Lim, Chae Eun;Choi, Jung Nam;Kim, In A;Lee, Shin Ae;Hwang, Yong-Sic;Lee, Choong Hwan;Lim, Jun
Molecules and Cells
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제25권3호
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pp.368-375
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2008
Approximately 120 UDP-glycosyltransferases (UGTs), which are classified into 14 distinct groups (A to N), have been annotated in the Arabidopsis genome. UGTs catalyze the transfer of sugars to various acceptor molecules including flavonoids. Previously, UGT71C1 was shown to glycosylate the 3-OH of hydroxycinnamates and flavonoids in vitro. Such secondary metabolites are known to play important roles in plant growth and development. To help define the role of UGT71C1 in planta, we investigated its expression patterns, and isolated and characterized a loss-of-function mutation in the UGT71C1 gene (named ugt71c1-1). Our analyses by quantitative real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (qRT-PCR), microarray data mining, and histochemical detection of GUS activity driven by the UGT71C1 promoter region, revealed the tissue-specific expression patterns of UGT71C1 with highest expression in roots. Interestingly, upon treatment with methyl viologen (MV, paraquat), ugt71c1-1 plants displayed enhanced resistance to oxidative stress, and ROS scavenging activity was higher than normal. Metabolite profiling revealed that the levels of two major glycosides of quercetin and kaempferol were reduced in ugt71c1-1 plants. In addition, when exposed to MV-induced oxidative stress, eight representative ROS response genes were expressed at lower levels in ugt71c1-1 plants, indicating that ugt71c1-1 probably has higher non-enzymatic antioxidant activity. Taken together, our results indicate that ugt71c1-1 has increased resistance to oxidative stress, suggesting that UGT71C1 plays a role in some glycosylation pathways affecting secondary metabolites such as flavonoids in response to oxidative stress.
Kim, Do-Man;Seo, Eun-Seong;Lee, Jin-Ha;Kang, Hee-Kyoung;Cho, Jae-Young
한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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한국미생물생명공학회 2004년도 Annual Meeting BioExibition International Symposium
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pp.215-218
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2004
Dextrans make up a class of polysaccharides that are D-glucans of various structures with contiguous $\alpha$-1longrightarrow6 ~6 glycosidic linkages in the main chains and $\alpha$-1longrightarrow2, $\alpha$-1longrightarrow3, or $\alpha$-1longrightarrow4 branch glycosidic linkages, depending on the specificity of the particular dextransucrase. Glucansucrases that catalyze glucans synthesis from sucrose. When other carbohydrates, in addition to sucrose, are present in the enzyme digest, the enzyme transfers glucose to the carbohydrate acceptors in the secondary reaction that diverts some of the glucose from incorporation into glucan. Many carbohydrate acceptors have been recognized and the products that result are dependent on the particular enzyme and the structure of the particular acceptor. Because of these unique catalytic characteristics, various dextransucrases have many important industrial and medical uses. To improve the understanding of their action mode and extend their applications, this study describes mechanism of glucan synthesis and potential industrial uses of dextransucrases, and our recent findings on the structural, functional organization and directed evolution of the glucansucrases to offer for designing glucansucrases with improved properties.
N-acetylglucosamine kinase (GlcNAc kinase or NAGK; EC 2.7.1.59) is highly expressed and plays a critical role in the development of dendrites in brain neurons. In this study, the authors conducted structure-function analysis to verify the previously proposed 3D model structure of GlcNAc/ATP-bound NAGK. Three point NAGK mutants with different substrate binding capacities and reaction velocities were produced. Wild-type (WT) NAGK showed strong substrate preference for GlcNAc. Conversion of Cys143, which does not make direct hydrogen bonds with GlcNAc, to Ser (i.e., C143S) had the least affect on the enzymatic activity of NAGK. Conversion of Asn36, which plays a role in domain closure by making a hydrogen bond with GlcNAc, to Ala (i.e., N36A) mildly reduced NAGK enzyme activity. Conversion of Asp107, which makes hydrogen bonds with GlcNAc and would act as a proton acceptor during nucleophilic attack on the ${\gamma}$-phosphate of ATP, to Ala (i.e., D107A), caused a total loss in enzyme activity. The overexpression of EGFP-tagged WT or any of the mutant NAGKs in rat hippocampal neurons (DIV 5-9) increased dendritic architectural complexity. Finally, the overexpression of the small, but not of the large, domain of NAGK resulted in dendrite degeneration. Our data show the effect of structure on the functional aspects of NAGK, and in particular, that the small domain of NAGK, and not its NAGK kinase activity, plays a critical role in the upregulation of dendritogenesis.
Xylitol을 당수용체로하여 당알콜 올리고당 gluosyl-xylitol을 생산하기 위하여 갭술고정화 전세포 CGTase를 제조하고자 하였다. CGTase를 생산하기 위하여 Bacillus macerans를 배양하는 경우 organic form의 질소원을 사용하는 경우 inorganic form의 질소원을 사용하는 경우보다 더 많은 CGTase를 생산하였고 배양도중 탄소원인 starch가 분해되는 동안 CGTase가 생성되었다. B. macerans에 의하여 생산된 CGTase는 80% 이상이 extracellular cnzyme 이며, intracellular enzyme은 20% 이내이었다. E. coh, C. glutamicum, S. cerevisiae 등과 달리 캡슐내부에 B. macerans를 접종하고 캡슐내부에서 고농도로 배양할 수 없었다. 배양액속에 존재하는 CGTase는 다른 이온성 물질들로 인하여 활성탄, Ambolite, Sephadex 등의 흡착제에 흡착시킬 수 없었다. 미생물을 배양한 배양책 전체를 10배로 농축하여 캡슐내에 고정화함으로써 캡슐고정화 전세포 CGTase를 제조할 수 있었다. 농축배양액을 이요하여 제조된 캡슐고정화 전세포 CGTase는 hydrolysis, intermolecular transglycosylation을 수행하였으며, xylitol을 당수용체로 하고 dextrin을 당공여체ㅗ 하여 glucosyl-xylitol을 생산하였다.
The metal complexes can be influenced not only by the central metal atoms and the substituent groups, but also by the native of the chelating atoms. For example, near-infrared absorbing chromophores were synthesized by the reaction of phenylenediamine derivatives with a solution of pottassium hydroxide followed by the addition of nickel(II) chloride. These dyes provide absorbing infrared light over 780-840 nm with an extinction coefficient of $2.5-6.0{\times}10^4$. By introduction of alkyl, alkoxyl, cyano, and other functional group into the parent dye, these dyes greatly improved the solubility in organic solvent. New near-infrared absorbing donor-acceptor chromophores have been investigated by varying the electron donating and accepting strength of the two halves of the molecule. The cyanine chromophores permit the simplest way of obtaining systems that absorb well into the near-infrared region of the spectrum. Cyanine dyes possess high extinction coefficients that initially increase with Increasing chain length. These chromophores could be useful in near-infrared optical materials.
To better understand dissimilatory iron and sulfate reduction (DIR and DSR) by subsurface microorganisms, we investigated the effects of sulfate and electron donors on the microbial goethite (${\alpha}$-FeOOH) reduction. Batch systems were created 1) with acetate or glucose (donor), 2) with goethite and sulfate (acceptor), and 3) with aquifer sediment (microbial source). With 0.2 mM sulfate, goethite reduction coupled with acetate oxidation was limited. However, with 10 mM sulfate, 8 mM goethite reduction occurred with complete sulfate reduction and x-ray absorption fine-structure analysis indicated the formation of iron sulfide. This suggests that goethite reduction was due to the sulfide species produced by DSR bacteria rather than direct microbial reaction by DIR bacteria. Both acetate and glucose promoted goethite reduction. The rate of goethite reduction was faster with glucose, while the extent of goethite reduction was higher with acetate. Sulfate reduction (10 mM) occurred only with acetate. The results suggest that glucose-fermenting bacteria rapidly stimulated goethite reduction, but acetate-oxidizing DSR bacteria reduced goethite indirectly by producing sulfides. This study suggests that the availability of specific electron donor and sulfate significantly influence microbial community activities as well as goethite transformation, which should be considered for the bioremediation of contaminated environments.
Reactions of $Rh(ClO_4)(CO)(AsPh_3)_2$ with unsaturated nitriles and aldehyde, L, produce a series of new cationic rhodium (I) complexes, $[RhL(CO)(AsPh_3)_2]ClO_4$ (L = $CH_2$ = CHCN, $CH_2$ = C($CH_3$)CN, trans-$CH_3CH$ = CHCN, $CH_2$ = CH$CH_2$CN, trans-$C_6H_5CH$ = CHCN, and trans-$C_6H_5CH$ = CHCHD) where L are coordinated through the nitrogen and oxygen, respectively but not through the ${\pi}$-system of the olefinic group. Dissociation constants for the reaction, $[RhL(CO)(AsPh_3)_2]ClO_4$$\rightleftharpoons$$Rh(ClO_4)(CO)(AsPh_3)_2$ + L, have been measured to be $1.20{\times}10^{-4}$ M (L = $CH_2$ = CHCN), $1.05{\times}10^{-4}$ M (L = $CH_2$ = C($CH_3$)CN, $3.26{\times}10^{-5}$ M (L = trans-$CH_3$CH = CHCN) and $6.45{\times}10^{-5}$ M (L = $CH_2$ = CH$CH_2$CN) in chlorobenzene at $25^{\circ}C, and higher than those of triphenylphosphine complexes, $[RhL(CO)(AsPh_3)_2]ClO_4$ where L are the corresponding nitriles that are coordinated through the nitrogen atom. The differences in dissociation constants seem to be predominantly due to the differences in ${\Delta}H$ (not due to the differences in ${\Delta}S$). The weaker Rh-N (unsaturated nitriles) bonding in $AsPh_3$ complexes than in $PPh_3$ complexes (based on ${\Delta}H$ values) suggests that the unsaturated nitriles in 2∼5 are good ${\sigma}$-donor and poor ${\pi}$-acceptor.
Ziheng Huang;Ruifeng Niu; Depeng Wang;Weitian Wang
한국재료학회지
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제34권7호
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pp.321-329
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2024
In this work, a series of BaTiO3-based ceramic materials, Ba(Al0.5Nb0.5)xTi1-xO3 (x = 0, 0.04, 0.06, 0.08), were synthesized using a standard solid-state reaction technique. X-ray diffraction profiles indicated that the Al+Nb co-doping into BaTiO3 does not change the crystal structure significantly with a doping concentration up to 8 %. The doping ions exist in Al3+ and Nb5+ chemical states, as revealed by X-ray photoelectron spectroscopy. The frequency-dependent complex dielectric properties and electric modulus were studied in the temperature range of 100~380 K. A colossal dielectric permittivity (>1.5 × 104) and low dielectric loss (<0.01) were demonstrated at the optimal dopant concentration x = 0.04. The observed dielectric behavior of Ba(Al0.5Nb0.5)xTi1-xO3 ceramics can be attributed to the Universal Dielectric Response. The complex electric modulus spectra indicated the grains exhibited a significant decrease in capacitance and permittivity with increasing co-doping concentration. Our results provide insight into the roles of donor and acceptor co-doping on the properties of BaTiO3-based ceramics, which is important for dielectric and energy storage applications.
Single-crystal $ZnIn_2S_4$ layers were grown on a thoroughly etched semi-insulating GaAs (100) substrate at $450^{\circ}C$ with a hot wall epitaxy (HWE) system by evaporating a $ZnIn_2S_4$ source at $610^{\circ}C$. The crystalline structures of the single-crystal thin films were investigated via the photoluminescence (PL) and Double-crystal X-ray rocking curve (DCRC). The temperature dependence of the energy band gap of the $ZnIn_2S_4$ obtained from the absorption spectra was well described by Varshni's relationship, $E_g(T)=2.9514\;eV-(7.24{\times}10^{-4}\;eV/K)T2/(T+489K)$. After the as-grown $ZnIn_2S_4$ single-crystal thin films was annealed in Zn-, S-, and In-atmospheres, the origin-of-point defects of the $ZnIn_2S_4$ single-crystal thin films were investigated via the photoluminescence (PL) at 10 K. The native defects of $V_{Zn}$, $V_S$, $Zn_{int}$, and $S_{int}$ obtained from the PL measurements were classified as donor or acceptor types. Additionally, it was concluded that a heat treatment in an S-atmosphere converted $ZnIn_2S_4$ single crystal thin films into optical p-type films. Moreover, it was confirmed that In in $ZnIn_2S_4$/GaAs did not form a native defects, as In in $ZnIn_2S_4$ single-crystal thin films existed in the form of stable bonds.
김치 시료로부터 자동산화되지 않으며 열 및 중성 pH에서 안정한 AA 유도체인 AA-2G를 생산할 수 있는 당전이활성을 가진 CGTase 생산균주를 분리하였고, 분리균주의 형태학적, 배양학적, 생리학적 성질 및 16s-rDNA sequences를 조사한 결과 그람 양서의 간균으로 호기성이며 내생포자를 형성하는 전형적인 중온성 Bacillus sp. JK-43으로 동정되었다. Bacillus sp. JK-43의 CGTase는 AA-2G 뿐만 아니라 AA-6G로 추정되는 물질을 함께 생산하였으며, 효소 최적생산조건은 1.0% soluble starch, 1.0% yeast extract, 1.0% $Na_2CO_3\;0.1%\;K_2HPO_4,\;그리고\;0.02%\;MgSO_4{\cdot}7H_2O$가 함유된 배지에서 pH 7.0, $37^{\circ}C$에서 26시간 동안 진탕배양하였을 때였다. 각종 당공여채에 따른 Bacillus sp. JK-43의 AA-2G 생산성을 조사한 결과 ${\beta}-CD$에서 가장 높은 AA-2G 생산성을 보였으며, 식혜제도페액인 엿기름 및 밥당화액에서도 비교적 높은 AA-2G 생산성을 보였다. 또한 여러 가지 당수용체에 대한 JK-43의 CGTase의 당전이 반응을 검토한 결과 sucrose, mannitol 및 inositol에서 높은 당전이 수율인 70~90%를 나타내었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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