• 제목/요약/키워드: Chromosome number

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미꾸라지($Misgurnus$ $mizolepis$)와 미꾸리($M.$ $anguillicaudatus$) 및 유도된 종간 잡종의 세포유전학적 연구 (Cytogenetic Analysis of Reciprocal Hybrids Reveals a Robertsonian Translocation between Mud Loach ($Misgurnus$ $mizolepis$) and Cyprinid Loach ($M.$ $anguillicaudatus$))

  • 이승기;김동수
    • 한국어류학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.1-10
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    • 2012
  • 미꾸라지, 미꾸리 및 상반교배를 통해 유도된 종간 잡종의 세포유전학적 분석을 수행하였다. 미꾸라지와 미꾸리의 염색체 수는 각각 2n=48 (12M+4SM+32A), 2n=50 (10M+4SM+36A)이었고, 잡종군들의 염색체수는 각각 2n=49 (11M+4SM+34A)였다. 모든 그룹의 염색체는 동일한 arm number (NF=64)를 갖고 있었으며, 염색체 다형현상, 암수 간 이형의 염색체는 관찰되지 않았다. 적혈구의 크기, DNA 함량을 분석한 결과 잡종군들은 미꾸라지와 미꾸리의 중간 값을 나타냈다. 염색체의 NORs (nucleolar organizing regions)은 모두 동일한 중부염색체 단완부에서 Ag-positive signal이 나타났다. 이상의 결과는 미꾸라지의 1번 중부 염색체와 미꾸리의 차단부 염색체가 Robertsonian 형의 염색체 전좌 과정을 거쳤을 것을 시사한다.

Detection of copy number variation and selection signatures on the X chromosome in Chinese indigenous sheep with different types of tail

  • Zhu, Caiye;Li, Mingna;Qin, Shizhen;Zhao, Fuping;Fang, Suli
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제33권9호
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    • pp.1378-1386
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    • 2020
  • Objective: Chinese indigenous sheep breeds can be classified into the following three categories by their tail morphology: fat-tailed, fat-rumped and thin-tailed sheep. The typical sheep breeds corresponding to fat-tailed, fat-rumped, and thin-tailed sheep are large-tailed Han, Altay, and Tibetan sheep, respectively. Detection of copy number variation (CNV) and selection signatures provides information on the genetic mechanisms underlying the phenotypic differences of the different sheep types. Methods: In this study, PennCNV software and F-statistics (FST) were implemented to detect CNV and selection signatures, respectively, on the X chromosome in three Chinese indigenous sheep breeds using ovine high-density 600K single nucleotide polymorphism arrays. Results: In large-tailed Han, Altay, and Tibetan sheep, respectively, a total of six, four and 22 CNV regions (CNVRs) with lengths of 1.23, 0.93, and 7.02 Mb were identified on the X chromosome. In addition, 49, 34, and 55 candidate selection regions with respective lengths of 27.49, 16.47, and 25.42 Mb were identified in large-tailed Han, Altay, and Tibetan sheep, respectively. The bioinformatics analysis results indicated several genes in these regions were associated with fat, including dehydrogenase/reductase X-linked, calcium voltage-gated channel subunit alpha1 F, and patatin like phospholipase domain containing 4. In addition, three other genes were identified from this analysis: the family with sequence similarity 58 member A gene was associated with energy metabolism, the serine/arginine-rich protein specific kinase 3 gene was associated with skeletal muscle development, and the interleukin 2 receptor subunit gamma gene was associated with the immune system. Conclusion: The results of this study indicated CNVRs and selection regions on the X chromosome of Chinese indigenous sheep contained several genes associated with various heritable traits.

한국산 흰명아주와 근연종의 세포분류학적 연구 (Cytotaxonomical Study of the Chenopodium album and its Related Species in Korea)

  • 정영재;김무열;이병순
    • 식물분류학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.324-328
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    • 2011
  • 한국산 흰명아주(Chenopodium album var. album), 명아주(var. centrorubrum), 가는명아주(var. stenophyllum)를 대상으로 aceto-orcein에 의한 염색체 수와 모양을 조사하였고, 45S rDNA 유전자를 이용한 FISH (fluorescence in situ hybridization) 방법을 수행하여 세포유전학적 유연관계를 고찰하였다. 체세포 염색체 수는 흰명아주와 명아주는 모두 2n = 6x = 54개인 반면에 가는명아주는 2n = 4x = 36으로 뚜렷이 구별되었으며, 기본염색체수는 x = 9 개였다. 명아주속의 염색체에서 45S rDNA의 위치를 알아보기 위한 FISH 결과는 흰명아주의 경우 8개의 signal이, 가는명아주에서는 2개의 signal이 관찰되어 종간 차이를 보였으며, 모두 염색체 말단부위에서 관찰되었다. 염색체의 수와 형태, 45S rDNA를 이용한 FISH 결과는 명아주가 흰명아주에 통합되지만, 가는명아주와는 뚜렷이 구별됨을 지지해 주었다.

병렬계산의 스케쥴링에 있어서 유전자알고리즘에 관한 연구 (A study on the genetic algorithms for the scheduling of parallel computation)

  • 성기석;박지혁
    • 한국경영과학회:학술대회논문집
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    • 한국경영과학회 1997년도 추계학술대회발표논문집; 홍익대학교, 서울; 1 Nov. 1997
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    • pp.166-169
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    • 1997
  • For parallel processing, the compiler partitions a loaded program into a set of tasks and makes a schedule for the tasks that will minimize parallel processing time for the loaded program. Building an optimal schedule for a given set of partitioned tasks of a program has known to be NP-complete. In this paper we introduce a GA(Genetic Algorithm)-based scheduling method in which a chromosome consists of two parts of a string which decide the number and order of tasks on each processor. An additional computation is used for feasibility constraint in the chromosome. By granularity theory, a partitioned program is categorized into coarse-grain or fine-grain types. There exist good heuristic algorithms for coarse-grain type partitioning. We suggested another GA adaptive to the coarse-grain type partitioning. The infeasibility of chromosome is overcome by the encoding and operators. The number of processors are decided while the GA find the minimum parallel processing time.

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고초균(Bacillus) 염색체상에서 외래 유전자 Alkaline Elastase Gene의 증폭 (Multiple Chromosomal Integration of a Bacillus Ya-B Alkaline Elastase Gene)

  • 김병문;정봉현
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제23권5호
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    • pp.544-549
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    • 1995
  • The alkaline elastase is an extracellular serine protease of the alkalophilic Bacillus strain Ya-B. To increase the gene copy number and the production level of the alkaline elastase Ya-B, we designed, on the B. subtilis chromosome, a gene amplification of the 10.6 kb repeating unit containing amyE, aleE (alkaline elastase Ya-B gene) and tmrB. The aleE was inserted between amyE and tmrB, and B. subtilis APT119 strain was transformed with this amyE-aleE-tmrB-junction region fragment. As a result, we succeeded in obtaining tunicamycin-resistant (Tm$^{r}$) transformants (Tf-1, Tf-2) in which the designed gene amplification of 10.6 kb occurred in chromosome. The transformants showed high productivity of $\alpha $-amylase and alkaline elastase Ya-B. The copy number of the repeating unit (amyE-aleE-tmrB) was estimated to be 25, but plasmid vector (pUC19) was not integrated. The amplified aleE of chromosome was more stable than that of plasmid in absence of antibiotics.

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한국산 사초과 대사초절의 염색체 수 (Chromosome numbers of Carex section Siderostictae from Korea populations (Cyperaceae))

  • 정경숙;양종철;이유미
    • 식물분류학회지
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    • 제43권1호
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    • pp.22-26
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    • 2013
  • 한국산 사초과 Carex sect. Siderostictae Franch. ex Ohwi(대사초절, 3종), Carex ciliatomarginata Nakai(털대사초), C. okamotoi Ohwi(지리대사초), and C. siderosticta Hance(대사초)의 염색체 수를 2n = 12으로 밝힌다. 본 연구에서 한반도 자생 C. ciliatomarginata의 염색체 수를 최초로 보고한다. 해외의 다른 사초속 식물에서 보고된 바와 같이, 관찰된 모든 염색체에서 응축된 동원체가 관찰되지 않았으므로 크기는 다른 종들에서 관찰된 것보다는 길었다($1{\mu}m$이상). 대사초절의 종들도 모두 전부염색체(全部染色體, holocentric chromosome)를 가지며, 본 절이 tribe Cariceae Pax(사초족)에서 가장 먼저 분화된 분류군임을 감안할 때, 염색체 수가 적고(보고된 사초속 염색체 수의 변이 2n = 12 - 132) 크기가 큰 염색체가 Cariceae에서 원시적인 형질로 여겨진다. 사초속의 종 다양성에 크게 기여한 것으로 알려진 염색체 종 분화에 대한 이해를 위하여 한반도에 자생하는 사초속을 대상으로 하는 지속적인 세포학적 연구가 요구된다.

P. alba × glandulosa와 그 양친(両親)의 Pollen Mother Cell의 Meiosis에 관(關)한 연구(硏究) (Studies on Meiosis of PMC's in P. alba × glandulosa and Their Parents)

  • 정현배;전상근;김말숙;김정석
    • 한국산림과학회지
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    • 제45권1호
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    • pp.51-61
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    • 1979
  • 교배(交配) 모수(母樹)인 P. alba화분(花粉) 모수(母樹)인 P. glandulosa 및 그의 잡종(雜種)인 ${\times}$P. albaglandulosa에 관(關)한 화분모세포(花粉母細胞)의 감수분열(減數分裂)에 있어 염색체행동(染色体行動)과 대합(對合) 현상(現象)에 관(關)해 조사(調査)하였다. 1. Metaphase II에서 Earyl separation chromosome을 갖는 핵판(核板)이 가장 적은 개체(個体)는 P. glandulosa로 11.0%며 ${\times}$P. albaglandulosa는 13.0%로 가장 높았다. 2. Metaph se II에서 ${\times}$P. albaglandulosa는 11.0%의 Early separation chromosome이 출현(出現)했으나 양친양친수(兩親兩親樹)와 차이(差異)는 없었다. 3. Anahase I에서 Lagging chromosome의 출현율(出現律)은 ${\times}$P. albaglandulosa가 다소(多少) 높아 11.6%로 나타났으며 chromosome bridge에서는 양친수(兩親樹)와 거의 차(差)가 없었다. 4. Anaphase II때 Lagging chromososome은 ${\times}$P. albaglandulosa에서 다소(多少) 높은 빈도(頻度)로 10.2%였으며 chromosome bridge P. glandulosa에서 가장 높은 빈도(頻度)로 출현(出現)하였다. 5. Abnormal pollen sporad는 ${\times}$P. albaglandulosa에서 가장 많이 출현(出現)하여 8.2%를 나타냈다. 이상(以上)의 결과(結果) P. alba, P. glandulosa 및 ${\times}$P. albaglandulosa는 화분모세포분열(花粉母細胞分裂)에 있어서 염색체분열접합(染色体分裂接合)이 정상적(正常的) 행동(行動)을 하고 있어 결국(結局) 정상(正常) 화분형식(花粉形式)을 행(行)하는 수종(樹種)이라 결론(結論)할 수 있다.

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Fusarium속의 염색체에 관한 연구 (Chromosomal Study on the Genus Fusarium)

  • 민병례
    • 한국균학회지
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    • 제18권3호
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    • pp.132-136
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    • 1990
  • Fusarium속의 10균주를 PDA 배지에서 배양하고 HCI-Giemsa 염색법을 이용하여 균사내에서의 영양핵의 핵분열을 관찰하였다. 관찰한 결과는 F. moniliforme 1750과 7219는 n=8개였다. F. subglutinans 1082는 n=8개, F subglutinans 1083은 n=7개로 균주에 따라 염색체수에 차이가 있었다. F. nygamai 5668과 F. nygamai 7132는 각각 n=7, n=5개로 달랐다. F. beomiforme 9758과 9760은 두 균주 모두 n=7개였고, F. coccidicola ATCC 24138과 F. acuminatum ATCC 16560은 n=6개였다. 본 실험의 재료에서는 n=5-8개의 염색체수를 나타내고 있으나 다른 여러 종들에 대한 보고 등을 고려할 때 본 속의 기본 염색체수는 n=4개로 추정하였다.

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Efficacy of Primed In Situ Labelling in Determination of HER-2 Gene Amplification and CEN-17 Status in Breast Cancer Tissue

  • Salimi, Mahdieh;Mozdarani, Hossein;Majidzadeh-A, Keivan
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권1호
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    • pp.329-337
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    • 2012
  • Considerable attention has been given to the accuracy of HER-2 testing and the correlation between the results of different testing methods. This interest reflects the growing importance of HER-2 status in the management of patients with breast cancer. In this study the detection of HER-2 gene and centromere 17 status was evaluated using dual-colour primed in situ labelling (PRINS) in comparison with fluorescence in situ hybridization (FISH). These two methods were evaluated on a series of 27 formalin fixed paraffin embedded breast carcinoma tumours, previously tested for protein overexpression by HercepTest (grouped into Hercep 1+/0, 2+ and 3+). HER-2 gene amplification (ratio${\geq}2.2$) by PRINS was found in 3:3, 6:21 and 0:3 in IHC 3+, 2+ and 1+/0 cases, respectively. Comparing FISH and IHC (immunohistochemistry), showed the same results as for PRINS and IHC. Chromosome 17 aneusomy was found in 10 of 21 IHC 2+ cases (47.6%), of which 1 (10%) showed hypodisomy (chromosome 17 copy number per cell${\leq}1.75$), 7 (70%) showed low polysomy (chromosome 17 copy number per cell=2.26 - 3.75) and 2 (20%) showed high polysomy (chromosome 17 copy number per cell ${\geq}3.76$). The overall concordance of detection of HER-2 gene amplification by FISH and PRINS was 100% (27:27). Furthermore, both the level of HER-2 amplification and copy number of CEN17 analysis results correlated well between the two methods. In conclusion, PRINS is a reliable, reproducible technique and in our opinion can be used as an additional test to determine HER-2 status in breast tumours.