• Journal of Life Science
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• 제9권2호
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• pp.9-14
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• 1999

Pseudomonas iodinum IFO 3558 adenosine deaminase(ADA) gene was cloned by the polymerase chain reaction and deduced the amino acid sequence of the enzyme. DNA sequence homology of Pseudomonas iodinum IFO 3558 ADA gene was compared to those of E. coli, human and mouse ADA genes. Unambiguous sequence from both strands of pM21 was obtained for the region believed to encode ADA. The sequence included a 804-nucleotide open reading frame, bounded on one end by sense primer and on the other end by two antisense primer. This open reading frame encodes a protein of 268 amino acids having a molecular weight of 29,448. The deduced amino acid sequence shows considerable similarity to those of E. coli, mouse and human ADA. Pseudomonas iodinum IFO 3558 nucleotide sequence shows 98.5% homology with that of the E. coli ADA sequence and 51.7% homology with that of the mouse ADA sequence and 52.5% homology with that of the human ADA sequence. The ADA protein sequence of Pseudomonas iodinum IFO 3558 shows 96.9% homology with that of the E. coli and 40.7% homology with that of the mouse and 41.8% homology with that of the human. The distance between two of the conserved elements, TVHAGE and SL(1)NTDDP has veen exactly conserved at 76 amino acids for all four ADAs. Two of the four conserved sequence elements shared among the four ADAs are also present in the yeast, rat, human (M), and Human(L) AMP deaminase. The SLSTDDP sequence differs only in the conservative substitution of a serine for an asparagine. A conserved cysteine with conserved spacing between these two regions is also found. Thus, sequence analysis of four ADAs and four AMP deaminases revealed the presence of a highly conserved sequence motif, SLN(S)TDDP, a conserved dipeptide, HA, and a conserved cysteine residue.

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 1994년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.215.1-215
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• 1994

No Abstract, See Full Text

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 1995년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.280.1-280
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• 1995

No Abstract, See Full Text

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 1998년도 춘계임시총회 및 학술발표대회
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• pp.8-8
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• 1998

• 한국식물학회:학술대회논문집
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• 한국식물학회 1994년도 제8회 식물생명공학 심포지움 형질전환 식물체 연구의 현황과 전망 The Eighth Symposium on Plant Biotechnology -Plants in Korea-
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• pp.141-176
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• 1994

• 한국응용약물학회:학술대회논문집
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• 한국응용약물학회 1994년도 춘계학술대회 and 제3회 신약개발 연구발표회
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• pp.268-268
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• 1994

포자의 전자현미경사진과 mycelium의 광학현미경사진을 찍어 strain V-8 균주의 형태학적인 특성을 조사하였을 때 방선균 계열인 streptomyces로 확인되었다. 이 균주의 배양액은 노란색을 띠고 있고 이 노란색은 430 nm에서 특징적인 흡광을 보였다. 이 물질은 유기 용매로 추출되었다. 이 물질의 자외선 흡광스펙트럼의 특징을 기존에 보고된 화합물과 비교하여 이 물질이 actinomycin계열에 속함을 발견하였다. 이 물질의 FAB mass spectrum에서 각 분획들의 주성분들의 분자의 질량 + H 이온이 1290과 1292에서 각각 관찰되었다. 이 화합물들은 분자량이 1258인 actinomycin D와는 상이한 구조를 소유하고 있는 것으로 확인되었다. 각 분획 성분들의 proton 및 carbon HIR spectra를 얻어 기존에 알려진 화합물의 자료와 비교하였을 때 actinomycin계열에 속하는 신물질로 생각되었다. 지금까지 actinomycin 계열의 항생물질이 adenosine deaminase의 효소 활성을 저해한다는 사실은 보고된바 없다. 본 연구자는 분리한 2개의 화합물에 대하여 구조 연구를 계속하고 있다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제32권9호
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• pp.3411-3420
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• 2011

Kinetic and structural studies have been carried out on the effects of meso-tetrakis(4-sulfonatophenyl)-porphyrin ($H_2TPPS_4$) as an anionic and meso-tetrakis(3-N-methyl-pyridyl)porphyrin ($H_2TMPYP$) as a cationic porphyrin with adenosine deaminase (ADA) in 25 mM citrate/phosphate buffer, pH = 4-8, at $37^{\circ}C$ using UVvis spectrophotometry, circular dichroism (CD), fluorescence spectrophotometry as well as molecular dynamics (MD) and molecular docking. Kinetic results showed that the two porphyrins are non-competitive inhibitors. Increasing pH, increases $K_I$ and cationic porphyrin has a higher $K_I$ and lower binding constant ($K_b$) at all pH ranges. Analyzing the secondary structure revealed that both ligands decrease the secondary structure and that the anionic porphyrin is more effective.

• 대한흉부심장혈관외과학회:학술대회논문집
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• 대한흉부외과학회 1998년도 제30차 추계학술대회 대한흉부외과학회
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• pp.139-139
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• 1998

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제15권5호
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• pp.306-311
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• 1987

황산암모늄 분획, 2차례의 DEAE-Cellulose, DEAE-Sephadex A-50 및 Sephacryl S-200 superfine gel filtration으로 정제한 결과 Streptomyces sp. J-350P의 세포외 adenine deaminase는 0.3%의 수율로서 1764배로 정제되었다. Streptomyces sp. J-350P의 세포외 adenine deaminase는 pH6.5~8.5 사이에서 안정하였고, pH7.0에서 10분간 열처리하였을 때 5$0^{\circ}C$까지는 안정하였다. 효소 활성 최적 pH와 온도는 pH6.5와 35$^{\circ}C$ 였다. Sephacryl S-200 superfine gel filtration 의한 분자량의 측정 결과 본 효소의 분자량은 약 36,000이었다.

• 원예과학기술지
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• 제17권6호
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• pp.770-772
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• 1999

새로 육성된 품종의 보호를 위한 분자마커를 대상 작물에 전이시키는 체계를 확립하고자 본 실험을 실시하였다. 식물에서는 전혀 존재하지 않는 mouse adenosine deaminase(ADA) gene으로부터 분자마커로 활용 가능한 크기의 DNA 단편을 획득하고 이를 pBI101에 삽입하여 chimeric gene을 만들었다. 분자마커를 포함하는 형질전환된 담배를 획득하기 위해 A. tumefaciens LBA4404를 이용하여 형질전환을 실시하였다. 담배 절편체에서 형질전환된 신초를 얻기 위해 BAP $1.5mg{\cdot}L^{-1}$, kanamycin $50mg{\cdot}L^{-1}$과 cefotaxim $200mg{\cdot}L^{-1}$이 혼용된 MS배지에서 선발하였으며 신초 발생후 kanamycin의 농도를 2배, 4배로 증가시켜 chimeric gene이 완전하게 전이되어 저항성을 가진 8개체를 얻었다. 항생제에 의해 선발된 8개체를 분자마커 primer로 PCR분석하여 분자마커가 식물체의 genome내로의 전이를 확인하였다.