• 제목/요약/키워드: A2 mating type

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Genetic variation of Phytophthora infestans by RAPD analysis

  • Lee, Yun-Soo;Jeong young Song;Kim, Nam-Kyu;Nam Moon;Park, Hye-Jin;Kim, Hong-Gi
    • 한국식물병리학회:학술대회논문집
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    • 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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    • pp.116.2-117
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    • 2003
  • Late blight, caused by Phytophthora infestans, is one of the most destructive disease on potato and tomato cultivation. To analysis genetic diversity P. infeatans isolates were collected from potato and tomato fields in Korea. These pathogens contained both Al and A2 mating type with metalaxyl-resistant and sensitive isolates. Polymorphisms showed base on RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) in both potato and tomato isolates of P. infestans. Cluster analysis showed high level genetic variation in potato isolates of P. infestans than tomato isolates. P. infestans isolates were observed genetic diversity among them but not grouped among isolates related mating type and metalaxyl response. These results exhibited that P. infestans isolates showing genetic difference among them were distributed in Korea.

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Changes in the Sensitivity to Metalaxyl, Dimethomorph and Ethaboxam of Phytophthora infestans in Korea

  • Zhang, Xuan-Zhe;Ryu, Kyoung-Yul;Kim, Jeom-Soon;Cheon, Jung-Uk;Kim, Byung-Sup
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제21권1호
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    • pp.33-38
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    • 2005
  • Changes of control efficacy of chemical to potato late blight caused by Phytophthora infestans in potato fields from 2001 to 2004 were examined. Control efficacy of metalaxyl was suddenly decreased from 100% in 2002 to 50% in 2004 and that of dimethomorph also was similar to those of metalaxyl. However, the control efficacy of ethaboxam no great change. Both A1 and A2 mating type isolates were isolated from 2001 to 2004 in several areas in Korea. The majority of the P. infestans isolates were A1 mating type. Total 939 isolates of P. infestans obtained from several areas in Korea from 2001 to 2004 were examined for changes of sensitivity to metalaxyl. Frequencies of metalaxyl resistance isolates were gradually increased from 17% in 2001 to 84.2% in 2004, but isolation frequencies of metalaxyl sensitive and intermediate resistant isolate were decreased. Cause of decreasing control efficacy of metalaxyl was thought by increase of resistance isolates in A1 mating type population according to increasing metalaxyl use. Most isolates were grown at 0.5 ${\mu}g/ml of dimethomorph and isolates grown at 1 ${\mu}g/ml of dimethomorph were approximately 10.2-22.9%. However, no isolate was able to grow at 5.0 ${\mu}g/ml. Based on these results, minimum inhibitory concentrations (MIC) of dimethomorph to P. infestans were determined to be 0.5-1.0 ${\mu}g/ml. Our results indicated that the reason decreasing control efficacy of dimethomorph was not caused by occurrence of resistant isolates. About 5% and 12.1% isolates among the total isolates collected in 2003 and 2004 were grown on V-8 juice rye agar containing 1.0 ${\mu}g/ml ethaboxam. The 2.1 and 25.4% isolates had MICs of 0.2-0.4 ${\mu}g/ml, and MIC values of 87.9% and 74.3% isolates were less than 0.2 ${\mu}g/ml concentrations of ethaboxam. Therefore, resistance development by P. infestans to ethaboxam is not likely to occur in the natural condition.

종모돈의 정액성상과 번식성적에 미치는 품종, 연령, 계절, 산차 및 교배방법의 영향 (Effect of Breed, Age, Season, Parity and Mating Type on Boar Semen Characteristics and Fertilizing Capacity)

  • 전용민;윤희진;이종관;손영곤;강권;박창식
    • 한국가축번식학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.209-216
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    • 2000
  • 본 연구는 1996년부터 1999년까지 다비 AI 센타에서 사육되는 종모돈 199두와 종빈돈 4,181두를 가지고 종모돈의 정액생산과 번식성적에 미치는 품종, 연령, 계절, 산차 및 교배방법의 영향을 구명하고자 실시한 바, 그 얻어진 결과는 다음과 같았다. 1. 정액량은 Landrace (L) 종이 266.8 $m\ell$로 제일 많았고, Yorkshire (Y) 종이 그 다음으로 많았으며, Duroc (D) 종이 제일 적었다. 정자 운동성은 품종간에 차이가 없었다. 정자농도는 Landrace 종이 4.7$\times$109 sperm/$m\ell$로 제일 낮았고, 정액량이 제일적은 Duroc 종이 5.7$\times$$10^{9}$ sperm/$m\ell$ 로 제일 높았다. 종모돈의 연령에 따른 정액량은 2세 때가 213.3 $m\ell$로 제일 많았고, 4, 3 그리고 l 세의 순서로 정액량이 감소하였다. 2. 종모돈의 계절에 따른 정액량은 겨울철이 228.6 $m\ell$로 제 일 많았고, 가을, 여름, 봄의 순서로 정액량이 감소하였다. 정자농도는 봄철이 5.9$\times$109 sperm/$m\ell$로 제일 높았으며, 여름, 겨울, 그리고 가을의 순서로 낮았다. 3. 교배방법에 따른 복당 생시체중은 품종간 처리구간에 차이점을 인정할 수 없었으나 복당 출생시 생존수에 있어서는 자연종부후 인공수정을 실시한 처리구에서 9.5두로 제일 많았으며, 인공수정을 실시한 처리구에서는 9.2두, 그리고 자연종부를 실시한 처리구에서는 8.9두로 처리구간에 유의성 (P<0.01)이 인정되었다. 4. 교배그룹간에서는 L (우)$\times$Y (♂) 교배조합과 L (♀)$\times$L (♂) 교배조합이 Y (♀)$\times$ L (♂) 교배조합 Y (♀)$\times$Y (♂) 교배조합보다 복당 생시체중이 무거웠으며, 복당 출생시 생존 자돈수에 있어서도 비슷한 경향을 나타내었다. 자연종부와 인공수정간에 복당 생시체중과 복당 출생시 생존자돈수는 유의차가 없었다. 5. 산차간에 있어서는 2~6 산차의 복당 생시체중과 복당 출생시 생존 자돈수가 각각 13.5 kg 과 9.5 두로 1산차와 7~9 산차에 비하여 우수하였다.

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Rare Mating에 의한 양초효모에서의 glucoamylase 발현 균주 HCS 선별 및 특성 (Characterization of Brewing Yeast Expressing Glucoamylase Selected by Rare Mating.)

  • 최병주;장금일;김광엽
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제29권4호
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    • pp.212-220
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    • 2001
  • S. cerevisiae HBC52와 S, diataticus K114 의 rare mating 에 의해 개발된 HCS 균주들은 크기가 약 $13\mu\textrm{m}$ karyotype 분석결과 K114 균주에만 있는 약 1150kb 분자량을 가지는 염색체 band를 유지하였으며 전분을 분해하여 halo 를 형성하였다. Glucoamylase 활성은 약 2.7~3.4 unti/ml 를 가진 균주임이 밝혀졌으며 당 발효실험과 응집성 실험을 수행한 결과 HBC52 균주와 유사한 당 발효특성을 보이고 응집성 특성도 약응집성의 floculation type으로 비슷하였다. 그리고 HCS 균주의 포자형성과 피막형성 유무 실험에서는 양조효모인 HBC52 균주와 같이 포자가 형성되지 않았으며, 피막도 형성되지않았다. 균주들의 최종당도 실험은 HBC52균주가 약 68%의 발효수준을 나타냈고, HCS 균주들은 이 보다 높은 76~78%의 수준을 보였따. 즉 HBC52 균주가 최종당도($ 2.00^{\circ}$P)를 보인 반면 HCS 균주들은 ($0.7~0.93^{\circ}$P)를 보이는 결괄르 나타내어 맥주양조에서 low carbohydrate beer를 생산할 수있음이 확인되었다.

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경쟁배타에 의한 생태적 진화: 세포성 점균 Polysphondylium pallidum에 대한 실험적 접근 (Ecological Evolution by Competitive Exclusion / An Experimental Approach with Cellular Slime Mold , Polysphondylium pallidum)

  • 최형선
    • The Korean Journal of Ecology
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    • 제17권3호
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    • pp.299-310
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    • 1994
  • 종 내의 클론 상호작용은 개체군 구조에 중요한 영향을 미친다. 본 연구는 클론간의 경쟁에 의해 개체군 내에서 진화적 변화가 일어날 수 있는 가를 조사하고, 균일한 실험실 배양 조건에서 어떻게 다양한 클론이 진화하는지를 밝히고자 하였다. 자원소비율과 교배형이 다른 Polysphondylium pallidum의 클론들이 선택되었다. 실험은 T0에서 T4까지 4번의 시간 간격을 두고 시행되었다. 접종 후 자실체를 수확할 때까지의 한 번의 실험기간은 10~14일 정도 소요되었다. T0의 50개의 클론으로부터 일련의 실험기간 T1, T2, T3, T4에서 50 클론이 두 세트씩 만들어졌다. 개체군들의 자원소비율 변동은 T0와 두세트의 T4 클론들간에 비교되었다. 각 클론은 실험 시작 후 48~56세대가 지난 후에도 균일하고 제한된 Cerophyl 배지 환경에서 다양한 자원 소비율 즉, 다양한 생장율을 보였다. 생장율이 다른 다양한 클론은 서식처가 이질적인 토양 미세 환경 뿐만 아니라 한 장소의 균질한 배양 접시 속에서도 공존 할 수 있었다. 높은 클론 다양성은 한 개체군내의 클론에서 다른 클론을 만날 기회를 제공해 주었고 개체군내의 클론 경쟁이 활발히 일어났다. T0에서 T4까지의 총 실험 기간동안 교배형 I이었던 37개의 클론중에서 한 개체군의 31개가 교배형 II로 바뀌어 클론간에 일어난 경쟁배타율은 0.838이었다. 각 교배형의 출현 빈도는 연속적인 다음 세대마다 0.93~1.29% 만큼 바뀌었다. 2.6X108밀도의 박테리아를 먹이로 제공해 준 실험실 환경에서 한 세대가 지날 때 마다 한 클론에서 다른 클론으로 변화하는 진화적 변화확률이 1.26~1.75%라는 것을 의미한다.

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칡소의 MC1R의 유전자형에 따른 교배 조합이 자손의 모색과 유전자형 변이에 미치는 영향 (Effects of Genotype Mutation and Coat Color Phenotype on the Offspring from Mating System of MC1R Genotype Patterns in Korean Brindle Cattle)

  • 김상환;정경섭;이호준;백준석;정덕원;김대은;윤종택
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.215-222
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    • 2013
  • Bovine coat color is decided by the melanocortin receptor 1 (MC1R) genotype mutation and melanogenesis. Specially, in the various cattle breeds, dominant black coat color is expressed by dominant genotype of $E^D$, red or brown is expressed in the frame shift mutation of recessive homozygous e by base pair deletion and wild type of $E^+$ is expressed in various coat colors. However, not very well known about the effected of MC1R genotype mutation on the coat color through family lines in KBC. Therefore, this study were to investigate effect of MC1R genotype mutation on the coat color, and to suggest mating breed system in accordance with of MC1R genotype for increased on brindle coat color appearance. Parents (sire 2 heads and dam 3 heads) and offspring (total : 54 heads) from crossbreeding in KBC family line with the MC1R genotype and phenotype records were selected as experimental animals. The relationship between melanocortin 1 receptor (MC1R) genotypes expression verified by PCR-RFLP, and brindle coat color appearance to the family line of the cross mating breed from MC1R genotype pattern was determined. As a result, 4MC1R genetic variations, $E^+/E^+$ (sire 1), $E^+/e$ (sire 2 and dam 3), $E^+/e$ with 4 bands of 174, 207 and 328 bp (dam 1) and $E^+/e$ with 3 bands of 174, 207, 328 and 535 bp (dam 2) from parents (sire and dam) of KBC. However, 3 genetic variations, e/e (24%), $E^+/E^+$ (22%) and $E^+/e$ (56%) were identified in offspring. Also, brindle coat color expressrated was the e/e with the 0%, $E^+/E^+$ with 67% and $E^+/e$ with 77% from MC1R genotype in offspring on the cross mating of KBC. Furthermore, when the sire had $E^+/e$ genotype and the dam had $E^+/E^+$ with the 3 bands or $E^+/e$ genotype, and both had whole body-brindle coat color, 62% of the offspring had whole body-brindle coat color. Therefore, the seresults, the mating system from MC1R genotype patterns of the sires ($E^+/e$) and dams ($E^+/E^+$ with the 3 bands or $E^+/e$) with brindle coat color may have the highest whole body-brindle coat color expression in their offspring.

Functional Characterization of cAMP-Regulated Gene, CAR1, in Cryptococcus neoformans

  • Jung, Kwang-Woo;Maeng, Shin-Ae;Bahn, Yong-Sun
    • Mycobiology
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    • 제38권1호
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    • pp.26-32
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    • 2010
  • The cyclic AMP (cAMP) pathway plays a major role in growth, sexual differentiation, and virulence factor synthesis of pathogenic fungi. In Cryptococcus neoformans, perturbation of the cAMP pathway, such as a deletion in the gene encoding adenylyl cyclase (CAC1), causes defects in the production of virulence factors, including capsule and melanin production, as well as mating. Previously, we performed a comparative transcriptome analysis of the Ras- and cAMP- pathway mutants, which revealed 163 potential cAMP-regulated genes (38 genes at a 2-fold cutoff). The present study characterized the role of one of the cAMP pathway-dependent genes (serotype A identification number CNAG_ 06576.2). The expression patterns were confirmed by Northern blot analysis and the gene was designated cAMP-regulated gene 1 (CAR1). Interestingly, deletion of CAR1 did not affect biosynthesis of any virulence factors and the mating process, unlike the cAMP-signaling deficient cac1$\Delta$ mutant. Furthermore, the car1$\Delta$ mutant exhibited wild-type levels of the stress-response phenotype against diverse environmental cues, indicating that Car1, albeit regulated by the cAMP-pathway, is not essential to confer a cAMP-dependent phenotype in C. neoformans.

금개구리(Rana plancyi)의 소리 유형과 수온에 따른 소리변화 (The Call Patterns and the Change of Calls by Water Temperature in Rana plancyi (Amphibia, Anura))

  • 박시룡;이병근;양서영
    • The Korean Journal of Ecology
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    • 제21권3호
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    • pp.269-276
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    • 1998
  • The study of the Rana plancyi, was done during the calling period at a pond in Osong, Chungbuk, Korea from May to the middle of August of 1996 and 1997. Five basic types of call-A, B, C, D, E, - were identified in Rana plancyi according to the structure of call types. The structure of A type call has only one pulse, B type call has two pulses and C, D type call has one separated pulse which is called introductory call and pulse group as follow it. On the other hand, E type call has 3-6 separate pulses. The interval between introductory call and pulse group is $0.73{\pm}0.29$ s(n=159) in C type call and $0.60{\pm}0.21$ s (n=48) in D type call. The number of pulses in the pulse group is $30.08{\pm}8.69$ in C type call and $15.78{\pm}2.40$ in D type call. An increase in water temperature induces a decrease in C and D type call duration (C type call r= -0.4153, p<0.001, D type call r=-0.7064, p<0.001). In case of C and D type call, the interval between introductory call and pulse group influenced more call duration than pulse group duration. We regarded A, B type call as a territorial call and C, D type call as a mating call and we recognized that E type call has the function of threat or alarm.

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Phytophthora nicotianae에 의한 아이비줄기썩음병 (Stem Rot of English Ivy Caused by Phytophthora nicotianae)

  • 김형무;진교훈;고정애
    • 식물병연구
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    • 제14권2호
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    • pp.122-126
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    • 2008
  • 2007년 7월 전북 전주의 식물원에서 판매중인 아이비에서 줄기와 잎이 갈색으로 썩으며 급격히 말라죽는 증상으로부터 병원균을 분리 동정한 결과 Phytophthora nicotianae로 동정되었다. 병원균의 형태적 특성은 유두돌기가 있고 탈락성이 없는 난형의 유주자낭을 형성하였고, 크기는 평균 $35.4{\times}25.2{\mu}m$었고, 구형의 후막포자를 다량 형성하였으며, 크기는 평균 직경이 28.5 ${\mu}m$였다. 유성생식형은 자웅이주로 A1 mating type이 관찰되었고 난포자의 크기는 평균 직경이 23.3 ${\mu}m$였다. 균사의 생육적온은 $25{\sim}30^{\circ}C$였다. P. nicotianae에 의한 아이비줄기썩음병의 발생은 국내에서는 처음이다.

Construction of a CRISPR/Cas9-Mediated Genome Editing System in Lentinula edodes

  • Moon, Suyun;An, Jee Young;Choi, Yeon-Jae;Oh, Youn-Lee;Ro, Hyeon-Su;Ryu, Hojin
    • Mycobiology
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    • 제49권6호
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    • pp.599-603
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    • 2021
  • CRISPR/Cas9 genome editing systems have been established in a broad range of eukaryotic species. Herein, we report the first method for genetic engineering in pyogo (shiitake) mushrooms (Lentinula edodes) using CRISPR/Cas9. For in vivo expression of guide RNAs (gRNAs) targeting the mating-type gene HD1 (LeA1), we identified an endogenous LeU6 promoter in the L. edodes genome. We constructed a plasmid containing the LeU6 and glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (LeGPD) promoters to express the Cas9 protein. Among the eight gRNAs we tested, three successfully disrupted the LeA1 locus. Although the CRISPR-Cas9-induced alleles did not affect mating with compatible monokaryotic strains, disruption of the transcription levels of the downstream genes of LeHD1 and LeHD2 was detected. Based on this result, we present the first report of a simple and powerful genetic manipulation tool using the CRISPR/Cas9 toolbox for the scientifically and industrially important edible mushroom, L. edodes.