• 한국통신학회논문지
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• 제31권11C호
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• pp.1037-1043
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• 2006

본 논문에서는 차세대 대용량 데이터 저장장치로 부각되고 있는 홀로그래픽 데이터 저장장치를 위한 2차원 변조코드를 제안한다. 단위 면적당 기록 밀도의 증가로 인한 인접 심볼간 간섭과 3차원적인 홀그래픽 저장으로 인한 페이지간 섭 등에 강인한 성능을 갖도록 같은 페이지 내의 1과 0의 개수가 거의 동일하도록 설계하였으며, 또 가능한 많은 1과 0의 천이가 일어나도록 설계하였다. 제안된 코드의 코드율은 5/9로서 기존의 4/9 코드보다 25%의 코드율 개선을 하였다.

• Journal of Plant Biology
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• 제36권4호
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• pp.377-382
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• 1993

벼(Oryza sativa L.) 캘러스는 2.0 mg/L 2,4-D와 0.5 mg/L kinetin이 첨가된 MS 배지에서 성숙종자로부터 유도되었으며 embryogenic callus(EC)와 nonembryogenic callus(NEC)는 색깔과 외부형태에 의해 경시적으로 선별되었다. EC와 NEC의 전체 단백질로부터 SDS-PAGE와 등전점 전기영동에 의한 전기영동적 분석은 EC와 NEC의 각각에 대해 특이적, 양적인 차이를 보여주었다. 또한 EC와 NEC의 2차원 전기영동 분석은 약 20여개 이상의 EC 특이단백질과 10여개의 NEC 특이 단백질 양상을 보여주었으며, 아울러 EC 특이적인 90, 65, 50 kD의 단백질은 microheterogeneity를 보여주는 반면, NEC에서는 분자량의 변이가 큰 일련의 산성 이질단백질군을 보여주었다.

• 한국시뮬레이션학회논문지
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• 제20권2호
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• pp.77-85
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• 2011

생물 및 의학계에서는 생물정보학(bioinformatics)의 데이터 중 혈청 단백질(proteome)에서 추출한 데이터가 질병의 진단에 관련된 정보를 가지고 있고, 이 데이터를 분류 분석함으로 질병을 조기에 진단 할 수 있다고 믿고 있다. 본 논문에서는 혈청 단백질(2-D PAGE: Two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis)로부터 암과 정상을 판별하는 새로운 복합분류기를 제안한다. 새로운 복합 분류기에서는 support vector machine(SVM)와 다층 퍼셉트론(multi-layer perceptron: MLP)와 k-최근 접 이웃(k-nearest neighbor: k-NN)분류기를 앙상블(ensemble) 방법으로 통합하는 동시에 다중 부스팅(boosting) 방법으로 각 분류기를 확장하여 부분류기(subclassifier)의 배열(array)으로서 복합분류기를 구성하였다. 각 부분류기에서는 최적 특성 집합 (feature set)을 탐색하기 위하여 유전 알고리즘(genetic algorithm: GA)를 적용하였다. 복합분류기의 성능을 측정하기 위하여 암연구에서 얻어진 임상 데이터를 복합분류기에 적용하였고 결과로서 단일 분류기 보다 높은 분류 정확도와 안정성을 보여 주었다.

• 한국잠사학회:학술대회논문집
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• 한국잠사학회 2003년도 제46회 춘계 학술연구 발표회
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• pp.43-43
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• 2003

잠란의 휴면 개시, 유지 및 각성 등에 따른 단백질의 변화를 알아보기 위해 2D-전기영동에 의한 peptides 분석을 하였다. 잠품종은 백옥잠을 사용하였으며, 단백질 분석은 산란 후 5일 경과란(휴면란), 산란 후 20시간에 침산하여 1일 및 2일 경과란, 및 산란 후 2일 경과 후 냉장(5$^{\circ}C$)처리하여 1일, 3일, 5일된 잠란을 각각 대상으로 하였다. 2D-전기영동은 1차로 pH3-10 range에서 isoelectric focusing 하고 2차로 SDS-PAGE한 후 silve stainin으로 peptides를 검출하였다. (중략)

• 한국수산과학회지
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• 제30권3호
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• pp.480-487
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• 1997

범가자미, Verasper variegatus의 vitellogenin (Vg)을 분리하기 위하여 수컷에 $etradiol-17\beta(E_2) $를 처리하여 Vg의 합성을 유도하여 SDS-PAGE와 western blot으로 확인 하였다. 분리된 Vg의 분자량은 175 kD 이었으며 암컷 특이단백질이었다. $E_2$ 처리한 수컷 혈청을 찬 증류수로 침전시킨후 Sepharose CL-6B column chromatography에 의해 Vg을 분리하였다. 분리한 Vg에 대한 항혈청을 만들어 특이성을 western blot으로 확인하였고, 또한 Vg를 대한 단클론항체를 만들기 위하여 분리한 Vg을 Balb/c에 면역시켜 비장세포와 NS1 myeloma 세포를 세포융합하여 hybridoma를 만들었다. 세포융합된 18개 clone중 효소면역측정법에 의해 Vg과 가장 반응성이 높은 clone을 4D6으로 명명하였고, 이에 대한 특이성을 $E_2$가 처리되지 않은 수컷 혈청, $E_2$가 처리된 수컷혈청과 분리한 Vg를 사용하여 western blot으로 확인하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제14권3호
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• pp.620-627
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• 2004

On the foundation of a database of genome sequences and protein analyses, the ability to clone a gene based on a peptide analysis is becoming more feasible and effective for identifying a specific gene and its protein product of interest. As such, the current study conducted a protein analysis using 2-D PAGE followed by MALDI- TOF and ESI-MS to identify a highly expressed gene product of C. parasitica. A distinctive and highly expressed protein spot with a molecular size of 47.2 kDa was randomly selected and MALDI-TOF MS analysis was conducted. A homology search indicated that the protein appeared to be a fungal enolase (enol). Meanwhile, multiple alignments of fungal enolases revealed a conserved amino acid sequence, from which degenerated primers were designed. A screening of the genomic $\lambda$ library of C. parasitica, using the PCR amplicon as a probe, was conducted to obtain the full-length gene, while RT-PCR was performed for the cDNA. The E. coli-expressed eno 1 exhibited enolase enzymatic activity, indicating that the cloned gene encoded the C. parasitica enolase. Moreover, ESI-MS of two of the separated peptides resolved from the protein spot on 2-D PAGE revealed sequences identical to the deduced sequences, suggesting that the cloned gene indeed encoded the resolved protein spot. Northern blot analysis indicated a consistent accumulation of an eno1 transcript during the cultivation.

• 한국잡초학회지
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• 제10권3호
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• pp.233-239
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• 1990

Alachlor를 귀리(Avena sativa L.)의 뿌리에 처리시(處理時) peroxidase의 변화(變化)에 대해서 조사(調査)한 결과(結果)는 다음과 같다. 1. Alachlor 처리구(處理區)는 무처리구(無處理區)에 비해서 $10^{-6}M$에서 0.20 unit, $10^{-3}M$은 0.27 unit로, 농도(濃度)가 높을수록 peroxidase의 합성량(合成量)이 증가(增加)되었다. 2. Peroxide를 직접 귀리의 뿌리에 12시간(時間) 처리시(處理時), 65mM에서 16%, 130mM에서 59%의 뿌리 생장(生長) 억제(抑制)되었다. 3. 귀리의 근단(根端) 분열(分裂) 조직(組織)은 4개의 동위(同位) peroxidase로 분리(分離)되는데, alachlor 처리시에는 특히 $P_1$, $P_6$와 $P_7$의 isoperoxidaserk 생성(生成)되었으며, SDS-PAGE에서 귀리의 근단(根端) 조직(組織)은 100kD 이하의 단백질(蛋白質)로 구성(構成)되어 있다.

• Journal of Plant Biology
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• 제38권4호
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• pp.349-357
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• 1995

The alkaline invertase ($\beta$-D-fructofuranoside fructohydrolase, EC 3.2.1.26) was isolated and characterized from the hypocotyls of mung bean (Phaseolus radiatus L.). The enzyme was purified by consecutive step using diethylaminoethyl (DEAE)-cellulose anion exchange, 1st Sephadex G-200, DEAE-Sephadex A50 and 2nd Sephadex G-200 chromatography. The overall purification was about 77-fold with a yield of about 6%. The finally purified enzyme exhibited a specific activity of about 48 $\mu$mol of glucose produced mg-1 protein min-1 at pH 7.0 and appeared to be a single protein by nondenaturing polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE). The enzyme had the native molecular weight of 450 kD and subunits molecular weight of 63 kD and 38 kD as estimated by Sephadex G-200 chromatography and SDS-PAGE, respectively, suggesting that the enzyme is a heteromultimeric protein composed of two types of subunits. On the other hand, the enzyme appeared to be not a glycoprotein according to the results of Con A chromatography and glycoprotein staining. The enzyme had a Km for sucrose of 19.7 mM at pH 7.0 and maximum activity around pH 7.5. The enzyme was most active with sucrose as substrate, compared to raffinose, cellobiose, maltose and lactose. These results indicate the alkaline invertase is a $\beta$-fructofuranosidase.

• 한국동물학회지
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• 제36권2호
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• pp.238-244
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• 1993

We identified juvenile hormone binding protein (JHBP) from last instar larval hemollvnph of Hvphantria cunea using gel filtration and non-SDS PAGE. Two kinds of JHBP in hemollnnph were found at two peaks by gel filtration (Sephadex G-100) and also at Rm values of 0.13 and 0.57 by non-SDS PAGE. JHBP was partially purified using anion exchange chromatosraphv, preparative gel filteration, and preparative PAGE. Dextrin coated charcoal (DCC) binding assay was employed to monitor the location of JHBP in chromatographic profile during the purification process. Purity of JHBP was checked by silver staining of 1091 SDS-Polyacrvlamide.

• 생명과학회지
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• 제5권2호
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• pp.63-69
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• 1995

Cockroach antigen have been known as a cause of allergic disease. German ockroach(Blattella germanica L.) was chosen because it has the highest distribution range and poulation density. To identify the common and specific antigens of adult and larval stage of german cockroach, we made monoclonal antibodies which were confirmen by SDS-PAGE and EITB. Anti-B. germanica antibody producing hybridomas were 24 among the total 960wells. Only 4 hybridomas did not have cross reaction to other species of cockroach and hluse dust mites(Dermatophagodies farinae and D. pteronyssius). SDS-PAGE revealed about 20 bands from 90Kd to 15Kd to 15Kd. ETB showed specific antigens a6 60, 72 and 82Kd which were experimented by the culture supernatant of 4 selected hybridomas. Especially 60Kd coincided with a band of immunized mouse sera.