• 제목/요약/키워드: Bgl II

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Comparison in Restriction Profile Analysis of Vibrio furnissi, Vibrio fluvialis, and Vibrio parahaemolyicus Bacteriophage from Sea Product

  • Younghee Kim
    • 한국환경과학회지
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    • 제1권2호
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    • pp.99-103
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    • 1992
  • The bacteriophages lytic for Vibrio furnissi, Vibrio furniulis and Vibrio parahemolyticus were isolated from fish gills and shellfish. Nucleic acid of bacteriophage was prepared and restriction endonuclease profile was compared. All isolates contained deoxyribonucleic acid. V. fumissi bacteriophage from fish gills showed 2 bands with Bgl II, 1 with Pst, 3 with Hind III, 1 with Bm HI and 2 with EcoR I. V Puuialis phage represented 7 fragments with Bgl II, 1 with Pst, 4 with Hind III, and 2 with EcoR I. V parhemolyticn produced 13 sites with Hind III and 4 sites with EcoR I. The fragment types were varied depending on the phage isolation. All three phages were digested with Hind III and EcoR I with different sizes. V furnissi phage were digested with 5 different restriction enzymes. Key words: Bacteriophage, Vibrio furnissi, Vibrio fluvialis, Vibrio pnrahemolyticus, Deoxyribonucleic acid, Pst, Bam HI, Hind III, EcoR I, Bgl II.

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Comparison in Restriction Profile Analysis of Vibrio furnissi, Vibrio fluvialis, and Vibrio parahaemolyticus Bacteriophage from Sea Product

  • Kim, Young-Hee
    • Environmental Sciences Bulletin of The Korean Environmental Sciences Society
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    • 제1권2호
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    • pp.99-103
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    • 1997
  • The bacteriophages lytic for Vibrio furnissi, Vibrio fluvialis and Vibrio parahaemolyticus were isolated from fish gills and shellfish. Nucleic acid of bacteriophages was prepared and restriction endonuclease profile was compared. All isolates contained deoxyribonucleic acid. V. furnissi bacteriophage from fish gills showed 2 bands with Bgl II, 1 with Pst, 3 with Hind III, I with Bam HI and 2 with EcoR 1. V fluvialis phage represented 7 fragments with Bgl II, 1 with Pst, 4 with Hind III, and 2 with EcoR 1. V. parahamolyticus produced 13 sites with Hind III and 4 sites with EcoR 1. The fragment types were varied depending on the phage isolation. All three phages were digested with Hind III and EcoR I with different sizes. V. furnissi phage were digested with 5 different restriction enzymes.

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Bacillus subtilis LYH201균주의 섬유소 분해효소의 유전자 Cloning 및 특성분석 (Gene Cloning of Cellulose Degradation Enzyme of Bacillus subtilis LYH201 Strain)

  • 이영한;박상렬
    • 한국토양비료학회지
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    • 제34권5호
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    • pp.333-341
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    • 2001
  • 퇴비화 촉진 미생물인 Bacillus subtilis LYH201균주가 분비하는 섬유소 분해효소를 분자생물학적으로 연구한 결과는 다음과 같다. 섬유소를 분해하는 유전자는 유전자은행에 의해 구한 약 5,000개의 clone 중 CMC 배지 상에서 활성을 가지는 clone을 선발하여 bglC(pLYH7-39)로 명명하였다. 섬유소를 분해하는 bglC 유전자는 Pvu II, EcoRI, SspI의 제한효소 site를 가지고 있었으며, BglC는 Clostridium acetobutylicum GUN_CLOAB(P15704)와 57%의 identity와 71%의 homology를 나타내어 상동성이 가장 높았으며, CMC-SDS-PAGE 분석으로 56 kDa의 분자량을 나타냈고, 온도는 $50^{\circ}C$, pH는 7에서 활성이 가장 높았다.

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Saccharomyces cerevisiae에서 RNA1 유전자의 클로닝 (Cloning of RNA1 Gene from Saccharomyces cerevisiae)

  • 송영환;고상석;이영석;강현삼
    • 미생물학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.77-84
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    • 1989
  • Saccharomyces cerevisiae의 RNAI 유전자의 온도 감수성 돌연변이 균주는 성장허용 온도인 23"C에서는 정상적인 성"J--을하나, 성 장억제 온도인 36°C에서는 tRNA, rRNA 그러고 mRNA 의 선우울질을을 핵내에 축적함으후써 성장을 못한다. 본 실 험에서는 complementation 에 의하여 RNAI 유전자를 클로녕하였으며 concomitant loss 실험에 의하여 이 유천자의 클로닝 을 확인하였다. 유전자의 위치를 확인한 결과 3.5kb의 Bgl II 조각내에 RNAI 유전자가 존재함을 알 수 있였으며, 2.1kb에 해당하는 BamH I -Bgl II 조각에서는 RNAI 유전지에 의한 complementation 능력이 상실되는 것으후 보아 RNAI 유전자 는 3.5kb의 BglIl 조각내에 포함되는 BamH 1 자리 주위에 결쳐 있픔을 알 수 있었다.

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Relationship between Genetic Variants of Mitochondrial DNA and Growth Traits in Hanwoo Cattle

  • Jeon, G.J.;Chung, H.Y.;Choi, J.G.;Lee, M.S.;Lee, C.W.;Park, J.J.;Ha, J.M.;Lee, H.K.;Sung, H.H.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제18권3호
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    • pp.301-307
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    • 2005
  • Genetic variants of Hanwoo mtDNA in the region of cytochrome oxidase subunit I, II and III complex were detected using restriction enzymes. PCR primers were designed based on the bovine mtDNA sequence, and 6 primer sets (Mt4, Mt5, Mt6, Mt7, Mt8 and Mt9) were used. A total of 20 restriction enzymes were used, and 6 restriction enzymes, which were Hinf I, Pvu II, Rsa I, Eco RI, Bgl II, and Msp I, showed genetic polymorphisms. Significant associations between genetic variants and weight traits were observed at WT15 (p<0.05) and WT18 (p<0.01) with Pvu II for Mt9, Bgl II for Mt6 and Rsa I for Mt8 segments in the region of cytochrome oxidase subunit complex. Significant associations were also observed at Mt9-Pvu II and Mt6-Bgl II segments for WT9 (p=0.01), WT12 (p=0.02), respectively. These results suggest that genetic variants of mtDNA in the region of cytochrome oxidase subunit complex may be candidate segments for improvement of animal growth as weight traits.

황색포도상구균에서 테트라사이클린 내성을 나타내는 플라스미드의 동정 (Characterization of Tetracycline Resistant Plasmid in Staphylococcus aureus by Restriction Enzyme Mapping)

  • 김기현;김종명;문경호
    • 약학회지
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    • 제36권3호
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    • pp.255-258
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    • 1992
  • The clinical isolate Staphylococcus aureus SA8 was resistant to tetracycline(Tc) and harboured a plasmid pKH1(24.82 kb). pKH1 was shown by curing and by transformation to specify resistance to Tc. The cleavage map of a pKH1 was determined by restricction enzyme mapping techniques. Cleavage map is given for BglII, EcoRI, HpaII, PvuII and SalI. Restriction endonuclease BamHI, BglI, BstEII, HpaI, PstI, and XhoI have no sites on this plasmid. HaeIII, XbaI, and HindIII have 5, 6, 14 sites, respectively.

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Bacillus thuringiensis serovar israelensis 4Q1로부터 분리된 plasmid 제한효소지도 작성 (Restriction endonuclease maps of three plasmids from bacillus thuringiensis serovar israelensis 4Q1)

  • ;이영근;강석권
    • 미생물학회지
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    • 제23권2호
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    • pp.122-128
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    • 1985
  • Bacillus thuringiensis serovar israelensis 4Q1 contains 8 different covalently closed-circular (CCC) plasmids of molecular weight 204, 267, 109, 103, 16, 7.6, 6.4, and 5.0kb. The three smallest plasmids, designated pBti6, and pBti8 may prove to be useful as cloning vectors because of thier size and ease of isolation. The three plasmids were incubated separately with 9 different restriction enzymes and 7 of the enzymes tested cleaved one or more of the plasmids. Plasmid pBti6 has a single site for Bg1 II, Pst I and Pvu II, two sites for Bc1 I and Eco RI, and five sites for Hind III. Plasmid pBti7 has a single site for Bam HI and Pst I, two sites for Hind III, and three sites for PvuII. Plasmic pBti8 has a single site for Bam HI, BelI and Hind III, two sites for Eco RI, and three sites for Bgl II and Pvu II. Composite restriction enzyme maps for pBti6, pBti7 and pBti8 were constructed. The sites of restriction enzyme cleavage were determined by single, double and partial digests of the plasmid DNA. All the restriction sites were aligned relative to the single Bgl II(pBti6), Pst I(pBti7) or Hind III(pBti8) site, respectively.

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Cloning된 효모의 RNAI 유전자의 특성에 관하여 (Characterization of the cloned RNA1 gene of Saccharomyces cerevisiae)

  • 송영환;김대영;김진경
    • 한국어병학회지
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    • 제6권2호
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    • pp.93-101
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    • 1993
  • 효모의 RNAI유전자는 RNA processing에 관여 하는지 혹은 RNA transport에 관여 하는지 아직까지 유전자의 기능이 정확히 알려져 있지 않은 실정이다. 효모의 RNAI 유전자의 기능을 파악하기 위한 방법으로 본 연구에서는 rna1-1 mutant gene을 cloning하여 이에 대한 DNA sequence를 조사함으로써 RNAI 유전자와 rna1-1 유전자의 차이점을 이해하고자 하였다. rna1-1 marker를 갖는 yeast strain(R49)로 부터 genomic DNA를 추출하여 이를 BglII로 절단하여 genomic southern blotting을 행한 결과 wild type의 경우와 동일하게 3.4 kb에서 hybridization되는 signal을 얻었으며, RNAl 및 rna1-1이 yeast genome내에 single site로 존재함을 보여 주는 결과를 얻었다. mutant strain으로 부터 얻은 3.4 kb의 BglI fragment를 pUC19의 BamHI site에 subcloning하여 transformant들을 얻었고, wild type RNAl 유전자를 probe로 하여 rna1-1 mutant 유전자를 cloning할 수 있었다. pUC19에 cloning된 RNA1유전자 및 rna1-1유전자로부터 다양한 Ba131유도체를 얻어 이들에 대한 염기 서열을 비교한 결과 transcription initation site에서부터 down stream쪽으로 17 아미노산위치에 TCC가 TTC로 대치되어 있었으며 그 결과 serine이 phenylalanine으로 변환되는 결과를 얻었다. Wild type RNAI gene의 5'-region에는 3군데의 TATA-like sequence가 true TATA box인지 확인하기 위하여 Bal3I deletion에 의해 -103nt까지 deletion된 유도체를 얻었으며 ${\Delta}RNAI$, rna1-1, 81-2-6 clone이 rna1-1 allele와 complementation한지 확인하였으나 ${\Delta}RNAI$은 TS-complementation을 하지 못하였다. 따라서 현재까지 TATA-box라고 알려진 부분은 promoter로 작용하지 못함을 확인하였다.

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Transposon Tn5에 의한 Bacillus thuringiensis 독소단백질 유전자의 Pseudomonas 내로의 도입 및 발현 (Integration and Expression of BaciZlus thun'ngiensis Crystal Protein Gene in Chromosomal DNA of Pseudomonas Strains Using Transposon Tn5)

  • 신병식;구본탁;박승환;김정일
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제19권1호
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    • pp.25-30
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    • 1991
  • 국내농작물의 근부토양으로 분리한 Pseudomonas의 염색체 DNA에 Tn5를 사용하여 Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki HD73의 독소유전자(cp)를 도입하였다. Tn5의 중심부위에 있는 BamHI위치 (Tn5-cp)와 BglII 위치 (IS5OL-cp)에 각각 독소유 전자를 도입하였으며 두 종류의 Pseudomonas 균주에는 Tn5-cp로써 그리고 다른 세 종류의 Pseudomonase 균주에는 IS5OL-cp로써 transposition하였다. 면역학적 방법과 흰불나방 애벌레에 대한 살충성 검정으로서 독소유전자의 도입과 발현을 확인하였다.

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황어아과어류 2속 5종의 mtDNA분석 (mtDNA Analysis of 5 Species of the genera Moroco and Phoxinus(Pisces, Leuciscinae))

  • 민미숙;김영진양서영
    • 한국동물학회지
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    • 제38권1호
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    • pp.87-95
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    • 1995
  • 한국산 담수어류의 잉어목, 황어아과(Leuciscinae) 어류 2속 5종의 계통적 유연관계를 구명하기 위하여 mtDNA분석을 실시하였다 6 base를 인지하는 10개의 제한효소를 처리하여 얻어진 강tDNA의 크기는 16.5-17.5 Kb였으며 Bcl I, Bgl I, Bgl II, Hin dIII, Pvu II, Xba I 등은 종간 차이가 뚜렷하였다. 각종의 집단간 mtDNA분화정도는 매우 낮았으나(p=1% 미만) M. oxyephalus의 무주집단과 제주집단은 예리적으로 큰 차이를 보였다(p=5.3%) Moroco속의 종간 분화정도를 비교한 결과 M. oxycephafus와 M. lagowsk서 사이가 평균 f=7.2%로 근면관계가 제일 가까웠고 M. keumkang과 M. semotilus는 타종들과 근연관계가 제일 멀었다. Moroco속과 Phoxinus속간의 평균 유전적 분화정도는 f=13.7%로 현저한 차이를 보였다. Brown 등(1979)의 공식을 이용하여 이들 황어아과 2속 5종의 분화시기를 추정한 결과 이들은 후기 선신세(Pliocene)와 흥적세(Pleistocene) 사이에 분화된 것으로 추정되었으며 이 결과는 동위효소 연구에서 얻어진 결파(Yang and Min, 1989)와 잘 일치한다.

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