• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2012년도 한국컴퓨터종합학술대회논문집 Vol.39 No.1(B)
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• pp.357-359
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• 2012

초 고성능 바이오 서열 분석 장비 기술의 발달로 대량의 바이오 정보가 쏟아져 나오고 있으며, 바이오산업의 발달로 개인별 유전체 정보에 의한 맞춤의학의 시대가 도래되고 있다. 수많은 서열에 대한 분석에는 많은 저장장치 및 주기억장치가 필요하므로 슈퍼컴퓨터 급의 서버와 대량의 데이터를 빠르게 처리할 수 있는 프로그램이 필요하다. 이러한 분석에는 염기서열 일치 검색과 이를 기반으로 하는 Alignment와 Assembly 분석이 있으며, 이를 수행하는 기존의 알고리즘 및 대부분의 프로그램들은 염기서열을 문자열로 취급하고, 해쉬 인덱스 테이블, Brujin 그래프의 사용, 버러우즈 휠러 변환(BWT) 등의 기법을 활용하여 효율적인 분석을 도모하였다. 본 논문에서는 염기서열을 문자열이 아닌 k-mer 묶음의 정수형 하나로 변환하여 검색함으로써 저장 공간의 크기를 약 28% 이상으로 줄이고 형 변환 상태에서의 검색을 수행할 수 있는 알고리즘을 제안한다. Assembly 분석 프로그램인 CalcGen 프로그램을 개발하여 본 알고리즘의 효용성 및 효율성을 실험을 통해 검증하였다. 이 연구의 결과는 향후 대량의 유전체 염기서열의 효율적 분석과 저장 및 처리에 또 하나의 새로운 접근 방법을 제안하는데에 그 의미를 둘 수 있다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2004년도 봄 학술발표논문집 Vol.31 No.1 (B)
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• pp.850-852
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• 2004

고급 언어 (high-level language)로 프로그램을 쓰고 그것이 맞다고 증명 했을때, 프로그램과 증명을 동시에 "컴파일"해주는 방법을 찾으려고 한다. 이러한 방법은 "증명 보내기"(Proof Carrying Code)라는 제안을 실용화할 때 요긴하게 사용할 수 있는 기술이다. 지면관계상 "반복문에서 명령어 끄집어내기"(Loop Invariant Code Motion)라는 최적화 과정에 맞게 Hoare 증명을 변환하는 방법에 대해서만 알아보겠다.

• 한국멀티미디어학회논문지
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• 제5권3호
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• pp.342-350
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• 2002

자바 프로그래밍 언어는 웹 브라우저에서 실행되는 작은 크기의 응용 프로그램 수행에서는 실행 속도 문제가 중요한 요소가 아니지만 대형 프로그램의 수행에서는 실행 속도가 현저히 저하되는 단점을 지니고 있다. 이러한 문제점을 해결하기 위해 전통적인 컴파일 방법을 사용하여 바이트코드를 특정 프로세서에서 수행될 수 있는 목적기계 코드로 변환하는 다양한 연구가 진행중이다. 본 연구에서도 자바 응용 프로그램의 실행 속도의 개선을 위해 바이트코드로부터 직접 i386코드를 생성하는 네이티브 코드 생성 시스템을 위한 중간 코드 변환기를 설계하고 구현한다. 중간 코드 변환기는 자바 언어 의 중간 코드인 *.class 파일을 입력으로 받아 레지스터 기반의 중간 코드로 변환한다.

• 정보과학회 논문지
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• 제41권11호
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• pp.892-899
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• 2014

동적 인스트루멘테이션 기법은 동적 코드 변환 기법을 사용하여 프로그램의 수행 흐름을 흐트러뜨리지 않으면서 분석 코드를 삽입하는 구현 기법으로 사용되고 있다. 기존의 동적 코드 변환 기법은 머신 코드 스트림을 중간 코드 형태로 파싱하고, 이를 일반적인 컴파일러 기법에 적용함으로써 코드를 변환한다. 이러한 방식의 코드 변환 과정에서 수반되는 높은 변환 오버헤드는 응답성이 높은 사용자 프로그램에 적용을 어렵게 한다. 본 논문에서는 변환 과정의 경량화를 통해 변환 오버헤드를 줄임으로써, 높은 동적 코드 변환 성능을 가지는 경량 동적 코드 변환 기법을 제안하고, 이를 기반으로 하는 동적 인스트루멘테이션 프레임워크를 제안한다. 제안 기법은 테이블 기반의 새로운 동적 주소 변환 기법으로 코드를 변환하고, 더불어 자주 실행되는 라이브러리 함수에 대해 변환 과정에 대해서는 주소 변환만을 함으로써 변환 오버헤드를 줄이는 변환 우회 기법을 이용한다. 기존 동적 코드 변환 기법과의 비교를 통해 2%~65%의 성능 향상을 확인하였다.

• 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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• 제31권11호
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• pp.1551-1559
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• 2004

자바는 플랫폼에 독립적인 객체지향 프로그래밍 언어로서 널리 사용되고 있지만, 플랫폼에 의존적인 기능을 사용해야 하거나 흑은 유산 시스템(legacy system)을 재사용하기 위해서는 JNI를 이용해야 한다. JNI는 자바가 C/C++ 언어와 결합하기 위한 표준화된 규칙과 API를 제공하지만, 개발자가 JNI를 이용해서 프로그램을 개발하는 것은 매우 복잡하고, 번거롭다는 단점이 있다. 이러한 문제를 해결하기 위해서 본 논문에서는 자바 프로그램에 내장된 C 프로그램 코드를 자동적으로 JNI 명세에 맞는 C 언어로 변환할 수 있는 C2JNI라는 변환기를 소개한다. C2JNI를 사용하는 경우에 내장된 C 언어 프로그램은 JNI API를 사용하지 않고서도 C 언어와 자바 프로그램을 결합할 수 있기 때문에 개발자는 자바와 C 언어에 대한 지식만 있으면, 자바와 C 언어를 결합해서 사용할 수 있다.

• 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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• 제28권12호
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• pp.955-965
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• 2001

본 논문에서는 함수형 언어 Haskell 을 Java언어로 변환하여 Java Virtual Machine 에 수행하는 컴파일 방법을 제안한다. 이 컴파일 방법은 추상 기계 Spineless Tageless G-machine(STGM)을 수행 모델로 삼는다 L-code로 명명한 중간 언어를 도입하여 추상기계의 각각의 세부 동작을 이 언어의 명령어로 표현하고, 일견의 세부 동작들을 이 언어의 바인딩을 통해 표현한다. 각 명령어는 Java의 문장으로 변환하기 쉽도록 정의하였다. Java에서의 표현 방법을 결정하고. STS 프로그램의 L-code 프로그램으로의 컴파일 규칙과 Java 프로그램으로의 컴파일 규칙을 세안한다. 실험을 통해 제안한 컴파일러에 의해 Haskell 프로그램으로부터 생성된 Java 프로그램의 수행 성능은 Glasgow Haskell 컴파일러의 최적화 변환을 적용했을 때 기존의 Haskell 인터프리터인 Hugs와 대등함을 보인다

• 한국도로학회논문집
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• 제5권4호
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• pp.1-11
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• 2003

최근 국내에서는 국내 여건을 고려한 설계법을 개발함과 동시에 이미 공용중에 있는 도로 포장의 성능향상을 위한 $\ulcorner$한국형 포장 설계법 개발과 성능개선 연구$\lrcorner$가 진행되고 있다. 본 연구에서 개발된 $\ulcorner$하중변환 알고리듬을 적용한 줄눈콘크리트 포장 해석 프로그램$\lrcorner$은 이러한 연구의 세부분야인 콘크리트 포장 설계법 개발분야의 연구 결과로서 기본 프로그램 부분과 하중변환 부분으로 구분되어 구성되며, 기본 프로그램 부분에서는 판/쉘 요소, 스프링 요소 보 요소를 이용하여 줄눈 콘크리트 포장의 콘크리트 슬래브, 하부층, 다웰바를 모사한다. 하중변환 부분에서는 기존의 연속체 요소에 대한 하중변환 알고리듬을 수정/적용하여 요소망에 제약을 받지 않고 다양한 하중 조건을 해석한다. 또한 프로그램은 하중변환 알고리듬을 적용하여 해석을 수행하는 등분포 하중 이외에, 집중하중. 온도하중, 자중 등을 고려할 수 있는 특징이 있다. 개발된 프로그램의 특성을 분석하기 위한 민감도 분석 결과 하중크기 및 위치와 콘크리트 슬래브의 두께가 포장의 거동에 가장 큰 영향을 미치는 인자로 분석되었으며 이는 Westergaard 계산식, ILLISLAB과 유사한 결과이다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 1999년도 가을 학술발표논문집 Vol.26 No.2 (1)
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• pp.487-489
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• 1999

기존의 절차 중심적으로 개발되어진 시스템들은 일반적으로 오래 전에 개발되었으며 규모가 크고 구조화되어 있지 않아서 이해하기 어렵고 분석에 드는 비용이 크다. 그러나 그런 시스템들은 이미 운영환경에 관한 많은 비용과 중요한 정보들을 포함하고 있어서 시스템을 폐기하기 곤란하며 새로 개발하는 데에도 많은 비용과 시간이 요구된다. 이러한 절차 중심적 소프트웨어들이 제공하는 서비스를 계속 유지해가면서 그 시스템을 현대화하기 위한 방안으로 객체 지향 구조로의 소프트웨어 재공학이 요구되고 있다. 본 논문에서는 기존의 절차 중시적 소프트웨어 시스템을 객체 지향 소프트웨어 시스템으로 변환하는 방법에 관하여 논의한다. 이를 위해 프로그램에 내재되어 있는 타입 가시성 정보와 자료 가시성 정보를 그래프로 표현하고 이 그래프를 이용하여 객체를 추출하는 방법을 제시한다. 또한, 추출된 객체들을 클래스로 표현하고 클래스들 간의 관계를 파악하며, 클래스들을 기반으로 기존의 코드를 객체 지향 중심의 코드로 변환하기 위한 방법들을 연구한다.

• 한국시뮬레이션학회:학술대회논문집
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• 한국시뮬레이션학회 1993년도 제3회 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.12-13
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• 1993

컴퓨터를 이용한 모의 실험 방법은 과학 및 공학 분야뿐만 아니라 경제,사회 현상등에도 널리 적용될 수 있는 유용한 도구이다. 그 중에서도 연속체계 모의 실험은 미분 방정식으로 모델링되는 시스템을 대상으로 하는 경우가 맡으며, 이를 위하여 그동안 맡은 연속체계 모의 실험 언어들이 개발되었다. 그러나 그들은 대부분 사용하기가 복잡하여 사용자 편의성을 고려한 모의 실험 언어에 대한 필요성이 증대되었다. 본 연구에서는 사용자에개 최대한 편의성을 제공하는 연속체계 모의 실험 언어인 PCSL (Postech Continuous-system Simulation language)을 개발하였다. PCSL 프로그램은 프로그램 헤더, 상수 정의부, 함수 정의부, 매개 변수 정의부, 초기화 선언부, 모델 정의부, 종료 조건 선언부, 출력 선언부 등으로 나누어 진다. 그리고 출력으로는 계산 결과를 파일에 저장, 흑은 수치로 인쇄하거나 그래프로 그려서 보여준다. PCSL 처리 시스템은 모델 정의부에서 주어진 미분방정식을 해석해서 digital-analog simulation 기법으로 풀 수 있는 형태로 변환하는 번역기와 이렇게 변환된 형태의 미분방정식과 여러 가지 조건들을 고려해서 C 프로그램을 생성해주는 생성기, 생성된 C 프로그램을 실행시켜서 그 결과를 얻는 실행기,그리고 사용자에게 편리한 입출력 방법을 제공하는 사용자 인터페이스로 구성된다. 번역기에서는 모델로 주어진 미분방정식의 종류를 결정한 후에 이들을 digital-analog simulation 기법으로 풀 수 있는 형태로 변환한다. 생성기에서는 번역기의 결과를 받고,프로그램 상의 여러 가지 조건들을 고려해서 C 프로그램을 생성한다. 여기서 생성된 C프로그램은 미분방정식을 포함하는 ‘f.c'와 조건들을 포함하는'main.h', 그리고 digital-analog simulation 기법을 이용하는 모의 실험 알고리즘을 구현한 'main.c'로 구성된다. 그리고 실행기에서는 생성기에서 생성한 C 프로그램을 실행시켜서 결과를 얻는다. 여기에서 필요로 하는 PCSL 프로그램의 내응은 종료 조건 선언부, 출력 선언부 등이다. 마지막으로 사용자 인터페이스는 사용자가 간편하게 PCSL 프로그램을 입력할 수 있게 도와주며 모의 실험 결과를 쉽게 화면상에 보여주기 위한 것이다. 이 때에 사용자가 원하면 계산 결과를 그래프로 그려서 보여주는 기능과 화면에 보이는 결과를 프린터로 출력할 수 있는 기능을 제공한다. 실형 결과로는 먼저 선형 상미분방정식의 예로 mass-damper-spring system, 비선형 상미분방정식의 예로는 van der Pol 방정식, 연립 상미분방정식의 예로는 mixing tank problem 등을 보였으며, 그의 공학에서 일어나는 여러 가지 문제들도 다루었다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2005년도 가을 학술발표논문집 Vol.32 No.2 (1)
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• pp.592-594
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• 2005

XML은 현재 어플리케이션에서 데이터를 저장하는 W3C 표준으로 많은 응용 분야에서 사용되고 있다. 어떤 응용 프로그램에서 사용하던 기존의 XML문서를 다른 응용 프로그램에서 재사용하기 위해서는 변환 XML 문서가 가지고 있는 정보와 구조의 손실 없이 피 변환 XML의 구조에 합당하게 변환해야 한다. XML 문서 정보의 의미는 엘리먼트를 통해 표현되는데 자동으로 분석하여 변환에 적용하기 어렵다. 그러나 XML 문서는 DTD나 XML 스키마와 같은 구조적 정보를 가지고 있고 XML의 구조 정보는 엘리먼트에 속성을 표현한다. 이에 착안하여 DTD의 의미정보를 분석하여 XML 문서의 변환에 적용하는 방법이 제안되었다. 하지만 DTD는 지원하는 데이터 형식이 한정되어 있고 엘리먼트의 반복 속성도 제안되어 있다. 본 논문은 XML의 엘리먼트 정보를 분석하기 위해서 XML 스키마를 사용한다. XML 스키마는 기존에 DTD보다 다수의 데이터 타일과 엘리먼트의 반복적 속성을 다양하게 제공하고 있다. 그러므로 기존 방법보다 더 많은 정보를 변환에 적용할 수 있는 장점을 가지고 있다. 제안하는 시스템은 한번 작성한 XML 문서를 다른 XML 어플리케이션에서 재사용함으로써 XML 문서 제작성에 따른 비용을 절감할 것으로 기대된다.