• 제목/요약/키워드: ATPase/helicase motif

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Functional Analysis of RAD4 Gene Required for Nucleotide Excision Repair of UV-induced DNA Damage in Saccharomyces cerevisiae

  • Park, Sang Dai;Park, In Soon
    • Animal cells and systems
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    • 제6권4호
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    • pp.311-315
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    • 2002
  • The RAD4 gene is essential for nucleotide excision repair in Saccharomyces cerevisiae. It has been known that the deduced amino acid sequence of Rad4 protein contains three DNA-dependent ATPase/helicase motifs. To determine the biochemical activities and functional role of RAD4 the Rad4 protein was expressed and purified. Immunoblot analysis showed a specific band of 21 kDa, which was well-matched with the size of open reading frame of the RAD4 gene. The purified Rad4 protein had no detectable helicase activity. However, the protein could interact with double stranded oligonucleotides, as judged by mobility shift assay. This result suggests that the Rad4 protein is a DNA binding protein.

Schizosaccharomyces pombe에서 SNF2에 속하는 hrp2+ 유전자의 특성 연구 (Isolation and Characterization of hrp2+ Gene Related to SNF2 Family In Yeast)

  • 최인순
    • 생명과학회지
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    • 제15권2호
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    • pp.192-196
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    • 2005
  • 본 연구는 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe에서 여러 가지 DNA 절제회복 및 유전자 발현에 관여하는 SNF2/SW12유전자의 기능을 연구하기 위하여 이에 관련되는 유전자를 분리하고 그 특성을 연구하였다. SNF2 motif의 conserved sequence를 primer로 하여 중합효소 연쇄반응 (PCR) 방법으로 480 bp 크기의 DNA fragment를 분리하여, 이를 probe로 하여 효모에서 hrp2+ 유전자를 분리하였다. 분리한 hrp+ 유전자의 sequence homology를 비교한 결과 3개의 SNF2 motif를 포함하고 있었다. hrp2+ 유전자의 전사체 크기는 4.7kb임을 Northern hybridization으로 확인하였다. 분리한 유전자의 특성 연구를 위하여 Northern hybridization 으로 hrp2+ 유전자의 UV와 MMS에 대한 유도성을 조사한 결과 자외선에 대해서만 유전자의 발현이 유도되었다. 이 결과 분리한 hrp2+는 UV-inducible 유전자임을 확인하였다. 또한 분리한 유전자의 특성연구 중 하나로 hrp2+ 단백질을 분리하여 helicase activity를 측정하였다. 이 결과 분리한 hrp2+ 유전자는 전혀 helicase activity를 나타내지 않았다.