In this review, the compositions of the sex pheromones of 22 lepidopteran species were analyzed and briefly arranged by comparing the research results conducted in different locations worldwide. These compositions can be used as monitoring tools for pests of rice, maize, leguminous crops, perilla, and sesame in Korea. The sex pheromone compounds and those compositions of four species were successfully identified within Korean populations. The optimal compositions of sex pheromones of three other species were selected through behavioral studies using synthetic chemicals of the known pheromone compounds in laboratories and fields, without chemical identification processes in the sex pheromone compounds of Korean populations. For a few species, the roles of the minor components of the sex pheromone volatiles should be re-assessed for use in the development of optimal monitoring lures.
Kang, Hyo Rin;Seong, Mi So;Nah, Jin Ju;Ryoo, Soyoon;Ku, Bok Kyung;Cheong, JaeHun
Journal of Life Science
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v.30
no.3
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pp.285-290
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2020
Foot-and-mouth disease virus (FMDV), a member of the genus Aphthovirus in the Picornaviridae family, affects wild and domesticated ruminants and pigs. FMDV causes various clinical symptoms, including severe inflammation in infected tissue. Genome RNA of FMDV shows a positive single-strand chain approximately 8.3 kb long and encodes a single long open reading frame (ORF). The ORF is translated into structural and non-structural proteins by viral proteases. The FMDV 2C protein is one of the non-structural proteins encoded by FMDV and plays a critical role in FMD pathogenesis, including inflammation, apoptosis, and viral replication. In this study, we examined whether FMDV 2C induces intracellular expression of pro-inflammatory cytokine tumor necrosis factor alpha (TNFα). FMDV 2C expression in pig IBRS-2 cells increased mRNA and protein expression of TNFα at the transcriptional level via activation of TNFα promoter. Treatment with 4-phenylbutyric acid, an endoplasmic reticulum (ER) stress reducer, decreased TNFα expression induced by FMDV 2C. Activating transcription factor 4 (ATF4), a transcription factor mediating ER stress response, induced transactivation of TNFα promoter and expression of mRNA and protein of TNFα. However, the dominant negative mutant of ATF4 did not induce FMDV 2C-mediated TNFα expression. The results indicate that FMDV 2C protein increases clinical inflammation via ATF4-mediated TNFα expression and is associated with ER stress induction.
This study was performed in Korea to get serological information for bovine herpesvirus 1 (BoHV-1), most commonly found in cattle. Antibodies against BoHV-1 were examined by targeting infectious bovine rhinotracheitis (IBR) in unvaccinated and vaccinated cattle, using viral neutralization (VN) test. In 2013, among 261 sera collected from IBR-unvaccinated herds, 7 sera (2.7%) were found seropositive and their VN titers were ranging from 1:4 to 1:32. Among 315 sera collected from IBR-vaccinated herds in large capacity farms, 303 sera (96.2%) were found to be seropositive for BoHV-1 and their VN titers were in the range of 1:4 to 1:2048. It was found that the IBR-vaccinated herds had higher levels of VN titer than IBR-unvaccinated herds. The results indicated that it may be due to heavy vaccination in vaccinated herds and no or a little infection in unvaccinated herds. At the end of the study it was concluded that although the seropositivity in IBR-unvaccinated herds was low, the monitoring of IBR should be continuously practiced to control and prevent the disease because of exportation of living cattle causing its nationwide outbreaks.
Mycobacterium bovis, a member of the M. tuberculosis complex (MTC), is the causative agent of bovine tuberculosis. Detection of M. bovis and M. tuberculosis using conventional culture- and biochemical-based assays is time-consuming. Therefore, a simple and sensitive molecular assay for rapid detection would be of great help in specific situations such as faster diagnosis of bovine tuberculosis (bTB) infection in the abattoirs. We developed a novel multiplex real-time PCR assay which was applied directly to biological samples with evidence of bTB and it was allowed to differentiate between M. bovis and M. tuberculosis. The primers and TaqMan probes were designed to target the IS1081 gene, the multi-copy insertion element in the MTC and the 12.7-kb fragment which presents in M. tuberculosis, not in the M. bovis genome. The assay was optimized and validated by testing 10 species of mycobacteria including M. bovis and M. tuberculosis, and 10 other bacterial species such as Escherichia coli, and cattle lymph nodes (n=113). The tests identified 96.4% (27/28) as M. bovis from the MTC-positive bTB samples using conventional PCR for specific insertion elements IS1081. And MTC-negative bTB samples (n=85) were tested using conventional PCR and the real-time PCR. When comparative analyses were conducted on all bovine samples, using conventional PCR as the gold standard, the relative accuracy of real-time PCR was 99.1%, the relative specificity was 100%, and the agreement quotient (kappa) was 0.976. The detection limits of the real-time PCR assays for M. bovis and M. tuberculosis genomic DNA were 10 fg and 0.1 pg per PCR reaction, respectively. Consequently, this multiplex real-time PCR assay is a useful diagnotic tool for the identification of MTC and differentiation of M. bovis and M. tuberculosis, as well as the epidemiologic surveillance of animals slaughtered in abattoir.
Kim, Tae Sun;Kim, Min Ji;Kim, Sun Hee;Seo, Jin-Jong;Kee, Hye Young;Chung, Jae Keun;Kim, Eun Sun;Moon, Yong Woon;Ha, Dong Ryong;Kim, Min Kyeong;Lim, Suk Kyung;Nam, Hyang-Mi
Korean Journal of Microbiology
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v.49
no.2
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pp.118-125
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2013
Antibiotic susceptibility was examined for 596 Salmonella isolates from patients with acute gastroenteritis during 2000-2009 in Gwangju area in South Korea. Of 16 antibiotics tested, ampicillin resistance (43%) was the most commonly observed resistance among the 596 Salmonella sp. isolates, followed by tetracycline (35.9%), nalidixic acid (31.5%), and chloramphenicol (26.2%). Antibiotic resistance varied among serotypes: The highest resistance of S. Enteritidis and S. Typhimurium was to ampicillin (51.1%) and tetracycline (77.9%), respectively. A total of 89 resistance patterns were observed, and 26% (155/596) of Salmonella isolates were susceptible to all antibiotics tested in this study. About 21% (127/596) and 15% (87/596) of the isolates were resistant to one and two antibiotics, respectively. The rest of Salmonella isolates (227/596, 38%) were resistant to three or more antibiotic agents. The highest multi-drug resistance (MDR) was observed in serotype S. Paratyphi B (76.5%), followed by S. Typhimurium (58.2%), and S. Enteritidis (40.2%). The most common resistance pattern of MDR isolates was ampicillin-chloramphenicol-nalidixic acid-ticarcillin (36/227, 15.8%), most of which (35/36, 97.2%) were S. Enteritidis.
Le, Tran Bac;Lee, Hyun-Jeong;Le, Van Phan;Choi, Kang-Seuk
Korean Journal of Poultry Science
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v.46
no.2
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pp.127-136
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2019
Three strains of infectious bronchitis viruses (IBVs), designated VNUA3, VNUA8 and VNUA11, were isolated from diseased/infected chickens in Hanoi, Thainguyen, and Haiphong provinces of Vietnam. These birds had received a live IBV vaccination but still suffered from infectious bronchitis. VNUA3, VNUA8 and VNUA11 harbor cleavage sites (RRTGR, HRRRR, and HRRKR, respectively) within the S protein. A BLASTN search revealed that the S gene of VNUA3, VNUA8, and VNUA11 showed the highest nucleotide identity with those of IBV strains CK/Italy/I2022/13, CK/CH/LHLJ/08-6, and GX-NN120084, respectively. Phylogenetic analyses based on the S gene nucleotide sequences revealed that VNUA3, VNUA8 and VNUA11 clustered with Q1-like, QX-like and TC07-2-like genotypes, respectively, and were closely related to reference IBV strains from China. However, the Vietnam IBVs showed high divergence from vaccine strains 4/91 and Ma5, which are used in the Vietnamese farms from which the isolates were obtained. Taken together, these results indicate that at least three genotypes of IBV are circulating among chickens in North Vietnam. This is the first report of the molecular epidemiology of IBV in Vietnam.
In this study, understanding the habitats on spot-billed duck that wintering-breed in the korea, which using the GPS-Mobile based Telemtry (WT-200), I tried to take advantage as the basic data of the protection and management of the habitats of the waterbirds of Korea. Study area is Gyeonggi-do Bokhacheon, Chonmichon, Chungcheongnam-do Gokugyochon, Chungcheongbuk-do Byeongcheoncheon, Jeollabuk-do Mangyunggang, which Five rivers and Jeju Island reservoir, I have attached the tracking of the location(WT -200) to the twenty-five spot-billed ducks. among twenty five ducks, twelve ducks moved to overseas countries, the arrival site was China, North Korea, Russia. Moving average distance was 683km, the largest distance was 1,238km. The average northbound starting date was April 26. The average daily movement distance of thirteen ducks remaining in the domestic country is $1.0{\pm}0.89km$, maximum travel distance was 23.8km. The average daily movement distance of wintering prior to average going north dating is a 0.9km, is the largest 14.6km, the breeding season is an average 1.3km, maximum was 14.4km. Spot-billed duck used the rivers in domestic country most frequently, following was rice field, a filed, reservoir. It used the river most frequently during the wintering period, in the breeding season it used paddy paddies most frequently. While wintering, during the day and night's utilization rate was the highest in the river, but utilization rate was incleased on filed, paddy filed at night. During breeding season, daytime and night's utilization rate was the highest but, utilization rate was increased on river and utilization rate was decreased on river. In accordance with time change, spot-billed duck showed different tendency in paddy fields, and they utilized the filed adjacent to rivers mostly.
Background: To date, various genotypes of infectious bronchitis virus (IBV) have co-circulated and in Korea, GI-15 and GI-19 lineages were prevailing. The spike protein, particularly S1 subunit, is responsible for receptor binding, contains hypervariable regions and is also responsible for the emerging of novel variants. Objective: This study aims to investigate the putative major amino acid substitutions for the variants in GI-19. Methods: The S1 sequence data of IBV isolated from 1986 to 2021 in Korea (n = 188) were analyzed. Sequence alignments were carried out using Multiple alignment using Fast Fourier Transform of Geneious prime. The phylogenetic tree was generated using MEGA-11 (ver. 11.0.10) and Bayesian analysis was performed by BEAST v1.10.4. Selective pressure was analyzed via online server Datamonkey. Highlights and visualization of putative critical amino acid were conducted by using PyMol software (version 2.3). Results: Most (93.5%) belonged to the GI-19 lineage in Korea, and the GI-19 lineage was further divided into seven subgroups: KM91-like (Clade A and B), K40/09-like, QX-like (I-IV). Positive selection was identified at nine and six residues in S1 for KM91-like and QX-like IBVs, respectively. In addition, several positive selection sites of S1-NTD were indicated to have mutations at common locations even when new clades were generated. They were all located on the lateral surface of the quaternary structure of the S1 subunits in close proximity to the receptor-binding motif (RBM), putative RBM motif and neutralizing antigenic sites in S1. Conclusions: Our results suggest RBM surrounding sites in the S1 subunit of IBV are highly susceptible to mutation by selective pressure during evolution.
Lee, Won-Chang;Yoon, Hachung;Lee, Myeong-Jin;Kwon, Young Hwan
Korean journal of aerospace and environmental medicine
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v.29
no.2
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pp.72-76
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2019
Over the last decade, human brucellosis (HB) has become a principal zoonosis in Korea. The objective of this study was observing the epidemiological trends of the extensive eradication programs for bovine brucellosis (BB) outbreaks-associated HB in Korea from 2002 to 2013. The raw data analysis in this study was obtained from the website of brucellosis outbreaks by Korea Center for Disease Control and Prevention (KCDC) and Animal and Plant Quarantine Agency (QIA), Korea, 2002~2013. The number of cases of BB outbreaks-associated HB in Korea was increased after 2003 and peaked in 2006 before decreasing thereafter. There were a total of 89,240 infected BB in domestic cattle with a cumulative incidence rate (CIR) of 611.8 per 100,000 cattle; during the same period there were a total of 703 cases of HB with a CIR of 0.12 per 100,000 persons. Moreover, the correlation coefficient of brucellosis outbreaks between cattle and human was highly significant (r=+0.985). The attack ratio of HB was 7.88 per 1,000 BB cases. All of the control measures of HB were applied in the extensive eradication programs for brucellosis outbreaks of infection source in domestic animals and contributed significantly to the reduction in the outbreaks of HB in Korea.
This study estimated and analyzed the incremental profits to compare the imported buff-tailed bumblebees, Bombus terrestris, and their pollination alternatives. A result of the analysis showed that the incremental profit, which is defined as the sales revenue minus the common production cost, was higher when using pollinator insects than when using the artificial pollination and that the incremental costs were lower when using domestic bumblebees or artificial pollination than when using imported bumblebees or honeybees. The incremental profits of each alternative were 46,801 million won for imported bumblebees, 47,170 million won for domestic bumblebees, 46,975 million won for honeybees, and 29,839 million won for artificial pollination. The incremental profit means the accounting profit that can be realized from each alternative. However, not all of the accounting profits can be attributed to pollen-mediated alternatives since they include potential costs such as imputed rent or normal profits. Considering the opportunity costs, which are the potential costs, it appears that the alternative of using imported bumblebees can lead to an economic loss. It means that fruit and vegetable farmers can expect additional economic profits if they choose other alternatives instead of using imported bumblebees.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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