• 제목/요약/키워드: 5a

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PI(3,5)P2 5-phosphatase Fig4와 Kinesin superfamily 5A (KIF5A)의 결합 (PtdIns(3,5)P2 5-phosphatase Fig4 Interacts with Kinesin Superfamily 5A (KIF5A))

  • 장원희;석대현
    • 생명과학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.14-19
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    • 2014
  • Kinesin-1은 2개의 장쇄(KHCs, 또는 KIF5s)와 2개의 단쇄(KLCs)가 결합한 복합체로 되어 있다. 본 연구에서 효모 two-hybrid system을 이용하여 중추신경계의 신경세포에서 주로 발현되는 KIF5A와 결합하는 단백질을 탐색한 결과 phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate ($PI(3,5)P_2$)의 5번 위치 인산을 제거하는 탈인산화효소 Fig4(Sac3)를 분리하였다. KIF5A는 Fig4의 C-말단과 결합함을 효모 two-hybrid assay로 확인하였다. Fig4는 KIF5A의 C-말단과 결합하지만, 두 개의 다른 장쇄인 KIF5B와 KIF5C 그리고 KLC1와는 결합하지 않았다. 단백질 간 결합을 glutathione S-transferase pull-down assay와 공동면역침강으로 추가 검증하였다. 생쥐의 뇌 파쇄액을 KIF5A 항체로 면역 침강한 결과 Fig4가 같이 침강하였다. 이러한 결과들은 kinesin-1이 Fig4와 결합한 단백질 복합체 혹은 운반체를 세포 내에서 운반함을 시사한다.

감자로부터 Eukaryotic Translation Initiation Factor 5A (elF-5A) 유전자의 동정 및 발현 분석 (Isolation and Characterization of Eukaryotic Translation Initiation Factor 5A (eIF-5A) from Potato)

  • 인준교;신동호;최관삼;양덕춘
    • 식물조직배양학회지
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    • 제28권5호
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    • pp.283-287
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    • 2001
  • 감자 (Solanum tuberosum L. cv. Irish Cobbler)의 괴경형성과정 (tuberization) 동안에 발현하는 유전자들의 발현양상을 조사하고자 differential display법을 실시하였다. Differential display를 이용하여 분리된 eIF5A DNA단편을 probe로 사용하여 감자의 cDNA library screening을 통하여 eIF5A full-length cDNA를 감자에서 처음으로 분리하였다. 감자의 eIF5A, clone은 토마토의 eIF5A cDNA 염기서열과 94.8%. 아미노산 서열에서는 97.5%로 매우 높은 유사성을 나타내었다. 감자의 eIF5A 유전자는 길이가 716 bp로 하나의 단백질 code영역 (ORF)을 포함하고 있었다. 이 영역은 분자량 17.4 kD, pI 5.5로 추정되는 160개의 아미노산으로 구성된 eIF5A단백질을 code하고 있었다. eIF5A 단백질들에서 12개의 아미노산 서열 (STSKTGKHGHAK)은 효모에서 사람에 이르기까지 완벽하게 보존되어 있는 것으로 알려져 있는데, 감자에서도 또한 잘 보존되어 있었다. 이 영역은 eIF5A 단백질의 활성을 나타내는 데 있어서 필수적인 hypusine을 생성하는 전사 후 수식 부위가 들어 있는 아주 중요한 곳이다. 감자에서 eIF5A 유전자의 발현양상을 조사한 결과 감자의 전조직에서 발현을 보였는데, 성숙잎이나 괴경보다는 세포분열 및 물질축적이 활발히 일어나고 있는 꽃기관들 (stamen, ovary, petal. sepal), 과실 (fruit)과 stolen 등의 조직들에서 비교적 활발히 발현되고 있었다.

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방사선유도 돌연변이체 Bacillus lentimorbus WJ5a17에 의한 Pythium Root rot의 방제 (Biological Control of Pythium Root Rot by Radiation Induced Mutant, Bacillus lentimorbus WJ5a17)

  • 이영근;김재성;장병일;장유신;이호용
    • 환경생물
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    • 제21권3호
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    • pp.276-285
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    • 2003
  • Pythium ultimum에 의한 뿌리썩음병을 생물학적으로 방제하기 위하여 이에 대한 항진균 활성이 있는 세균 Bacillus lentimorbus WJ5를 방사선 ($^{60}Co$)을 조사하여 보다 더 강한 항진균 활성을 가지는 돌연변이체 B. lentimorbus WJ5a17을 유도하였다. B. lentimorbus WJ5와 WJ5a17을 각각 활용한 미생물제제 FWJ5와 FWJ5a17을 조제하였으며 균체수는 $1.0\times 10^{11}$ CFU $g^{-1}$ 이였다. 미생물제제는 저장 30일째에도 항진균 세균이 $50.\times 10^{10}$ $g^{-1}$ 이상 생존하였고, 상토와 밭 토양에서는 $1.0\times 10^{7}$ CFU $g^{-1}$이상의 생존세포수를 유지하였다. 또한 P. ultimum의 포자발아를 B. lentimorbus WJ5 제제 (FWJ5)가 71.0% 억제하였고, B. lentimorbus WJ5a17 제제(FWJ5a17)는 81.4%억제하였다. 미생물제제인 FWJ5와 FWJ5a17은 고추, 배추와 무의 종자 발아와 초기생장에 유해한 영향을 주지 않을 뿐만 아니라, 작물 생육초기와 중기에 1회 처리하였을 경우에도 P ultimum에 의한 뿌리썩음병징의 발생을 유의하게 (p<0.05) 억제하였기에 매우 효과적인 생물학적 제어제임을 알 수 있었다.

Crystal Structures of Substrate and Inhibitor Complexes of Ribose 5-Phosphate Isomerase A from Vibrio vulnificus YJ016

  • Kim, Tae Gyun;Kwon, Taek Hun;Min, Kyoungin;Dong, Mi-Sook;Park, Young In;Ban, Changill
    • Molecules and Cells
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    • 제27권1호
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    • pp.99-103
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    • 2009
  • Ribose-5-phosphate isomerase A (RpiA) plays an important role in interconverting between ribose-5-phosphate (R5P) and ribulose-5-phosphate in the pentose phosphate pathway and the Calvin cycle. We have determined the crystal structures of the open form RpiA from Vibrio vulnificus YJ106 (VvRpiA) in complex with the R5P and the closed form with arabinose-5-phosphate (A5P) in parallel with the apo VvRpiA at $2.0{\AA}$ resolution. VvRpiA is highly similar to Escherichia coli RpiA, and the VvRpiA-R5P complex strongly resembles the E. coli RpiA-A5P complex. Interestingly, unlike the E. coli RpiA-A5P complex, the position of A5P in the VvRpiA-A5P complex reveals a different position than the R5P binding mode. VvRpiA-A5P has a sugar ring inside the binding pocket and a phosphate group outside the binding pocket: By contrast, the sugar ring of A5P interacts with the Asp4, Lys7, Ser30, Asp118, and Lys121 residues; the phosphate group of A5P interacts with two water molecules, W51 and W82.

Synthesis of Hydroxylactams and Esters Derived from Thalidomide and Their Antitumor Activities

  • Sun, Guanglong;Liu, Xiangchao;Zhou, Heng;Liu, Zenglu;Mao, Zhenmin
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제35권5호
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    • pp.1337-1342
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    • 2014
  • A novel and convenient route for the synthesis of a series of thalidomide derivatives is described. Compound 2 was cyclized with different amines under alkaline condition to obtain 4-nitro substituted phthalimidines 3a-d. Hydroxylactams 4a-d were produced via bromination and hydroxylation. Different acyl chlorides were reacted with hydroxylactams to provide the desired esters 5a-d. All compounds were evaluated by MTT assay for their inhibitory activities against HCT-116, MG-63, MCF-7, HUVEC and HMVEC cell lines in vitro. Most of them showed no obvious cytotoxic effect on normal human cells, compounds 4a-d, $5a_2$, $5a_4$, $5a_5$, $5b_2$, $5c_2$ and $5d_2$ exhibited potent antitumor activities, among which compounds $5a_2$ and $5b_2$ were more effective than 5-FU.

항균성을 가진 Tetrazolo[1,5-a]quinoxaline류의 합성 (Synthesis of Tetrazolo[1,5-a]quinoxalines with Antimicrobial Activity)

  • 김호식;김동은
    • 대한화학회지
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    • 제45권4호
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    • pp.325-333
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    • 2001
  • 4-치환 tetrazolo[1,5-a]quinoxaline류는 4-chlorotetrazolo[1,5-a]quinoxaline(8) 또는 4hydra-zino-[1,5-a]quinoxaline(9)으로부터 합성하였다. N,N-디메틸포름아미드 용매에서 tetrazololo[1,5-a]quinoxaline(12)를 환류시켜 1,2,4-triazolo[3,4-c]tetrazolo[1,5-a]quinoxaline (13)을 합성하였으며, 이것은 N,N-디메틸포름아미드 용매에서 화합물 9와 ethyl chloroformate를 반응시켜도 합성할 수 있었다. 화합물 9를 isothiocyanate류와 반응시켜 tetrazololo[1,5-a]quinoxaline류(14)를 합성하였으며, 이것을 dimethyl acethylenedicarboxyla-te와 반응시켜 tetrazololo[1,5-a]quinoxaline류(15)를 합성하였다. 그리고 화합물 9를 alkyl (ethoxymethylene)-cyanoacetate류와 반응시켜 tetrazololo[1,5-a]quinoxaline류(18)를 합성하였다. 합성한 화합물 중에서 몇 가지는 몇 가지 균주에 대하여 항균성, 항진균성 도는 항조류성을 나타내었다.

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열산화법 및 PECVD 법에 의한 T$a_2O_5$ 유전 박막 (T$a_2O_5$Dielectric Thin Films by Thermal Oxidation and PECVD)

  • 문환성;이재석;한성욱;박상균;양승기;이재학;박형호;박종완
    • 한국재료학회지
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    • 제2권5호
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    • pp.353-359
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    • 1992
  • 열산화법과 PECVD법으로 p-type (100) Si 기판위에 T$a_2O_5$ 박막을 형성시킨 후 A1/T$a_2O_5$/p-Si capacitor를 제작하였다. 제작된 시편의 제반 물성은 XRD, AES, high frequency C-V analyzer, I-V meter, TEM 등을 사용하여 분석하였다. XRD 분석을 통해 T$a_2O_5$ 박막은 비정질임이 확인되었으며 65$0^{\circ}C$ 열처리의 경우에는 hexagonal $\delta$-T$a_2O_5$ 상으로 결정화가 일어남을 확인할 수 있었다. AES spectrum의 분석을 통해 T$a_2O_5$ 박막의 조성이 2:5의 stoichiometry에 근접해 있음이 관찰되었다. 열산화법에 의해 제작된 T$a_2O_5$는 산화온도 60$0^{\circ}C$의 조건에서 누설전류 5${ imes}10^{-6}$A/c$m^2와 유전상수 31.5로 가장 좋은 성질을 나타냈으며, PECVD로 제작한 T$a_2O_5$는 RF Power가 0.47W/c$m^2일 때 2.5${ imes}10^{-5}$A c$m^2and 24.0으로 가장 좋은 특성을 나타내었다. TEM 분석을 통해 제조된 박막과 계면을 관찰하였다.

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알릴아민 항진균제의 합성과 생물학적 평가 (Synthesis and Biological Evaluation as a Potential Allylamine Type Antimycotics)

  • 정병호;조원제;천승훈;정순영;유진철
    • 약학회지
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    • 제47권5호
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    • pp.293-299
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    • 2003
  • Structure-activity relationship studies of allylamine type of antimycotics were carried out to evaluate the effect of naphthyl and methyl portion of naftifine. Compounds with 4-fluorophenyl(2a-5a), 2-fluorophenyl(2b-5b), 2,4-dichlorophenyl(2c-5c), 2,6-dichlorophenyl(2d-5d), 4-nitrophenyl(2e-5e), and 2,3-dihydro-benzo[1,4]dioxan-6-yl( 2f-5f) instead of naphthyl group with hydrogen(3a-3f), methyl(4a-4f), and ethyl(5a-5f) in the place of methyl in naftifine were synthesized and tested their in vitro anti-fungal activity against five different fungi. Eight compounds(3a, 5a, 3c, 4c, 4d, 5d, 5e, and 4f) showed significant antifungal activity against T. mentagrophytes. (E)-N-Ethyl-(3-phenyl-2-propenyl)-4-nitro-benzenemethaneamine(5e) displayed moderate antifungal activity against all five different fungi.

Iodine Sorption Complexes of Partially Cobalt(II) Exchanged Zeolite A. Two Crystal Structures of $Co_{3.5}Na_5Si_{12}Al_{12}O_{48}\cdot2.5I_2\;and\;Co_{3.5}Na_5Si_{12}Al_{12}O_{48}\cdot5.0I_2$

  • Kim, Yang;Lee, Suk-Hee;Seff, Karl
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제10권5호
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    • pp.426-430
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    • 1989
  • Two crystal structures of iodine sorption complexes of dehydrated partially Co(Ⅱ )-exchanged zeolite A, $Co_{3.5}Na_5-A{\cdot}xI_2$, x = 2.5 and 5.0, have been determined by single crystal X-ray diffraction techniques. Both structures were solved and refined in cubic space group, Pm3m at $21(1)^{\circ}C$. The structures of $Co_{3.5}Na_5-A{\cdot}2.5I_2$(a = 12.173(1) ${\AA}$) and $Co_{3.5}Na_5-A{\cdot}5.0I_2$(a = 12.130(1) ${\AA}$) were refined to the final error indices, $R_1$ = 0.081 and $R_2$ = 0.077 with 261 reflections and $R_1$ = 0.103 and $R_2$ = 0.112 with 225 reflections, respectively, for which I>3${\sigma}$(I). In both structures, 3.5 $Co^{2+}$ ions and 4.5 $Na^+$ ions per unit cell lie at two crystallographically different 6-ring positions. 0.5 $Na^+$ ion lines in an 8-oxygen ring plane. Dehydrated $Co_{3.5}Na_5$-A sorbs 2.5 iodine molecules per unit cell at $70^{\circ}C$ (vapor pressure of $I_2$ is ca. 8.3 torr) within 30 minutes and 5 iodine molecules per unit cell at $80^{\circ}C$ (vapor pressure of $I_2$ is ca. 14.3 torr) within 24 hours. Each iodine molecule makes a close approach, along its axis to framework oxygen atom with I-I-O = $175^{\circ}$.

Kinesin-I의 kinesin heavy chains과 직접 결합하는 heterotrimeric G protein의 β subunit의 규명 (The β Subunit of Heterotrimeric G Protein Interacts Directly with Kinesin Heavy Chains, Kinesin-I)

  • 석대현
    • 생명과학회지
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    • 제20권8호
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    • pp.1166-1172
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    • 2010
  • Kinesin-I은 4분자의 단백질로 구성되어 있으며, N-말단의 motor 영역과 C-말단영역을 가지는 장쇄(KHC, 또한 KIF5s로도 통용) 2분자와 KIF5s (KIF5A, KIF5B와 KIF5C)의 줄기영역과 결합하는 단쇄(KLC) 2분자로 구성되어 있다. KIF5A의 결합 단백질을 동정하기 위하여 효모 two-hybrid system을 사용하여 특이적으로 결합하는 heterotrimeric G 단백질의 ${\beta}$ 단위체 단백질($G{\beta}$)을 분리하였다. $G{\beta}$은 KIF5A의 808에서 935아미노산 부위와 결합하며, 다른 KIF5들과도 결합함을 효모 two-hybrid assay로 확인하였다. 또한 $G{\beta}$의 WD40 반복 서열은 KIF5A와의 결합에 필수영역임을 확인하였으며, 이러한 단백질간의 결합은 Glutathione S-transferase (GST) pull-down assay를 통하여 확인하였다. 생쥐의 뇌 파쇄액에 KIF5들의 항체로 면역침강을 행하여 heterotrimeric G 단백질을 확인한 결과, KIF5들은 heterotrimeric G 단백질과 특이적으로 같이 침강하였다. 이러한 결과들은 kinesin-I는 heterotrimeric G 단백질이 포함된 소포를 미세소관을 따라 이동시킴을 시사한다.