• 제목/요약/키워드: Cell network

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Endoplasmic recticulum stress와 관련된 유전자기능과 전사조절인자의 In silico 분석 (In Silico Analysis of Gene Function and Transcriptional Regulators Associated with Endoplasmic Recticulum (ER) Stress)

  • 김태민;여지영;박찬선;이문수;정명호
    • 생명과학회지
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    • 제19권8호
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    • pp.1159-1163
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    • 2009
  • ER stress에 관련된 유전자의 기능변화와 전사조절인자 분석하기 위해 ER stress를 유도한 간세포에서 expression microarray로 유전자 발현을 확보한 후 GSECA로 분석하였다. ER stress가 유도되면, ER에 주어지는 과도한 부하를 감소시키는 기능들이 증가하는 반면, ER stress가 더 증가함에 따라 ATP 생성이나 DNA repair, 더 나아가 세포분열의 기능이 감소하는 등 세포가 damage을 받음을 알 수 있었다. ER stress에 관련된 전사조절인자로는 FOX04, AP-1, FOX03, HNF4, IRF-1, GATA 등의 전사조절인자들이 ER stress에 의해 발현이 증가하는 유전자들의 promoter에 공통적으로 존재하였으며, E2F, Nrf-1, Elk-1, YY1, CREB, MTF-1, STAT-1, ATF 등의 전사인자들이 발현이 감소하는 유전자들의 promoter에서 공통적으로 존재하여, 이들의 전사인자들이 ER stress에 의한 유전자의 발현조절에 중요한 역할을 하는 전사조절인자임을 알 수 있었다.

CM1 Ligation Induces Apoptosis via Fas-FasL Interaction in Ramos Cells, but via Down-regulation of Bcl-2 and Subsequent Decrease of Mitochondrial Membrane Potential in Raji Cells

  • Lee, Young-Sun;Kim, Yeong-Seok;Kim, Dae-Jin;Hur, Dae-Young;Kang, Jae-Seung;Kim, Young-In;Hahm, Eun-Sil;Cho, Dae-Ho;Hwang, Young-Il;Lee, Wang-Jae
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제6권2호
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    • pp.59-66
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    • 2006
  • Background: CM1 (Centrocyte/-blast Marker I) defined by a mAb developed against concanavalin-A activated PBMC, is expressed specifically on a subpopulation of centroblasts and centrocytes of human germinal center (GC) B cells. Burkitt lymphoma (BL) is a tumor consisting of tumor cells with the characteristics of GC B cell. Previously we reported that CM1 ligation with anti-CM1 mAb induced apoptosis in Ramos $(IgM^{high})$ and Raji $(IgM^{low})$ cells. Methods & Results: In the present study, we observed that CM1 ligation with anti-CM1 mAb induced Fas ligand and Fas expression in Ramos cells, but not in Raji cells. Furthermore, anti-Fas blocking antibody, ZB4, blocked CM1-mediated apoptosis effectively in Ramos cells, but not in Raji cells. Increased mitochondrial membrane permeabilization, which was measured by $DiOC_6$, was observed only in Raji cells. In contrast to no significant change of Bax known as pro-apoptotic protein, anti-apoptotic protein Bcl-2 was significantly decreased in Raji cells. In addition, we observed that CM1 ligation increased release of mitochondrial cytochrome c and upregulated caspase-9 activity in Raji cells. Conclusion: These results suggest that apoptosis induced by CM1-ligation is mediated by Fas-Fas ligand interaction in Ramos cells, whereas apoptosis is mediated by down-regulation of Bcl-2 and subsequent decrease of mitochondrial membrane potential in Raji cells.

Characterization of Monoclonal Antibodies against Human Leukocyte Common Antigen (CD45)

  • Shin, Hyang-Mi;Cho, Woon-Dong;Lee, Geon-Kook;Lee, Seon-Hwa;Lee, Kyung-Mee;Ji, Gil-Yong;Yoon, Sang-Soon;Koo, Ji-Hae;Lee, Ho-Chang;Lee, Ki-Hyeong;Song, Hyung-Geun
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제11권2호
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    • pp.114-122
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    • 2011
  • Background: The leukocyte common antigen (CD45) is a transmembrane-type protein tyrosine phosphatase that has five isoforms. Methods: We generated seven murine mAbs against human CD45 by injecting cells from different origins, such as human thymocytes, PBMCs, and leukemic cell lines. By using various immunological methods including flow cytometry, immunohistochemistry, and immunoprecipitation, we evaluated the reactivity of those mAbs to CD45 of thymus as well as tonsil lysates. Furthermore, we transiently transfected COS-7 cells with each of gene constructs that express five human CD45 isoforms respectively, and examined the specificities of the mAbs against the transfected isoforms. Results: In case of thymocytes, lymphocytes, and monocytes, all the seven mAbs demonstrated positive reactivities whereas none was reactive to erythrocytes and platelets. The majority of immune cells in formalin-fixed paraffin-embedded thymus and tonsil tissues displayed strong membranous immunoreactivity, and the main antigen was detected near 220 kDa in all cases. Among the mAbs, four mAbs (AP4, DN11, SHL-1, and P6) recognized a region commonly present in all the five isoforms. One mAb, YG27, recognized four isoforms (ABC, AB, BC, and O). Two mAbs, P1 and P14, recognized the isoforms that contain exon A encoded regions (ABC and AB). Conclusion: In this study, we confirmed that AP4, DN11, SHL-1, YG27 and P6, are mAbs reactive with the CD45 antigen whereas P1 and P14 are reactive with the CD45RA antigen.

Sulfadiazine의 結晶 및 分子構造 (The Crystal and Molecular Structure of Sulfadiazine)

  • 신현소;인권식;금훈섭;구정회
    • 대한화학회지
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    • 제18권5호
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    • pp.329-340
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    • 1974
  • X-선 회절법을 이용하여 sulfadiazine, $C_{10}H_{10}N_4O_2S$, 의 결정 및 분자 구조를 규명하였다. Acetone 과 ethanol의 혼합용액으로 부터 얻은 결정은 일사축계에 속하며, 단위세포에는 4분자가 있고, 공간군은 P21/c이다. 단위세포 상수는 $a=13.71{\pm}0.04,\;b=5.84{\pm}0.03,\;c=15.11{\pm}0.05{\AA},\;{\beta}=115.0{\pm}0.3^{\circ}$이다. 결정구조는 3차원적인 와이센버그사진으로 부터 얻어진 실험치를 이용하여 패터슨합성과 프리에합성을 하고 이를 해석하여 밝혀냈다. 수소원자를 제외한 원자들의 좌표치는 최소자승법으로 정밀화 하였으며, 최종 R값은 관측된 1517개의 독립반사에 대하여 0.15이다. 벤젠고리와 피리미딘고리의 두 평면이 이루는 각은 $76^{\circ}$이고, S-N(1)결합을 중심으로 한 N(1)-C(1) 결합과 S-C(5)결합이 이루는 conformational angle은 $77^{\circ}$로서 gauche형을 하고 있다. 이미노기의 질소원자, N(1)은 대칭중심에 의하여 옮겨지는 다른 분자의 피리미딘고리의 질소원자, N(3)와 $N-H{\cdots}N$형의 수소결합을 이루고 있으며, 아미노기의 질소원자, N(4)는 b축의 거리만큼 떨어져 있는 다른분자의 산소원자, O(1) 및 O(2)와 두개의 $N-H{\cdots}O$형 수소결합을 이루고 있다. 이들 수소결합의 2차원적 그물은 (100)면에 평행한 무한한 분자층을 형성하며 인접분자층 사이에는 van der Waals의 힘에 의하여 결합되어 있다

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Characterization of Two Novel mAbs Recognizing Different Epitopes on CD43

  • Kim, Soseul;Hong, Jeong Won;Cho, Woon-Dong;Moon, Yoo Ri;Yoon, Sang Soon;Kim, Min-Young;Hong, Kwon Pyo;Lee, Yong-Moon;Yi, Jae Hyuk;Ham, Young Jun;Rah, Hyung Chul;Kim, Seung Ryul;Song, Hyung Geun
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제14권3호
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    • pp.164-170
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    • 2014
  • JL1, a specific epitope on CD43, is a potential biomarker for the diagnosis of acute leukemia. Although qualitative assays for detecting leukemia-specific CD43 exist, there is a need to develop quantitative assays for the same. Here, we developed two novel monoclonal antibodies (mAbs), 2C8 and 8E10, recognizing different epitopes on CD43. These clones are capable of pairing with YG5, another mAb against JL1 epitope, because they were selectively obtained using sandwich ELISA. Antigens recognized by 2C8 and 8E10 were confirmed as CD43 by western blotting using the CD43-hFC recombinant protein. When expression on various leukemic cell lines was investigated, 2C8 and 8E10 displayed a disparity in the distribution of the epitope. Enzyme assays revealed that these mAbs recognized a sialic acid-dependent epitope on CD43. Using normal thymus and lymph node paraffin-embedded tissues, we confirmed a difference in the epitopes recognized by the two mAbs that was predicted based on the maturity of the cells in the tissue. In summary, we developed and characterized two mAbs, 2C8 and 8E10, which can be used with YG5 in a sandwich ELISA for detecting leukemia-specific CD43.

산악지대의 일 최저기온 공간내삽모형 (A Spatial Interpolation Model for Daily Minimum Temperature over Mountainous Regions)

  • 윤진일;최재연;윤영관;정유란
    • 한국농림기상학회지
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    • 제2권4호
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    • pp.175-182
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    • 2000
  • 표준관측소의 점 단위 기온 관측 및 예보값을 농업분야에서 활용하기 위해서는 공간내삽이 필요한 경우가 많지만 기후학적 평년값 같은 장기간의 평균값 내삽과는 달리 지형효과를 반영하기 어려워 거리역산가중법이 수정 없이 사용되고 있다. 우리 나라처럼 지형이 복잡한 산악지역에서는 수평 거리에만 의존한 내삽 결과에 심각한 오류가 포함될 수 있으므로, 영농지원 정보로서 중요한 일 최저기온을 대상으로 추정오차의 최대근원인 해발고도의 영향을 보정 할 수 있는 간단한 공간내삽모형을 작성하였다. 먼저 남한 육지 상에 위치한 63개 표준관측소에서 수집된 일 최저기온자료와 관측소의 위치, 해안으로부터 거리, 경사향, 표고 등 국지기온 결정인자를 회귀분석 하여 표고에 따른 기온감율 추정식을 날짜의 함수로 표현하였다. 63개 관측점의 표고값을 공간내삽 하여 재구성한 전국의 가상 지형으로부터 1 km$\times$ 1 km 공간단위의 전국 수치고도값 편차를 계산하고, 여기에 해당 날짜의 기온감율을 적용하여 보정값을 계산한다. 기존의 거리역산가중법에 의한 기온추정값을 이 보정값에 의해 수정함으로써 최종 기온값을 얻는다. 임의로 선발된 1999년의 월별 하루씩 총 12일에 대하여 이 모형과 기존 거리역산가중법을 각기 적용하여 267개 자동기상관측지점의 일 최저기온을 추정한후 실측값과 비교하였다 오차평균, 절대오차평균, 그리고 평방근오차평균 등 세가지 추정오차를 분석한 결과 이 방법이 거리역산가중법에 비해 산악지역에서의 일 최저기온 추정에 있어 뚜렷한 개선효과를 보였다.

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시공간적으로 편중된 강우에 의한 홍수사상 수치모의 - 2017년 8월 17일 청계천 홍수사상을 대상으로 (Numerical Simulation of the Flood Event Induced Temporally and Spatially Concentrated Rainfall - On August 17, 2017, the Flood Event of Cheonggyecheon)

  • 안정환;정창삼
    • 한국방재안전학회논문집
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    • 제11권2호
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    • pp.45-52
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    • 2018
  • 본 연구는 2017년 8월 17일 청계천에서 발생한 시민고립사고의 원인을 규명하고, 고밀도 기상관측망의 관측자료를 이용하여 안전한 도시하천 관리 방안을 제시한 연구이다. SK 텔레콤 기지국에 설치된 고밀도 기상관측망인 SK techx와 상대적으로 공간적 밀도가 낮은 기상청 AWS의 사고 당일 강우자료를 도시유출모형에 적용하여 당시 상황을 모의하였다. 사고원인 중 하나로 가정한 CSO 관로 내 체수현상을 구현하여 수치모의한 결과, 기상청 AWS에서 계측된 강우량은 사고를 발생시키지 않았다. 하지만 실제 현상과 더 유사한 고밀도 기상관측망인 SK techx의 강우자료를 적용했을 때는 당일 발생한 사고와 유사한 결과가 나타났다. 이는 낮은 공간 밀도인 기상청 AWS는 청계천에서 일어나는 실제현상을 예측할 수 없고, 안전한 하천관리르 위해 고밀도 기상관측소가 필요하다는 것을 의미한다. 또한 CSO 관로 내 체수 유무를 독립변수로 수치 모의한 결과 비우당교의 CSO 관로 내 체수가 사고의 직접적인 원인으로 분석되었다.

산악 조난자의 위치추정을 위한 이동성 모델 및 조난 시뮬레이터 (Hiker Mobility Model and Mountain Distress Simulator for Location Estimation of Mountain Distress Victim)

  • 김한솔;조용규;조창혁
    • 한국시뮬레이션학회논문지
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    • 제31권3호
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    • pp.55-61
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    • 2022
  • 현재 경찰과 소방이 범죄신고, 긴급출동과 같은 구조 상황발생 시 통화권영역 내에서는 이동통신 사업자가 구축한 네트워크,와이파이,GPS기반의 긴급 구조용 측위시스템을 활용하여 요구조자의 단말과 직접 연동하여 예상위치를 정밀 측위를 하고 있다. 그러나 산악구조의 경우 조난자가 산악지형의 음영지역에 위치하거나 단말의 방전(power off) 시에는 단말과 직접 연동하여 정밀 측위가 불가능하며 마지막 접속 기지국 정보만을 받고 있어 수색의 위치를 한정할 수 없으므로 구조 골든타임 확보가 어려운 상황이다. 본 논문에서는 개선방안으로 시계열 기지국 정보, 위치정보 및 조난자의 성별, 나이, 행동적 특성을 반영한 이동성 모델과 지능형 추론을 기반으로 하는 전파분석 및 위치추정 시뮬레이션과 같은 이동통신 포렌식 기술을 통해 조난자의 예상 위치정보의 확률에 따른 히트맵 방식의 시각화를 통해 위치정보의 정확성을 높여 소방, 수색대의 수색지역을 축소하여 신속하고 정확한 인명구조에 기여할 수 있기를 기대한다.

Fe3O4 magnetic nanoparticles provide a novel alternative strategy for Staphylococcus aureus bone infection

  • Youliang, Ren;Jin, Yang;Jinghui, Zhang;Xiao, Yang;Lei, Shi;Dajing, Guo;Yuanyi, Zheng;Haitao, Ran;Zhongliang, Deng;Lei, Chu
    • Advances in nano research
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    • 제13권6호
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    • pp.575-585
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    • 2022
  • Due to its biofilm formation and colonization of the osteocyte-lacuno canalicular network (OLCN), Staphylococcus aureus (S.aureus) implant-associated bone infection (SIABI) is difficult to cure thoroughly, and may occur recurrently subsequently after a long period dormant. It is essential to explore an alternative therapeutic strategy that can eradicate the pathogens in the infected foci. To address this, the polymethylmethacrylate (PMMA) bone cement and Fe3O4 nanoparticles compound cylinder were developed as implants based on their size and mechanical properties for the alternative magnetic field (AMF) induced thermal ablation, The PMMA mixed with optimized 2% Fe3O4 nanoparticles showed an excellent antibacterial efficacy in vitro. It was evaluated by the CFU, CT scan and histopathological staining on a rabbit 1-stage transtibial screw model. The results showed that on week 7, the CFU of infected soft tissue and implants, and the white blood cells (WBCs) of the PMMA+2% Fe3O4+AMF group decreased significantly from their controls (p<0.05). PMMA+2% Fe3O4+AMF group did not observe bone resorption, periosteal reaction, and infectious reactive bone formation by CT images. Further histopathological H&E and Gram Staining confirmed there was no obvious inflammatory cell infiltration, neither pathogens residue nor noticeably burn damage around the infected screw channel in the PMMA+2% Fe3O4+AMF group. Further investigation of nanoparticle distributions in bone marrow medullary and vital organs of heart, liver, spleen, lung, and kidney. There were no significantly extra Fe3O4 nanoparticles were observed in the medullary cavity and all vital organs either. In the current study, PMMA+2% Fe3O4+AMF shows promising therapeutic potential for SIABI by providing excellent mechanical support, and promising efficacy of eradicating the residual pathogenic bacteria in bone infected lesions.

소 미성숙난자의 체외성숙과 배발생에 황체의 형태가 미치는 영향 (Effect of Luteal Morphology of Donors on the Maturation and Subsequent Development in Vitro of Bovine Immature Oocytes)

  • Kim, B. K.
    • 한국가축번식학회지
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    • 제24권4호
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    • pp.375-383
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    • 2000
  • 본 연구는 공여난소의 황체 형태가 소 미성숙난자의 체외 성숙과 발생에 미치는 영향을 감수분열과 수정란 생산을 비교하여 조사하였다. 공여난소를 황체의 형태에 따라 다음과 같이 4 group 으로 분류하였다. Group 1 ; 최근에 배란한 흔적으로 보이는 혈포가 있는 난소. Group 2 ; 황체는 적색 또는 갈색이며, 혈관이 황체의 가장자리에 국한되어 분포하고 있는 난소. Group 3 ; 황체는 오렌지 또는 황갈색이며, 혈관이 황체의 정상부 까지 분포한 난소. Group 4 ; 황체는 잃은 황색 또는 백색이며, 황체 정상부의 혈관분포가 사라진 난소. 미성숙난자의 체외성숙과 배발생을 위하여 각각 TCM 199과 TLP-PVA을 기본배지로 사용하였다. 각 group에서 채취한 미성숙 난자를 4, 14, 24시간 체외성숙시켰을 때 metaphase I과 metaphase II에 도달한 난자의 비율은 각 group 사이에 차이가 없었으며, 각 group 에서 metaphaseII난자는 체외성숙 후 14시간에 나타나기 시작하여 24시간에 성숙이 종료하였다. 체외 배발생 후 2세포기와 8세포기까지의 발생에는 공여난소 황체의 형태가 영향을 미치지 않았으나, 상실배와 배반포로 발생한 수정란의 비율은 group 1과 3에서 채취한 난자에서 group 2와 4에서 채란한 난자에 비하여 유의적으로 증가하였다 (p<0.05). 이러한 결과는 공여난소의 번식상태가 체외 수정란생산에 유의적인 영향을 미치는 것으로 암시하고 있다.

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