The family Velutinidae is found in various intertidal and subtidal habitats worldwide including Arctic and Antarctic seas. They are characterized by possessing a fragile shell that is partially or entirely covered by the mantle. Eight valid species of the genus Coriocella have been reported mostly in the Indo-West Pacific. Here we report Coriocella jayi Wellens, 1996 from Korean waters for the first time and describe details of their external morphology and radula characteristics using scanning electron microscopy, and provide the mtDNA cox1 sequence as a DNA barcode sequence information. This species is distinguished from other congeneric species by having six cylinder-shaped tubercular lobes of their dorsal part of mantle body and mantle color. Phylogenetic tree using the mtDNA cox1 sequence data shows that two Coriocella species (C. jayi and C. nigra) are grouped as their respective sister among Velutinidae species, and these relationships are strongly supported by 100% bootstrap value. Despite the morphological similarities, further investigation will be needed to confirm whether the African and Korean populations can be justified as the same species with a disconnected distribution range, or represent morphologically similar but two distinct species.
In a majority of mammals, male infants have heavier body mass and grow faster than female infants. Accordingly, male offspring nursing requires a much greater maternal energy contribution to lactation. It is possible that the maternal-fetal immunoendocrine dialog plays an important role in female preparation for lactation during pregnancy. Immune system genes are an integral part of gene regulatory networks in lactation and tumor necrosis factor alpha ($TNF{\alpha}$) is a proinflammatory cytokine that also plays an important role in normal mammary gland development. The aim of this study was to evaluate the influence of the sex of calf and/or the -824A/G polymorphism in the promoter region of $TNF{\alpha}$ gene on milk performance traits in Black Pied cattle over the course of lactation. We also studied the allele frequency differences of -824A/G variants across several cattle breeds, which were bred in different climatic conditions. The G allele frequency decreased gradually over the course of lactation events in the Black Pied dairy cattle because of a higher culling rate of cows with the G/G genotype (p<0.001). In contrast to the genotypes A/A and A/G, cows with G/G genotype showed significant variability of milk and milk fat yield subject to sex of delivered calf. Milk yield and milk fat yield were significantly higher in the case of birth of a bull calf than with a heifer calf (p<0.03). The G allele frequency varies from 48% to 58% in Grey Ukrainian and Black Pied cattle to 77% in aboriginal Yakut cattle. Our results suggest that the $TNF{\alpha}$-824A/G gene polymorphism may have an influence on the reproductive efforts of cows over the course of lactation events depending on the sex of progeny. Allocation of resources according to sex of the calf allows optimizing the energy cost of lactation. This may be a probable reason for high G allele frequency in Yakut cattle breeding in extreme environmental conditions. Similarly, the dramatic fall in milk production after birth of a heifer calf increases the probability of culling for the cows with the G/G genotype in animal husbandry.
절지동물은 지금까지 전세계적으로 기록된 동물 총 수의 3/4이상을 차지 하고 있으며, 지구상의 거의 모든 서식처에 살고 있다. 그러므로 절지동물은 우리 인간생활과 벌정한 관계를 맺고 었으며, 이에따라 절지동물의 연구는 동서고금을 막론하고 국가적인 차원에서 지원되고 있다. 그러나 우리의 상황은 선진국 에 비하여 상당히 뒤떨어져 있는 바, 보다 체계적인 연구를 바탕으로 순수학문 과 응용분야가 함께 발전할 수 있도록 국가정책의 배려가 절실하게 요구되고 있다. 따라서 본 논문은 이러한 필요성에 입각하여, 절지동물의 대부분을 차지하고 있는 곤충류와 갑각류를 대상으로 하여 한국 절지동물 연구에 관하여 고찰하였다. 과거 및 현재에 관한 논의에서는 한국산 절지동물의 연구사, 국가정책에 이용된 예, 표본의 보존현황 등을 조사하였으며, 연구의 발전방향에 관한 부분 에서는 이러한 과거 및 현재에 대한 조사를 바탕으로 하여 몇가지 중요사항을 논의하였는데, 이에는 범국가적 표본시설의 건립, 자료의 전산화, 연구방법의 체계적 다양화, 해충관리 전략의 확립, 자연보호와 환경관리에의 기여, 실험재료로서의 으용, 국민복지생활 증진을 위한 연구, 전문인력의 양성과 국가적 지원의 대책 등이 포함되어 있다.
Baek, Su Youn;Shin, ChoRong;Kim, Kyung Min;Choi, Eun-Hwa;Hwang, Jihye;Jun, Jumin;Park, Taeseo;Kil, Hyun Jong;Suk, Ho Young;Min, Mi-Sook;Park, Yoonseong;Lee, YoungSup;Hwang, Ui Wook
Animal Systematics, Evolution and Diversity
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제36권4호
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pp.354-362
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2020
A common snapping turtle Chelydra serpentina inhabiting North America is internationally protected as an endangered species. It is known that the individuals of common snapping turtles were imported to South Korea as pets, and after being abandoned, some inhabit the natural ecosystem of South Korea like wild animals. No genetic survey has yet been performed for the common snapping turtles imported to South Korea. Hereby, cytochrome c oxidase subunit I (COI) information, which is 594 bp long, was determined for a total of 16 C. serpentina individuals, of which one was found in nature, twelve legally imported and their descendants, and the other three were provided from the Kansas Herpetological Society, USA. The obtained data were combined with thirteen COI sequences of C. serpentina retrieved from NCBI GenBank for the subsequent population genetic analyses. The results showed that there exist five haplotypes with high sequence similarity (only three parsimoniously informative sites). In the TCS and phylogenetic analyses, all the examined C. serpentina samples coincidently formed a strong monoclade with those collected mostly from Kansas State, USA, indicating that the imported ones to South Korea are from the central North America. In addition, there found the amino acid changes and the high degree of nucleotide sequence differences between C. serpentina and C. rossignoni with some important morphological characters. It is expected that the present results could provide an important framework for systematic management and control of exotic snapping turtles imported and released to nature of South Korea.
중국과 북동 중국에 서식하는 등줄쥐 2아종 (Apodemus agrarius coreae와 A. agrarius manchuricus)의 아종 내의 유전자 다양성의 정도를 파악하고 2아종간의 차이를 확인하기 위해, 미토콘드리아 DNA cytochrome b 유전자의 부분 염기서열을 분석하였다. 열 여덟마리의 A. agrarius coreae로부터 10 haplotype이, 그리고 2마리의 A. agrarius manchuricus로부터 1 haplotype이 밝혀졌다. 아종 coreae의 10 haplotype간의 Tamura-Nei nucleotide 거리는 0.36에서 1.86%였고, 2아종 coreae와 manchuricus간의 nucleotide 거리는 0.37에서 1.47%였다. 아종 coreae내 최대 genetic divergene 거리는 2아종간의 최대거리보다 크게 나타났다. 또한 2아종의 11 haplotype을 비교했을 때에, 뚜렷하게 아군으로 나뉘어지지 않았다. 본 염기서열의 분석 결과는 지금까지의 형태적 연구의 결과와 일치하지 않았으며, cytochrome b 유전자는 A. agrarius의 2아종을 구분하기에 좋은 유전자 marker가 아닌 것으로 판단됐다. 앞으로, A. agrarius의 2아종간의 유전적 관계를 밝히기 위해 미토콘드리아 DNA control region의 분석이 필요하다고 본다.
The objective of this study was to determine the degree of mitochondrial DNA (mtDNA) divergence between two subspecies of $Mustela$$sibirica$ from Korea ($M.$$s.$$coreanus$ on the Korean Peninsula and ($M.$$s.$$quelpartis$ on Jeju Island) and to examine the taxonomic status of ($M.$$s.$$quelpartis$. Thus, we obtained complete sequences of mtDNA cytochrome $b$ gene (1,140 bp) from the two subspecies, and these sequences were compared to a corresponding haplotype of ($M.$$s.$$coreanus$, downloaded from GenBank. From this analysis, it was observed that the sequences from monogenic ($M.$$s.$$quelpartis$ on Jeju Island were identical to the sequences of four ($M.$$s.$$coreanus$from four locations across the Korean Peninsula, and that the two subspecies formed a single clade; the average nucleotide distance between the two subspecies was 0.26% (range, 0.00 to 0.53%). We found that the subspecies $quelpartis$ is not genetically distinct from the subspecies $coreanus$, and that this cytochrome $b$ sequencing result does not support the current classification, distinguishing these two subspecies by pelage color. Further systematic analyses using morphometric characters and other DNA markers are necessary to confirm the taxonomic status of ($M.$$s.$$quelpartis$.
한국, 중국, 러시아에 서식하는 등줄쥐 Apodemus agrarius 6아종 111마리를 이용하여, 미토콘드리아 DNA를 8개의 제한효소로 절단한 단편들을 blot hybridization법으로 분석하였다. 모두 32개의 단편들이 보여졌고, 9개의 haplotype이 밝혀졌으며, 평균 발산값이 0.896에서 1.150%인 4아군이 나타났다. 결론적으로 세 형을 인정할 수가 있었다: [I. 아종 chejuensis (제주도, 한국)], [ll, 아종 pallescens(남서 한국), coreae(중앙 한국), 및 septentrionalis(러시아)], and [lll, 아종 manchuricus(북동 중국)와 pallidior(북부 중국)]. 그러나 아종 coreae의 일부 표본들은 다른 6아종의 표본들과 다소 차이를 보였고, 아종 pallidior의 일부 표본들은 아종 septentrionalis의 모든 표본들과 같아서 동일한 haplotype을 형성하였다. 아종 a. agrarius chejuensis는 독특한 아종중의 하나이고, 아종 corea(pallescens포함)도 독특한 아종중의 하나이며, 아종 manch-uricus와 pallidior는 아종 ningpoensis의 동아종이명이고, 아종 septentrionalis도 아종 agrarius의 동아종이명임이 재확인되었다. 뿐만 아니라, 등줄쥐는 염색체 핵형이 일정하며, 미토콘드리아 DNA 유전형에 약간의 변이를 보이고, 형태형질의 상당한 발산을 보이고 있지만, 이들 분류형질의 변이 정도의 파악과 아종분류의 재검토를 위하여 유라시아산 등줄주의 보다 많은 표본을 이용한 분석이 앞으로 필요하다.
Hung Sun Koh;Yong Seok Roh;Sang Bok Kim;Byung Sun Yoo
Animal Systematics, Evolution and Diversity
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제11권4호
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pp.409-416
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1995
한국의 청주에서 채집한 집쥐(Rattus norvegicus caraco) 40마리를 사용하여, 8개 제한효소로 절단한 미토콘드리아 DNA(mtDNA)의 단편들을 분석하였다 총 36개의 절단단편들이 나타났고, 6개 mtDNA의 clone이 밝혀졌다. 여섯 mtDNA clone간의 nucleotide-sequence divergence(p)는 0.35-2.73%였으며 , 이들 6개 clone은 3개 소군으로 나뒤어졌다. 한 소군은 3개 clone의 29마리였고, 다른 한 소 군은 2개 clone의 열마리였으며, 나머지 소군은 한 clone의 한마리였다. 둘째와 셋 째 소군은 첫째 소군과 Pvu II의 genotype이 달랐으며, 셋째 소군은 나머지 두 소 군과 Dra I에 있어서 뚜렸한 차이를 보였다. 뿐만아니라, 한국산 집쥐를 사용한 본 연구의 결과로 밝혀진 최대 divergence는 Brown과 Simpson(1981)의 미국과 일 본의 집쥐를 사용해서 연구한 최대값보다 컸다 이들 뚜렷한 mtDNA 소군의 분류 학적 위치를 규명하기 위하여 한국내 다른 지역의 더 많은 표본들을 사용한 계속적 인 연구가 필요하게 되었다.
한국에 살고 있는 다람쥐(Tamias sibiricus barberi)의 형태적 형질, 염색체 핵형 및 미토콘드리아 DNA 절단단편의 변이의 정도를 파악하기 위하여, 다변량분석, 골수세포 및 blot-hybridization법으로 표본들을 분석하였다. 아종 barberi의 분류학적 재검토를 위하여, 만주에 살고 있는 다람쥐(Tamias sibiricus orientalis)의 표본들의 형태적 형질들도 함께 분석하였다. 한국의 6개 지역의 다람쥐는 서로 형태적으로 유사했으며, 만주산 다람쥐는 한국의 다람쥐와 다른 군을 형서알 정도로의 뚜렷한 형태적 차이를 보이지는 않았다. 한국의 4개 지역의 다람쥐는 동일한 핵형(2n = 38)을 가졌고, 5개 미토콘드리아 DNA clone이 나타난 한국의 3개 지역의 다람쥐의 미토콘드리아 절단단편의 양상도 서로 유사하였다. 한국산 다람쥐는 단일한 집단이며, Corbet(1978)가 지적했던대로 아종 barberi는 아종 orientalis의 synonym임이었다. 한국과 만주산 다람쥐의 학명은 T.sibiricus orientalis이지만 분류학적 재 검토를 위하여 북한, 만주 및 중국의 표본들을 사용한 계통분류학적 연구가 필요하다고 본다.
한국의 산양 (Naemorhedus caudatus)의 유전정보를 종보전에 활용하기 위하여, 한국의 2개 장소에서 채집한 6마리의 미토콘드리아 cytochrome b 유전자 염기서열(606 bp)의 양상을 조사하였다 상응하는 중국의 산양의 염기서열은 GenBank에서 얻어서 이용하였다. 한국의 산양의 4개 haplotype의 각각과 중국의 산양의 한 haplotype간의 nucleotide Tamura-Nei 거리는 0.0650부터 0.0803 가지의 변이를 보였으며, 산양은 소과 내에서 높은 수준의 염기서열 다양성을 나타냈다 한국의 산양에서, 양구표본의 3개 haplotype간의 거리는 0.0151부터 0.0185로, 양구집단의 유전자 다양성이 낮은 수준으로 감소되었음을 보여준다. 또한 양구의 3개 haplotype의 각각과 삼척의 한 haplotype간의 거리는 0.0343에서 0.0479였다. 지리적 거리의 멀어짐에 따르는 유전자 거리의 증가가 서식처 단절에 의해 야기되었다고 판단됨으로, 한국의 산양의 유전자 다양성의 감소를 막기 위한 여러 가지 보전 대책이 즉각적으로 수행되어야 할 것이다 산양의 분류학적 검토를 위하여 GenBank에 있는 히말라야산양 (N. goral)의 염기서열 (276 bp)도 이용하였으며, 산양은 히말라야산양과 뚜렷한 차이가 없었다. 산양과 히말라야 산양은 동종으로 판단할 수가 있지만, 두 종의 보다 많은 표본을 이용한 후속 연구가 필요하다
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[게시일 2004년 10월 1일]
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