• 제목/요약/키워드: Clinical Metadata

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CDISC Transformer: a metadata-based transformation tool for clinical trial and research data into CDISC standards

  • Park, Yu-Rang;Kim, Hye-Hyeon;Seo, Hwa-Jeong;Kim, Ju-Han
    • KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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    • 제5권10호
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    • pp.1830-1840
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    • 2011
  • CDISC (Clinical Data Interchanging Standards Consortium) standards are to support the acquisition, exchange, submission and archival of clinical trial and research data. SDTM (Study Data Tabulation Model) for Case Report Forms (CRFs) was recommended for U.S. Food and Drug Administration (FDA) regulatory submissions since 2004. Although the SDTM Implementation Guide gives a standardized and predefined collection of submission metadata 'domains' containing extensive variable collections, transforming CRFs to SDTM files for FDA submission is still a very hard and time-consuming task. For addressing this issue, we developed metadata based SDTM mapping rules. Using these mapping rules, we also developed a semi-automatic tool, named CDISC Transformer, for transforming clinical trial data to CDISC standard compliant data. The performance of CDISC Transformer with or without MDR support was evaluated using CDISC blank CRF as the 'gold standard'. Both MDR and user inquiry-supported transformation substantially improved the accuracy of our transformation rules. CDISC Transformer will greatly reduce the workloads and enhance standardized data entry and integration for clinical trial and research in various healthcare domains.

의료용 데이터 웨어하우스를 위한 메타데이터 기반의 보안 프로토타입 시스템 구현 (Implementing Metadata-based Security Prototype System for Medical Data Warehouse)

  • 김종호;김태훈;송해용;홍수희;박진두;민성우;이희석
    • 한국데이타베이스학회:학술대회논문집
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    • 한국데이타베이스학회 1999년도 국제컨퍼런스 디지털컨텐츠 활용을 통한 지식경영의 확산
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    • pp.113-118
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    • 1999
  • 본 연구는 통합병원정보시스템 (Integrated Hospital Information System) 에서 의료용 데이터 웨어하우스 (Medical Data Warehouse) 부분의 보안 프로토타입 시스템을 메타데이터 기반으로 설계하고 구현하는 데 주안점을 두었다. 특히, 의료용 데이터 웨어하우스 중에서도 임상 데이터 웨어하우스 (Clinical Data Warehouse) 에 초점을 두었으며 이에 대한 프로토타입은 ㅈ 병원에 적용되어서 개발되었다.

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지연 응답 모델에 기반한 성능 개선 진료정보 교류 프레임워크의 설계 (A Design of Clinical Information Exchange Framework for Performance Improvement based on Lazy Response Model)

  • 이세훈;심우호
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제17권9호
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    • pp.157-164
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    • 2012
  • 최근 의료서비스 환경에서 진료정보 교류는 의료의 안정성 및 질 증대, 진료업무 효율성 향상, 의료기관 운영 효율성, 환자의 편의성 증대를 가져올 수 있는 필수 의료 서비스 모델이다. 하지만 의료기관별 정보화 수준이 다양하고, 표준화된 시스템이 마련되어 있지 않으며, 기관별로 서로 상이한 정보시스템이 구축되어 있어 실질적인 진료정보 교류가 어려운 상황이다. 이 논문에서는 국내 법제도 안에서 진료정보 교류를 활성화 하기위해 관련 기술표준 및 진료정보 교류 모델에 대해 분석하였고 이중 가장 이상적인 지연 응답 모델을 기반으로 보다 나은 성능 개선을 위하여 진료정보 교류 프레임워크를 설계하였다. 성능 개선 진료정보 교류 프레임워크는 진료정보 교류 시 메타데이터 플로우와 실제 CDA 문서 플로우를 구분하여 기존 지연 응답 모델 기반 시스템과의 성능 비교 실험 결과 약 24%의 성능 향상을 얻었다.

Standard Terminology System Referenced by 3D Human Body Model

  • Choi, Byung-Kwan;Lim, Ji-Hye
    • Journal of information and communication convergence engineering
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    • 제17권2호
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    • pp.91-96
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    • 2019
  • In this study, a system to increase the expressiveness of existing standard terminology using three-dimensional (3D) data is designed. We analyze the existing medical terminology system by searching the reference literature and perform an expert group focus survey. A human body image is generated using a 3D modeling tool. Then, the anatomical position of the human body is mapped to the 3D coordinates' identification (ID) and metadata. We define the term to represent the 3D human body position in a total of 12 categories, including semantic terminology entity and semantic disorder. The Blender and 3ds Max programs are used to create the 3D model from medical imaging data. The generated 3D human body model is expressed by the ID of the coordinate type (x, y, and z axes) based on the anatomical position and mapped to the semantic entity including the meaning. We propose a system of standard terminology enabling integration and utilization of the 3D human body model, coordinates (ID), and metadata. In the future, through cooperation with the Electronic Health Record system, we will contribute to clinical research to generate higher-quality big data.

감염관리를 위한 항생제 사용량 데이터마트의 구축 (Building the Data Mart on Antibiotic Usage for Infection Control)

  • 임인수
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제48권4호
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    • pp.348-354
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    • 2016
  • 병원정보시스템에 저장되어 있는 자료들은 적절성 평가 및 질관리를 향상시키는 데 있어 많은 잠재력을 가지고 있으며 이를 기반으로 하는 데이터웨어하우스의 구축은 질 관리의 향상과 임상진료에 많은 도움을 줄 수 있는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 감염관리 정보의 체계적이고 효과적인 자료 분석을 위한 일환으로 항생제 사용량 분석이 가능한 데이터마트를 구축하였다. 감염관리의 구성요소 및 평가 척도를 선정 후 XML DTD 방법으로 메타데이터를 설계하였고 모델링을 통해 데이터마트를 구축하여 항생제 사용량 분석을 위한 다차원 분석 도구인 OLAP를 시현하였다. 실험 자료는 1997년 7월 한 달 동안의 천안 지역의 일개 대학병원의 항생제 사용량 자료를 이용하였다. 감염관리 메타데이터의 상위요소는 항생제 내성 정보, 항생제 사용량 정보, 감염 정보, 검사 정보, 환자 정보 및 감염 관련 비용으로서 구성하였다. 이 중 항생제 사용량 정보를 스타 스키마에 적용하기 위한 데이터베이스의 설계를 하여 데이터마트를 구축하였다. 그리고 일 개월 간 사용된 항생제 사용량에 대해 OLAP을 시현하였다. 본 연구는 XML과 OLAP 기술의 구현을 통해 항생제 사용량에 대한 감염관리 데이터마트를 수립하였다. 개념적이고 구조화된 데이터마트의 구축은 감염관리 정보에 대해 신속하고 다양한 분석을 제공할 것으로 사료되었다.

수술 동영상의 비식별화를 위한 개인식별정보 자동 검출 시스템 설계 및 구현 (Design and Implementation of Automated Detection System of Personal Identification Information for Surgical Video De-Identification)

  • 조영탁;안기옥
    • 융합보안논문지
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    • 제19권5호
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    • pp.75-84
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    • 2019
  • 최근 의료정보기술 분야에서 비디오는 풍부한 임상정보를 포함하는 특징으로 인하여 새로운 서비스 창출 및 연구개발을 위한 중요한 데이터로서 그 가치를 새롭게 평가받고 있다. 그러나 임상정보는 개인정보를 포함하고 있어, 생명윤리 혹은 연구 윤리에 대한 고려가 필요하다. 따라서 비디오 또한 의료영상으로서 비식별화가 요구되지만 기존 방법은 주로 정형데이터와 정지영상에 특화되어 기존의 방법을 그대로 적용하기 어려운 문제가 있다. 본 논문에서는 개인정보 비식별화 처리 시스템과의 연동을 고려하여 비디오 내에서 개인식별정보를 검출하는 자동화 시스템을 제안한다. 제안 시스템은 장면분할과 체내외 영역 검출의 전처리 후에 텍스트 및 사람검출을 통한 인덱싱과정을 수행한다. 검출된 개인식별 인덱스 정보는 비식별화를 수행하는 외부 시스템 및 시각화를 위한 메타데이터로 제공된다. 제안 시스템의 효용성을 검증하기 위하여 프로토타입을 구현하고 실제 수술비디오를 대상으로 인덱싱 속도를 측정하였다. 그 결과 입력 비디오의 재생시간 대비 2배 이상의 빠른 작업속도를 보였으며, 수술교육콘텐츠 제작 및 학술용 반자동 편집시스템의 사례를 통해 빠른 의사결정을 보조할 수 있음을 확인하였다.

최적화된 메타데이터 추출물 위한 CDA 기반의 의료영상전달시스템 설계 및 구현 (Design and Implementation of CDA Based PACS for Optimized Metadata Extraction)

  • 김선칠;조훈;곽연식;김일곤;김화선
    • 대한전기학회논문지:시스템및제어부문D
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    • 제54권5호
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    • pp.315-323
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    • 2005
  • The recent development of embodiment technology of the medical images makes most medical institutions introduce PACS in haste. However, while many older HIS and PACS systems are not yet capable of some of the integration, several new systems are moving rapidly in that direction. Typical PACS system architecture begins with the HIS since this is where the correct patient demographic information and in many cases the orders originate. So, PACS developed convenience of users and to satisfy user's demand because of financial limitations and administrator-oriented considerations in the process of development. Therefore, we have developed a CDA (Clinical Document Architecture) based PACS with HIS, by which we can search and refer to the patient's medical images and information with few restrictions of time and space for diagnosis and treatment. Target model of this research limited to 135 of hospital have 200 beds. We'll make more effort to develop the application which insures the better quality and information of medical images. Medical Image History manages the patient's image files and various medical informations like film chart in connection with time. This trial will contribute to the reduction of the financial loss caused by unnecessary devices and improve the quality in the medical services. The demand on the development of the program which refers to the medical data quickly and keeps them stable will be continued by the medical institute. This will satisfy the client's demand and improve the service to the patients in that the program will be modified from the standpoint of the users.