• 제목/요약/키워드: 2D Marker

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두경부 편평상피세포암 세포주에서 세포주기조절인자의 활성 및 이상 : 후두편평상피세포암에서 종양억제유전자 CDKN2 유전자의 발현이상 (Activation and Abnormalities of Cell Cycle Regulating Factor in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Cell Lines: Abnormal Expression of CDKN2 Gene in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma)

  • 송시연;한태희;배창훈;김용대;송계원
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제22권2호
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    • pp.166-182
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    • 2005
  • 정상인의 말초혈액 림프구 DNA를 주형으로 사용하여 DNA PCR을 시행하였다. 그 결과 5례 모두에서 예상되는 167bp 크기의 CDKN2 genomic DNA 단편이 증폭됨을 관찰할 수 있었다. 정상인의 말초혈액 림프구로부터 분리한 mRNA를 사용하여 cDNA를 합성하고 이를 주형으로 사용하여 RT-PCR와 시행하였다. 그 결과 예상되는 355bp 및 468bp의 CDKN2 및 ${\alpha}$-actin의 mRNA 전사산물이 전례에서 발현됨을 관찰할 수 있었다. 또한 CDKN2 mRNA의 RT-PCR 산물을 Sal I 제한효소로 절단하여 252bp와 103bp의 두 단편으로 나뉘어짐을 관찰하였다. 총 5례의 후두 편평상피세포암 세포주에서 CDKN2가 발현되는지를 RT-PCR로 관찰하였으며 각 세포주로부터 mRNA의 분리가 잘되었는지는 ${\alpha}$-actin의 발현을 통하여 RT-PCR로 관찰하였다. 5례의 세포주에서 모두 ${\alpha}$-actin의 발현을 관찰할 수 있었으며 이들의 mRNA를 사용하여 CDKN2 RT-PCR와 시행한 결과 총 4례(80%)의 세포주에서 CDKN2의 발현이 상실되어 있음을 알 수 있었다. CDKN2 발현의 이상이 있는 후두 편평상피세포암 세포주 및 발현이 정상인 후두 편평상피 세포암 세포주 모두에서 CDKN2 유전자의 존재를 DNA-PCR로 관찰하여 총 5례의 세포주 중 2례(40%)에서 CDKN2 유전자의 결손을 관찰할 수 있었다. 이 2례의 후두 편평상피세포암 세포주는 CDKN2의 발현이 일어나지 않은 것으로 RT-PCR의 결과와 일치하였다. 총 8례의 후두 편평상피세포암세포들에서 CDKN2의 이종접합성의 상실이 발견되는지를 DNA-PCR로 관찰하여 7례(87.5%)에서 최소한 한 개 이상의 microsatellite marker에 대한 이종접합성의 상실이 발견되었으며, 6례(75%)에서 최소한 한 개 이상의 microsatellite marker에 대한 증폭이 발견되었다. 또한 2례에서 최소한 한 개 이상의 microsatellite marker에 대한 microsatellite의 불안정이 발견되었다. 이종접합성의 상실, 증폭 또는 microsatellite의 불안정의 세 가지 모두를 보면 전례에서 한가지 이상의 CDKN2의 이상이 발견되었다. 이상의 결과로 볼 때 CDKN2가 후두암의 발생에 중요한 역할을 하고 있을 것으로 사료된다.

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디지털 수치수조 기법에 의한 연안 Tsunami의 수치 시뮬레이션 (Numerical Simulation of a Near shore Tsunami Using a Digital Wave Tank Simulation Technique)

  • 박종천;전호환
    • 한국해양공학회지
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    • 제17권6호
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    • pp.7-15
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    • 2003
  • A Digital Wave Tank simulation technique, based on a finite-difference method and a modified marker-and-cell (MAC) algorithm, is applied in order to investigate the characteristics of nonlinear Tsunami propagations and their interactions with a 2D sloping beach, Ohkushiri Island, and to predict maximum wove run-up around the island. The Navier-Stokes (NS) and continuity equation are governed in the computational domain, and the boundary values are updated at each time step, by a finite-difference time-marching scheme in the frame of the rectangular coordinate system. The fully nonlinear, kinematic, free-surface condition is satisfied by the modified marker-density function technique. The near shore Tsunami is assumed to be a solitary wave, and is generated from the numerical wave-maker in the developed Digital Wave Tank. The simulation results are compared with the experiments and other numerical methods, based on the shallow-water wave theory.

칼만필터를 이용한 이동 목표물의 실시간 시각추적의 구현 (The Implementation of the Realtime Visual Tracking of Moving Terget by using Kalman Filter)

  • 임양남;방두열;이성철
    • 한국정밀공학회:학술대회논문집
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    • 한국정밀공학회 1996년도 춘계학술대회 논문집
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    • pp.254-258
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    • 1996
  • In this paper, we proposed realtime visual tracking system of moving object for 2D target using extended Kalman Filter Algorithm. A targeting marker are recongnized in each image frame and positions of targer object in each frame from a CCD camera while te targeting marker is attached to the tip of the SCARA robot hand. After the detection of a target coming into any position of the field-of-view, the target is tracked and always made to be located at the center of target window. Then, we can track the moving object which moved in inter-frames. The experimental results show the effectiveness of the Kalman filter algorithm for realtime tracking and estimated state value of filter, predicting the position of moving object to minimize an image processing area, and by reducing the effect by quantization noise of image

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디지털 수치수조 기법에 의한 연안 Tsunami의 수치 시뮬레이션 (Numerical Simulation of Nearshore Tsunami Using a Digital Wave Tank Simulation Technique)

  • 박종천;전호환
    • 한국해양공학회:학술대회논문집
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    • 한국해양공학회 2003년도 춘계학술대회 논문집
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    • pp.231-239
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    • 2003
  • A Digital Wave Tank simulation technique based on a finite-difference method and a modified marker-and-cell (MAC) algorithm is applied to investigate the characteristics of nonlinear Tsunami propagations and their interactions with a 2D sloping beach and Ohkushiri island, and to predict maximum wave run-up around the island. The Navier-Stokes (NS) and continuity equation are governed in the computational domain and the boundary values updated at each time step by a finite-difference time-marching scheme in the frame of rectangular coordinate system. The fully nonlinear kinematic free-surface condition is satisfied by the modified marker-density function technique. The Nearshore Tsunami is assumed to be a solitary wave and generated from the numerical wavemaker in the developed Digital Wave Tank. The simulation results are compared with the experiments and other numerical methods based on the shallow-water wave theory.

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Delayed radiation-induced inflammation accompanying a marked carbohydrate antigen 19-9 elevation in a patient with resected pancreatic cancer

  • Mattes, Malcolm D.;Cardinal, Jon S.;Jacobson, Geraldine M.
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제34권2호
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    • pp.156-159
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    • 2016
  • Although carbohydrate antigen (CA) 19-9 is a useful tumor marker for pancreatic cancer, it can also become elevated from a variety of benign and malignant conditions. Herein we describe an unusual presentation of elevated CA 19-9 in an asymptomatic patient who had previously undergone adjuvant chemotherapy and radiation therapy for resected early stage pancreatic cancer. The rise in CA 19-9 might be due to delayed radiation-induced inflammation related to previous intra-abdominal radiation therapy with or without radiation recall induced by gemcitabine. After treatment with corticosteroids the CA 19-9 level decreased to normal, and the patient has not developed any evidence of recurrent cancer to date.

SSR 분자표지이용 콩 불마름병 저항성 관여 양적형질 유전자좌(QTL) 분석 (Identification of Quantitative Trait Loci Associated with Resistance to Bacterial Pustule (Xanthomonas axonopodis pv. glycines) in Soybean)

  • 서민정;강성택;문중경;이석기;김율호;정광호;윤홍태
    • 한국육종학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.456-462
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    • 2009
  • 본 연구는 최근 우리나라에서 급격하게 발생되고 있는 콩 불마름병에 대한 저항성 중간모본을 육성하고자 할 때 marker-assisted selection에 적용할 수 있는 저항성 근접 분자표지를 개발하고자 수행하였다. 1. 불마름병에 이병성인 큰올콩과 저항성인 신팔달콩의 RIL 116 계통에 대하여 콩 불마름병 균주 8ra에 대한 저항성과 연관된 QTL을 탐색한 결과 포장에서는 연관군 B2, D2, I와 K에서, 온실에서는 연관군 D2, C1과 F에서 불마름병과 관련된 QTL이 나타났다. 2. 포장과 온실에서 공통적으로 탐색된 QTL은 연관군 D2에 위치해 있었는데 정확한 위치는 포장과 온실에서 각각 Satt135와 Satt397의 사이에서 LOD score 6.64와 3.43으로 Satt135에서 14.01 cM과 0.01 cM 떨어진 위치에서 탐색되었다.

단일 카메라를 이용한 보행자의 높이 및 위치 추정 기법 (Estimation of Human Height and Position using a Single Camera)

  • 이석한;최종수
    • 전자공학회논문지SC
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    • 제45권3호
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    • pp.20-31
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    • 2008
  • 본 논문에서는 단일 카메라를 이용하여 영상 내에 존재하는 객체의 3차원 공간 상에서의 위치 및 높이를 추출하기 위한 기법을 제안한다. 본 논문에서 제안하는 방법은 영상으로 사영된 3차원 장면(scene)에 대한 기준 좌표계를 마커(marker)를 이용해서 설정한 다음, 대상 물체의 2차원 영상을 기준 좌표계로 직접 역사영(back-projection) 시킴으로써 대상 물체에 대한 3차원 공간에서의 위치 및 높이를 계산한다. 그리고 부정확한 카메라 교정으로 인하여 발생하는 역사영 오차를 마커의 기하학 정보를 이용해서 보정한다. 제안된 방법은 기존의 방법에서 주로 이용되던 소실점(vanishing point) 및 소실선(vanishing line) 등을 이용하지 않으며, 3차원 공간 내에서의 객체의 높이 및 위치의 동시 추정이 가능한 장점이 있다. 또한 단일 카메라만을 이용하여 필요한 위치 및 높이 정보를 추출하기 때문에 다중 카메라를 이용한 기법에서 발생할 수 있는 3차원 좌표계 상에서의 대응점의 모호성, 다수의 카메라를 정확히 교정시켜야 하는 어려움 등의 문제가 발생하지 않는다. 실험 결과를 통하여 제안된 기법의 정확도 및 안정성을 확인하였다.

목통의 페놀성 화합물의 항산화 활성 및 HPLC-UV 동시 함량분석 (Anti-oxidant Activity of Phenolic Compounds and Simultaneous Contents Determination using HPLC-UV from the Akebiae caulis)

  • 경민지;전혜진;황완균
    • 약학회지
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    • 제59권3호
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    • pp.120-126
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    • 2015
  • Akebiae caulis have been used in folk medicines for diuretic, menstrual pain, and diuretic pain. It has been also resolved nephritis and cystitis. In this study, we isolated three phenolic compounds from 70% methanol extract using the open column chromatography. These isolated compounds which were 2-(3,4-dihydroxyphenyl)-ethyl-${\beta}$-D-glucopyranoside, 5-O-caffeoylquinic acid, and syringoylglycerol 2-O-${\beta}$-D-glucoside were determined by physico-chemical apparatus. Furthermore, we conducted DPPH and ABTS assay in order to screen the antioxidant activity of isolated three compounds. Also, we developed a rapidly HPLC-UV analysis method of two phenolic compounds (2-(3,4-dihydroxyphenyl)-ethyl-${\beta}$-D-glucopyranoside, 5-O-caffeoylquinic acid) for evaluating the Akebiae Caulis collected 30 samples from different regions. From the experiments, all three isolated compounds showed the significant antioxidant activity. We suggested that the content criteria of marker compounds were shown by a simple and rapid HPLC-UV method. The contents respectively were 0.009% (2-(3,4-dihydroxyphenyl)-ethyl-${\beta}$-D-glucopyranoside) and 0.036% (5-O-caffeoylquinic acid).

Aspirin-Triggered Resolvin D1 Inhibits TGF-β1-Induced EndMT through Increasing the Expression of Smad7 and Is Closely Related to Oxidative Stress

  • Shu, Yusheng;Liu, Yu;Li, Xinxin;Cao, Ling;Yuan, Xiaolong;Li, Wenhui;Cao, Qianqian
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제24권2호
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    • pp.132-139
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    • 2016
  • The endothelial-mesenchymal transition (EndMT) is known to be involved in the transformation of vascular endothelial cells to mesenchymal cells. EndMT has been confirmed that occur in various pathologic conditions. Transforming growth factor ${\beta}1$ (TGF-${\beta}1$) is a potent stimulator of the vascular endothelial to mesenchymal transition (EMT). Aspirin-triggered resolvin D1 (AT-RvD1) has been known to be involved in the resolution of inflammation, but whether it has effects on TGF-${\beta}1$-induced EndMT is not yet clear. Therefore, we investigated the effects of AT-RvD1 on the EndMT of human umbilical vein vascular endothelial cells line (HUVECs). Treatment with TGF-${\beta}1$ reduced the expression of Nrf2 and enhanced the level of F-actin, which is associated with paracellular permeability. The expression of endothelial marker VE-cadherin in HUVEC cells was reduced, and the expression of mesenchymal marker vimentin was enhanced. AT-RvD1 restored the expression of Nrf2 and vimentin and enhanced the expression of VE-cadherin. AT-RvD1 did also affect the migration of HUVEC cells. Inhibitory ${\kappa}B$ kinase 16 (IKK 16), which is known to inhibit the NF-${\kappa}B$ pathway, had an ability to increase the expression of Nrf2 and was associated with the inhibition effect of AT-RvD1 on TGF-${\beta}1$-induced EndMT, but it had no effect on TGF-${\beta}1$-induced EndMT alone. Smad7, which is a key regulator of TGF-${\beta}$/Smads signaling by negative feedback loops, was significantly increased with the treatment of AT-RvD1. These results suggest the possibility that AT-RvD1 suppresses the TGF-${\beta}1$-induced EndMT through increasing the expression of Smad7 and is closely related to oxidative stress.

대한민국내 주요 돼지 품종의 순종 식별을 위한 품종특이 DNA marker의 활용 (Application of Breed-specific DNA Markers for the use of Identifying Major Pure Pig Breeds Maintained in Korea)

  • 서보영;김재환;박응우;임현태;조인철;김병우;오성종;정일정;이정규;전진태
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권5호
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    • pp.735-742
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    • 2004
  • 본 연구는 돼지의 품종특이 DNA marker를 이용하여 Large White, Landrace, Duroc의 순종 판별을 가능하게 하기 위해서 실시하였다 순종 판별을 위해 현재 알려져 있는 KIT과 돼지내의 모색과 밀접한 연관성이 있는 MCIR 그리고 mitrochondrial DNA상에서 종 특이적인 현상을 보이는 D-loop 지역의 11-bp 중복과 ND2 유전자의 개시 codon 변이를 이용하였다 품종간의 판별을 위해 KIT 유전자 exon17의 splicing 지역 변이를 활용하여 백색종과 유색종을 분류 하였다. MCIR 유전자의 (N121D)변이를 이용하여 유색종들로부터 Duroc 종이 분류되었다. 그러나 Duroc 이외의 유색종들 간에는 특이한 변이가 발견되지 않아 이 이상의 분류는 불가능 하였다 D-loop 지역의 11-bp 중복현상과 ND2 개시 codon의 변이에 의해 백색종인 Landrace(11-bp비중복과 ATT)종과 Large White(llbp 중복과 ATA) 종을 분류할 수 있었다. 결론적으로 본 연구에서 설정된 판별방법을 통하여 Landrace, Large White와 Duroc 종의 순종 판별이 완벽히 가능함을 입증하였다.