• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 2020년도 추계국제학술대회
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• pp.47-47
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• 2020

In this study, we aimed to study carnation italian ringspot virus (CIRV) in Erigeron annuus (L.) Pers. in Bonghwa County, Korea. The collected samples showed mosaic and malformation symptoms. To identify the virus species, we performed high-throughput sequencing, reverse transcription polymerase chain reaction, and cloning. The virus was confirmed to be an unreported species, and therefore we performed genome sequencing of the samples. The complete genome was 4,746 nucleotides in length. The CIRV contained five open reading frames (ORFs), and it showed the typical features of members of the genus Tombusvirus. Phylogenetic analyses revealed that ClRV isolates had the highest nucleotide identities with the CZ isolate (95.89%) from Korea. In recent years, these viruses have sporadically been reported in floral scent and medicinal plants. This research found the first natural host infected with CIRV, and provides baseline information to determine the correlation between weeds and crops.

• 식물병연구
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• 제19권1호
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• pp.36-44
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• 2013

카네이션은 세계 3대 절화용 화훼작물의 하나로, 농가 생산액 210억 원에 이르는 주요작물이다. 이들은 절화, 종자, 묘 및 삽수의 4 품목으로 수출입 되고 있다. 카네이션과 같은 영양번식성 작물의 경우, 증식하는 과정 중에 바이러스의 확산과 전파가 용이한데, 우리나라에서는 카네이션괴저바이러스(CNFV)와 카네이션둥근반점바이러스(CRSV)를 식물검역 바이러스로 지정하여 수입검사를 수행하고 있다. 본 연구에서는 CNFV와 CRSV를 신속, 정밀하고 쉽게 진단할 수 있는 특이적인 프라이머를 고안하였으며, 높은 검출 감도를 가지는 nested 프라이머 조합을 개발하였다. CNFV를 검사하기 위해 최종 선발된 특이적인 프라이머는 2 세트로 288과 447 bp를, CRSV를 검사하기 위해 최종 선발된 특이적인 프라이머는 2 세트로 503과 549 bp를 증폭하였다. CNFV의 nested는 2 세트 모두 147 bp로 동일하며, CRSV는 각각 395와 347 bp의 밴드를 증폭하였다. 또한, 실험의 신뢰도를 높이기 위하여, 증폭산물에 염기서열 6개를 삽입한 플라스미드를 제작하여 양성대조구로 활용하였다. 본 연구에서 개발한 방법은, 향후 CNFV와 CRSV에 대한 신속, 정밀한 국경검역을 지원할 수 있을 것이라고 기대된다.