• 제목/요약/키워드: Clustered Response Normal Data

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Variable Selection in Linear Random Effects Models for Normal Data

  • Kim, Hea-Jung
    • Journal of the Korean Statistical Society
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    • 제27권4호
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    • pp.407-420
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    • 1998
  • This paper is concerned with selecting covariates to be included in building linear random effects models designed to analyze clustered response normal data. It is based on a Bayesian approach, intended to propose and develop a procedure that uses probabilistic considerations for selecting premising subsets of covariates. The approach reformulates the linear random effects model in a hierarchical normal and point mass mixture model by introducing a set of latent variables that will be used to identify subset choices. The hierarchical model is flexible to easily accommodate sign constraints in the number of regression coefficients. Utilizing Gibbs sampler, the appropriate posterior probability of each subset of covariates is obtained. Thus, In this procedure, the most promising subset of covariates can be identified as that with highest posterior probability. The procedure is illustrated through a simulation study.

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Effects on Regression Estimates under Misspecified Generalized Linear Mixed Models for Counts Data

  • Jeong, Kwang Mo
    • 응용통계연구
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    • 제25권6호
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    • pp.1037-1047
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    • 2012
  • The generalized linear mixed model(GLMM) is widely used in fitting categorical responses of clustered data. In the numerical approximation of likelihood function the normality is assumed for the random effects distribution; subsequently, the commercial statistical packages also routinely fit GLMM under this normality assumption. We may also encounter departures from the distributional assumption on the response variable. It would be interesting to investigate the impact on the estimates of parameters under misspecification of distributions; however, there has been limited researche on these topics. We study the sensitivity or robustness of the maximum likelihood estimators(MLEs) of GLMM for counts data when the true underlying distribution is normal, gamma, exponential, and a mixture of two normal distributions. We also consider the effects on the MLEs when we fit Poisson-normal GLMM whereas the outcomes are generated from the negative binomial distribution with overdispersion. Through a small scale Monte Carlo study we check the empirical coverage probabilities of parameters and biases of MLEs of GLMM.

기계학습 기반 유전자 발현 데이터를 이용한 치주질환 예측 (Prediction for Periodontal Disease using Gene Expression Profile Data based on Machine Learning)

  • 이제근
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제23권8호
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    • pp.903-909
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    • 2019
  • 치주질환은 상당수의 성인들이 가지고 있는 질환이지만 아직 분자적인 수준에서의 발생 기작과 치료 방법에 대해서는 많은 것이 밝혀져 있지 않다. 본 연구에서는 치주질환 조직과 정상 조직에서 얻어진 유전자 발현 데이터를 이용하여 치주질환 조직과 정상 조직 사이에 분자적 차이가 있는지를 확인한다. 특히 기계학습 알고리즘을 이용하여 유전자 발현양 기반 치주질환 조직과 정상 조직의 분류가 가능한지를 확인하고, 각 조직에서 발현양 차이가 나는 유전자들이 주로 어떤 기능을 하는 것인지 살펴본다. t-SNE를 이용한 분석 결과 정상 조직과 치주질환 조직 샘플이 명확히 구분되어 군집화 될 수 있음이 확인되었다. 또한, 결정 트리, 랜덤 포레스트, 서포트 벡터 머신을 이용한 분류 알고리즘을 적용한 결과 불균형 데이터임에도 높은 정확도와 민감도, 특이도를 보였으며, 염증 반응 및 면역 반응 관련 유전자들이 주로 두 집단 간에 차이를 보임이 확인되었다.