We performed nuclear DNA typing and mitochondrial DNA sequencing analysis based on PCR from an ancient Korean remainsexcavated from Siheung in Korea. 7 bones were collected and partially STR(short tandem repeat) systems, Sex determination Amelogenin kit(Promega co, USA), were used in this study. Mitochondrial DNAs were also amplified and sequenced by ABI 310 DNA sequencer. We know that sample no. 2 and no. 3 were females and also sample no. 2 and no.7 possessed the same maternal inheritance by mitochondrial DNA sequencing results. Throughout this research, the mitochondrial DNA sequencing of human in the middle of Joseon Dynasty in Korea is obtained. In addition, this finding will be an important foundation for the future research.
동굴은 우리의 옛 조상들이 강 가까운 동굴 속에 살면서 바닷가나 냇가에서 물고기를 잡아먹으며 살아가는 등 먼 옛날 석기시대에는 혈거생활의 주거지로 이용되어 왔을 뿐만 아니라 그 후 인류가 발전함에 따라 다양하게 이용되어 왔다. 즉, 때로는 은신처로 이용되어 왔고 때로는 묘지로, 작전기지로, 그리고 물자의 저장고로도 이용되었고 그밖에 수양터와 신앙의 장소 등으로 사용되었었다. 이러한 증거로서 인골화석, 생활을 위해 선조들이 사용하였던 다량의 도구 등 일상용품이 아직도 보존되어 남아있는 것이 발견되고 있다. 우리 나라에서 가장 독특한 문화를 갖고 있는 제주도에서도 여러 개의 동굴이 발견되었다. 이들은 성인상으로는 모두 제주도의 화산 폭발과 관련된 것이어서 용암동굴로 분류되고 있다. 그 중에서 삼성혈은 제주도의 삼성신화, 즉 부족 형성과 관련 있는 것이고, 빌레못동굴은 구석기시대에도 재주도가 주거지로 이용되었음을 인증 받는 중요한 자료로 활용되고 있다. 또한 김녕사굴의 설화는 재주도 설화의 하나로서 제주도 정부와 주민들간의 일치단결에 대한 예를 보여주고 있으며, 산방굴은 제주도 여인들의 기개에 대한 예를 나타내 주는 곳이고, 세계에서 가장 긴 동굴군계인 만장굴은 여인의 한을 전설로 담고 있다. 이렇듯이 동굴은 인류와 매우 밀접하게 관련되어 있음을 확인할 수 있다. 따라서 이제 동굴은 그 학술적ㆍ문화적 가치로서는 물론 최근에 붐이 일고 있는 관광적 측면에서도 그 보전 및 연구ㆍ개발이 시급하다 하겠다.
The ancient biomolecular remains are the potential source for paleobiology and paleoanthropology. Especially, ancient human specimens such as bone, teeth, and hair are powerful materials to identify historical origin and migration of ancestor population from the past. However, most excavated human specimens in archaeological sites have commonly problems as natural damage and exogenous contamination. We carried out histological and molecular analyses of excavated bone from the historic sites in South Korea from the recently discovered in tumulus of Seochun and Naju. Biological deterioration of bone was observed anatomically by optical and scanning electron microscope (SEM). We extracted degraded DNA, and amplified hyper variable region (HVR) of mitochondrial DNA (mtDNA) and amelogenin of nucleus DNA. This study applied and examined the relationships between histological preservation and DNA survival in excavated bone.
We investigated the nucleotide substitution and insertion polymorphism of the hypervariable region Ⅰ and Ⅱ in mt DNA by sequencing ancient DNA from 51 ancient bones and teeth excavated at Nuk-do and Yimdang-dong in Korea. It revealed 35 sequence types from the ancient Korean. Of these, different sequences were 34 sequences. There were 19 and 38 base substitutions in HVI and HVⅡ, respectively. Some substitutions were characteristic of East Asian populations as compared with data reported on Caucacianpopulations,16051, 16150, 16172, 16223 in region I and 73, 263 in region II were noted as polymorphic sites, respectively. These were distributed evenly along the control region, though the frequency of each site was variable. Nucleotide substitution rather than insertion and deletion was the prevalent pattern of variation. Insertion of cytosine between312 and 315 in region HVⅡ were detected up to 98% in 51 ancient bone samples. This sequence data represents a phylogenetic tree using NTI DNA Suite computer program. The phylogenetic tree showed that mt DNA sequences of Nuk-do bones were relative to west Siberian and Indonesian. The usefulness of mt DNA sequencing in ancient Korean population excavated atarchaeological sites is based on biological and historical evidence for origin and migration of ancient Korean.
Preservation of artifacts that are excavated from archeological sites is closely related to soil environment. Biological remains are especially influenced by degradation activity of microorganism from soil environment. In this study a preserved human bone in archaeological tomb, Tou-kwang-myo from Joseon Period was analyzed to characterize bacteria groups by molecular genetic tools using 16S rDNA sequences. 117 clones were identified and classified 9 phylogenetic groups : ${\alpha}$-, ${\beta}$-, ${\gamma}$-, ${\delta}$-Proteobacteria, Sphingobacteria, Clostridia, Actinobacteridae, Nitrospiraceae, and Gemmatimonadetes according to homologous 16S rDNA sequences submitted in NCBI. ${\gamma}$-Proteobacteria group appears the highest ratio in bones (about 35%) while about 19.6% belong to the Actinobacteria group. The results may contribute to study on the effect of microorganisms on the human remains with burial method.
고고 유적지에서 출토된 뼈에서 추출한 DNA는 부식산과 풀빅산 등의 토양성분과 콜라겐 등 다양한 오염물질이 포함되어 있어 DNA의 추출 및 분석이 매우 어렵다. 본 연구에서는 phenol 추출법, silica 추출법 등 두 가지 대표적인 고대 DNA 추출법의 효율을 DNA 증폭 결과에 의하여 비교하였다. 또한 울트라급의 초음파를 시료 용해에 적용한 후 silica 추출법으로 DNA를 분리한 방법이 기존의 phenol 및 silica 추출법에 비하여 미토콘드리아 DNA와 아밀로제닌 유전자 증폭 결과가 더 우수한 것으로 나타났다.
In this study human bones and teeth, excavated from the Myeongam-risite in Asan, Chungcheongnam-do Province, have been analysed by nuclear DNA typing and mitochondrial DNA sequencing methods. Twenty-one samples of long bones and twenty-seven samples of teeth from twenty-one individuals were collected and analysed. Among these thirteenteeth were successfully subjected to nuclear DNA extraction, quantification, and PCR(Polymerase Chain Reaction) amplification. Silver STR III (D16S539, D7S820, D13S317) multiplex PCR method was used in this study for a short tandem repeat (STR) analysis. Mitochondrial DNAs of tooth samples were also amplified and sequenced by a DNA sequencer. These analyses show that a sample from Burial no. 29 and one from Burial no. 38(right) possessed the same maternal inheritance. This may suggest that the Myeongam-ri cemetery was used by a kin group for a relatively long period of time.
본고는 한국 상장례 중에서 빈의 연구에 대한 선행적인 작업으로써, 일본 고대의 빈(모가리)에 대한 기본적인 내용을 살펴보는데 있다. 빈(모가리)은 일본 고대의 상장례 중의 하나로서, 사람의 죽음부터 장지에 매장하기까지의 기간 동안에 행해진 일련의 의례를 말한다. 이것은 ${\ulcorner}$위지${\lrcorner}$위인전이나 ${\ulcorner}$일본서기${\lrcorner}$ 등의 문헌기록에도 나타나 있다. 이러한 문헌기록을 통해서 3세기대부터 상장례에서 빈이 행해졌음을 알 수 있다. 또한, 고고학에서도 식륜의 배치나 선각화 및 장식벽화에서도 빈 의례의 모습을 엿볼 수 있다. 본고에서는 특히 빈의 기간, 빈옥의 위치 및 구조, 그리고 讀의 내용에 대해서 고대의 문헌기록과 고고 유구 및 유물을 대상으로 검토하였다. 빈의 기간에 대해서는 문헌기록마다 다르며, 또한 같은 천황이라도 2개월부터 5년 8개월 등으로 일정하지 않다. 또한 고고학적 검토에서는 인골과 사람의 대변 분석을 통하여 문헌기록의 8일이나 10여일로 합치한다고 보고 있다. 빈옥의 위치는 옥외에 있다는 문헌기록과 고분의 주위에 있다는 고고학적 연구결과도 있다. 빈옥의 구조에 대해서도 문헌의 기록에서는 칼로써 베어 무너뜨릴 수 있는 간단한 구조로 기술되어 있는 반면에, 고고학의 가형식륜이나 장식벽화에 묘사된 것을 보면 견고한 가옥구조로 되어 있다. 빈 동안에 실시된 의례는 문헌기록이나 고분의 식륜배치 및 장식벽화에 나타난 것을 종합 해 볼 때, 사자의 초혼이나 진혼등을 위한 가무나 기도, 그리고 공선의례 등이 실시된 것으로 보인다. 본고는 일본 고대의 빈에 대한 검토이지만, 한편으로는 한국 고대의 빈 연구에 있어서 참고가 될 부분이 있을 것으로 생각한다.
The author studied to determine the sex and age of 8 ancient human skeletal remains, which had excavated from ancient tombs located in Yeanri, Kimhae. Some kinds of personal identification methods their skulls and teeth were used for this study and the results were obtained as follows : 1. Sex determination was possible in ancient teeth from 4th to 5th century, using detection of X-Y homologous amelogenin gene by polymerase chain reaction. 2. DNA analysis proved that the materials examined were all male, but which always did not coincide with the results from other methods for sex determination including comparison of sexual differentiation of cranium and teeth and use of discriminant functions in the dental measurement. 3. There was little difference of the estimated ages between the methods by regression of pulp cavity and attrition in teeth. The ages from these two methods always did not coincide with ones from evaluation closure of cranial and palatal sutures. 4. Sex and age of the materials were determined as follows ; $\cdot$ Y9 was estimated to be male in early sixties. $\cdot$ Yl2 was estimated to be male in late twenties to early thirties. $\cdot$ Y37 was estimated to be male in early forties. $\cdot$ Y70 was estimated to be male in early sixties. $\cdot$ Y87 was estimated to be male in late forties. $\cdot$ Y109 was estimated to be male in early forties. $\cdot$ Yl29 was estimated to be male in late thirties to early forties. $\cdot$ Yl42 was estimated to be male in late fifties to early sixties.
목적: 이 연구는 인공슬관절 전치환술을 받은 환자들에서 인공관절의 감염을 진단하는데 $^{99m}Tc$-HMPAO 표지 백혈구 스캔의 진단적 유용성을 평가하고자하였다. 대상 및 방법: 인공슬관절 전치환술 후 감염이 의심되어 $^{99m}Tc$-HMPAO 표지 백혈구 스캔 검사를 받은 20예 중 최종진단이 확실한 17명의 25예의 인골슬관절을 대상으로 하였다. 대상 환자는 남자가 1명, 여자가 16명으로, 평균연령은 65세였다. 모든 환자에서 $^{99m}Tc$-HMPAO 표지 백혈구를 이용한 전신 평면영상과 슬관절 SPECT를 얻었다. 대상군은 임상적으로 감염이 의심되는 정도에 따라 3군으로 나누었다. 감염이 강하게 의심되었던 인공슬관절군 (A군: 11예), 감염 여부를 감별하기 어려웠던 인공슬관절군 (B군: 6예), 무증상의 반대측 인공슬관절군 (C군: 8예)으로 분류하였다. 최종진단은 수술, 조직소견, 균 배양 및 임상적 추적검사로 결정하였다. 결과: A군 인골관절 11예 모두와 B군의 6예중 2예, 총 13예가 감염으로 확진되었다. $^{99m}Tc$-HMPAO 표지 백혈구 스캔은 A군 11예 모두에서 진양성을 보였고, B군에서는 진양성 2예, 위양성.: 1예, 진음성 3예를 보였으며, C군에서는 위양성 2예와 진음성 6예를 보였다. 전체적으로 인공슬관절의 감염을 진단하는 데 있어서 그 예민도, 특이도, 및 정확도는 각각 100%, 75%, 88%이었다. 결론: 인공슬관절 감염의 진단에 있어 $^{99m}Tc$-HMPAO표지 백혈구 스캔은 매우 예민한 방법이었다. 그러나, 상대적으로 낮은 진단적 특이도를 높이기 위하여 추가적인 골수 스캔이 인공슬관절 감염이 의심되는 환자의 진단에 필요하리라 생각된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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