The purpose of this study was to evaluate the usefulness of the automated TB-PCR assay for the detection of Mycobacterium tuberculosis. The 807 cases were analyzed with their TB-PCR, AFB smear and culture in bronchial washing fluids, sputum and body fluids samples. The TB-PCR positive of the bronchial washing fluid, sputum and body fluids were 11.3%, 7.3% and 3.6%, respectively, in cases of AFB smear-negative and culture-negative. The sensitivity values of the bronchial washing fluid, sputum and body fluids were 93.3%, 100% and 50%, respectively, according to the culture result. The sensitivity of body fluids was lower than that of the bronchial washing fluid and sputum. The specificity values of the bronchial washing fluid, sputum and body fluids were 83.3%, 89.0% and 95.7%, respectively, according to the culture result. In conclusion, the automated TB-PCR assay proved to be a useful method for the detection of Mycobacterium tuberculosis in the bronchial washing fluid and sputum. But we think that there is still a need for us to study body fluids further.
Background: The clinical manifestation of $M.$$tuberculosis$ infection ranges from asymptomatic latent infection, to focal forms with minimal symptoms and low bacterial burdens, and finally to advanced tuberculosis (TB) with severe symptoms and high bacillary loads. We investigated the diagnostic sensitivity of the whole-blood interferon-${\gamma}$ release assay according to the wide spectrum of clinical phenotypes. Methods: In patients diagnosed with active TB that underwent $QuantiFERON^{(R)}$ (QFT) testing, the QFT results were compared with patients known to be infected with pulmonary tuberculosis (P-TB) and extra-pulmonary TB (EP-TB). In addition, the results of the QFT test were further analyzed according to the radiographic extent of disease in patients with P-TB and the location of disease in patients with EP-TB. Results: There were no statistical differences in the overall distribution of QFT results between 177 patients with P-TB and 84 patients with EP-TB; the positive results of QFT test in patients with P-TB and EP-TB were 70.1% and 64.3%, respectively. Among patients with P-TB, patients with mild extents of disease showed higher frequency of positive results of QFT test than that of patients with severe form (75.2% vs. 57.1%, respectively; p=0.043) mainly due to an increase of indeterminate results in severe P-TB. Patients with TB pleurisy showed lower sensitivity by the QFT test than those with tuberculous lymphadenitis (48.8% vs. 78.8%, respectively; p=0.019). Conclusion: Although QFT test showed similar results between overall patients with P-TB and EP-TB, individual sensitivity was different according to the radiographic extent of disease in P-TB and the location of disease in EP-TB.
Seo, Ji-Hyun;Park, June-Woo;Lee, Sung-Kyu;Kim, Woo-Keun
The Korean Journal of Pesticide Science
/
v.18
no.1
/
pp.8-13
/
2014
This study evaluated in vitro cytotoxicity of 5 pesticides, including 2 herbicides, 2 germicides, and an insecticide, as an alternative to the fish acute toxicity test. The in vitro cytotoxicity was tested using a neutral red uptake (NRU) assay with epithelioma papulosum cyprini (EPC) cells that originated from the epidermal tissue of Cyprinus carpio (common carp). An in vivo fish acute toxicity test was conducted according to OECD Test Guideline No. 203 using Aphyocypris chinensis (Chinese bleak), Oryzias latipes (Japanese medaka), and C. carpio. The results showed that the sensitivity of the cell viability assay for the pesticides was similar to the fish acute test in ranking order despite having approximately 10 times less absolute sensitivity. The $r^2$ correlation values were calculated as 0.38 (p = 0.26), 0.76 (p = 0.05) and 0.90 (p = 0.01) for A. chinensis, O. latipes, and C. carpio, respectively. These results suggested that the potential of EPC cell viability assay as an alternative to the fish acute toxicity test due to their good correlation and NRU assay is expected to serve as a useful tool for predicting acute fish lethality for pesticides if further studies with a large set of pesticides are conducted.
Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) causes paratuberculosis or Johne's disease, an intestinal granulomatous infection in domestic and wild animals. The study aimed to develop and evaluate a panel of multiplex quantitative real-time polymerase chain reaction (mqPCR) assay for simultaneous detection of three MAP-specific genes (IS900, F57 and ISMAP02 genes). The analytic sensitivity (i.e., limit of detection, expressed as cells per 1 ml) was 150 for IS900, 1500 for F57, and 50 for ISMAP02. The specificity of the method was determined by testing 152 bovine fecal samples. Based on the test, it showed that the assay simultaneously detected the target genes in short period of time and at lower cost compared to laboratory routine tests. The test agreement between the assay and routine test was 94%. The discrepancy in the results was due to samples that were tested positive by the panel but negative by the routine tests, suggesting that the assay has higher sensitivity than the routine tests. In conclusion, the mqPCR assay could be a rapid and accurate testing tool for investigating paratuberculosis or Johne's disease cases in domestic and wild animals.
We evaluated the PCR assay and two commercialized PCR kits for the detection of mycoplasma in veterinary via live vaccines. The PCR assay could specifically detect all the tested Mycoplasma spp. and Acholeplasma spp., whereas two commercialized PCR kits did not. Also, the specificity of the PCR assay showed that 4 reference strains and 7 field isolates belonging to avian mycoplasma species could be all detected. The sensitivity of the PCR assay was determined using pure cultured Mycoplasma spp. and Acholeplasma spp. with a range of 1 to 100 colony forming units/ml in 9 CFR Mycoplasma broth. To test the availability of the PCR assay for veterinary live viral vaccines, A. laidlawii was artificially inoculated into the swine transmissible gastroenteritis-rota virus combined vaccine and canine parvovirus vaccine, respectively and the sensitivity of the PCR assay was similar with the result of cultured samples. In this study, the PCR assays could be used as rapid and sensitive methods for the detection of mycoplasma in veterinary live viral vaccines.
To assess the analytic performance of immunoradiometric TSH assay (IRMA TSH), assay precision determined by intra and interassay variance, assay accuracy determined by dilution and recovery study, were evaluated by using two commercial kit $(Abott^{(R)}\;and\;Daichi^{(R)})$. Normal range of basal serum TSH and TRH stimulated TSH increment were also determined in 234 healthy subjects (male 110, female 124; age 20-70) and 30 voluteers (male 10, female 20; age 21-26). In addition, basal TSH levels of 70 patients with untreated hyperthyroidism, 50 untreated hypothyroidism, and 60 euthyroidism were measured to assess the clinical utility of IRMA TSH. The detection limit of IRMA TSH was 0.04 mU/l and 0.08 mU/l by Abott Kit and Daichi kit respectively. Using Abott kit, intra assay variance were 2.0, 3.1 and 1.4% in mean TSH concentration 2.4, 31.6 and 98.2 mU/l repectively and interassay variance were 2.0 and 3.2% in mean TSH concentration 2.3 and 31.3 mU/l. Mean recovery rate was 92.5% and dilution study showed nearly straight line. When Daichi kit was used, intrasssay variance were 5.6, 5.2 and 6.2% in mean TSH concentration of 2.4, 31.6 and 98.2 mU/l respectively and interassay variance were 7.1 and 7.4% in mean TSH of 2.3 and 31.3 mU/l. Mean recoveray rate was 89.9%. Normal range of basal TSH and TRH stimulated peak TSH were 0.38-4.02 mU/l and 2.85-30.8 mU/l repectively (95% confidence interval, Abott kit used). Sensitivity and specificity of basal TSH levels for diagnosing hypothyroidism as well as specificity for diagnosing hyperthyroidism were 100% by using both kit. Sensitivity of basal TSH level for diagnosing hyperthyroidism was 100% when TSH levels were measured by Abott kit while that was 80.9% when measured by Daichi kit. These results suggest that IRMA TSH was very precise and accurate method and might be used as a first line test in the evaluation of thyroid function.
Most progesterone enzyme immunoassays(EIA) are used liquid-phase double-antibody or single-antibody seperation. These methods consume considerable time and reagents because of the requirements for several washing and centrifugation steps involving the reactants. Because of these several problems, we were prompted to develop an effective enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA) system that would be equal or superior to RIA for assay of progesterone. The results were obtained as follows. 1. Cross reaction of the progesterone antiserum with other steroids determined was shown with progesterone(100%), $11{\alpha}$-deoxycorti-costerone(2.271%), but the other steroids were shown below 0.9%. 2. Standard curve for progesterone ELISA was shown available difference according to progesterone concentration from 0 to 1,000pg/ml. 3. The lower limit of sensitivity was 0.2pg/well 4. Progesterone concentration was 1.6ng/ml for before parturition, and that was below 0.5ng/ml for after parturition. This development enzyme-linked immunosorbent assay for progesterone can be detected pregnancy diagnosis in cattle, and also applicable 10 research on physiological function including such as reproductive disorders.
This study established a new polymerase spiral reaction (PSR) that combines with reverse transcription reactions for HCV detection targeting 5'UTR gene. To avoid cross-contamination of aerosols, an isothermal amplification tube (IAT), as a separate containment control, was used to judge the result. After optimizing the RT-PSR reaction system, its effectiveness and specificity were tested against 15 different virus strains which included 8 that were HCV positive and 7 as non-HCV controls. The results showed that the RT-PSR assay effectively detected all 8 HCV strains, and no false positives were found among the 7 non-HCV strains. The detection limit of our RT-PSR assay is comparable to the real-time RT-PCR, but is more sensitive than the RT-LAMP. The established RT-PSR assay was further evaluated for detection of HCV in clinical blood samples, and the resulting 80.25% detection rate demonstrated better or similar effectiveness compared to the RT-LAMP (79.63%) and real-time RT-PCR (80.25%). Overall, the results showed that the RT-PSR assay offers high specificity and sensitivity for HCV detection with great potential for screening HCV in clinical blood samples.
Kim, Gi-Young;Morgan, Mark;Ess, Daniel;Hahm, Byoung-Kwon;Kothapalli, Aparna;Bhunia, Arun
Food Science and Biotechnology
/
v.16
no.3
/
pp.337-342
/
2007
Conventional methods for pathogen detection and identification are labor-intensive and take days to complete. Biosensors have shown great potential for the rapid detection of foodborne pathogens. Fiber-optic biosensors have been used to rapidly detect pathogens because they can be very sensitive and are simple to operate. However, many fiber-optic biosensors rely on manual sensor handling and the sandwich assay, which require more effort and are less sensitive. To increase the simplicity of operation and detection sensitivity, a binding inhibition assay method for detecting Listeria monocytogenes in food samples was developed using an automated, fiber-optic-based immunosensor: RAPTOR (Research International, Monroe, WA, USA). For the assay, fiber-optic biosensors were developed by the immobilization of Listeria antibodies on polystyrene fiber waveguides through a biotin-avidin reaction. Developed fiber-optic biosensors were incorporated into the RAPTOR to evaluate the detection of L. monocytogenes in frankfurter samples. The binding inhibition method combined with RAPTOR was sensitive enough to detect L. monocytogenes ($5.4{\times}10^7\;CFU/mL$) in a frankfurter sample.
We developed an mPCR assay for the simultaneous detection, in one tube, of Escherichia coli O157:H7, Salmonella spp., Staphylococcus aureus and Listeria monocytogenes using species-specific primers. The mPCR employed the E. coli O157:H7 specific primer Stx2A, Salmonella spp. specific primer Its, S. aureus specific primer Cap8A-B and L. monocytogenes specific primer Hly. Amplification with these primers produced products of 553, 312, 405 and 210 bp, respectively. All PCR products were easily detected by agarose gel electrophoresis, and the sequences of the specific amplicons assessed. Potential pathogenic bacteria, in laboratory-prepared and four commercially available kimchi products, were using this mPCR assay, and the amplicons cloned and sequenced. The results correlated exactly with sequences derived for amplicons obtained during preliminry tests with known organisms. The sensitivity of the assay was determined for the purified pathogen DNAs from four strains. The mPCR detected pathogen DNA at concentrations ranging from approximately 0.45 to $0.05\;pM/{\mu}l$. Thus, this mPCR assay may allow for the rapid, reliable and cost-effective identification of four potentially pathogens present in the mixed bacterial communities of commercially available kimchi.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.