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ATF2 전사인자의 발현과 AP-1 전사인자인 BATF, c-Fos, c-Jun과의 이량체 형성 (Expression of ATE2 Transcription Factor and the Interaction with AP-1 Factors : BATF, c-Fos, c-Jun)

  • 장혜영;김재호
    • 생명과학회지
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    • 제15권6호
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    • pp.928-934
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    • 2005
  • ATF2는 c-Fos와 c-Jun과 같은 전사인자이며 이들은 루신지퍼 단백질이다. 루신지퍼 단백질은 동형이합체 혹은 이형이합체를 형성하며 promoter 영역에 결합하여 전사조절에 중요한 역할을 한다. 세포의 전사인자 ATF2는 ATF/CRE site에 결합하며 특히 선택적인 interfamily 이형이량체를 형성함으로써 전사 조절에 있어서 다양한 메카니즘을 제공할 수 있다. 본 연구에서는 ATF2 cDNA를 6xHis를 가진 expression vector에 subcloning하여 E.cnli BL2l에서 발현시켰다. 6xHis tag은 nickel-chelating chromatography를 가능하게 하였다 발현된 ATF2는 In vitro binding pull-down assay에서 동형이합체를 이를 뿐만 아니라 AP-1 그룹의 인자들과 선택적인 이형이합체를 형성함을 보여 주었다. BATF와는 강하게 결합하였으며 c-Jun과도 안정된 이합체를 형성하였다. 그러나 c-Fos와는 이합체를 형성하지 않으므로서 AP-1그룹 내에서도 이합체 형성이 선택적으로 이루어짐을 알 수 있다.

니트로메탄의 분자 간 수소결합과 니트로메탄 이합체의 안정화에 관한 이론적 연구 (A Theoretical Study on the Inter-molecular Hydrogen Bond Between Nitromethanes and the Stabilization of Nitromethane Dimer)

  • 이민주;김지영
    • 대한화학회지
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    • 제48권3호
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    • pp.229-235
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    • 2004
  • 고에너지 화합물의 수소결합 현상을 연구하기 위하여 nitromethane 단량체 (monomer)와 이합체 (dimer)에 대하여 Gaussian-98 프로그램을 사용하여 restricted BLYP/6-311++G(d,p), B3LYP/6-311++G(d,p), MP2/6-311++G 계산을 수행하였다 . 이러한 이론적 연구를 통하여 nitromethane 단량체 및 이합체의 구조와 수소결합 및 진동스펙트럼을 구하였다 . 본 연구의 결과 nitromethane 상온에서 분자 간에 두 개의 수소결합을 이루며 이합체를 형성하는 것이 유리하고 , 이 이합체는 단량체보다 BLYP, B3LYP, MP2 level 계산에서 각각 약 15.2, 19.4, 32.6 kJ/mol 만큼 안정화됨을 알 수 있었다.

매트릭스에 의해 희석된 ACETONITRILE과 DMF 분자클라스터의 80K에서 적외선 흡수 스펙트럼의 분석 (The Infrared Absorption Spectra of Molecular Clusters of Acetonitrile and DMF Diluted by Matrices at 80K)

  • 김완희;정종학;정기호
    • 분석과학
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    • 제5권3호
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    • pp.285-294
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    • 1992
  • 80K에서 사염화탄소 또는 크세논 매트릭스에 의해 희석된 상태에서 $CH_3CN$과 DMF 분자의 이합체의 구조를 적외선 흡수 분광법으로 연구하였다. 시료와 매트릭스 물질을 저온의 KBr트랩창에 함께 퇴적시키고, 순수한 시료와 매트릭스에 희석된 시료의 적외선 스펙트럼을 비교하여 이합체의 구조를 설명하였다. $CH_3CN$의 이합체는 반평행 모양을 그리고 DMF 이합체는 마주보는 선형을 나타내었다. 매트릭스에 희석된 시료에 온도를 상승시키면 순수한 시료와 같은 모양의 적외선 스펙트럼을 보여 주었다.

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다양한 기질 특이성을 갖는 $\alpha$-Amylase계열 Cycloma1todextrin 분해효소들의 구조와 기능간의 관계 (Relationship between Structure and Function of Cyclomaltodextrinases in Their Multispecificity)

  • 김정완;조희연;김영배;박관화
    • 미생물과산업
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    • 제27권1호
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    • pp.2-17
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    • 2001
  • Cyclomaltodextrinase(CDase, EC 3.2.1.54), maltogenic amylase(EC 3.2.1.133). neopullulanase(EC 3.2.1.135)는 cyclomaltodextrin(CD), pullulan 및 전분을 가수분해하는 효소들이다. 이 효소들은 $\alpha$-1,4-Ο-glycosidic 결합에 작용하여 CD와 전분을 말토오스로 pullulan을 panose로 가수분해할 뿐만 아니라 올리고당들을 다양한 당 수용체 분자들의 C-3, C-4. C-6 수산기로 전이시키는 활성도 갖고 있다. 이러한 특성들은 기존의 $\alpha$-amylase를 비롯한 판수화물 분해효소들과 뚜렷이 구별되는 것으로 전분 분해효소들의 분류체계에 새로운 기준점을 제시한다고 하겠다. 본 총설에서는 CDase, maltogenic amylase, neopullulanase처럼 pullulan이나 전분보다 CD를 훨씬 더 잘 분해하는 효소들과 Thermoactinomyces vulgaris amylase II(TVA II)처럼 CD를 분해하기는 하나 pullulan을 더 잘 분해하는 효소들의 생화학적, 효소적, 구조적 특성들을 종합하여 소개하고자 하였다. 이 효소들은 40~60% 정도로 아미노산 서열이 동일하고, 세포 내에 존재하며, 분자량이 62~90 kDa로 $\alpha$-amylase보다 다소 크다. 아미노산 서열 비교분석 및 maltogenic amylase와 TVA II 등의 3차구조 분석 결과, 이 효소들은 아미노 말단에 보통 $\alpha$-amylase에는 존재하지 않는 약 130개 아미노산으로된 영역을 갖고 있어 이를 매개로 이합체를 형성할 수 있는 것으로 나타났다. 이합체-단위체 평형은 염 농도, 효소 농도, 산도 등에 의해 조절되고 단위체와 이합체 모두 효소환성을 갖고 있으나, 기질 특이성이 다르며 단위체는 전분을, 이합체는 CD를 선호하는데 이는 이합체 형성 시 활성부위의 구조적 변화에 따른 것으로 분석되었다. 본 총설에서는 CD 분해효소들의 다양한 기질 특이성을 올리고머 형성 등의 구조적 특성과 관련하여 논함으로써 관련 효소들의 분류체계를 보다 명확히 할 수 있는 자료를 제공하고자 하였으며, 이러한 효소들의 생리적 기능 및 산업적 이용에 대해 제안하고자 하였다.

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Rose Bengal과 Allylthiourea의 광촉매 이합체화 반응에 관한 연구 (A Study on the Photocatalytic Dimerization of Rose Bengal and Allylthiourea)

  • 윤길중;함은정;김강진
    • 분석과학
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    • 제11권1호
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    • pp.20-28
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    • 1998
  • 감응제인 rose bengal과 초감응제인 allylthiourea를 포함하고 있는 광전기화학 전지를 이용하여 태양에너지를 전기에너지로 변환시킬 때, 광전류가 지속성이 없는 원인을 규명하기 위하여, 광조사 전후의 염료 용액을 형광 및 흡수 분광법으로 분석하였다. 그 결과, 감응제와 초감응제 사이에 광촉매 이합체화 반응이 일어나는 것을 확인하였다. 또한 이합체를 구성하는 각 분자의 기하학적 쌍극자 배열은 사각임을 확인하였다.

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올리고펩티드 사슬이합체의 헬릭스-코일 전이 이론 (A Theory for the Helix/Coil Transition of Oligopeptide Chain Dimer)

  • 김영구;박형석
    • 대한화학회지
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    • 제39권10호
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    • pp.776-782
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    • 1995
  • .alpha. 트로포마이신솨 파라마이신등은 .alpha. 나선-사슬이합체를 이룰수 있다. 사슬이합체의 나선에서 코일로의 전이 현상을 적절이 설명할수 있는 이론을 얻을 수 있었다. 이전의 이론은 Zimm-Bragg 매개변수를 사용하는 행렬식으로 올리고펩티드 사슬 이합체의 전이를 설명하였지만 이 이론으로는 올리고펩티드에서 무시할 수 없는 dangling H-bond를 고려할 수 없었다. 본 이론에서는 dangling H-bond까지 고려할수 있는 zipper 모형을 사용하였다. 나선도를 단일 사슬에서 사용되는 나선 개시상수(.sigma.), 나선 안정화(.zeta.)와 소수성상호 인력 매개변수(.omega.) 등의 함수로서 계산할 수 있었다. .alpha. 트로포마이신에서 나선 안정화의 경향을 계산 하였다. 이 올리고펩티드의 온도, 올리고펩티드의 온도, 올리고펩티드농도 변화에 의한 전이는 사슬의 해리와 동시에 일어난다. S-S 결합 등으로 이어진 사슬이 합체나 긴 사슬을 가지는 폴리펩티드는 항상 나선구조로 존재하여 전이가 일어나기 힘들다. 올리고펩티드의 농도에 의한 전이는 사슬의 길이 또는 온도계에 의한 전이보다 급격함을 알 수 있었다.

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p-aminodiphenylamine을 이용한 폴리아닐린 분자량 조절 (Control of Polyaniline Molecular Weight Based on p-aminodiphenylamine)

  • 홍장후;전제열
    • 공업화학
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    • 제20권1호
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    • pp.75-79
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    • 2009
  • 아닐린 단량체(monomer)의 화학적 중합시 사슬성장의 핵심생성구간에서 아닐린 이합체(dimer, p-aminodiphenylamine)의 몰 비율을 조절하여 반응용액에 첨가함으로써 분자량(Mw, 20000~10000) 조절이 가능한 폴리아닐린을 합성 하였다. 중합반응의 개시로 부터 측정된 반응시간에 따른 open-circuit potential 측정결과 첨가된 이합체의 몰수가 증가할수록 중합속도가 빨라짐을 확인하였다. 첨가된 이합체의 몰수가 증가할수록 UV/Vis. 측정결과 합성된 폴리아닐린의 흡수띄가 단파장으로 이동하였으며, GPC 측정결과 분자량이 감소하는 것을 볼 수 있었다.

Rose Bengal 과 Thiourea 의 광촉매 이합체화 반응에 관한 연구 (A Study on the Photocatalytic Dimerization of Rose Bengal and Thiourea)

  • 윤길중
    • 분석과학
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    • 제12권3호
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    • pp.209-217
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    • 1999
  • Rose bengal과 thiourea로 각각 감응 및 초감응된 광전류의 감소 원인을 규명하기 위하여 염료용액을 분광학적인 방법으로 분석하였다. 광조사 전후 감응용액의 흡수 및 형광 스펙트럼을 분석하므로서 RB와 TU사이에 일어나는 광촉매 이합체화 반응 기구를 확인할 수 있었다. 또 두 염료분자가 이루는 쌍극자 모멘트의 기하학적 배열은 사각이었으며, 이들 사이의 각도는 $124^{\circ}$임을 알 수 있었다.

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