• 한국균학회지
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• 제43권1호
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• pp.71-76
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• 2015

수생식물 샘플은 낙동강과 금호강이 만나는 달성습지에서 자라풀을 채집하였다. 자라풀의 뿌리에서 내생균류를 분리하고 형태가 다른 균주를 관찰하여 최종적으로 16개 균주를 선발하였다. 내생균류의 배양여과액은 식물생장촉진활성 검정을 위하여 난장이벼에 처리하여 스크리닝하였으며, HD1008 균주가 식물생장촉진활성이 가장 높은 것으로 확인되었다. HD1008 균주의 배양여과액을 HPLC와 GC/MS-SIM을 이용하여 분석하였고, HD1008 균주가 식물호르몬인 지베렐린 $GA_1$ (1.2 ng/100 mL)과 $GA_4$ (5 ng/100 mL) 를 생산하는 것을 정량분석을 통하여 확인하였다. 또한, HD1008균주의 beta-tubulin 유전자 염기서열을 이용하여 동정에 이용하였으며, 분자적인 방법과 형태적인 방법으로 관찰하였을 때, 지베렐린을 생산하는 새로운 P. trzebinskii로 동정되었다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제33권2호
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• pp.140-147
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• 2017

Fusarium wilts of strawberry, caused by Fusarium oxysporum f. sp. fragariae, is a serious soil-borne disease. Fusarium wilt causes dramatic yield losses in commercial strawberry production and it is a very stubborn disease to control. Reliable chemical control of strawberry Fusarium wilt disease is not yet available. Moreover, other well-known F. oxysporum have different genetic information from F. oxysporum f. sp. fragariae. This analysis investigates the genetic diversity of strawberry Fusairum wilt pathogen. In total, 110 pathogens were isolated from three major strawberry production regions, namely Sukok, Hadong, Sancheong in Gyeongnam province in South Korea. The isolates were confirmed using F. oxysporum f. sp. fragariae species-specific primer sets. Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analyses were executed using the internal transcribed spacer, intergenic spacer, translation elongation factor1-${\alpha}$, and ${\beta}$-tubulin genes of the pathogens and four restriction enzymes: AluI, HhaI, HinP1I and HpyCH4V. Regarding results, there were diverse patterns in the three gene regions except for the ${\beta}$-tubulin gene region. Correlation analysis of strawberry cultivation region, cultivation method, variety, and phenotype of isolated pathogen, confirmed that genetic diversity depended on the classification of the cultivated region.

• The Plant Pathology Journal
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• 제26권1호
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• pp.49-56
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• 2010

Thirty-six isolates of Colletotrichum spp. were obtained from infected grapes in two different locations of Korea; 18 isolates from Cheonahn, where carbendazim (MBC) and the mixture of MBC and diethofencarb (NPC) had been applied to control grape ripe rot, and 18 isolates from Cheongju, where no fungicides had been used. Sequences analysis of the internal transcribed spacer (ITS) and the $\beta$-tubulin gene identified 34 of the 36 isolates as Colletotrichum gloeosporioides. The remaining two isolates from Cheongju were identified as C. acutatum. Of the 18 isolates from Cheonahn, 12 were resistant to both MBC and the mixture (MBC+NPC), and six were sensitive to them. All C. gloeosporioides isolates from Cheongju, but not the two C. acutatum isolates, were sensitive to these fungicides. Sequence analysis of the $\beta$-tubulin gene in all isolates revealed that C. gloeosporioides resistant to MBC and MBC+NPC had a tyrosine instead of phenylalanine at the amino acid position 200. The appearance of resistance to MBC and the mixture in C. gloeosporioides correlated with the history of fungicide application in Korea.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제51권1호
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• pp.1-6
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• 2008

Estrogens, a group of steroid compounds functioning as the primary female sex hormone, play an important role in the development and progression of breast cancer. In this study, using a novel annealing control primer-based GeneFishing PCR technology, five differentially expressed genes (DEGs), expressed using 10nM mitogenic estrogens, $17{\beta}$-estradiol (E2) and $16{\alpha}$-hydroxyestrone ($16{\alpha}$-OHE1), were selected from the estrogen receptor (ER)-positive MCF-7 human breast cancer cells. The DEGs, MRPL42, TUBA1B, SSBP1, KNCT2, and RUVBL1, were identified by comparison with the known genes via direct sequencing and sequence homology search in BLAST. Quantitative real-time PCR data showed that two DEGs, tubulin ${\alpha}1b$ and kinetochore associated 2, were greater than 2-fold upregulated by E2 or $16{\alpha}$-OHE1. Both genes could be new biomarkers for the treatment and prognosis of cancers, and further study may provide insights into the molecular mechanisms underlying development and progression of breast cancer.

• 한국균학회지
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• 제45권4호
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• pp.292-303
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• 2017

2016년 버섯 재배사 내 실내공기, 식물병반(동백나무의 잎, 줄딸기, 은방울꽃, 생강나무), 버섯 배양배지 재료, 오염된 가구 등에서 진균을 분리 동정하였다. 동정된 진균 중 18종이 국내 미기록임을 확인하였다. 동정된 진균은 버섯 재배사 내 실내공기에서 6종, 식물병반에서 6종, 버섯 배양배지 재료에서 5종, 오염된 가구에서 1종이 각각 분리되었다 이들 동정된 균주에 대한 형태학적 특성과 ITS rDNA, 18S rDNA, 28S rDNA, calmodulin gene, translation elongation factor gene, ${\beta}-tubulin$ gene 등의 염기서열에 기반한 분자계통학적 관계에 대하여 기술하였다.

• 한국균학회지
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• 제45권4호
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• pp.345-354
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• 2017

본 연구에서는 소나무(Pinus densiflora)와 아로니아(Aronia melanocarpa)의 잎을 채취하여 표면살균한 후 내생균을 분리하였다. 분리한 균주는 형태적 특징과 internal transcribed spacer (ITS) rDNA 지역과 28S rDNA 지역 그리고 ${\beta}-tubulin$ 유전자의 염기서열을 이용하여 계통분석을 통해 동정하였다. 소나무에서 분리한 두 종의 균주인 Pestalotia lawsoniae와 Zasmidium fructicola, 그리고 아로니아에서 분리한 세 종의 균주인 Pestalotiopsis chamaeropis, Pestalotiopsis jesteri, Stagonosporopsis cucurbitacearum는 국내 미기록 진균으로 보고하고자 한다.

• Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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• 제40권4호
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• pp.173-180
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• 2014

Objectives: The purpose of this study was to investigate the neurogenic differentiation of human dental pulp stem cells (DPSCs), periodontal ligament stem cells (PDLSCs), and stem cells from apical papilla (SCAP). Materials and Methods: After induction of neurogenic differentiation using commercial differentiation medium, expression levels of neural markers, microtubule-associated protein 2 (MAP2), class III ${\beta}$-tubulin, and glial fibrillary acidic protein (GFAP) were identified using reverse transcriptase polymerase chain reaction (PCR), real-time PCR, and immunocytochemistry. Results: The induced cells showed neuron-like morphologies, similar to axons, dendrites, and perikaryons, which are composed of neurons in DPSCs, PDLSCs, and SCAP. The mRNA levels of neuronal markers tended to increase in differentiated cells. The expression of MAP2 and ${\beta}$-tubulin III also increased at the protein level in differentiation groups, even though GFAP was not detected via immunocytochemistry. Conclusion: Human dental stem cells including DPSCs, PDLSCs, and SCAP may have neurogenic differentiation capability in vitro. The presented data support the use of human dental stem cells as a possible alternative source of stem cells for therapeutic utility in the treatment of neurological diseases.

• 식물병연구
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• 제22권1호
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• pp.44-49
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• 2016

2015년 6월에 경북 문경시에서 재배하는 오미자에서 줄기마름증상이 발생하였다. 발병 초기에는 잎의 선단 부위부터 위축되면서 고사현상이 발생하였고, 병이 진행됨에 따라 줄기를 거쳐 식물체 전체가 고사하였으며 주변으로 전염되었다. 감염된 줄기에서 병원균을 분리배양하여 배양적, 형태적 특징을 관찰한 결과 해당 병원균은 Botryosphaeria속에 속하는 것으로 나타났으며, 인공접종에 의한 병원성 검정에서도 동일한 병징을 나타내었다. 병원균의 정확한 동정을 위해 ITS 영역과 ${\beta}$-tubulin, EF1-${\alpha}$ 유전자의 염기서열을 복합적으로 사용한 염기서열 분석을 수행하였으며, 분석 결과 오미자의 줄기마름 증상을 일으키는 원인균은 B. dothidea로 동정되었다. 지금까지 국내에서 B. dothidea에 의한 오미자의 병이 보고되지 않았기에 본 연구를 통해 국내 처음으로 B. dothidea에 의한 오미자 줄기마름병을 보고한다.

• 한국균학회지
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• 제41권2호
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• pp.132-135
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• 2013

검은 Aspergillus 속균은 동양의 발효산업에서 매우 중요한 곰팡이로서 식품산업에 관련된 검은 Aspergillus를 흑국균이라고 한다. 흑국균은 A. luchuensis, A. niger, A. tubingensis로 구성이 되어 있는데 이 중에서 A. luchuensis는 동양의 발효산업에서 매우 중요한 곰팡이로 알려져 있다. 우리나라 전통 된장과 간장의 주요 원료가 되는 메주에서도 검은 Aspergillus가 흔히 발견되었다. 33균주의 검은 Aspergillus가 2008년부터 2011년 사이에 전국적으로 수집한 98개의 완성메주로부터 분리되었고 추가로, 발효과정에 있는 메주로부터 검은 Aspergillus 21균주를 분리하였다. ${\beta}$-tubulin과 calmodulin 유전자 염기서열 분석을 통하여 이들을 동정한 결과 이들은 A. niger 21균주, A. luchuensis 14균주, A. tubingensis 10균주, A. welwitschiae 9균주로 동정되었다. 이 중 A. luchuensis는 생장이 활발하고 단백질, 지방, 탄수화물 분해력이 높은 것으로 조사되어 이들의 산업적 응용에 대한 추가의 연구가 필요한 것으로 사료된다.

• 한국균학회지
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• 제44권4호
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• pp.252-258
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• 2016

본 연구는 제주도 사려니숲과 동백동산에서 편백나무(Chamaecyparis obtusa), 삼나무(Cryptomeria japonica), 비자나무(Torreya nucifera), 꽝꽝나무(Ilex crenata), 동백나무(Camellia japonica) 등 5종의 목본 식물의 잎에서 내생균을 분리하고, 형태 및 분자생물학적 특징 통해 동정하였다. 이를 위해 primer인 ITS1F와 ITS4를 이용하여 internal transcribed spacer (ITS) rDNA영역과 primer LR0R과 LR16을 이용하여 large subunit rDNA 영역을 그리고 primer Bt2a과 Bt2b를 이용하여 ${\beta}$-tubulin 영역의 염기서열을 동시에 분석하였다. 그 결과 Mycosphaerella aleuritidis, Neofusicoccum eucalyptorum, Neofusicoccum parvum, Phyllosticta citrichinensis, Phyllosticta cryptomeriae, Phomopsis cotoneastri, Sphaerulina rhododendricola, Guignardia mangiferae, Lophodermium jiangnanense, Lophodermium minus 등 10종의 미기록 내생균을 동정하였고, 이를 보고하고자 한다.