• 한국정보과학회:학술대회논문집
• /
• 한국정보과학회 2003년도 봄 학술발표논문집 Vol.30 No.1 (A)
• /
• pp.536-538
• /
• 2003

대량의 짧은 문자열들에 대해 부분 문자열의 발생 빈도를 예측하는 문제는 카운트 서픽스 트리를 미리 생성한 후 이를 이용함으로써 처리될 수 있다. 카운트 서픽스 트리는 모든 부분 문자열의 발생 빈도를 저장한 뒤 가지치기를 함으로써, 제한된 트리 크기와 발생 빈도 예측이라는 두 가지 목표를 처리한다. 하지만, 염기서열에서 처럼 저장된 문자열의 길이가 길어질 경우 카운트 서픽스 트리를 생성하기가 대단히 어려워진다는 문제점이 발생한다. 이 논문에서는 선삽입, 후가지치기 방식의 카운트 서픽스 트리 대신 처음부터 길이가 q 이하인 문자열들만을 삽입하는 큐그램 트리를 제안한다. 큐그램 트리는 제한된 트리 크기에 따라 저장할 부분 문자열의 크기를 미리 결정할 수 있으며, 데이타베이스에 저장된 문자열의 전체 길이가 N일 때 O(N) 시간에 생성 가능하다. 실험 결과 제한된 부분 문자열을 가지고 있음에도 불구하고 긴 부분 문자열의 발생 빈도를 매우 정확하게 예측할 수 있음을 보였다.

• 한국정보과학회논문지:데이타베이스
• /
• 제30권2호
• /
• pp.168-175
• /
• 2003

지금까지 문자열 데이타에 대한 선택도 추정은 문자열들의 등장 회수에 대한 정보를 저장하고 있는 '카운트 서픽스 트리'를 생성한 뒤, 이 트리를 이용하여 부분 문자열들의 선택도를 추정하는 방법으로 이루어졌다. 그런데, 문자열 데이타가 생물학 서열처럼 매우 길어질 경우 카운트 서픽스 트리를 생성하는 일은 거의 불가능해진다는 문제점이 발생한다. 이 논문에서는 길이가 q인 부분 문자열들만을 삽입한 '카운트 큐그램 트리'를 제안한다. 카운트 큐그램 트리는 서열 내의 길이가 q 이하인 모든 부분 문자열(큐그램) 들의 정확한 등장 회수를 저장하고 있으며, 문자열의 전체 길이 N에 상관없는 크기로, O(N) 시간에 생성 가능하다. 또한, 이 논문에서는 카운트 큐그램 트리를 이용한 'k번째 최대겹침' 추정 방법을 제시한다. 이 추정 방법은 질의 문자열을 길이 q인 부분 문자열로 나눌 때 부분 문자열들의 겹치는 정도 k를 선택할 수 있도록 한 방법으로 이전 연구에서 제시한 '최대겹침' 방법을 확장하였다. q와 k를 변화시키며 진행한 실험 올 통해 대부분의 경우에 매우 정확하게 선택도를 추정할 수 있음을 확인하였다.

• 한국정보과학회논문지:데이타베이스
• /
• 제34권2호
• /
• pp.141-152
• /
• 2007

선택도 추측은 관계형 데이타베이스에서 질의 최적화의 한 중요한 요소이다. 숫자 데이타에 대한 조건식에 대하여 이 주제는 많은 연구가 되어 왔으나 부분문자열에 대한 조건식은 최근에 이르러서야 관심의 초점이 되고 있다. 우리는 이 논문에서 이 문제를 위한 새로운 서픽스 트리 변환 알고리즘을 제시한다. 제안하는 기법은 서픽스 트리의 노드들을 단순히 잘라 없애 버리기 보다는 기본적으로 비슷한 카운트를 갖는 노드들을 구조적 정보를 유지하면서 병합하여 전체 크기를 줄인다. 본 논문은 여러 제약 사항하에서 서픽스 트리를 그 크기를 줄이도록 변환을 하는 알고리즘을 제시하고 실생활 데이타를 대상으로 실험을 수행하여 우리가 제안하는 알고리즘이 기존의 알고리즘들보다 우수한 평균 상대 에러와 에러 분포 특성을 지니고 있음을 보인다.