• Parasites, Hosts and Diseases
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• v.34 no.1
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• pp.15-20
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• 1996

Cysts of Entamoebn histoIMtica are still found from humans in Korea, but notall of the cysts are known as pathogenic. The non-pathogenic strain is regarded as a differenL species, E. nispnr. In this study, Korean isolates of conventional E. histolvticn were subjected for the differentiation by polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. Human stools were screened by routine microscopic examination, and cyst or trophozoite positive stools were inoculated into Robinson media. The cultivated trophozoites were prepared for DNA extraction, and the DNAs were used for PCR with common primers of Pl gene. The PCR products were divested with 3 restriction enzymes and RFLP was observed. Also anti-sense primers containing the cleavage site of each restriction eWe were designed for differentiation only by PCR. The PCR products of Korean isolates 59,512, YS-6, and YS-27 were spliced by Taq I and Xmnl but not byAccl, and the isolates S1, S3, S11, S15, S16, S17, S20, YS- l7, and YS-44 were spliced by Acc I but not by Taq I and Xmn I. These RFLP pattern correlated well with PCR products by the species specific primers. The findings confirm that the Korean isolates 59,512, YS-6, and YS-27 are E. histolwtico and others are E. dispar. In Korea, most of the asymptomatic cyst carriers are infected by E. dispar, not by E. histolytica. Key words: Entcmoebc histolytica, Entcmoebn dispar Korean isolates, polymerase chain reaction (PCR), restriction fragment length polymorphism (RFLP)

• Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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• 1994.04a
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• pp.192-192
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• 1994

본 논문에서는 cytochrome P450 LA1 유전자의 5'-upsteam 조절부위의 클로닝을 실시하였다. pUC19 vector에 연결시킨 3.4 Kb 크기의 Pstl DNA조각을 Sst1, Nco1 제한 효소로 자른 뒤, Exonuclease III 를 처리하여 약 200bp 씩의 차이를 갖는 여러 크기의 plasmid들을 얻었다. 이 plasmid 의 핵산서열을 알아보기 위해 dideoxy nucletide를 이용한 sequencing방법으로 그 핵산서열의 결정 실험을 시도하였다. 또한, 다환상 방향족 탄화수소 화합물에 반응성을 갖는 C57BL/6N 생쥐와 반응성을 갖지않는 DBA/2N 생쥐에 있어 phase II 대사 효소인UDP-glucuronosyltransferase 효소활성에 대한 3-methylcholanthrene의 영향을 알아보기 위해 C57BL/6N 생쥐와 DBA/2N 생쥐에 각각 다른 농도의 3-methylcholanthrene을 처리하거나 각기 다른 시간에 3-methylcholanthrene를 처리하였다. 그 결과 UDP-glucuronosyl-transferase의 mRNA가 3-methylcholanthrene양의 증가에 따라, 처치시간이 길어짐에 따라 증가되어지며 그 mRNA위 크기는 약 2.2Kb 정도임을 알았다. 이로부터 UDP-ghucuronosyltransferase 또한 cytochrome P45O와 함께 다환상 방향족 탄화수소 화합물 조절인자를 통한 조절을 받을 것이며 phase I phase II 약물 대사 효소가 조절상 밀접한 관련을 가짐을 예측할 수 있었다.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.32 no.4
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• pp.285-290
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• 1994

About 500 bacterial and fungal strains from a wide variety of natural habitats were screened for a new type II restriction endonuclease. Among the 500 species, we selected one species that produced a new restriction endonuclease. This strain has an optimum temperature of $30^{circ}C$ for growth. Morphological, cultural, and physiological characteristics were examined for identification of the isolated strain J-482. This strain was found to belong to the genus Alcaligenes. The restriction endonuclease was named as AspJI and partially purified from Alcaligenes sp. J-482 by DEAE-Sephadex A-50 column chromatography and gel filtration. Most of other nucleases were removed by the purification steps. The AspJI has a substrate specificity to ${lambda}$ DNA, pBR322 and Adenovirus-2 DNA. For its maximal activity, the isolated enzyme requires $MgCl_2$, which should be at least 12.5 mM and it does not need any other cofactors. It is maximally active in the absence of NaCl and is completely inactivated at 100 mM NaCl. The pH and temperature optima for activity were pH 7.5 and $37^{circ}C$, respectively. The DNA fragments generated by digesting ${lambda}$ DNA, pBR322, and Adenovirus-2 DNA with AspJI were the same as that produced by AatII. This suggests that AspJI is an isoschizomer of AatII.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• v.17 no.1
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• pp.73-80
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• 2002

Pyruvate dehydrogenase phosphatase (PDP)와 kinase는 당대사시 해당과정에서의 대사 산물인 pyruvate를 acetyl CoA로 만들어 구연산 회로로 진입시켜 주는 효소인 pyruvate dehydrogenase complex (PDC)의 활성을 조절하는 중요한 효소이다. PDP의 catalytic subunit는 PDC의 dihydrolipoamide acetyltransferase (E2), PDP regulatory subunit (PDPr), 그리고 칼슘 결합 도메인 등으로 구성되어 있는 것으로 추측되어지고 있다. 본 연구에서는 그 구조와 기능과의 상관관계를 알아보기 위해 PDPc를 E. coli JM101에서 발현시켜 순수 정제 후 단백분해 효소를 이용한 제한적 가수분해 방법을 이용해 그 구조와 기능과의 상관관계에 대해 연구하고자 하였다 정제된 PDPc는 trypsin, chymotrypsin, Arg-C 그리고 elastase를 이용하여 3$0^{\circ}C$ 그리고 pH 7.0에서 제한적으로 분해시켰으며 각 분해산물의 아미노 말단의 아미노산 배열을 분석하였다. 그 결과 PDPc는 trypsin, chymotrypsin, elastase에 의해 N-terminal의 50 kD과 C-terminal의 10 kD의 두개의 분해산물을 만들었으며, Arg-C에 의해 50kD의 분해산물은 약 35kD와 15kD으로 더 가수분해가 되었다. 이러한 결과로 볼 때 PDPc는 앞에서 추측한데로 세개의 주요한 기능적 도메인으로 이루어져 있음을 알 수 있었다 또한 C-terminal의 10kD은 PDPc의 활성에는 영향을 주지 않는 것으로 밝혀졌으나 다른 도메인의 기능은 더 연구가 되어져야 할 것으로 생각된다.

• Journal of The Korean Society of Inherited Metabolic disease
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• v.16 no.3
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• pp.117-122
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• 2016

제1형 고셔병(Gaucher disease type 1)은 리소좀 효소인 산성 ${\beta}$-글루코시다아제(acid ${\beta}-glucosidase$)의 결핍으로 인한 리소솜 축적 질환이다. 효소 활성도가 감소되어 기질이 축적되어, 간비종대, 빈혈, 혈소판감소증 및 골질환을 포함한 전신 증상이 발생한다. 재조합 효소 단백을 정맥 주입하는 효소 대체요법(Enzyme replacement therapy)는 지난 20년 넘게 고셔병의 표준 치료법이었다. 그러나 성공적인 효소 대체요법에도 불구하고, 심각한 폐증상과 골격 증상 등 고셔병 치료에 여전히 해결되지 않는 문제들이 남아 있다. 기질 감소 치료(Substrate reduction therapy)는 기질의 생합성을 억제하여 축적을 감소시킨다. 최근 새로운 경구용 기질감소 치료제인 엘리글루스타트(eliglustat)가 적합한 CYP2D6 대사 표현형을 가진 고셔병 성인 환자를 위한 1차 치료제로 미국과 유럽에서 승인되었다. 엘리글루스타트가 아직 한국에서는 쓰이지 않고 있지만, 본 종설에서는 문헌 검토를 통해 고셔병의 새로운 치료로서의 효소 대체요법을 소개하고자 한다. 아직 확고한 결론을 도출하기에는 연구 결과가 제한적이기는 하지만, 현재까지의 데이터에 따르면 엘리글루스타트는 임상 효능에 있어서 효소 보충 요법에 비열등성을 보인다. 장기 결과에 대한 추가 연구가 필요하지만, 엘리글루스타트의 승인은 해당 1형 고셔병 성인 환자들에게 경구 치료제라는 새로운 선택을 가능하게 하였다. 향후 국내에서 엘리글루스타트가 처방 가능해 지면, 각 환자 마다 철저한 평가를 통해 치료법을 선택할 수 있도록 해야 할 것이다. 나아가, 국내 1형 고셔병 환자들을 위해 엘리글루스타트의 사용에 관한 임상적 지침 또한 조만간 개발될 필요가 있다.

• Transactions of the Korean Society of Mechanical Engineers A
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• v.28 no.10
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• pp.1598-1602
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• 2004

In this paper, we report a microthermostat using PDMS (poly-dimethylsiloxane) and glass. This PDMS/glass chip is able to maintain constant temperature that is necessary for restriction enzyme reaction. Since PDMS is the low-cost and the mass-producible material and has very good biochemical compatibility, PDMS chip has more benefit than general Si chip. Heater was made of Au wiring patterned on Pyrex glass. A reaction chamber has a capacity of about 3 ${mu}ell$. We performed a restriction enzyme reaction by using the fabricated microthermostat and conventional method. Then, with the electrophoresis, we made a comparison between the result from the micro reactor and the one from conventional method.

• Transactions of the Korean Society of Mechanical Engineers A
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• v.30 no.1 s.244
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• pp.26-31
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• 2006

This paper reports low-cost PDMS/glass based DNA microbiochip for the restriction enzyme reaction and its products detection using the capillary electrophoresis. The microbiochip ($25mm{\times}75mm$) has the heater integrated reactor ($5{\mu}{\ell}$) for DNA restriction enzyme reaction at $37^{\circ}C$ and the microchannel ($80\;{\mu}m{\times}100\;{\mu}m{\times}58mm$) for the capillary electrophoresis detection. It is experimentally confirmed that the digestion of the plasmid ($pGEM^{(R)}-4Z$) by the enzyme (Hind III and Sca I) is performed for less than 10 min and its electrophoresis detection is able to sequentially on the fabricated microbiochip.

• Korean Journal Plant Pathology
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• v.12 no.2
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• pp.169-175
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• 1996

콩 불마름병균 Xanthomonas campestris pv. glycines 8ra는 X. c. pv. vesicatoria에 길항력이 있는 bacteriocin인 glycinecin을 생성 분비한다. Bacteriocin 생성 분비 능력이 있는 콩 불마름병균을 효과적인 생물학적 방제원으로 활용하기 위해서는 좀더 체계적인 연구가 필요하여, bacteriocin 생성에 관계되는 유전자의 분리를 시도하였다. 약 2,000개의 Xanthomonas campestris pv. glycines 8ra cosmid library에서 bacteriocin의 생성 분비 능력을 조사하여 다섯 개의 clone을, pG011, pG0113, pG33과 pG35, 선발하였다. 그중 한 clone pG08을 임의로 선택하여 plasmid DNA를 분리하였다. Plasmid pG08에서 약 6.0 kb의 DNA를 떼어내어 다른 plasmid vector에 넣은 subclone pBL5는 bacteriocin의 생성 분비 능력이 있었다. Plasmid pG08을 제한효소 처리후 다시 접함시켜 만든 몇 개의 subclone과 pBL5의 제한효소 지도를 비교 분석한 결과 약 3.0 kb의 BamHI-HindIII 부분의 DNA가 bacteriocin의 생성에 관계함을 알았다.

• Microbiology and Biotechnology Letters
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• v.18 no.1
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• pp.94-97
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• 1990

The restriction cleavage map of multi-copy recombinant plasmid, pJY502 (5.5 kb), carrying the thiostrepton resistance gene (tsr) was determined. Comparison of the restriction pattern with that of Streptomyces plasmids previously demonstrated that pJY502 was novel. The plasmid pJY502 had a broad host range in Streptomyces and contained single BgtII site for cloning purpose. Transformation frequency of pJY502 was $2.2 \times 10^5$ in S. lividans. E. coti-Streptomyces bifunctional plasmid, pJY504, was also constructed.

• The Korean Journal of Malacology
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• v.13 no.1
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• pp.1-7
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• 1997

한국산 가리비, 큰가리비(Patinopecten yessoensis)와 주문진가리비(Chlamys swifti), 2종에 대한 28S ribosomal RNA 유전자의 PCR- 산물을 이용 RFLP 및 염기서열을 밝히고, 이미 보고된 2과 3종의 염기서열과 상동성을 비교 분석하였다. 그 결과 28S rRNA유전자를 이용하여 7가지 제한효소를 처리한 PCR-RFLP의 종간 차이에서 Taq I 제한효소에서만 차이를 볼 수 있었다. 한편 두종간에 28S rRNA유전자의 D1 부위의 염기서열에서 231개 부위 중 14군데에서 변이를 보였다.