Acidovorax avenae subsp. avenae is the causal pathogen of several hosts including oats corn foxtail millet wheatgrass sugarcane and rice. The pathogen is a seedborne pathogen of rice and known to occur widely in rice growing countries. The pathogen cause inhibition of germination brown stripe on the leaf curling of the leaf sheath and abnormal elongation of the mesocotyl of irce. Bacterial colonies grow slowly and are convex circular and creamy with tan to brown center. The causal baterium is Gram-negative and rod shape with a single polar flagellum Nonfluorescence poly-$\beta$-hydroxybutyrate accumulation and precipitate formation around the colony on the medium are useful in the differentiation of this bacterium from other subspecies of A. avenae as well as nonfluorescent bacteria pathogenic to rice. This bacterium has belonged to the genus of Psdeudomonas but recently was transferred to the new genus Acidovorax on the basis of bacteriological and molecular biological data. However the difference of biochemical characteristics protein profile of the cell and host range among strains should be more clarified. To develop an effective control strategy for this disease understanding of detailed life cycle of the disease ritical environmental factors affecting disease development on each host and relationship to grain discoloration of rice are prerequisite. Although the affected area has been world-widely reported there is on recent progress on the understanding of the bacteriological and ecological characteristics of the causal bacterium and control means of the disease.
A selective agar medium was developed and tested for the isolation of Acidovorax avenae subsp. avenae, the causal bacterial pathogen of bacterial brown stripe, from rice seeds. The new selective agar medium, designated sorbitol pyroglutamic acid agar (SPA) medium, contained 0.5 g of $K_2$HPO$_4$, 3.0 g of Na$_2$HPO$_4$, 2.0 g of D-sorbitol, 0.2 g of L-pyroglutamic acid, 10.0 $m\ell$ of tween 80, 40.0 mg of victoria blue B, 15.0 g of agar, 150.0 mg of ampicillin and 25.0 mg of vancomycin per litter. Colonies of A. avenae subsp. avenae on SPA medium were smooth, round, convex, shiny, blue and 1.5-2.0 mm in diameter 4 days after incubation at 28$^{\circ}C$. Blue colored colony having dark blue zone was typical type of A. avenae subsp. avenae colonies on the medium. Mean recovery of 8 isolates of A. avenae subsp. avenae on the selective SPA medium was 95.8% in comparison to that on KB medium. The saprophytic bacteria were reduced to 97.9% on SPA medium compared to those on KB medium. Most of other rice seedborne bacteria as well as reported pathogenic bacteria were failed to grow on SPA medium. This medium was highly selective for recovering A. avenae subsp. avenae from rice seed samples, and it could be used to enhance the recovery of this bacterium from rice seed samples, which may be contaminated with large numbers of competing microorganisms.
2009년 7월 밀양지역의 농가포장에서 재배된 기장의 잎에 세균성 줄무늬증상이 발생되었다. 병징은 잎과 줄기전신에서 갈색의 괴저줄무늬를 보였으며, 포장전체에서 확인되었다. 이병된 잎에서 분리된 4계통의 세균들은 배양적, 생리 생화학적 특성, Biolog 검정, 16S rRNA 유전자 염기서열분석에 의하여 Acidovorax avenae subsp. avenae로 동정되었다. 또한 담배, 토마토에 접종하여 과민성반응을 확인하였으며, 기장에 접종하여 동일 병반을 확인할 수 있었다. 이상의 연구결과에 의하여 기장에서 Acidovorax avenae subsp. avenae에 의한 세균성줄무늬병을 국내 처음으로 보고한다.
2005년 전남 나주와 광주의 멜론 재배포장에서 잎맥을 따라 갈색으로 변색되면서 시드는 증상이 관찰되었고, 과실 표면에는 점무늬의 수침상이 형성되며 과실 내부는 갈색으로 썩는 증상이 관찰되었다. 잎과 과실의 병반부로부터 2개의 세균을 분리하여 생리생화학적 실험, 유전적 실험 및 병원성 실험 결과 Acidovorax avenae subsp. citrulli로 동정되었다. 이 보고는 국내에서 최초이며, 이 병을 멜론 과실썩음병으로 명명할 것을 제안한다.
Cho, Min Seok;Park, Duck Hwan;Ahn, Tae-Young;Park, Dong Suk
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제25권9호
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pp.1401-1409
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2015
The aim of this study was to develop a SYBR Green-based real-time PCR assay for the rapid, specific, and sensitive detection of Acidovorax avenae subsp. citrulli, which causes bacterial fruit blotch (BFB), a serious disease of cucurbit plants. The molecular and serological methods currently available for the detection of this pathogen are insufficiently sensitive and specific. Thus, a novel SYBR Green-based real-time PCR assay targeting the YD-repeat protein gene of A. avenae subsp. citrulli was developed. The specificity of the primer set was evaluated using DNA purified from 6 isolates of A. avenae subsp. citrulli, 7 other Acidovorax species, and 22 of non-targeted strains, including pathogens and non-pathogens. The AC158F/R primer set amplified a single band of the expected size from genomic DNA obtained from the A. avenae subsp. citrulli strains but not from the genomic DNA of other Acidovorax species, including that of other bacterial genera. Using this assay, it was possible to detect at least one genomeequivalents of the cloned amplified target DNA using 5 × 100 fg/µl of purified genomic DNA per reaction or using a calibrated cell suspension, with 6.5 colony-forming units per reaction being employed. In addition, this assay is a highly sensitive and reliable method for identifying and quantifying the target pathogen in infected samples that does not require DNA extraction. Therefore, we suggest that this approach is suitable for the rapid and efficient diagnosis of A. avenae subsp. citrulli contaminations of seed lots and plants.
팔레놉시스 주요 재배지역인 경기, 부산에서 잎에 점무늬를 형성하며 병반의 가장자리는 선명한 노란색을 띄며, 잎 뒷면을 햇빛에 비춰볼 때 수침상을 나타내었고 병징이 심해지면 수침상 점무늬 병반이 합쳐지면서 잎 전체가 짙은 갈색으로 말라죽었다. 팔레놉시스 잎의 병반부로부터 세균을 분리하여 생리생화학적 방법, 병원성 시험결과 Acidovorax avenae subsp. cattleyae로 동정하였으며 이 병을 팔레놉시스 세균성갈색점무늬병으로 명명하였다.
본 연구는 수박 과실썩음병의 원인균인 A. avenae subsp. citrulli에 대해 항균활성을 갖는 친환경 유기농자재를 개발할 목적으로 오배자(S. chinensis)를 대상으로 수행되었다. 오배자를 MeOH로 추출하여 용매분획을 하였고, 용매분획 중에서 가장 강한 활성을 나타낸 hexane fraction을 column chromatography로 분리하여 활성이 강한 분획들을 GC-MS로 분석하였다. GC chromatogram 상의 주요 peak에 해당하는 mass spectrum과 Wiley library를 비교하여 profiling한 결과, 지방산인 myristic acid, palmitic acid와 3-n-pentadecylphenol이 주요 물질로 검출되었다. 이들 검출 화합물의 항균활성을 검정하기 위하여 표준품을 사용하여 bioassay한 결과, myristic acid와 3-n-pentadecylphenol 화합물이 강한 활성을 보였다. 따라서 오배자로부터 분리한 myristic acid와 3-n-pentadecylphenol 화합물이 항균 활성물질인 것을 구명하였다.
본 연구는 수박 과실썩음병의 원인균인 Acidovorax avenae subsp. citrulli 균에 대해서 항균활성을 갖는 친환경 유기농자재를 개발할 목적으로 약용식물 133종을 대상으로 진행되었다. 이들 133종 약용식물의 MeOH 추출물에 대한 bioassay를 통해 항균 활성을 검정한 결과 청피(Citrus unshiu Markovich) 추출물에서 강한 항균활성을 보였다. 청피(Citrus unshiu Markovich)로부터 항균활성물질을 구명하고자 용매분획을 하였고, 용매분획 중에서 hexane fraction이 가장 강한 활성을 나타내었다. Hexane fraction을 GC-MS로 분석하여 chromatogram상의 각각의 peak에 해당하는 mass spectrum과 Wiley library를 비교하여 profiling 한 결과, essential oil인 d-limonene, ${\gamma}$-terpinene, ${\beta}$-linalool, terpineol과 지방산인 palmitic acid, 9,12-octadecadienoic acid, linolenic acid 그리고 steroid 화합물인 stigmasterol이 검출되었다. 이들 검출화합물 중에서 항균 활성물질로 추정되는 d-limonene, ${\gamma}$-terpinene, ${\beta}$-linalool, terpineol의 항균 활성을 검정하기 위해 표준품을 사용하여 bioassay한 결과 두 화합물 d-limonene, ${\gamma}$-terpinene에서 높은 항균활성을 보였다. 따라서 본 연구를 통해 청피로부터 분리한 d-limonene과 ${\gamma}$-terpinene 화합물이 항균 활성물질인 것을 구명하였다. 항균력이 강한 청피 추출물 또는 d-limonene과 ${\gamma}$-terpinene을 주성분으로 하는 추출물을 수박 과실썩음병에 대한 친환경 방제용 자제로 개발이 가능할 것으로 판단되었다.
Kang, In Jeong;Kang, Mi-Hyung;Noh, Tae-Hwan;Shim, Hyeong Kwon;Shin, Dong Bum;Heu, Suggi
The Plant Pathology Journal
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제32권6호
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pp.575-579
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2016
Burkholderia glumae (bacterial grain rot), Xanthomonas oryzae pv. oryzae (bacterial leaf blight), and Acidovorax avenae subsp. avenae (bacterial brown stripe) are major seedborne pathogens of rice. Based on the 16S and 23S rDNA sequences for A. avenae subsp. avenae and B. glumae, and transposase A gene sequence for X. oryzae pv. oryzae, three sets of primers had been designed to produce 402 bp for B. glumae, 490 bp for X. oryzae, and 290 bp for A. avenae subsp. avenae with the $63^{\circ}C$ as an optimum annealing temperature. Samples collected from naturally infected fields were detected with two bacteria, B. glumae and A. avenae subsp. avenae but X. oryzae pv. oryzae was not detected. This assay can be used to identify pathogens directly from infected seeds, and will be an effective tool for the identification of the three pathogens in rice plants.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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