• 제목/요약/키워드: Collection Analysis

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공기 중 박테리아 포집을 위한 습식 사이클론의 CFD 해석을 이용한 설계 및 성능 평가 (Design and Performance Evaluation using Computational Fluid Dynamics (CFD) Analysis of Wetcyclones for the Collection of Airborne Bacteria)

  • 고현식;박정우;정지우;황정호
    • 한국입자에어로졸학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.77-87
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    • 2023
  • We present the development of a wetcyclone sampler designed for the sampling of airborne bacteria. The wetcyclone design involves a combination of two traditional cyclone shapes and computational fluid dynamics (CFD) analysis to validate its effectiveness in terms of pressure drop and collection efficiency. The wetcyclone exhibits a collection efficiency of over 90% for bacteria, specifically targeting Staphylococcus aureus. Additionally, the wetcyclone enables continuous bioaerosol sampling using a liquid medium (deionized water), demonstrating a concentration ratio exceeding >105 and a stable microbial recovery rate of 81.9%. The application of real-time quantitative polymerase chain reaction (qPCR) and the colony counting method ensures precise measurement of the concentration ratio and microbial recovery rate.

Sphingomonas abietis sp. nov., an Endophytic Bacterium Isolated from Korean Fir

  • Lingmin Jiang;Hanna Choe;Yuxin Peng;Doeun Jeon;Donghyun Cho;Yue Jiang;Ju Huck Lee;Cha Young Kim;Jiyoung Lee
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제33권10호
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    • pp.1292-1298
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    • 2023
  • PAMB 00755T, a bacterial strain, was isolated from Korean fir leaves. The strain exhibits yellow colonies and consists of Gram-negative, non-motile, short rods or ovoid-shaped cells. It displays optimal growth conditions at 20℃, 0% NaCl, and pH 6.0. Results of 16S rRNA gene-based phylogenetic analyses showed that strain PAMB 00755T was most closely related to Sphingomonas chungangi MAH-6T (97.7%) and Sphingomonas polyaromaticivorans B2-7T (97.4%), and ≤96.5% sequence similarity to other members of the genus Sphingomonas. The values of average nucleotide identity (79.9-81.3%), average amino acid identity (73.3-75.9%), and digital DNA-DNA hybridization (73.3-75.9%) were significantly lower than the threshold values for species boundaries; these overall genome-related indexes (OGRI) analyses indicated that the strain represents a novel species. Genomic analysis revealed that the strain has a 4.4-Mbp genome encoding 4,083 functional genes, while the DNA G+C content of the whole genome is 66.1%. The genome of strain PAMB 00755T showed a putative carotenoid biosynthetic cluster responsible for its antioxidant activity. The respiratory quinone was identified as ubiquinone 10 (Q-10), while the major fatty acids in the profile were identified as C18:1ω7c and/or C18:1ω6c (summed feature 8). The major polar lipids of strain PAMB 00755T were diphosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, sphingoglycolipid, and phosphatidylcholine. Based on a comprehensive analysis of genomic, phenotypic, and chemotaxonomic characteristics, we proposed the name Sphingomonas abietis sp. nov. for this novel species, with PAMB 00755T as the type strain (= KCTC 92781T = GDMCC 1.3779T).

SNMP를 이용한 인터넷 분석 파라미터 추출 시스템의 설계 및 구현 (The Design and Implementation of Parameter Extraction System for Analyzing Internet Using SNMP)

  • 신상철;안성진;정진욱
    • 한국정보처리학회논문지
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    • 제6권3호
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    • pp.710-721
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    • 1999
  • In this paper, we have designed and implemented a parameter extraction system for analyzing Internet using SNMP. The extraction system has two modules; one is collection request module, and the other is analysis request module. The collection request module generates a polling script, which is used to collect management information from the managed system periodically. With this collected data, analysis request module extracts analysis parameters. These parameters are traffic flow analysis, interface traffic analysis, packet traffic analysis, and management traffic analysis parameter. For management activity, we have introduced two-step-analysis-view. One is Summary-View, which is used find out malfunction of a system among the entire managed systems. The Other is Specific-View. With this view we can analyze the specific system with all our analysis parameters. To show available data as indicators for line capacity planning, network redesigning decision making of performance upgrade for a network device and things like that.

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건강한 한국인 분변으로부터 분리된 Olsenella sp. KGMB 04489 균주의 유전체 염기서열 초안 (Draft genome sequence of Olsenella sp. KGMB 04489 isolated from healthy Korean human feces)

  • 한국일;강세원;김지선;이근철;엄미경;서민국;박승환;이주혁;박잠언;오병섭;유승엽;최승현;이동호;윤혁;김병용;양승조;이정숙
    • 미생물학회지
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    • 제54권4호
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    • pp.456-459
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    • 2018
  • Olsenella 속 균주들은 척추동물의 구강, 반추위 및 분변 등에서 분리된 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 건강한 한국인 분변으로부터 Olsenella sp. KGMB 04489 균주를 분리하였으며 PacBio Sequel 플랫폼을 이용하여 Olsenella sp. KGMB 04489 균주의 유전체서열을 분석하였다. 유전체는 G + C 구성 비율이 65.5%이고, 1,838개의 유전자와 rRNA 13개, tRNA 52개로 구성되었으며, 염색체의 크기는 2,108,034 bp였다. 또한, 유전체 분석 결과를 통해 가수분해효소와 항생제 합성 및 내성과 관련된 다양한 유전자를 발견하였다.

학교도서관 이벤트컬렉션 프로그램의 독서 효과에 관한 연구: 한국사 분야를 중심으로 (A Study on the Reading Effectiveness of School Library Event Collection Programs: Focusing on Korean History)

  • 이은정;김기영
    • 정보관리학회지
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    • 제34권1호
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    • pp.73-110
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    • 2017
  • 본 연구는 학교교육 및 교과연계와 도서관의 자원 활용을 아우르는 협력모델로 이벤트 체험과 컬렉션 체험의 융합 프로그램인 이벤트컬렉션 프로그램의 효과와 활용방안을 모색하는데 그 목적이 있다. 이를 위해 양적 및 질적 데이터를 이용하여 다각적으로 분석한 결과, 이벤트컬렉션 프로그램의 효과로 학생들의 독서와 도서관의 역할 인식에 긍정적인 영향을 미치고 있음을 확인하였다. 본 연구는 이벤트컬렉션이 주제분류에 의한 자료배열로서는 제공할 수 없는 특정 관심분야와 관련된 다양한 자료를 제시함으로써 학생들에게 새로운 지식 발견 및 그 깊이와 범위의 확장을 통한 지식의 구조화를 지원하고, 전시이벤트 형식의 체험마케팅 요소를 통해 독서자료와 학생의 상호작용 및 공유와 참여를 촉진함으로써 자기주도적 독서에 효과적인 도구임을 제안하였다는 데에 의의가 있다.

학교도서관의 장서관리 현황조사 및 분석 (A Survey and Analysis of Current Collection Management State in School Libraries)

  • 김성준;이병기
    • 한국도서관정보학회지
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    • 제48권1호
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    • pp.21-42
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    • 2017
  • 이 연구는 학교도서관의 장서관리 현황을 파악하기 위해 전국의 154개교를 대상으로 설문조사를 실시하여 분석한 결과이다. 설문지는 학교도서관의 장서현황, 이용현황, 장서관리 체제의 3개 영역에 걸친 총 12개의 조사내용으로 구성되었다. 분석결과 도출된 주요 내용을 종합하면 다음과 같다. 첫째, 자료현황에서 2015년 기준 학생 1명당 단행본 수는 전문단체인 한국도서관협회기준과 비교하여 초등학교와 중학교는 기준을 초과하였으나, 고등학교는 기준에 미치지 못하였다. 입수자료의 주제별 비율은 문학이 압도적으로 높았으며, 다음 주제로 사회과학과 역사의 비율이 높게 나타났다. 둘째, 이용현황에서 학교급별 대출현황은 학생, 교사, 학부모 모두 초등학교에서 높게 나타났다. 그리고 2013년부터 2015년까지 한 번도 대출된 적이 없는 자료는 전체 장서의 64.6%로 나타났다. 셋째, 장서관리 체제에서 전체 154개교 중 114개교(74%)가 자체의 장서관리 정책서를 보유하고 있고, 이들 모든 학교는 연간 1회 이상의 장서점검 및 평가를 실시하였다. 그리고 대부분의 학교는 자체의 학교도서관운영위원회를 구성하고 있으며, 이들은 연 중 2~3회의 회의를 개최하는 것으로 나타났다. 그리고 학교도서관운영위원회는 학교도서관 현안문제에 대한 대화와 소통의 장으로, 그리고 장서개발, 운영지원, 홍보에서 중요한 역할을 수행하는 것으로 조사되었다.

북큐레이션을 통한 테마 컬렉션의 구축과 운영에 관한 연구 - 공공도서관 담당자의 심층면담을 통해 - (A Study on the Construction and Operation of Theme Collections through Book Curation: In-depth Interview with Public Librarians)

  • 표순희;백지원
    • 한국문헌정보학회지
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    • 제53권4호
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    • pp.189-211
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    • 2019
  • 본 연구는 도서관에서 이루어지는 테마 컬렉션의 개념을 정립하고, 테마 컬렉션 운영의 실제를 밝혀 향후 테마 컬렉션 구축과 운영을 위한 방법론 설정 및 향후 발전을 위한 시사점을 제공하고자 하는 목적으로 수행되었다. 이를 위하여 본 연구는 서울 경기지역 공공도서관 네 곳의 관장 및 테마 컬렉션 담당 사서 총 12명을 대상으로 심층면담을 수행하였다. 분석의 결과, 테마 컬렉션은 자관의 장서와 이용자 및 커뮤니티에 대해 충실하게 이해하고, 자관의 서비스 목표와 지향을 공유한 상태에서 제대로 구축되고 기능할 수 있음을 밝혔다. 또한 테마 컬렉션 구축 업무는 사서 개인의 정체성 확립에 기여하는 면이 있으며, 기존의 도서관 업무 경계를 넘나드는 상호 연계된 성격을 지녔음을 파악하였다. 마지막으로 테마 컬렉션 구축 및 운영을 위해서 참조할 수 있는 현행 테마 컬렉션의 종합적인 모형을 제시하고 이의 의의와 향후 과제를 논하였다.

공공도서관 테마 컬렉션의 기능과 특성 - 이용자 중심 분류의 관점에서 - (Functions and Characteristics of Public Library Theme Collection: Focusing on the User-centered Classification Perspective)

  • 백지원
    • 한국문헌정보학회지
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    • 제52권4호
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    • pp.51-69
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    • 2018
  • 본 연구는 테마 컬렉션이 가지는 이용자 중심적인 분류로서의 잠재적 가능성에 주목하여 이의 기능과 특성을 분류의 관점에서 분석하고자 했다. 이를 위해 테마 컬렉션의 등장 배경을 도서관 자원 조직의 문제와 북 큐레이션 서비스 도입에 관한 논의를 통해 파악하였고, 도서관의 테마 컬렉션의 개념을 정의하고 목적을 밝혔다. 또한, 테마 컬렉션을 구축하고 있는 도서관들의 사례 분석을 바탕으로 테마 컬렉션의 구체적인 개념과 특성을 도출하였다. 이상의 논의를 바탕으로 공공도서관 테마 컬렉션의 분류와 범주화 특성을 분석하고 분류로서의 기능 및 특성을 다른 지식조직체계와 상대적으로 비교하였다. 또한, 테마 컬렉션의 효용과 활용성을 제시하여 향후 도서관의 이용자 중심적인 분류체계 설계에 관한 논의에 기반으로 삼고자 했다.

Re-identification of Colletotrichum gloeosporioides Species Complex Isolates in Korea and Their Host Plants

  • Le Dinh Thao;Hyorim Choi;Yunhee, Choi;Anbazhagan Mageswari;Daseul Lee;Dong-Hyun Kim;Hyeon-Dong Shin;Hyowon Choi;Ho-Jong Ju;Seung-Beom Hong
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제40권1호
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    • pp.16-29
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    • 2024
  • The Colletotrichum gloeosporioides species complex includes many phytopathogenic species, causing anthracnose disease on a wide range of host plants and appearing to be globally distributed. Seventy-one Colletotrichum isolates in the complex from different plants and geographic regions in Korea were preserved in the Korean Agricultural Culture Collection (KACC). Most of them had been identified based on hosts and morphological features, this could lead to inaccurate species names. Therefore, the KACC isolates were re-identified using DNA sequence analyses of six loci, comprising internal transcribed spacer, gapdh, chs-1, his3, act, and tub2 in this study. Based on the combined phylogenetic analysis, KACC strains were assigned to 12 known species and three new species candidates. The detected species are C. siamense (n = 20), C. fructicola (n = 19), C. gloeosporioides (n = 9), C. aenigma (n = 5), C. camelliae (n = 3), C. temperatum (n = 3), C. musae (n = 2), C. theobromicola (n = 2), C. viniferum (n = 2), C. alatae (n = 1), C. jiangxiense (n = 1), and C. yulongense (n = 1). Of these, C. jiangxiense, C. temperatum, C. theobromicola and C. yulongense are unrecorded species in Korea. Host plant comparisons showed that 27 fungus-host associations are newly reported in the country. However, plant-fungus interactions need to be investigated by pathogenicity tests.

Diversity and Genotypic Structure of ECOR Collection Determined by Repetitive Extragenic Palindromic PCR Genome Fingerprinting

  • HWANG KEUM-OK;JANG HYO-MI;CHO JAE-CHANG
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권3호
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    • pp.672-677
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    • 2005
  • The standard reference collection of strains for E. coli, the ECOR collection, was analyzed by a genome-based typing method. Seventy-one ECOR strains were subjected to repetitive extragenic palindromic PCR genome fingerprinting with BOX primers (BOX-PCR). Using a similarity value of 0.8 or more after cluster analysis of BOX-PCR fingerprinting patterns to define the same genotypes, we identified 28 genotypes in the ECOR collection. Shannon's entropy-based diversity index was 3.07, and the incident-based coverage estimator indicated potentially 420 genotypes among E. coli populations. Chi-square test of goodness-of-fit showed statistically significant association between the genotypes defined by BOX-PCR fingerprinting and the groups previously defined by multi-locus enzyme electrophoresis. This study suggests that the diversification of E. coli strains in natural populations is actively ongoing, and rep-PCR fingerprinting is a convenient and reliable method to type E. coli strains for the purposes ranging from ecology to quarantine.ine.