• Journal of the Korea Society of Computer and Information
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• v.19 no.1
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• pp.57-64
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• 2014

As Steiner minimum tree building belongs to NP-Complete problem domain, heuristics for the problem ask for immense amount execution time and computations in numerous inputs. In this paper, we propose an efficient mechanism of euclidean Steiner minimum tree construction for numerous inputs using combination of Delaunay triangulation and Prim's minimum spanning tree algorithm. Trees built by proposed mechanism are compared respectively with the Prim's minimum spanning tree and minimums spanning tree based Steiner minimum tree. For 30,000 input nodes, Steiner minimum tree by proposed mechanism shows about 2.1% tree length less and 138.2% execution time more than minimum spanning tree, and does about 0.013% tree length less and 18.9% execution time less than minimum spanning tree based Steiner minimum tree in experimental results. Therefore the proposed mechanism can work moderately well to many useful applications where execution time is not critical but reduction of tree length is a key factor.

• Annual Conference of KIPS
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• 2009.04a
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• pp.999-1001
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• 2009

절단 접미사 트리(truncated suffix tree)는 접미사 트리의 절단 버전으로, 주어진 문자열의 부분 문자열 중 일정 길이 이하인 것들만을 표현하는 자료구조이다. 절단 접미사 트리는 일정 길이 이하의 문자열들만을 고려하는 응용에 유용한데, 특히 LZ77 압축과 같이 온라인 생성 알고리즘이 필요한 응용들도 있다. 본 논문에서는 절단 접미사 트리를 온라인으로 생성하는 새로운 알고리즘을 제시한다.

• The KIPS Transactions:PartA
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• v.16A no.6
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• pp.509-518
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• 2009

In this paper, a mechanism that produces an approximation edges minimum spanning tree swiftly using virtual nodes called portals dividing given edges into same distance sub-edges. The approximation edges minimum spanning tree can be used in many useful areas as connecting communication lines, road networks and railroad systems. For 3000 random input edges, when portal distance is 0.3, tree building time decreased 29.74% while the length of the produced tree increased 1.8% comparing with optimal edge minimum spanning tree in our experiment. When portal distance is 0.75, tree building time decreased 39.96% while the tree length increased 2.96%. The result shows this mechanism might be well applied to the applications that may allow a little length overhead, but should produce an edge connecting tree in short time. And the proposed mechanism can produce an approximation edge minimum spanning tree focusing on tree length or on building time to meet user requests by adjusting portal distance or portal discard ratio as parameter.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2003.04a
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• pp.536-538
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• 2003

대량의 짧은 문자열들에 대해 부분 문자열의 발생 빈도를 예측하는 문제는 카운트 서픽스 트리를 미리 생성한 후 이를 이용함으로써 처리될 수 있다. 카운트 서픽스 트리는 모든 부분 문자열의 발생 빈도를 저장한 뒤 가지치기를 함으로써, 제한된 트리 크기와 발생 빈도 예측이라는 두 가지 목표를 처리한다. 하지만, 염기서열에서 처럼 저장된 문자열의 길이가 길어질 경우 카운트 서픽스 트리를 생성하기가 대단히 어려워진다는 문제점이 발생한다. 이 논문에서는 선삽입, 후가지치기 방식의 카운트 서픽스 트리 대신 처음부터 길이가 q 이하인 문자열들만을 삽입하는 큐그램 트리를 제안한다. 큐그램 트리는 제한된 트리 크기에 따라 저장할 부분 문자열의 크기를 미리 결정할 수 있으며, 데이타베이스에 저장된 문자열의 전체 길이가 N일 때 O(N) 시간에 생성 가능하다. 실험 결과 제한된 부분 문자열을 가지고 있음에도 불구하고 긴 부분 문자열의 발생 빈도를 매우 정확하게 예측할 수 있음을 보였다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2004.04b
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• pp.94-96
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• 2004

캐쉬 인식 트리는 주기억장치의 느린 액세스 속도를 캐쉬를 활용함으로써 개선하려는 주기억장치 데이터베이스 인덱스이다. 본 논문에서는 기존의 캐처 인식 트리에서 사용된 기법들을 살펴보고, 이를 통함, 개선하여 새로운 캐쉬 인식 트리를 제안한다. 기존의 캐쉬 인식 트리는 키 압축과 포인터 알축을 따로 고려하였기 때문에 각각 노드의 크기와 키의 길이 변화에 취약한 문제점이 있었다. 이에 반해 제안하는 부분키 캐쉬 인식 $B^{＋}$트리는 키와 포인터를 동시에 압축하여 이러한 문제점을 해결하고. 보다 캐쉬 활용도를 높였다. 또한 제안하는 트리의 벌크로드, 삽입, 삭제 알고리즘을 제시하고 이론적인 분석 통길 각 알고리즘이 올바르게 수행되고, 성능에 개선됨을 확인하였다.

• The KIPS Transactions:PartA
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• v.13A no.6 s.103
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• pp.541-544
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• 2006

In a tree with each edge associated with a length and a weight (positive, negative, or zero are possible) we develop an O(nlognloglogn) time algorithm for finding a path such that its sum of weights is maximized and its sum of lengths does not exceed a given value. The previously best-known result is O($nlog^2n$), where n is the number of nodes in the tree.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 1998.10b
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• pp.658-660
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• 1998

계층적 자료구조인 사진트리는 이진 영상을 표현하는데 매우 중요한 자료구조이다. 선형 사진트리는 사진트리를 메모리에 저장하는데 매우 효율적이므로 사진트리와 관련된 연산의 수행을 위해 많은 연구가 진행되어 왔다. 본 논문에서는 RMESH(Reconfigurable MESH) 구조에서 3-차원 n$\times$n$\times$n 프로세서를 사용하여 선형 사진트리로 표현된 이진 영상의 둘레 길이를 계산하는 상수 시간 알고리즘을 제안한다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2002.10e
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• pp.1-3
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• 2002

백본 라우터에서의 최장 길이 프리픽스 검색(LPM: Longest Prefix Matching) 속도를 향상시키기 위해 활발히 연구된 방식들은 계산 량과 사용 메모리 량을 교환하는 방식들이다. 이러한 방식들은 성능향상을 위해서 대용량의 포워딩 테이블(Forwarding Table)을 캐쉬(Cache)에 저장할 수 있는 소용량 인덱스 테이블(Index Table)로 압축함으로써 고속 캐쉬 접근 회수와 그 계산량은 증가하는 대신 저속 메모리 접근 회수를 줄이는 방식이다.〔1〕본논문에서는 저속 메모리 사용량이 증가하는 반면 저속 메모리의 접근 빈도와 계산량을 동시에 감소시키는 FPLL(Fixed Prefix Length Lookup) 방식을 소개한다. 이 방식은 포워딩 엔트리(Entry)들을 프리픽스의 상위 비트(Bit)에 의해 그룹으로 나누고, 각 그룹에 속하는 엔트리들을 같은 길이로 정렬한다. FPLL에서의 LPM검색은 목적지 주소가 속하는 그룹들의 길이를 계산하여 검색할 최장 프리픽스의 길이를 미리 결정하고, 결정된 프리픽스를 키(key)로 하여 해시 테이블(Hash Table)로 구성된 포워딩 테이블에서 완전 일치(Exact Matching) 검색을 한다. 완전 일치 검색을 위해 같은 그룹에 속한 엔트리들을 정렬할 필요가 있는데 이 정렬을 위해 여분의 포워딩 테이블 엔트리가 생성된다. 3만개 엔트리를 갖는 Mae-West〔2〕 경우에, FPLL방식은 12만개 정도의 여분의 엔트리가 추가로 생성되는 대신에 1번 캐쉬 접근과 O(1)의 복잡도를 갖는 해시 테이블 검색으로 LPM 검색을 수행한다.

• Journal of KIISE:Databases
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• v.30 no.2
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• pp.168-175
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• 2003

Until now, substring selectivities have been estimated by two steps. First step is to build up a count-suffix tree, which has statistical information about substrings, and second step is to estimate substring selectivity using it. However, it's actually impossible to build up a count-suffix tree from biological sequences because their lengths are too long. So, this paper proposes a novel data structure, count q-gram tree, consisting of fixed length substrings. The Count q-gram tree retains the exact counts of all substrings whose lengths are equal to or less than q and this tree is generated in 0(N) time and in site not subject to total length of all sequences, N. This paper also presents an estimation technique, k-MO. k-MO can choose overlapping length of splitted substrings from a query string, and this choice will affect accuracy of selectivity and query processing time. Experiments show k-MO can estimate very accurately.

• Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea CI
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• v.47 no.5
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• pp.25-34
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• 2010

By introducing additional nodes called Steiner points, the problem of Steiner Minimum Tree whose length can be shorter than Minimum Spanning Tree and which connects all input terminal nodes belongs to Non-Polynomial Complete domain. Though diverse heuristic methods can be applied to the problem, most of them may meet serious pains in computing and waiting for a solution of the problem with numerous input nodes. For numerous input nodes, an efficient PTAS approximation method producing candidate unit steiner trees with portals in most bottom layer, merging them hierarchically to construct their parent steiner trees in upper layer and building swiftly final approximation Steiner tree in most top layer is suggested in this paper. The experiment with 16,000 input nodes and designed 16 unit areas in most bottom layer shows 85.4% execution time improvement in serial processing and 98.9% in parallel processing comparing with pure Steiner heuristic method, though 0.24% overhead of tree length. Therefore, the suggested PTAS Steiner tree method can have a wide range applications to build a large scale approximation Steiner tree quickly.