Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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2006.02a
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pp.109-114
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2006
최근 Human 지놈 프로젝트를 포함한 다양한 종의 지놈 프로젝트가 수행되고 수많은 지놈정보가 생산되고 있으며 이를 해석하고 서로 연관성를 찾기 위한 다양한 연구가 진행되고 있다. 즉 최신 생명공학과 관련된 연구방향이 DNA의 구조적 해석에서 기능 해석과 유전자들의 상호연관성을 규명하는 방향으로 변화하고 있으며 이를 위한 강력한 도구로서 DNA microarray (DNA chip)는 방대한 양의 지놈 정보를 이용하여 단시간에 대량으로 고속처리하여 효율적으로 유전자 기능을 분석할 수 있는 주목받고 있는 방법이다. DNA microarray 실험과 분석에 있어 데이터분석, 재현성, 종간의 비교, 확인실험 및 비용 등의 문제가 있지만 유전자발현양상 데이터로부터 정확한 환자의 예후를 예측할 수 있는 비교적 적은 유전자 그룹의 진단마커를 찾거나, 하나의 유전자가 아니라 mouse 전체 지놈의 유전자발현 패턴을 인간의 암을 위시한 각종 질병 연구를 위한 발현 신호나 변화 등을 발견하여 신약개발 등에 활용하고자 하는 시도가 활발히 진행되고 있다. 서로 다른 종간에 비슷한 phenotype의 유전자발현도 진화적으로 보존되었다는 전제 하에서 지놈 sequence의 비교연구가 가능하고 DNA microarray 발현 데이터에 근거하여 독립적으로 각 종간의 유전자발현패턴을 비교함으로써 난치병 등을 새롭게 분류할 수 있다. 즉, 암세포 등에서 유전자발현 양상은 유전학적, 환경적 alteration들이 잘 반영되어 있다고 간주하고, 이러한 양상을 바탕으로 인간의 암을 위시한 다양한 질병 연구를 위한 최적의 mouse 모델을 찾을 수 있고, 이는 결국 새로운 치료 방법 개발이나 맞춤의학 실현에 중요한 역할을 할 것으로 기대된다. 특히 pathway 타겟으로 하는 치료를 위해서는 Human-mouse 비교를 통한 발현 신호를 찾는 것이 진단에서는 매우 유용한 방법이다. 이를 위한 고성능의 분석방법이나 시스템의 개발이 중요하게 된다.. 관류의 정도와 조영증강정도를 중심으로 관류 MR 영상소견과 조직학적 소견을 관련지어 분석하였다. 결과: 조영증강 T1강조MR영상에서 환상조영증강을 보이는 다형성 교보세포종 2예에서는 변연부 외륜이 고관류를, 중심부의 괴사부위는 저관류로 나타났다. 저등급 교종은 경계가 불분명한 저관류부위로 보였다. 뇌농양 2예는 변연부 외륜이 경도의 고관류를, 중심부는 저관류로 나타났다. 뇌수막종은 미만성의 균일한 중등도 혹은 고도의 고관류로 보였으며, 임파종과 배아종은 경계가 명확한 저관류부위로 나타났다. 신경세포종은 종괴\ulcorner 일부에 중등도 혹은 고도의 고관류부위가 관찰되었고, 전이암은 다수병변중 일부에서 중등도의 고관류를 보였다. 방사선괴사는 저관류부위내에 국소적 고관류부위를 보였다. 결론: 관류 MR영상은 뇌종양의 관류상태를 비교적 잘 반영하며, 조직학적 특성을 예측하는데에 도움을 주 수 있을 것으로 기대된다. 뇌종야에서의 관류MR영상의 분명한 역할을 규명하기 위해서는 앞으로 더 많은 임상적 연구가 필요할 것으로 생각된다.조증 환자의 자극성 전타액내 lactobacilli양은 peroxidase system을 함유한 세치제를 사용한 군에서 대조군에 비해 상대적으로 낮게 나타났으나(p = 0.067) 통계학적 유의성은 없었다.같은 예에서 찾아 볼 수 있다. 첫째, 발음상으로 동사의 변화형에서 "porte[$p{\jmath}rte$](들다: 현재형), porte[$p{\jmath}rte$](과거분사형), porta[$p{\jmath}rte$](단순과거형)"등이 대립되며, 이휘 "Porto[$p{\jmath}rte$](포르토)"와도 대립된다. 둘째, 어휘적 대립 "le haut[$l{\partial}o$](위)/l'eau[lo](물)"와 형태론적 대립 "le[$l{\partial}$](정관사, 남성단수)/l
비만은 제2형 당뇨병, 심혈관계 질환, 그리고 암을 비롯해 각종 질병의 위험인자로 작용한다. 비만은 낮은 수준의 전신성 염증상태로 간주되며, 비만시 증가하는 염증성 분자는 제2형 당뇨병 또는 동맥경화등의 비만성 질병 발생과정에 깊이 관여한다. 따라서, 염증제어는 비만성 질환제어를 위해 매우 중요하다. 지방세포 비대에 따른 지방세포 기능이상은 아디포사이토카인의 분비 이상을 초래하고, 비만성 질환의 발생 및 촉진자로 작용한다. 비만환자에게서의 MCP-1과 같은 염증성 아디포사이토카인의 분비 제어는 비만성 질환을 예방하거나, 또는 질병 발생 및 진행을 지연시키는 전략적 가치가 있을 것으로 사료된다. 지방세포가 분비하는 케모카인 가운데 MCP-1은 비대한 지방조직내로의 대식세포의 침윤 및 활성화를 유도하며, 특히 비대한 지방조직에서의 염증반응을 증폭시키는 역할을 한다. MCP-1은 내 장지 방조직에서 특히 그 분비량이 높았고, 따라서, 복부비만 관련 질환의 타겟분자로서 가치가 있을 것으로 생각된다. 또한, MCP-1 작용을 저해하는 항염증성 phytochemical은 비만으로 인한 염증성 질환의 발생을 지연시키거나, 즉 예방적인 차원에서 유용할 것으로 사료된다.
Choi, Ju Young;Chang, Hye Jeong;Lee, Min Jin;Sim, Sung Sin;Ryu, Yon Ju;Moon, Jin Uk;Lee, Jin Hwa;Chun, Eun Mi;Chang, Jung Hyun
Tuberculosis and Respiratory Diseases
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v.61
no.3
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pp.279-284
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2006
A multiple primary malignant tumor is a disease mainly encountered in the of the older age groups. Attempts should be made to rule out a second primary malignant neoplasm in the elderly patients with unusual signs and symptoms. We encountered a case of a 67-year-old male with triple primary malignant tumors of the stomach, larynx, and lung. The patient had been treated with a subtotal gastrectomy for early gastric cancer in 1991 and a Laser laryngectomy for the laryngeal squamous cell carcinoma in 2003. In 2005, lung cancer was found with the biopsy revealing an adenosquamous carcinoma. Systemic chemotherapy was performed.
Journal of Advanced Marine Engineering and Technology
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v.41
no.3
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pp.258-268
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2017
In this study, we aim to converge a technology for analyzing the hydraulic circuit of a loading arm with an- other one for analyzing multi-body dynamics by utilizing analysis software SimulationX. Further, this study intends to overcome the limitations of the existing technology for analyzing a hydraulic circuit with a variation at the rotation center of the moving mass and the difficulty of incorporating the behavior in a gravity field. First, the specifications of the hydraulic circuit components were reflected in an analysis model to secure reliability. Hydraulic circuit modeling was then performed using a single analysis model with a verified reliability. Subsequently, the multi-body system (MBS) model of the loading arm was formed. Finally, the analysis model of the hydraulic circuit and the MBS model were converged to check if the circuit analysis result was exactly reflected in the MBS model. The convergence analysis model has development cost-saving effect because it is capable of predicting the dynamic behavior of an object without the prototype.
Park, Jeong-Seok;Yoo, Hwa-Seung;Lee, Yeon-Weol;Cho, Jung-Hyo;Son, Chang-Gue;Cho, Chong-Kwan
The Journal of Internal Korean Medicine
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v.28
no.3
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pp.531-543
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2007
Backgrounds : Gastric cancer is one of the most frequent causes of cancer-related deaths worldwide. Gastric cancer patients frequently exhibit distant metastasis at the time of diagnosis and at present, there is no standard regimen after operation or chemotherapy to prevent metastasis and recurrences. Aims : The objective of the study was to compare the overall survival and disease free survival in patients treated with wheel balance therapy (WBT) with patients treated with WBT alone or the combination of WBT and conventional therapy and see if there were any significant improvements in survival between the two groups. Setting & Design : East-West Cancer Center at Daejeon University: retrospective study. Materials & Methods : We retrospectively analyzed 62 patients with stage III (40 patients) and stage IV (22 patients) gastric cancer who have received operation or chemotherapy 2 months prior to beginning WBT. The patients followed the WBT protocol which includes herbal medicine such as PSM capsules, OnePlus syrup, or HAD capsules which prevent metastasis and recurrences. Overall survival and disease free survival were analyzed and the patients were treated for 89.55 weeks and 49.27 weeks (median value) for stages III and IV, respectively. Statistical analysis used : Overall survival and disease free survival were estimated using the Kaplan-Meier method and the WBT and combination treatment arms were compared using the log rank test. Results : For stage III, the 3 year overall survival was 78.5% and disease free survival was 78.3%. Metastasis and recurrence occurred in 13 of 40 patients (32.5%). For stage IV, the 2 year overall survival was 18.2% and disease free survival was also 18.2%. Metastasis and recurrence occurred in 19 of 22 patients (86.4%). No significant difference was found statistically between the WBT alone and combination treatment arms though the combination regimen showed superiority (overall survival p=0.5093, disease free survival p=0.5175). Conclusions : WBT yielded satisfactory results in prolonging survival and preventing metastasis and recurrence in gastric cancer patients. The major treatment unit of WBT is composed of herbal medications (HAD, PSM capsules, OnePlus syrup) and a randomized, prospective study should be carried out using only this treatment unit in the future.
Hwang Jee Young;Kim Sun Hee;Kang Chi Dug;Yoon Man Soo
Journal of Life Science
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v.15
no.3
s.70
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pp.406-414
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2005
The genetic instability of cancer cells may be related to inappropriately activated DNA repair pathways. In present study, the modulated expression of DNA-dependent protein kinase (DNA-PK), a major DNA repair protein, in human cancer metastatic cells was tested. The expressions of Ku70/80, regulatory subunit of DNA-PK, and the Ku DNA-binding activity in various highly metastatic cell lines were higher than those in each parental cell line. Also, the expression of DNA-PKcs, catalytic subunit of DNA-PK, and the kinase activity of the whole DNA-PK complex in highly metastatic cells were significantly increased as compared to those of parental cells, suggesting that the enhanced DNA repair capacity of metastatic cells could be associated with aberrant use of DNA repair, which may mediate tumor progression and metastatic potential. Increased EGFR (epidermal growth factor receptor) signaling has been associated with tumor invasion and metastasis, and the linkage between EGFR-mediated signaling and DNA-PK has been suggested. This study showed that PKI166, the new EGFR tyrosine kinase inhibitor, modulated the expressions of Ku70/80 and DNA-PKcs and also revealed the chemosensitization effect of PKI166 against metastatic cells may be in part due to inhibition of Ku70/80. These results suggest that interference in EGFR signaling by EGFR inhibitor resulted in the impairment of DNA repair activity, and thus DNA-PK could be possible molecular targets for therapy against metastatic cancer cells.
기계학습 기반의 자연어처리 모듈에서 중요한 단계 중 하나는 모듈의 입력으로 단어를 표현하는 것이다. 벡터의 사이즈가 크고, 단어 간의 유사성의 개념이 존재하지 않는 One-hot 형태와 대조적으로 유사성을 표현하기 위해서 단어를 벡터로 표현하는 단어 표현 (word representation/embedding) 생성 작업은 자연어 처리 작업의 기계학습 모델의 성능을 개선하고, 몇몇 자연어 처리 분야의 모델에서 성능 향상을 보여 주어 많은 관심을 받고 있다. 본 논문에서는 Word2Vec, CCA, 그리고 GloVe를 사용하여 106,552개의 PubMed의 바이오메디컬 논문의 요약으로 구축된 말뭉치 카테고리의 각 단어 표현 모델의 카테고리 분류 능력을 확인한다. 세부적으로 나눈 카테고리에는 질병의 이름, 질병 증상, 그리고 난소암 마커가 있다. 분류 능력을 확인하기 위해 t-SNE를 이용하여 2차원으로 단어 표현 결과를 맵핑하여 가시화 한다. 2차원으로 맵핑된 결과 값을 코사인 유사도를 사용하여 질병과 바이오 마커간의 유사도를 구한다. 이 유사도 결과 값 상위 20쌍의 결과를 가지고 실제 연구가 되고 있는지 구글 스콜라를 통해 관련 논문을 검색하여 확인하고, 검색 결과를 점수화 한다. 실험 결과 상위 20쌍 중에서 85%의 쌍이 실제적으로 질병과 바이오 마커 간의 관계를 파악하는 방향으로 진행 되고 있으나, 나머지 15%의 쌍에 대해서는 실질적인 연구가 잘 되고 있지 않은 것으로 파악되었다.
Annual Conference on Human and Language Technology
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2016.10a
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pp.317-320
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2016
기계학습 기반의 자연어처리 모듈에서 중요한 단계 중 하나는 모듈의 입력으로 단어를 표현하는 것이다. 벡터의 사이즈가 크고, 단어 간의 유사성의 개념이 존재하지 않는 One-hot 형태와 대조적으로 유사성을 표현하기 위해서 단어를 벡터로 표현하는 단어 표현 (word representation/embedding) 생성 작업은 자연어 처리 작업의 기계학습 모델의 성능을 개선하고, 몇몇 자연어 처리 분야의 모델에서 성능 향상을 보여 주어 많은 관심을 받고 있다. 본 논문에서는 Word2Vec, CCA, 그리고 GloVe를 사용하여 106,552개의 PubMed의 바이오메디컬 논문의 요약으로 구축된 말뭉치 카테고리의 각 단어 표현 모델의 카테고리 분류 능력을 확인한다. 세부적으로 나눈 카테고리에는 질병의 이름, 질병 증상, 그리고 난소암 마커가 있다. 분류 능력을 확인하기 위해 t-SNE를 이용하여 2차원으로 단어 표현 결과를 맵핑하여 가시화 한다. 2차원으로 맵핑된 결과 값을 코사인 유사도를 사용하여 질병과 바이오 마커간의 유사도를 구한다. 이 유사도 결과 값 상위 20쌍의 결과를 가지고 실제 연구가 되고 있는지 구글 스콜라를 통해 관련 논문을 검색하여 확인하고, 검색 결과를 점수화 한다. 실험 결과 상위 20쌍 중에서 85%의 쌍이 실제적으로 질병과 바이오 마커 간의 관계를 파악하는 방향으로 진행 되고 있으나, 나머지 15%의 쌍에 대해서는 실질적인 연구가 잘 되고 있지 않은 것으로 파악되었다.
Plummer-Vinson syndrome(Paterson-Kelly syndrome) is characterized by dysphagia due to upper esophageal or hypopharyngeal web, iron deficiency anemia, and atropic oral and glossal mucosa. This syndrome is usually known as precancerous lesion that develops into postcricoid carcinoma. Universally, the clinical manifestations of this syndrome were markedly improved after oral iron replacement therapy or endoscopic balloon or electrocautery treatment. 63 year-old woman was received a short segment, free jejunal transfer to be released from esophageal stricture. After the operation, the stenotic lesion proved to be Plummer-vinson syndrome with carcinoma in situ by pathologic study.
Purpose Brown fat, or brown adipose tissue (BAT), is involved in non-shivering thermogenesis and creates heat through glucose metabolism. BAT activation occurs stochastically by internal factors such as age, sex, and body mass index (BMI) and external factors such as temperature and environment. In this study, as a retrospective, electronic medical record (EMR) observation study, statistical analysis is conducted to confirm BAT activation and various factors. Materials and Methods From January 2018 to December 2019, EMR of patients who underwent PET/CT scan at the National Cancer Center for two years were collected, a total of 9155 patients were extracted, and 13442 case data including duplicate scan were targeted. After performing a univariable logistic regression analysis to determine whether BAT activation is affected by the environment (outdoor temperature) and the patient's condition (BMI, cancer type, sex, and age), A multivariable regression model that affects BAT activation was finally analyzed by selecting univariable factors with P<0.1. Results BAT activation occurred in 93 cases (0.7%). According to the results of univariable logistic regression analysis, the likelihood of BAT activation was increased in patients under 50 years old (P<0.001), in females (P<0.001), in lower outdoor temperature below 14.5℃ (P<0.001), in lower BMI (P<0.001) and in patients who had a injection before 12:30 PM (P<0.001). It decreased in higher BMI (P<0.001) and in patients diagnosed with lung cancer (P<0.05) In multivariable results, BAT activation was significantly increased in patients under 50 years (P<0.001), in females (P<0.001) and in lower outdoor temperature below 14.5℃ (P<0.001). It was significantly decreased in higher BMI (P<0.05). Conclusion A retrospective study of factors affecting BAT activation in patients who underwent PET/CT scan for 2 years at the National Cancer Center was conducted. The results confirmed that BAT was significantly activated in normal-weight women under 50 years old who underwent PET/CT scan in weather with an outdoor temperature of less than 14.5℃. Based on this result, the patient applied to the factor can be identified in advance, and it is thought that it will help to reduce BAT activation through several studies in the future.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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