We have collected eight high-level streptomycin-resistant strains of Pseudomonas marginalis and P. syringae pv. actinidiae which were isolated from kiwifruit orchards in Korea and Japan, The molecular mechanisms of resistance were investigated by the PCR, susceptibility tests, and nucleotide sequence analysis. Of the eight high-level streptomycin-resistant strains, four harbored strA-strB genes, which encode streptomycin-inactivating enzymes. While the three Korean strains of R marginalis did not have plasmid and carried the resistant genes in the chromosomes, the Japanese strain of P. syringae pv. actinidiae had a plasmid containing strA-strB genes. The myomycin susceptibility test demonstrated that the high-level resistance to streptomycin of the remaining four strains is associated with mutations in the rpsL gene. Nucleotide sequence analyses revealed that they contain a single base-pair mutation in codon 43 of their rpsL gene.
Vitamin C has been well known to be a potential chemopreventive agent for several toxic compounds. It reduced the mutation frequencies of 6-sulfooxymethylbenzo[a]pyrene (SMBP) and 6hydroxymethylbenzo[a]pyrene (HMBP) in Salmonella typhimurium TA98 and TA100, indicating that corbic acid affects both frameshift and base-pair substitution mtltations. A similar type of dose-response relationship was shown in the V79 cells, although the inhibitory effect was less dramatic compared with that in S. typhimurium. However, SMBP or HMBP binding to calf thymus DNA was not affected by the presence of vitamin C, suggesting that SMBP seems to be much more reactive to calf thymus DNA than vitamin C. This was supported by migration pattern and fluorescence intensity of SMBP-modified plasmid on the gel. These restilts were not correlated with mutation tests in bacterial and mammalian cell systems. It has been already reported that vitamin C inactivates SMBP through the formation of covalently bound addact. It was found from HPLC analysis that the reaction between vitamin C and SMBP was accomplished within just 5 min and then produced the several products. These findings indicate that the beneficiary of vitamin C is not merely derived from the covalent adducts. On the other hand, the addition of DNA to incubation mixture reduced the amounts of vitamin C adducts while the magnitude of HMBP peak increased, suggesting that DNA accelerates the SMBP hydrolysis to intercept the interaction between SMBP and vitamin C or forms rapidly complex with SMBP.
간흡충 성충의 cDNAlibrary를 제작하고, 간흡충 감염 토끼 혈청으로 강한 양성 반응을 보이는 클론 (pBCs31) 한 개를 면역선별하였다. 이 클론이 28 kDa의 재조합단백을 encoding하는 것을 면역이적법으로 확인하였다. 클론된 유전자는 30개의 일정한 염기서열이 16번 반복된 후 320개의 다른 염기가 이어져 있었다. 이 반복되는 염기서열의 연역된 아미노산서열은 AQPPKSGDGG이었 다. 이 재조합항원을 이용한 효소면역검사법은 간흡충 감염 사람 혈청에 높은 특이도를 보였다.
Chuang, Linda Shyue Huey;Osato, Motomi;Ito, Yoshiaki
Molecules and Cells
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제43권2호
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pp.121-125
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2020
The identification of adult stem cells is challenging because of the heterogeneity and plasticity of stem cells in different organs. Within the same tissue, stem cells may be highly proliferative, or maintained in a quiescent state and only to be activated after tissue damage. Although various stem cell markers have been successfully identified, there is no universal stem cell marker, which is exclusively expressed in all stem cells. Here, we discuss the roles of master developmental regulator RUNX1 in stem cells and the development of a 270 base pair fragment of the Runx1 enhancer (eR1) for use as stem cell marker. Using eR1 to identify stem cells offers a distinct advantage over gene promoters, which might not be expressed exclusively in stem cells. Moreover, RUNX1 has been strongly implicated in various cancer types, such as leukemia, breast, esophageal, prostate, oral, skin, and ovarian cancers-it has been suggested that RUNX1 dysfunction promotes stem cell dysfunction and proliferation. As tissue stem cells are potential candidates for cancer cells-of-origin and cancer stem cells, we will also discuss the use of eR1 to target oncogenic gene manipulations in stem cells and to track subsequent neoplastic changes.
This paper presents an analytical investigation for a baseline-free imaging of a defect in plate-like structures using the time-reversal of Lamb waves. We first consider the flexural wave (A0 mode) propagation in a plate containing a defect, and reception and time reversal process of the output signal at the receiver. The received output signal is then composed of two parts: a directly propagated wave and a scattered wave from the defect. The time reversal of these waves recovers the original input signal, and produces two additional side bands that contain the time-of-flight information on the defect location. One of the side band signals is then extracted as a pure defect signal. A defect localization image is then constructed from a beamforming technique based on the time-frequency analysis of the side band signal for each transducer pair in a network of sensors. The simulation results show that the proposed scheme enables the accurate, baseline-free detection of a defect, so that experimental studies are needed to verify the proposed method and to be applied to real structure.
Myoung, Se Hun;Woo, Min-Su;Min, Won Gi;Park, Joo Myun
Fisheries and Aquatic Sciences
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제25권9호
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pp.489-497
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2022
The first specimen (54.8 mm standard length) of Ernogrammus zhirmunskii Markevich & Kharin, 2011, belonging to the family Stichaeidae, was recorded in Dokdo, East Sea, Korea on July 26, 2021. This species was characterized by a single ventral lateral-line canal from the posterior margin of the pelvic-fin base extending to the anus and one or two rigid spines on the posterior part of the anal fin. This species is similar to Ernogrammus hexagrammus and Ernogrammus walkeri but differs in the number of ventral lateral-line canal present, with E. zhirmunskii consisting of one (unpaired) ventral lateral-line canal compared to other two Ernogrammus species, which have a pair of parallel ventral lateral-line canal. For further analysis of species identification, a partial gene sequence from the mitochondrial DNA cytochrome oxidase subunit I (554 bp) of E. zhirmunskii was obtained for the first time. This study documents the first record of E. zhirmunskii in Korean waters and proposes the new Korean name of 'Il-gob-julbe-do-la-chi' for the species.
본 논문에서는 단위 추론 작업들 간의 순차 처리와 반복 처리에 효과적인 인-메모리 방식의 고속 클러스터 컴퓨팅 환경인 Apache Spark을 이용한 대용량의 정성적 공간 추론기의 설계와 구현에 관해 소개한다. 본 논문에서 제안하는 공간 추론기는 매우 효율적인 방법으로, 공간 객체들 간의 위상 관계와 방향 관계를 나타내는 대규모 공간 지식베이스의 무결성을 검사할 수 있을 뿐만 아니라, 주어진 공간 지식베이스로부터 새로운 사실들을 유도해냄으로써 지식베이스를 확장할 수도 있다. 일반적으로 공간 객체들 간의 위상 관계와 방향 관계에 관한 정성적 추론은 이접 관계들 간의 많은 조합 연산들을 포함한다. 본 추론기에서는 공간 추론에 필요한 최소한의 이접 관계 집합을 찾아내고 이들만을 포함하도록 조합 표를 축소함으로써, 추론의 효율성을 크게 개선시켰다. 또한, 본 추론기에서는 추론 성능 향상을 위해 Hadoop 클러스터 시스템에서 분산 추론 작업이 진행되는 동안 디스크 입출력을 최소화하도록 설계하였다. 대용량의 가상 및 실제 공간 지식베이스를 이용한 실험들에서, 본 논문에서 제안하는 Apache Spark 기반의 정성적 공간 추론기가 MapReduce 기반의 기존 추론기보다 더 높은 성능을 보여주었다.
본 연구는 맹꽁이 포접쌍의 개체별 크기와 연령을 확인하기 위하여 수행하였다. 맹꽁이는 2013년 6월 제주도 성산읍과 대정읍에 위치한 습지에서 총 23쌍을 포획하였으며, 각 개체별 크기를 측정하고 연령을 확인하였다. 채집한 23쌍의 체장(SVL, snout-vent length), 체중, 앞다리 길이, 뒷다리 길이를 분석한 결과 암컷이 수컷보다 체중이 더 나가며 체장과 뒷다리의 길이도 더 긴 것으로 나타났다. 앞다리 길이는 암수 사이에 유의한 차이를 보이지 않았다. 맹꽁이 포접쌍 가운데 수컷의 평균 연령은 $5.17{\pm}0.26$살, 암컷은 $6.22{\pm}0.28$살로 나타났으며, 암컷이 수컷보다 평균연령이 높은 것으로 확인되었다. 포접한 맹꽁이의 연령은 최소 3살부터 최대 10살까지 분포하였다. 맹꽁이 수컷은 연령과 체장이 양의 상관관계를 보였지만 암컷은 유의미한 차이를 보이지 않았다. 본 연구결과는 멸종위기종인 맹꽁이의 보호 및 복원전략 수립에 있어 중요한 기초자료로 활용될 수 있을 것으로 기대된다.
재배콩과 돌콩의 유전적 다양성과 유연관계를 밝히고, 콩을 사료작물로 개량하는데 필요한 유전정보를 얻기 위하여, RAPD 분석방법을 이용한 결과는 다음과 같다. 1. 증폭된 polymorphicband의 총 수는 74개였으며, 이중 다형현상을 보인 것은 50개로 67.6%, 증폭된 band의 크기는 0.13~2.0 Kb 범위에 있었다. 2. Random primer의 sequence 5'-CAG GCC CTT C-3'를 사용하였을 때, 0.56-2.0 Kb에서 콩의 종피 색깔에 따른 변이 (누런색과 검은색)가 나타났다. 그리고 Sequence 5'-TGC TCT GCC C-3'과 5'-GTC CAC ACG G-3'인 primer를 사용하였을 때, 각각 0.63~0.94, 0.94~2.0 Kb에서 검정콩 2호에 특정적인 genetic marker가 검출되었다. 3. Genetic similarity 값에 의한 품종간 유전적 변이성은 검정콩 2호 (0.81)가 가장 낮았고 검정콩 1호 (0.46)에서 가장 높았다. 4. 콩의 품종과 돌콩의 유연관계는 황금콩과 석량붓콩이 0.52로 가장 가까웠고 검정올콩 (0.47), 검정콩 l호 (0.46), 검정콩 2호 (0.42), 돌콩 (0.38)의 순서로 멀었다.
낙동강 하구지역에 서식하는 자주새우를 대상으로 1988년 6월부터 1989년 5월까지 성성숙과 산란에 대하여 조사한 결과는 다음과 같다. 1. 난소는 두흉부의 심장 하방에 위치하며 심장을 중심으로 전방은 촉각동맥 및 안동맥을 둘러싸고 둥글게 융합되어 있고, 후방은 1쌍의 관상으로 복부 2마디까지 뻗혀있다. 정소는 심장직하에 위치하며 심장을 중심으로 전방은 관상으로 곡정관의 형태를 취하고 있으며 후방은 1쌍의 관상의 형태를 띠고 있고, 이곳으로부터 연결된 저정낭이 제5흉지에 개구되어 있다. 2. 난자 및 정자의 배우자형성은 계절과 관계없이 단기간에 반복되고 있으며, 생식소상피의 전 구역에서 동시에 이루어지고 있다. 완숙난의 장경은 $430{\mu}m$ 전후이고, 변태된 정자는 두부 핵질이 뚜렷한 타원형의 구조를 나타낸다. 3. 생식주기는 약 40일을 간격으로 단주기성이며, 11월을 전후한 동계를 제외하고는 주년 산란종이다. 4. 포란된 난의 부화기간은 수온 $21^{\circ}C\~24^{\circ}C$의 실내사육에서 $12\~14$일이 소요되었다. 5. 포란된 개체의 평균 부화유생수는 1,602마리였고, 전장 32mm에서 1,372마리, 38.2개개에서 1,650마리였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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