• 제목/요약/키워드: 2-DE gel

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Fabrication of Microcrystalline NaPbLa(WO4)3:Yb3+/Ho3+ Phosphors and Their Upconversion Photoluminescent Characteristics

  • Lim, Chang Sung;Atuchin, Victor V.;Aleksandrovsky, Aleksandr S.;Denisenko, Yuriy G.;Molokeev, Maxim S.;Oreshonkov, Aleksandr S.
    • 한국재료학회지
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    • 제29권12호
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    • pp.741-746
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    • 2019
  • New triple tungstate phosphors NaPbLa(WO4)3:Yb3+/Ho3+ (x = Yb3+/Ho3+ = 7, 8, 9, 10) are successfully fabricated by microwave assisted sol-gel synthesis and their structural and frequency upconversion (UC) characteristics are investigated. The compounds crystallized in the tetragonal space group I41/a and the NaPbLa(WO4)3 host have unit cell parameters a = 5.3927(1) and c = 11.7961(3) Å, V = 343.05(2) Å3, Z = 4. Under excitation at 980 nm, the phosphors have yellowish green emissions, which are derived from the intense 5S2/5F45I8 transitions of Ho3+ ions in the green spectral range and strong 5F55I8 transitions in the red spectral range. The optimal Yb3+:Ho3+ ratio is revealed to be x = 9, which is attributed to the quenching effect of Ho3+ ions, as indicated by the composition dependence. The UC characteristics are evaluated in detail under consideration of the pump power dependence and Commission Internationale de L'Eclairage chromaticity. The spectroscopic features of Raman spectra are discussed in terms of the superposition of Ho3+ luminescence and vibrational lines. The possibility of controlling the spectral distribution of UC luminescence by the chemical content of tungstate hosts is demonstrated.

인삼 및 모상근의 프로테옴 분석을 위한 단백질 추출 방법 (Purification of Crude Protein Mixture from Panax ginseng and Hairy Root for Proteome Analysis)

  • 김승일;김수정;남명희;서종복;김수현;권경훈;김영환;최종순;유종신
    • 식물조직배양학회지
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    • 제28권6호
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    • pp.347-351
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    • 2001
  • 인삼 (Panax ginseng C.A. Meyer)은 우리나라의 전통약재로 수 세기 동안 사용되어 왔으며, 약효 및 성분에 대한 연구가 매우 활발하게 이루어져 왔으나, 인삼의 분자생물학적, 단백질 화학적 측면에서 생리연구는 매우 미미하였다. 본 연구에서는 프로테옴믹스를 이용한 인삼 단백질 군을 연구하기 위한 첫 단계로 인삼 (천풍)및 모상근의 단백질 추출 방법을 확립하고, 이차원 전기영동을 통하여 추출방법의 유용성을 확인하였다. Homogenizer와 황산암모늄 침전을 통한 단백질 추출과 액체질소 및 TCA를 이용한 단백질 추출 방법을 수행하여 비교해 본 결과 추출 단백질 양에는 큰 차이가 없으나 이차원 전기영동 수행 시 액체질소 및 TCA를 통한 방법이 프로테옴 연구에 적합하여 훨씬 해상도가 높은 gel 이미지를 얻었을 뿐 아니라, gel당 660개 이상의 단백질 sopt을 확인하였다. 또한 인삼과 모상근의 이차원 전기영동을 비교한 결과 상당히 다른 발현 패턴을 보여, 생장조건 등 외부 환경과 생리상태의 차이에 따라, 같은 유전자를 가지고 있는 조직체라 할지라도, 매우 다른 프로테옴 (proteome)을 보일 수 있음을 보여주었다.

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감자 단백질 분해효소 억제제-II 유전자로부터의 폴리펩타이드 카이모트립신 저해제와 homology가 있는 유전자단편의 클로닝 및 대장균에서의 발현 (Cloning of Gene Fragment having Homology with the Polypetide Chymotrypsin Inhibitor from the Potato Proteinase Inhibitor II Gene and Its Expression in E. coli.)

  • 정진;박상규
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제38권5호
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    • pp.382-386
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    • 1995
  • 감자의 단백질 분해효소 억제제-II(PI-II)단백질은 카이모트립신 저해부위와 트립신 저해부위로 나뉘어 있는데 PI-II 유전자중의 하나인 PI-IIT 유전자의 염기서열에서 비롯된 아미노산 서열이 폴리펩타이드 카이모트립신 저해제(PCI) 단백질의 아미노산 서열과 84%의 높은 동질성을 가지고 있으므로 감자의 단백질 분해효소 억제제유전자 집단 (family) 중의 하나인 PCI와 homology가 있는 유전자단편을 클로닝하기 위하여 이미 클론된 PI-IIT 유전자로부터 PCR을 행하여 얻어진 DNA 단편을 백터에 클로닝하고 염기서열을 결정하였다. 염기서열을 확인한 유전자 단편을 박테리오파아지 T7 promoter와 terminator를 갖고있는 플라스미드 pET3a에 옮겨 대장균 BL2l(DE3)에서 발현시켰던바 IPTG의 부가에 따라 유기되는 것을 확인 하였으나 발현수준은 기대했던것에 미치지 못하였다.

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Identification of Bovine Pregnancy-Specific Whey Proteins using Two-Dimensional Gel Electrophoresis

  • Han, Rong-Xun;Choi, Su-Min;Kim, Myung-Youn;Quan, Yan Shi;Kim, Baek-Chul;Diao, Yun Fei;Koqani, Reza;Park, Chang-Sik;Jin, Dong-Il
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제32권4호
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    • pp.255-261
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    • 2008
  • The early diagnosis of bovine pregnancy is an essential component of successful reproductive planning on farms, because lack of bovine pregnancy over the long term results in reproductive failure and low milk yield-the latter of which is a special concern on dairy farms. This study was designed to identify early pregnancy-specific whey proteins in bovine, by comparing milk samples collected from cattle during pregnancy (Days 30 and 50) and from non-pregnant cattle. In this study, differentially expressed proteins in five pregnant and five non-pregnant Holstein dairy cattle were investigated and compared, using proteomics analysis. The first dimension was applied to a pH $3.0{\sim}10.0$ strip, by loading a 2-mg milk protein sample. After the second-dimension separation was performed, the gels were stained with colloidal Coomassie brilliant blue. The stained gels were scanned and the images were analyzed, to detect variations in protein spots between non-pregnant and pregnant cattle milk protein spots, using ImageMaster, this was followed by analysis with MALDI TOF-MS. Analysis of the 2-DE gel image resulted in a total of approximately $500{\sim}600$ protein spots, of which 12 spots were differentially expressed, six spots were up-regulated, and four spots were down-regulated; two spots were identified as pregnancy-specific proteins. These proteins were identified as lactoferrin, NA-DH dehydrogenase subunit 2, albumin, serum albumin precursor and transferrin. Our results via 2-D PAGE analysis revealed composite profiles of several milk proteins related to early bovine pregnancy, implying the possible use of these milk proteins in the early detection of bovine pregnancy.

산오이풀 잎의 성분 (Constituents of Sanguisorba hakusanensis Leaves)

  • 권원준;황완균;김일혁
    • 약학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.262-272
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    • 1996
  • The constituents of Sanguisorba hakusanensis leaves (Rosaceae), of which the roots have been used as an astringent, hemostatics and antiphlogistics, were studied phytoche mically. From water fraction of the MeOH extract, gallic acid 3-O-${\beta}$-D-(6'-O-galloyl)-glucopyranoside(I), quercetin-3-O-${\beta$-D-galactopyranoside(II), quercetin-3-O-${\alpha}$-L-arabinopyranoside(III) and $2{\alpha},\;3{\beta},\;19{\alpha}$, 23-tetrahydroxyurs-12-en-28-oic acid 28-O-${\beta}$-D-glucopyranoside(IV) were isolated by column chromatographic separation using Amberlite XAD-2, ODS-gel and Sephadex LH-20. The structure of these compounds were elucidated by spectroscopic parameters of $^1H$-NMR, $^{13}C$-NMR, $^1H-^1H$ COSY, $^{13}C-^1H$ COSY, EI-Mass, FAB-Mass, IR, UV and by comparison with authentic samples.

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Streptomyces longwoodensis로부터 Autoregulator Receptor Protein 유전자의 클로닝 및 특성 (Characterization and Cloning of the Gene Encoding Autoregulator Receptor Protein from Streptomyces longwoodensis)

  • 여수환;이성봉;김현수
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제33권2호
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    • pp.96-105
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    • 2005
  • 공시균인 S. longwoodensis IFO 14251의 autoregulators 및 receptor gene 탐색의 일환으로 기존의 Streptomyces속 receptor gene의 공통배열을 primer로 이용하여 PCR을 수행하였다. 예상되는 100 bp 크기의 단편을 pUC19 vector에 ligation하여 E. coli $DH5{\alpha}$에 transformation한 후, plasmid를 분리하여 BamHI을 처리하여 $2\%$ agarose gel에 전기영동한 결과, pUC19 외에 receptor gene PCR product가 100 bp 위치에 존재하는 것을 확인하였다. 형질전환된 plasmid로 PCR을 수행한 후, 염기배열을 결정하여 분석한 결과, Streptomyces sp. 유래의 receptor gene의 일부분임이 확인되었다. 따라서 S. longwoodensis IFO 14251에는 lysocellin 생산에 관여한다고 추정되는 autoregulator receptor protein을 코드하는 유전자가 존재할 것으로 예상되어 100 bp의 PCR product를 probe로 이용하여 Southern 및 colony hybridization을 통하여 4.4 kb의 SphI 단편을 가지는 plasmid(pSLT)를 제작하였고 이를 sequencing한 결과, Streptomyces 속 유래의 autoregulator receptor 단백질을 코드하는 유전자와 3개의 open reading frame(651 bp)을 확인하여 sltR이라 명명하였다. 유전자 해석 결과, 기존의 autoregulator receptor proteins과 비교시 $35{\sim}46\%$의 homology를 나타내었다. 재조합 단백질의 발현을 위해, sltR/pET-l7b plasmid를 제작하고 E. coli BL21(DE3)/pLysS을 host cell로 이용하여 재조합 단백질을 발현시켰다. SltR 재조합 단백질의 정제는 DEAE-Sephacel column chromatography와 DEAE-5PW chromatography(HPLC)를 통해 수행하였다. Gel filtration chromatography(HPLC, 55 kDa)와 SDS-PAGE(28 kDa)를 통해 분자량을 확인한 결과, 재조합 단백질은 dimer형태로 존재하는 것으로 확인되었다. 또한, 결합활성에 있어 A-factor type의 autoregulator에 대해 가장 강한 결합활성을 나타내었다.

Characterization of Placental Proteins in Bovine Somatic Cell Clone Fetuses

  • Woo, Jei-Hyun;Ko, Yeoung-Gyu;Kim, Bong-Ki;Kim, Jong-Mu;Lee, Youn-Su;Kim, Nam-Yun;Im, Gi-Sun;Yang, Boung-Chul;Seong, Hwan-Hoo;Jung, Jin-Kwan;Kwun, Moo-Sik;Chung, Hak-Jae
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제29권2호
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    • pp.83-91
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    • 2005
  • Somatic cell nuclear transfer in cattle has limited efficiency in terms of production of live offspring due to high incidence of fetal failure after embryo transfer to recipients. Such low efficiency of cloning could possibly arise from abnormal and poorly developed placenta. In the present study the placental proteome in late pregnancy established from in vitro fertilization (IVF) and nuclear transfer (NT) was analysed. Proteome alternation was tested using two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2-DE) and matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI- TOF). Comparing placenta from NT embryos to those from IVF counterparts, significant changes in expression level were found in 18 proteins. Of these proteins 12 were not expressed in NT placenta but expressed in IVF counterpart, whereas the expression of the other 6 proteins was limited only in NT placenta. Among these proteins, cytokeratin 8 and vimentin are considered to be involved in regulation of post-implantation development. In particular, cytokeratin 8 and vimentin may be used as makers for placental development during pregnancy because their expression levels changed considerably in NT placental tissue compared with its IVF counterpart. Data from 2-DE suggest that protein expression was disorientated in late pregnancy from NT, but this distortion was eliminated with progression of pregnancy. These findings demonstrate abnormal placental development during late pregnancy from NT and suggest that alterations of specific placental protein expression may be involved in abnormal function of placenta.

멸치액젓의 항산화효과 (Antioxidant Effects of Fermented Anchovy)

  • 박종옥;윤미선;조은정;김희숙;류병호
    • 한국식품과학회지
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    • 제31권5호
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    • pp.1378-1385
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    • 1999
  • 멸치액젓으로부터 항산화활성을 가지는 물질을 분리하기 위하여 용매추출 및 chromatography를 행하였다. 모든 용매분획들에 항산화활성이 있었으며 그 중 BuOH층과 수용액층이 소금을 함유하고 있었으나 항산화활성이 우수하였다. 수용액층을 투석막(MWCO 1000)으로 증류수에 대하여 투석하였을 때 투석막 내액의 항산화활성이 소실되었으므로 멸치액젓의 항산화성 물질은 분자량 1000이하의 분자량을 가진 것으로 추정하였다. Sephadex G-50 gel filtration chromatography에서 얻은 항산화물질 분획(tube No. 230-245)로 DE-52 anion exchange chromatography를 행한 결과 column에 결합하지 않고 흘러나온 분획(0 N NaCl용액) 및 0.05N NaCl용액으로 용출된 분획에서 항산화활성이 있었으나 $15\;{\mu}M$$Fe^{+++}\;ion$의 존재하에서 0 N NaCl 분획만 항산화활성이 유지되었다. Biogel P2 chromatography를 행한 결과 3번과 5번 분획의 항산화 활성이 특히 우수하였으며 TLC확인결과 아미노기가 풍부한 분자들임을 알 수 있었고 아미노산 조성을 분석하였을 때 다른 분획들보다 3번과 5번 분획에 소수성 아미노산이 많이 함유되어 있었다. TLC로 분리하여 항산화활성이 우수한 하나의 band를 HPLC의 C18 column으로 분석하였을 때 3개의 peak 중 항산화활성을 갖은 물질은 methionine 유도체이었으며 이는 멸치젓 수용액층의 많은 항산화물질 중 하나로 여러 아미노산 또는 oligopeptide의 유도체들의 상승효과가 멸치액젓의 항산화성을 유지하는 것으로 사료된다.

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Overexpression, Purification, and Characterization of $\beta$-Subunit of Group II Chaperonin from Hyperthermophilic Aeropyrum pernix K1

  • Shin, Eun-Jung;Lee, Jin-Woo;Kim, Jeong-Hwan;Jeon, Sung-Jong;Kim, Yeon-Hee;Nam, Soo-Wan
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권3호
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    • pp.542-549
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    • 2010
  • In the present study, overexpression, purification, and characterization of Aeropyrum pernix K1 chaperonin B in E. coli were investigated. The chaperonin $\beta$-subunit gene (ApCpnB, 1,665 bp ORF) from the hyperthermophilic archaeon A. pernix K1 was amplified by PCR and subcloned into vector pET21a. The constructed pET21a-ApCpnB (6.9 kb) was transformed into E. coli BL21 Codonplus (DE3). The transformant cell successfully expressed ApCpnB, and the expression of ApCpnB (61.2 kDa) was identified through analysis of the fractions by SDS-PAGE (14% gel). The recombinant ApCpnB was purified to higher than 94% by using heat-shock treatment at $90^{\circ}C$ for 20 min and fast protein liquid chromatography on a HiTrap Q column step. The purified ApCpnB showed ATPase activity and its activity was dependent on temperature. In the presence of ATP, ApCpnB effectively protected citrate synthase (CS) and alcohol dehydrogenase (ADH) from thermal aggregation and inactivation at $43^{\circ}$ and $50^{\circ}$, respectively. Specifically, the activity of malate dehydrogenase (MDH) at $85^{\circ}$ was greatly stabilized by the addition of ApCpnB and ATP. Coexpression of pro-carboxypeptidase B (pro-CPB) and ApCpnB in E. coli BL21 Codonplus (DE3) had a marked effect on the yield of pro-CPB as a soluble and active form, speculating that ApCpnB facilitates the correct folding of pro-CPB. These results suggest that ApCpnB has both foldase and holdase activities and can be used as a powerful molecular machinery for the production of recombinant proteins as soluble and active forms in E. coli.

Lactobacillus fermentum KLB12의 열 전처리에 따른 열 스트레스 내성 증진 및 프로테옴 변화 (Improved Viability and Proteome Analysis of Lactobacillus fermentum KLB12 upon Heat Stress)

  • 김주현;박미영;김승철;윤현식;소재성
    • KSBB Journal
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    • 제18권4호
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    • pp.294-300
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    • 2003
  • 본 연구에서는 L. fermentum KLB12을 열 전처리 함으로서 제제화 과정 동안 거치게 되는 열 스트레스에 대한 내성이 증진됨을 확인하고, 최적의 열 전처리 조건을 수행하였다. 또한 열 전처리 뿐만 아니라, 저온과 열 전처리 조건에도 열 스트레스에 대한 간섭 효과를 확인하였다. 그리고 내성 증진에 신규 단백질 합성이 필요함을 확인하였으며 나아가, 2-D electrophoresis를 통하여 7개의 신규 단백질을 확인하였다. 따라서 이 균주를 제제화하기 위한 방법으로 열 전처리를 이용할 경우 생균력 유지에 큰 효과를 얻을 수 있다고 사료된다.