresis (2DE) produced approximately 250 Coomassie brilliant blue-stained spots, 64 of which were identified using matrix-assisted laser desorption/ionization-mass spectrometry (MALDIMS). In this study, several proteins including complement factor H, inter-${\alpha}$ (globulin) inhibitor H4, inter-${\alpha}$-trypsin inhibitor heavy chain H4 precursor, human zinc-${\alpha}$-2-glycoprotein chain B, PRO2619, PRO02044, and complex-forming glycoprotein HC were new proteins that have not been previously reported in HFF using proteomic methods. Additionally, we identified alloalbumin venezia for the first time from trichloroacetic acid (TCA)-precipitated HFF. These HFF proteins could serve as new biomarkers for important human reproductive processes.

Pharmacokinetics of New Solubilizer in Intravenous Micelle Formulation of Paclitaxel in Mice

  • Lee, Sun-A;Han, Kyu-Won;Um, So-Young;Kim, Kil-Soo
    • 대한약학회:학술대회논문집
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    • 대한약학회 2002년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2
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    • pp.413.2-413.2
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    • 2002
  • Paclitaxel is an antitumor agent with poor water solubility and its pharmacokinetics are nonlinear. Cremophor EL. a surfactant used in the formulation of paclitaxel. may cause adverse effects. New solubilizer(Aceporol 460) was developed to reduce side effects of Cremophor EL and to increase the effect of drug as surfactant used in the intravenous micelle formulation of anticancer drug paclitaxel. We studied easy, rapid quantitative determination of Aceporol 460 in mouse plasma samples. which was achieved by complexation of the compound with the Coomassie brilliant blue G-250 dye in protein-free extracts. (omitted)

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꺽지(Coreoperca herzi)의 정자형성 (Spermatogenesis of Coreoperca herzi (Perciformes; Percichthyidae))

  • 계명찬
    • 생태와환경
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    • 제35권3호통권99호
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    • pp.232-236
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    • 2002
  • 한국산 꺽지 번식에 대한 연구의 일환으로 정소 및 정자의 형태적 특징을 조사하였다. 2001년 5월부터 10월에 걸쳐 북한강 지류인 수입천 지역에 서식하는 꺽지(Corecperca herzi)를 채집하여 분석하였다. 정소는 흰색을 띄며 쐐기모양을 하고 복강의 등쪽에 좌우 균등하게 발달하였다. 동일한 정자형성 단계에 있는 생식세포들이소낭세포에 싸여 발달하며 여러 개가 모여 소엽구조를 형성한다. 각 소엽은 여러 개의 소낭들로 구성되며 소낭들은 각각 속에 들어 있는 생식세포의 정자형성 단계가 상이하였다. 정자는 길이는 43 ${\mu}$m로 둥근 형태의 두부는 2.2 ${\mu}$m 길이이며 0.5 ${\mu}$m길이의 중편이 두부 밑에 발달한다. 미부의 길이는 40 ${\mu}$m이다. omassie brilliant blue염색 결과 정자의 두부 선단에 강한 염색을 확인하였는데 첨체를 발달시키는 것으로 사료된다.

천잠(Antheraea yamamai) Vitellin의 분리와 생화학적 특성에 관한 연구 II. Vitellin의 생화학적 특성 (Studies on the Purification and Biochemical Properties of Vitellin in the Antheraea yamamai Guerin-Meneville II. Biochemical Properties of Vitellin)

  • 김철명;문재유
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.82-90
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    • 1989
  • 분리.정제한 전잠 vitellin의 분자량추정, 당 및 지질성분의 존재유무, 전기현미경적인 형태 및 크기, 아미노산 조성, 내열성 및 여러 가지 특성을 조사하였다. 1. 분리.정제된 천잠의 vitellin은 전기영동상의 이동도가 다른 large 및 small subunit로 되어 있다. 2. 천잠 vitellin의 분자량은 약 450,000d로 추정되었고, large subunit와 small subunit는 각각 174,000d와 44,000d로 추정되었다. 3. Coomassie brilliant blue, sudan black B 및 PAS 염색에 의해서 천잠의 vitellin은 glycolipoprotein으로 동정되었으며, 2개의 subunit도 당과 지질성분을 가지고 있었다. 4. 천잠 vitellin의 지질성분 중에는 가잠이나 Eri-참에 비하여 매우 다양한 종류들이 검출되며 특히 포화지방이라고 추정되는 물질도 있었다. 5. 천잠 vitellin의 단백질과 당성분은 7$0^{\circ}C$에 60분까지는 안전성을 보였으나, 같은 조건에서 지질성분은 검출되지 않았다. 6. 천잠 vitellin의 아미노산 성분 중 다른 곤충에서는 함량이 적은 glycine이 현격히 많았고 기타 성분의 함량은 가잠이나 Eri-잠과 같은 경향이었다. 7. 천잠의 vitellin은 직경이 14$\pm$0.8nm의 균일한 구형이었다.

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백색부후균 Phanerochaete chrysosporium에서 유래한 Manganese Peroxidase Gene(mnp5)의 Pichia pastoris에서의 이종발현 (Expression of a Manganese Peroxidase Gene (mnp5) from White rot fungus Phanerochaete chrysosporium in the Pichia pastoris)

  • 이재원;양인;五十嵐圭日子;鮫島正浩;최인규
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제33권4호통권132호
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    • pp.45-52
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    • 2005
  • 백색부후균 Phanerochaete chrysosporium으로부터 유래한 Manganese peroxidase (mnp5)를 methylotrophic yeast인 Pichia pastoris에서 이종 발현을 하였다. 이종발현으로부터 얻어진 단백질은 클로닝으로부터 예상되어지는 분자량보다 높은 분자량인 45 kDa으로 나타났다. 이것은 mnp5가 가지고 있는 glycosylation site에 의한 것이며, N-linked hyperglycosylation이 효소 활성에 영향을 미치는지를 site direct mutation에 의해 확인하였다. Sodium dodesyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE)와 Coomassie Brilliant Blue (CBB) 염색에 의해 분자량을 확인한 결과 약 37 kDa으로 나타났으며, 효소활성을 측정한 결과 glycosylation이 효소 활성에 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다. 따라서 본 연구로부터 P. pastoris에서 mnp5의 이종발현이 성공적으로 이루어졌으며 이러한 결과로부터 heme을 포함하고 있는 단백질의 이종발현 생산의 가능성을 보여주었다.