• 제목/요약/키워드: 조혈모세포기증

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협회소식

  • 한국조혈모세포은행협회
    • 나누는사람들
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    • 통권28호
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    • pp.20-23
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    • 2004

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차세대염기서열분석법을 이용한 HLA-A, -B 그리고 -DR 형별 분석법 개발 (Development of HLA-A, -B and -DR Typing Method Using Next-Generation Sequencing)

  • 서동희;이정민;박미옥;이현주;문서윤;오미진;김소영;이상헌;형기은;허혜진;조대연
    • 대한수혈학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.310-319
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    • 2018

  • 배경: 최근 차세대염기서열분석법(Next Generation Sequencing: NGS)을 이용한 HLA 형별 분석에 대한 연구가 활발히 진행되고 있다. 이에 HLA 고해상도 분석법의 내재적 한계인 위상 모호성의 문제를 해결하고, 대량 검체 처리가 가능한 NGS 기반 고해상도 HLA 형별 검사법을, 자체 기술로 개발하고자 본 연구를 실시하였다. 방법: HLA NGS를 위한 핵산 추출 조건, 라이브러리 제작 및 PCR 체계 확립, 그리고 생물정보학을 이용한 HLA 형별 분석법을 개발하였다. 본 기관에서 개발한 NGS 기반 HLA 형별 검사의 정확성을 알아보기 위해 SSOP법으로 HLA 형별을 알고 있는 192개 검체와 SBT법으로 HLA 형별을 알고 있는 28개 검체에 대해 NGS 기반으로 검사한 HLA-A, -B 그리고 -DR 형별 결과를 비교해 보았다. 결과: 두 단계의 PCR을 통한 DNA 라이브러리 제작과 MiSeq (Illumina Inc., San Diego, USA) 기기를 이용한 NGS 시퀸싱 그리고 데이터 분석 시스템을 구축하였다. 기존에 HLA 형별을 알고 있는 220개 혈액 검체에 대해 NGS 기반 HLA 형별검사 결과가 모두 일치함을 확인하였다. 결론: NSG 기반 HLA 형별 검사법은 많은 검체를 효율적인 시간 내에 처리가 가능하여 조혈모세포기증 희망자 HLA 검사 등에 유용할 것으로 기대된다.

  • https://doi.org/10.17945/kjbt.2018.29.3.310 인용