• 제목/요약/키워드: 중복 허용

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탠덤 질량 분석을 위한 디코이 데이터베이스 생성 방법의 중복성 관점에서의 성능 평가 (Evaluation of the Redundancy in Decoy Database Generation for Tandem Mass Analysis)

  • 이홍란;류단휘;이기욱;황규백
    • 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지
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    • 제22권1호
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    • pp.56-60
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    • 2016
  • 탠덤 질량 분석에서는 신뢰도 높은 펩타이드 동정을 위해 목표 데이터베이스의 참조 단백질 순서를 재배치한 디코이 데이터베이스가 주로 이용된다. 한편 목표 데이터베이스와 디코이 데이터베이스 사이 혹은 디코이 데이터베이스 내부에 서열이 동일한 중복 펩타이드가 존재할 수 있으며, 이는 단백질 동정을 어렵게 하는 요인이 된다. 따라서 디코이 데이터베이스의 중복성을 최소화하는 것은 중요한 문제이다. 본 논문에서는 디코이 데이터베이스 생성에 널리 사용되는 의사셔플(pseudo-shuffling)과 의사역순(pseudo-reversing) 방법이 디코이 데이터베이스의 중복성에 미치는 영향을 조사하였다. 실험 결과, 목표 데이터베이스 크기와 데이터베이스 생성 시 허용되는 'missed cleavage site'의 최대 개수는 중복성을 증가시킴을 확인하였다. 또한 동일한 조건에서는 의사역순 방법이 의사셔플보다 항상 낮은 수준의 중복성을 가지는 디코이 데이터베이스를 생성하였다.

병렬처리 시스템에서의 Dual 네트워크의 설계 및 오류허용 라우팅 전략 (Design and Fault Tolerant Routing Scheme of Dual Network in Parallel Processing System)

  • 최창훈;김성천
    • 한국통신학회논문지
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    • 제19권6호
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    • pp.1169-1181
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    • 1994
  • Gamma 네트워크는 많은 수의 중복경로를 포함하고 있기 때문에 오류발생시 그 오류를 허용할 수 있는 능력을 보유하고 있다. 그러나 근원지 번호와 목적지 번호가 동일한 경우에는 경로가 한개 뿐이어서 오류가 발생한다면 오류를 허용할 수 있는 어떠한 방법도 존재하지 않는다. 더욱이 그 네트워크가 동적 패킷 라우팅(dynamic packet routing) 전략을 사용할 경우에 오류가 발생한다면 다른 중복경로를 찾기위해 후진추적(backtracking)을 해야하는 문제점도 가지고 있다. 본 논문에서는 이러한 문제들을 새로운 스테이지 첨가 없이 해결할 수 있는 네트워크인 Dual 네트워크를 제안하고 있다. Dual 네트워크는 처음과 마지막 스테이지를 제외하면, Gamma 네트워크와 동일한 크기의 스위칭 소자를 사용하고 있으며, 특히 같은 크기의 Gamma 네트워크보다 스테이지(stage)수가 한개 줄어들어 매우 효율적인 네트워크이다. 또한, Dual 네트워크에서는 라우팅 방법으로 목적지 주소 라우팅(Destination Tag Routing)방법을 사용하기 때문에, 보다 간편하고 빠른 라우팅을 수행할 수 있는 장점도 가지고 있다.

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분산된 지리정보시스템에서 새로운 잠금기법을 이용한 중복된 공간 데이터의 변경 전파 (Update Propagation of Replicated Spatial Data using New Locking Techniques in Distributed Geographic Information System)

  • 최진오;홍봉희
    • 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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    • 제26권9호
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    • pp.1061-1072
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    • 1999
  • 한 개 이상의 사이트에 공간 데이타가 중복 저장된 분산 공간 DB에서, 동시에 수행될 수 있는 긴 트랜잭션의 변경은 일관성 제어를 위해 다른 사이트에 전파되어야 한다. 이때 같은 영역의 공간 데이타를 서로 다른 사이트에서 동시에 변경할 경우, 변경 상충 문제가 발생하거나 잠금 기법에 의한 오랜 대기 시간이 초래되는 문제가 있다. 또한 공간 객체는 잠금의 대상이 아닌 공간 관련성에 의한 종속성을 가진다.이 논문은 긴 트랜잭션으로 중복된 공간 데이타를 변경할 경우 중복 제어를 위한 변경 전파와 동시성 제어 문제를 다룬다. 중복된 공간 데이타의 변경 병렬성을 향상시키기 위해 영역 잠금 및 SR-bound WRITE 잠금 기법을 제시한다. 한 사이트에서 수정하는 객체들과 다른 사이트에서 수정하는 객체들 사이에 공간 관련성에 의한 종속성이 없을 경우 병렬 수정을 허용하도록 제어하며, 공간 관련성에 의한 종속성이 있을 경우 SR-based 2PC라 불리는, 확장된 2단계 완료 프로토콜로 협동작업을 수행해서 변경 상충을 해결하는 새로운 중복 제어 기법을 설계하고 구현한다.Abstract The update of a long transaction should be propagated to the other sites for consistency control, when spatial database are replicated at multiple sites to achieve availability, reliability, and performance. When the replicated spatial data are updated at the same time, the update of one site would be conflicted with the other or a user would not be able to access the replicated spatial data under the control of locking. Two spatial objects having spatial relationships should be cooperatively updated even if there are no conflicts of locking for them.This paper deals with the issues of concurrency control and update propagation of replicated spatial data. We present the concept of region lock and SR-bound WRITE lock for enhancing the parallelism of updating the replicated spatial data. If there are no spatial relationships between one site's objets and the other's objects, parallel update would be allowed. Concurrent update of two spatial objects having spatial relationships should be propagated and cooperated by using an extended two-phase commit protocol, called spatial relationship-based 2PC.

트래픽 중복 제거로 네트워크 에너지 소비를 최소화하기 위한 최적화 알고리즘 (Optimization Algorithm for Minimizing Network Energy Consumption with Traffic Redundancy Elimination)

  • 장길웅
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제25권7호
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    • pp.930-939
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    • 2021
  • 최근 네트워크에서 안정된 전송을 위해 광대역의 대역폭과 중복 링크를 사용함으로써 과도하게 에너지를 소비하고 전송효율을 떨어뜨리는 결과를 낳고 있다. 본 논문에서는 트래픽 중복이 허용되는 네트워크에서 중복 트래픽을 제거함으로써 전송 링크의 수를 줄이고 전송에너지를 최소화하는 최적화 알고리즘을 제안한다. 본 논문에서 제안하는 최적화 알고리즘은 타부서치 알고리즘을 이용한 메타휴리스틱방식을 사용한다. 제안된 최적화 알고리즘은 중복되는 트래픽을 효율적으로 경로 설정할 수 있도록 이웃해 생성방식을 설계하여 전송에너지를 최소화한다. 제안된 최적화 알고리즘의 성능평가는 네트워크에서 발생하는 모든 트래픽을 전송하기 위해 사용되는 링크의 수와 소모되는 전송에너지 관점에서 수행되었다. 성능평가 결과에서 제안된 알고리즘이 이전에 제안된 다른 알고리즘에 비해 더 우수한 성능 결과가 나타남을 확인할 수 있었다.

결함 허용을 제공하는 원격 프로시듀어 호출 기법 (Remote Procedure Call Scheme to Support Fault-Tolerance)

  • 한석진;구용완
    • 한국정보처리학회논문지
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    • 제2권4호
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    • pp.453-465
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    • 1995
  • 원격 프로시듀어 호출은 좀 더 효율적이며 신뢰성이 가미된 분산 프로그램을 프로 그래머가 작성하기 쉽도록 하기 위하여 연구 되어 왔다. 본 연구에서는 하드웨어 결함 에 대한 신뢰성 있는 결함 허용 원격 프로시듀어 호출 기법을 제시한다. 결합 허용은 chain이라 불리는 노드의 그룹으로 프로시듈어를 복제 하여 제공하며, chain내의 사본 들은 선형적인 순서로 되어 있다. 프로시듀어에 대한 호출은 chain내의 첫 번째 사본 (primary copy)으로 보내지며, 나머지 사본에게는 내부적으로 전파된다. 결함이 발생 한 경우, 결함이 발생하지 않은 chain 내의 첫 번째 사본이 caller에게 결과를 반환하 게 된다. 특히, 제한적으로 ack message을 사용함으로써 중복된 call message와 result message의 처리를 피하였다. 이 기법은 기존의 원격 프로시듀어 호출에 비하여 효율적 이고 신뢰성 있는 결함 허용을 제공하게 된다.

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일반적 네트워크에서의 결함허용 시스템 구성 알고리즘에 관한 연구 (A Study on Fault-Tolerant System Construction Algorithm in General Network)

  • 문윤호;김병기
    • 한국통신학회논문지
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    • 제23권6호
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    • pp.1538-1545
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    • 1998
  • 시스템의 신뢰성은 디지털 컴퓨터 시대가 시작된 이래 가장 중요한 관심사가 되어 왔다. 신뢰성을 증가시키는 가장 최근 방법 중 하나는 결함허용 시스템을 고안하는 것이다. 본 논문에서는 일반적 그래프 형태에 대해 결함 허용 시스템의 구성방법을 제안하였다. 이 시스템은 여러 개의 예비 노드를 가진다. 최근까지 결함허용 시스템 고안은 루프 형태와 트리 형태의 네트워크에서만 작용되어 왔다. 그러나 그것들은 매우 제한적인 경우이다. 본문의 알고리즘은 그러한 많은 제약을 가지지 않고서 어느 유형이든 적용될 수 있는 융통성을 갖도록 시도되었다. 이 알고리즘은 여러 단계로 구성되는데 최소 직경 스패닝 트리의 검출 단계, 최적 노드 결정 단계, 원래의 연결성 복구 단계 및 최종적으로 중복 그래프의 구성 단계이다.

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지수 평활법을 이용한 Predictive Smoothing Voter 개발 (Development of Predictive Smoothing Voter using Exponential Smoothing Method)

  • 김만호;임창휘;이석;이경창
    • 한국자동차공학회논문집
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    • 제14권6호
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    • pp.34-42
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    • 2006
  • As many systems depend on electronics, concern for fault tolerance is growing rapidly. For example, a car with its steering controlled by electronics and no mechanical linkage from steering wheel to front tires(steer-by-wire) should be fault tolerant because a failure can come without any warning and its effect is devastating. In order to make system fault tolerant, there has been a body of research mainly from aerospace field. This paper presents the structure of predictive smoothing voter that can filter out most erroneous values and noise. In addition, several numerical simulation results are given where the predictive smoothing voter outperforms well-known average and median voters.

정보 블록 정렬 알고리즘 (A New Sort Algorithm : Information Block Sort Algorithm(IBSA))

  • 송태옥;정상욱;김태영
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2000년도 추계학술발표논문집 (상)
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    • pp.195-198
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    • 2000
  • 본 논문에서는 정보블록알고리즘(IBPA; Information Block Preprocessing Algorithm)을 이용한 정보블록 정렬알고리즘(IBSA; Information Block Sort Algorithm)을 제안하고 그 성능을 평가하였다. IBSA의 시간복잡도는 O(N)이며, 데이터의 분포상태에 영향을 받지 않는다. IBPA의 성능을 측정해본 결과, 2백만개의 랜덤데이터를 정렬한 경우, 중복 값 허용의 경우(a)는 퀵 정렬의 32.42%, 기수정렬의 9%정도의 비교회수만으로도 정렬할 수 있음을 보여주었으며, 중복 값이 없는 경우(b)는 퀵 정렬의 53.12%, 기수정렬의 12.79%정도의 비교회수만으로도 정렬할 수 있음을 보여주었다.

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파일 자원 사용 빈도를 고려한 클러스터 파일시스템의 성능 향상 (Performance Improvement of Cluster File System Regarding Usage Frequency of File Resources)

  • 최창열;정지영;김성수
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2000년도 추계학술발표논문집 (하)
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    • pp.949-952
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    • 2000
  • 공유 저장장치에 접근할 수 있는 경로를 다중화함으로써 클러스터 파일시스템 내 한 노드에서 발생하는 결함을 허용할 수 있다. 공유 저장장치의 다중접근은 파일 이동과 파일 중복으로 이루어진다. 본 논문에서는 전역 파일 시스템의 평균 응답 시간을 줄이기 위해 파일 자원의 접근률에 따라 우선 순위를 두어 파일이동과 과일 중복 시 발생할 수 있는 클러스터 파일 시스템의 성능 저하 및 서비스 중단을 막기 위한 방법을 제안한다. 파일 자원의 접근률은 파일 처리 시에 사용되는 블록, 아이노드(mode), 슈퍼블록과 같은 자원 사용 빈도를 통해 얻어질 수 있다.

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국어 분절음 특성에 맞는 음성 데이터 베이스의 모형 (A Model of Speech Database in Korean in consideration of its segmental phonology)

  • 김종미
    • 한국음향학회:학술대회논문집
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    • 한국음향학회 1994년도 제11회 음성통신 및 신호처리 워크샵 논문집 (SCAS 11권 1호)
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    • pp.297-302
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    • 1994
  • 본 논문에서는 국어 분절음 특성에 맞는 음성 데이터베이스의 모형을 제시하고자 한다. 음성 데이터 베이스는 1) 각 음의 고유음가정보, 2) 인접음 정보, 3) 빈도수에 따른 확률정보를 포함해야 한다. 이 요건을 충족시키기 위해 본 모형은 1) 음운 단위별로 Labeling 하여, 고유음과 인접음 정보를 편집하고, 2) 음운 규칙과 제약정보에 의해 Phoneme Balanced Words를 작성하여, 허용되는 인접음을 취하고, 허용되지 않는 인접음을 탈락시키며 3) 시스템 평가시, 빈도수가 shb은 음과 음소열의 우선적인 인식 및 합성을 우월하게 평가한다는 고정서, 4) 데이터 집적시, 데이터의 음운기능의 중복과 편중을 피함으로서 데이터량을 간소화할 수 있다는 경제성을 들 수 있다.

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