• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제18권10호
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• pp.1368-1374
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• 2005

To investigate the genetic relationships among various cattle breeds, bovine mtDNA D-loop region was used in 411 animals of 18 cattle breeds, including 8 Asian Bos taurus, 7 European Bos taurus, 1 Asian Bos indicus, and 2 African Bos indicus. The size of amplified PCR products from mtDNA D-loop region was 964 bp and the products were digested by 15 different restriction enzymes. Two different band patterns were identified in eight restriction enzymes (BstXI, Hae III, Msp I, Apa I, Taq I, Alu I, BamH I, EcoN I) and the rest of restriction enzymes showed more than 3 different band patterns among which Apo I and MspR9 resulted in 7 different restriction patterns. The genotypes, number of haplotype, effective number of haplotype, and degree of heterozygosity were analyzed. Based on all the PCR-RFLP data, different haplotypes were constructed and analyzed for calculating genetic distances between these breeds using Nei's unbiased method and constructing a phylogenetic tree.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제39권4호
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• pp.317-323
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• 2011

Amylase를 생산하는 능력을 갖고 있는 A-3 균주가 대한민국 대천 해변가의 바닷물로부터 분리되었다. A-3 균주는 1개의 polar flagella를 갖으며, Artificial Sea Water-Yeast extract-Peptone(ASW-YP) 한천배지 위에서 배양할 경우 $20-37^{\circ}C$에서 잘 자라지만, $15^{\circ}C$와 $40^{\circ}C$에서는 천천히 자라는 속성을 보였다. 또한 ASW-YP 액체배지를 사용하는 경우, pH 6-9 범위에서 잘 자라는 반면 pH 4-5, pH 10에서는 전혀 성장하지 못했다. 16S rRNA sequence 분석 결과, A-3 균주는 Pseudoalteromonas phenolica O-$BC30^T$, Pseudoalteromonas luteoviolacea $NCIMB1893^T$, Pseudoalteromonas rubra $ATCC29570^T$, Pseudoalteromonas byunsanensis $FR1199^T$와 각각 98.3, 97.86, 97.78, 97.25%의 similarity를 보였으며, 이를 기초로 한 phylogenetic tree 분석결과, P. phenolica O-$BC30^T$와 같은 clade를 형성하였다. 그러나, A-3 균주는 5% 이상의 NaCl 농도에서 전혀 성장하지 않고, D-glucose, D-mannose, D-maltose, Dmelibiose를 이용하지 못하며, lipase 활성(C-14)이 없는 등 많은 생리학적 특성이 P. phenolica O-$BC30^T$와는 상당히 달랐다. 이러한 생리학적 차이로부터 우리는 A-3 균주가 P. phenolica O-$BC30^T$와는 다른 종으로 판단하고, 이 균주를 Pseudoalteromonas sp. A-3로 명명하였다. Pseudoalteromonas sp. A-3는 배양시기 동안 계속해서 안정적으로 ${\alpha}$-amylase를 생산했으며, 총 amylase 활성은 pH 7과 $37^{\circ}C$에서 최대값을 보였다. 이 amylase 활성은 pH 10까지도 비교적 안정적이었으며, 이러한 alkali-tolerant amylase는 산업적으로도 유용성이 클 것으로 사료된다.

• 대한전자공학회논문지SD
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• 제39권3호
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• pp.61-72
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• 2002

본 논문에서는 1-Steiner 휴리스틱 알고리즘을 응용하여 단일 소스 네트와 다중 소스 네트를 배선하는 두 가지 시간 지향(timing-driven) 배선 방법을 제안한다. 이 방법은1-Steiner 휴리스틱 알고리즘의 계산값 (cost)을 지연시간으로 수정한 것으로 이 방법의 특징은 모든 터미널이 임계터미널인 경우와 또 임계터미널이 부분적으로 존재하는 경우의 단일 소스 네트와 다중 소스 네트를 배선하는 데 동시 적용할 수 있다는 점이다. 실험결과 단일 소스를 배선하는 알고리즘은 기존의 SERT와 SERT-C에 비해 지연시간이 각각 평균 2.1%, 10.6% 감소하는 성능을 보였다. 그리고 다중 소스를 배선하는 알고리즘은 기존의 MCMD A-tree 알고리즘과 비교했을 때 모든 소스, 터미널 쌍이 임계쌍(critical pair)일 경우는 최대 지연 시간이 평균 2.7% 증가했지만 부분적인 임계쌍이 존재할 때는 최대 지연 시간이 평균 1.4% 감소하는 유사한 결과를 도출한다.

• 지적과 국토정보
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• 제46권2호
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• pp.27-42
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• 2016

산림은 우리나라 토지피복 면적의 64%에 해당하는 넓은 면적을 차지한다. 이와 같이 넓은 면적의 산림을 조사, 모니터링, 관리하기 위해서는 원격탐사 및 지리정보시스템 기술이 필수적이다. 위성영상의 분광반사 특성을 이용하여 임상 및 수종분류가 가능하며, 이를 통해 임상도를 제작할 수 있다. 3차원 자료인 LiDAR를 이용하여 개체목의 위치와 수고 측정, 이를 통해 바이오매스와 탄소량 추정이 가능하다. 그 외에도 대상물의 반사특성을 이용해서 각종 지수들이 추출될 수 있는데, 예를 들어 식생지수와 표면토양지수 등을 통해 식생의 활력도와 산림 황폐화 정도를 파악 할 수 있다. 이러한 식생지수들의 변이를 파악하여 소나무 재선충병, 참나무 시들음병 등의 조기탐지 및 관리도 가능하다. 또한 A/R CDM, REDD+ 등 최근 기후변화 대응 사업에 있어서 원격탐사는 사업성 판단과 이산화탄소 흡수 및 저장량을 산정하는데 중요한 역할을 하고 있다. 기후변화 취약성 평가에서는 지리정보시스템의 시공간자료를 이용하여 국가 및 지자체 단위의 취약성이 시공간적으로 평가되고 있다. 또한, 시공간자료를 영향변수로 추가시킨 각종 모델을 통해 산림생장, 입목고사, 산사태 및 산불 등의 예측이 시공간적으로 이루어 질 수 있다.

• 환경생물
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• 제28권4호
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• pp.223-230
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• 2010

제주도 연안해역 4개 지역(한림, 애월, 신촌, 함덕) 해수의 온도, 염분농도, 용존산소량(DO), 화학적 산소요구량(COD), 부유물질(SS), 암모니아성 질소($NH_3-N$), 질산성 질소($NO_3-N$) 및 아질산성 질소($NO_2-N$)와 같이 다양한 이화학적 특성을 확인하였다. 해수의 평균 온도는 $26.23{\sim}28.6^{\circ}C$, 염분농도는 31.4~32.88‰, pH는 8.15~8.35, COD는 0.48~0.91 mg $L^{-1}$, DO는 6.78~6.87 mg $L^{-1}$로 나타났다. 해수에서 분리된 해양방선균은 총 52종으로 제주시 동부지역(A, B)에서는 24균주, 서부지역(C, D)은 28균주가 분리되었다. 분리된 해양방선균은 16S rRNA 염기서열 분석을 이용하여 최종적으로 동정되었으며, 염기서열 정보를 기초로하여 유사도(similarity)를 조사하였다. 분리된 방선균의 16S rRNA 염기서열 분석을 통하여 계통 분류학적으로 어떤 division에 속하는지를 확인하여 본 결과 제주도 제주시 동부지역(Site A, B) 해양에서 분리된 방선균 24균주는 Gram positive bacteria (division)/Actinobacteria (class)/Actinomycetales (order)/Streptomy-cineae (suborder)/Streptomycataceae (family)/Streptomyces(genus)에 22 균주, Actinomycetales (order)/Streptosporangineae (suborder)/Nocardiopsaceae (family)/Nocardiopsis (genus)에 2 균주가 분리되었다. 제주시 서부지역(Site C, D) 해양에서 분리된 방선균 28균주는 Gram positive bacteria (division)/Actinobacteria (class)/Actinomycetales (order)/Streptomycineae (suborder)/Streptomycataceae (family)/Streptomyces (genus)에 27균주, Actinomycetales (order)/Streptosporangineae (suborder)/Nocardiopsaceae (family)/Nocardiopsis (genus)에 1균주가 분리되었다.

• 한국산림과학회지
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• 제83권2호
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• pp.221-228
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• 1994

소나무 유령목(幼齡木)의 생장(生長)에 따른 기관별(器官別) 호흡속도(呼吸速度)를 적외선(赤外線) $CO_2$ 가스 분석기(分析機)로 측정(測定)하여, 이 기초자료(基礎資料)를 Thornley의 생장식(生長式) $$R=(\frac{1-Yg}{Yg})\frac{dW}{dt}+mW$$에 적용(適用), 구성호흡(構成呼吸)에 관계되는 물질전환효율(物質轉換效率)(Yg), 유지호흡계수(維持呼吸係數)(m), 그리고 상대생장속도(相對生長速度)(${\mu}$)를 추정(推定)하였다. 물질전환효율(物質轉換效率) Yg는 0.3637g/g dw/yr, 유지호흡계수(維持呼吸係數) m는 0.094g/g dw/yr, 그리고 상대생장속도(相對生長速度) ${\mu}$는 0.90(2년생(年生))에서 0.33(11년생(年生))까지 연령(年齡) 증가(增加)에 따라 현저히 감소(減少)하는 경향을 보였다. 또, 소나무 유령목(幼齡木)의 총광합성량(總光合成量)(Pg)에 대한 총호흡량(總呼吸量)(R)의 비율(比率)(R/Pg)은 0.6~0.7 이었으며, 년간(年間) Pg의 64%가 새로운 물질(物質)을 구성(構成)하는 구성호흡(構成呼吸)으로 소비(消費)되었고, 체중(體重)(건물중(乾物重))의 3.4%가 유지호흡(維持呼吸)으로 소비(消費)되었다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제54권6호
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• pp.411-418
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• 2012

KIT gene is the major causative gene for coat color variation in diverse animal species. This gene regulates melanocyte migration from the neural crest to target tissues and the mutation of this gene can affect dominant white phenotypes in animals. Because this gene has a major influence for the coat color variation, single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 14 Korean cattle (Hanwoo) and 5 Holstein individuals were investigated. The Hanwoo DNA samples included three different colored (5 Black, 5 Yellow and 4 Stripe) animals. Total 126 polymorphisms have been identified and 23 of them are located in the exon region. Also, 5 bp (TTCTC) and 3 bp (TCT) intronic indels in intron 3 and intron 5, respectively, were identified. Out of 23 exonic polymorphisms, 15 SNPs are the missense mutations and the rest of the SNPs are silence mutations. The neighbor-joining phylogenetic tree was constructed for the different colored animals using the obtained KIT gene sequences. Holstein breed showed a clear breed-specific cluster in the phylogenetic tree which is differed from Hanwoo. Also, three colored Hanwoo animals were not discriminated among the breeds. The KIT gene polymorphisms identified in this study will possibly give some solutions for the color variations in cattle with further verifications.

• 한국균학회지
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• 제26권3호통권86호
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• pp.396-398
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• 1998

16종의 원목에 저령을 인공접종한 결과, 때죽나무의 원목에서 $3{\sim}5\;mm$ 크기의 조밀한 균핵이 다수 관찰되었으며, 왕성한 균사의 밀도를 나타내었다. 균핵의 형성은 16종의 원목 중 6종의 원목에서 관찰되었다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제32권11호
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• pp.1715-1724
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• 2019

Objective: As laying hens become aged, laying performance and egg quality are generally impaired. One of the practical methods to rejuvenate production and egg quality of aged laying hens with decreasing productivity is a forced molting. However, the changes in intestinal microbiota after forced molting of aged hens are not clearly known. The aim of the present study was to analyze the changes in excreta bacterial communities after forced molting of aged laying hens. Methods: A total of one hundred 66-wk-old Hy-Line Brown laying hens were induced to molt by a 2-d water removal and an 11-d fasting until egg production completely ceased. The excreta samples of 16 hens with similar body weight were collected before and immediately after molting. Excreta bacterial communities were analyzed by high-throughput sequencing of bacterial 16S rRNA genes. Results: Bacteroidetes, Firmicutes, and Proteobacteria were the three major bacterial phyla in pre-molting and immediate post-molting hens, accounting for more than 98.0%. Lactobacillus genus had relatively high abundance in both group, but decreased by molting (62.3% in premolting and 24.9% in post-molting hens). Moreover, pathogenic bacteria such as Enterococcus cecorum and Escherichia coli were more abundant in immediate post-molting hens than in pre-molting hens. Forced molting influenced the alpha diversity, with higher Chao1 (p = 0.012), phylogenetic diversity whole tree (p = 0.014), observed operational taxonomic unit indices (p = 0.006), and Simpson indices (p<0.001), which indicated that forced molting increased excreta bacterial richness of aged laying hens. Conclusion: This study improves the current knowledge of bacterial community alterations in the excreta by forced molting in aged laying hens, which can provide increasing opportunity to develop novel dietary and management skills for improving the gastrointestinal health of aged laying hens after molting.

• ETRI Journal
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• 제41권3호
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• pp.358-370
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• 2019

The main aim of this study is to select the optimal set of genes from microarray cancer datasets that contribute to the prediction of specific cancer types. This study proposes the enhancement of the feature selection filter algorithm based on Joe's normalized mutual information and its use for gene selection. The proposed algorithm is implemented and evaluated on seven benchmark microarray cancer datasets, namely, central nervous system, leukemia (binary), leukemia (3 class), leukemia (4 class), lymphoma, mixed lineage leukemia, and small round blue cell tumor, using five well-known classifiers, including the naive Bayes, radial basis function network, instance-based classifier, decision-based table, and decision tree. An average increase in the prediction accuracy of 5.1% is observed on all seven datasets averaged over all five classifiers. The average reduction in training time is 2.86 seconds. The performance of the proposed method is also compared with those of three other popular mutual information-based feature selection filters, namely, information gain, gain ratio, and symmetric uncertainty. The results are impressive when all five classifiers are used on all the datasets.